Clostridioides difficile CD196: CD196_2440
Help
Entry
CD196_2440 CDS
T00997
Name
(GenBank) putative carbon starvation
Organism
cdc
Clostridioides difficile CD196
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
CstA
CstA_5TM
GerA
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CBA64677
UniProt:
A0A0H3N4J8
LinkDB
All DBs
Position
complement(2833816..2835237)
Genome browser
AA seq
473 aa
AA seq
DB search
MVSFLGSIVVLIVGYFIYGTFVEKVFGINDKNQTPAIACRDGVDYVPMKWKRIFLIQFLN
IAGLGPIFGAIQGALFGPSAFLWIVFGTIFAGGVHDFASGYLSMKNKGTSASELVGLYLG
NGAKIAMRIFSVILLVLVGVVFVTGPAGLLKTLTGVNAQIWVGVIILYYIMATVLPIDKL
IGKIYPLFGAALLIMAVGVAGGLIIKGYNIPNINLQNMNPNGTPLFPYLFITIACGAISG
FHATQSPLMARCVEKESEARPVFYGSMVAEGIIALVWAAAAMSYFHGIPQLNVIFNDGGA
ATVVNTVSVGLMGPIGGALAILGVVACPITSGDTAFRSARLTIADAMNYNQDAVKNRFLI
ALPLFAVGVALTFIDFNIIWRYFSWANQTLAMIMLWTGSAYLVKANKNHYITTLPALFMT
VVTFSYIMQAKEGFRLPVNISNGIGIVVAIILGLLFFKKAKDIKEQNAHKLAS
NT seq
1422 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggtaagctttttaggttcaatagtagtacttatagtaggttattttatctatggtact
tttgtagaaaaggtttttggaatcaatgacaaaaaccaaactccagctatagcttgtagg
gatggagtagattatgtgccaatgaaatggaagagaatctttttaattcagtttctaaat
atagcagggttaggtccgatatttggagctatacaaggggcgttatttggaccatcagca
tttttgtggattgtgtttggaacaatctttgcaggtggagtacacgattttgcttcagga
tatttatcaatgaagaacaaaggtacatctgcatcagagttggtaggtctttatctagga
aatggtgcaaaaatagcaatgagaatatttagtgttattcttttagtattggttggagtt
gtatttgtaacaggtccagcaggattattaaagacattgacaggtgtaaacgcacaaata
tgggttggagtgataatactttattatattatggctactgttttaccaatagataaattg
attggtaaaatatatcctttatttggagcagcattattaattatggcagtaggtgtagct
ggaggattaataataaaggggtataacataccaaatataaatttacaaaatatgaatcca
aatggaacacctttattcccatacttatttataacaatagcatgtggagcaatatcaggt
ttccatgcaactcaatcaccacttatggcgagatgtgttgagaaagagagtgaggcaaga
ccagtattttatgggtcaatggttgcagaaggtataatagctttagtttgggcagcagca
gctatgtcatatttccatggtatacctcagcttaatgtaatatttaatgatggtggagca
gcaactgttgtaaatacagtatctgttggattaatgggacctattggaggcgctttggcc
atacttggtgttgtagcatgtcctataacttcaggggatacagcatttagaagtgctaga
ttaacaatagctgatgcaatgaattataatcaagatgcagttaaaaatagatttttaata
gctttgccattatttgctgtaggggttgcccttacatttatagattttaatataatttgg
agatatttctcttgggcaaatcaaacacttgctatgataatgttgtggactggttctgca
tatttagtcaaagcaaataaaaatcattacataactacattgccagcactttttatgact
gtagtaacatttagttatataatgcaggcaaaagaaggatttagacttccagttaatata
tctaatggaataggtattgtagttgcaataatccttggacttttattttttaaaaaagct
aaggatataaaagagcaaaatgctcataaattagcaagttaa
DBGET
integrated database retrieval system
