Clostridioides difficile CD196: CD196_2723
Help
Entry
CD196_2723 CDS
T00997
Name
(GenBank) putative drug/sodium antiporter
KO
K26937
MATE family, multidrug efflux pump
Organism
cdc
Clostridioides difficile CD196
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
cdc00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
cdc02000
]
CD196_2723
Transporters [BR:
cdc02000
]
Solute carrier family (SLC)
SLC47: Multidrug and Toxin Extrusion (MATE) family
CD196_2723
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
MatE
DUF5345
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CBA65262
UniProt:
A0A0H3N5D8
LinkDB
All DBs
Position
complement(3200982..3202322)
Genome browser
AA seq
446 aa
AA seq
DB search
MENQEALRHEKIWILLFRYSIPAIIAMMVTSLYNVVDRAFIGSMEGIGSIAIAGLGVTMP
VFTLIIAFGMLVSVGASTRLSIKLGERNREEAEKILGNALTLSIIISLIITILGLVFLED
ILFILGASKDSIFYAKDYMSVILIGSIFNLVAFSLNNAIRAEGNPKLAARTMIVGCVLNL
ILDPIFIFVFNLGIKGAAIATVLCQIVVFFWVTYYFIRGKSTLKLKKCNLKLNKDIVKKV
FAIGMTPFAMEVAISITHMFTNNSLKVYGGDLAIGAMTALTSILLMFMMPVFGLNQGMQT
IISYNYGAKQYERAKKTLILSIIVSVVILSFGFLIVQVFPEVFVGIFNKDSDLMDIAVRG
ISINLITLPIMGISIVGPVYFQCISKVKHSMFLTLLRQFILFIPLIIVLPIQFNLDGVWL
AQPVADFIAMIIVLLFLKREFKTSRV
NT seq
1341 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggagaatcaagaagcattaagacatgaaaaaatatggattttattatttaggtattcg
ataccggcaataatagcaatgatggtaacttcactttataatgtagtagatagagctttt
attggttctatggaaggtattggctctatagctattgcaggtcttggtgtaactatgcca
gtatttactctaataatagcttttggaatgttggtatcagtaggtgctagcacaagattg
tctataaaattaggggaaagaaatagagaagaagcagagaagatattaggtaatgctttg
acattatctataattatctctttaattataactatattaggattagttttcttagaagat
atactttttattttgggtgcaagtaaagattcaatattttatgcaaaagactatatgagt
gtcatattgattggaagtatatttaatttagttgcattttctcttaataatgcaattaga
gcagaaggtaatccaaaattagcagcaaggacaatgattgtaggatgtgtattaaacctg
atattggaccctatatttatatttgtgtttaatttaggtataaaaggagcagctatagca
acagtactatgtcaaatagtagtattcttttgggtaacatattattttataagagggaag
tccactttaaaactaaaaaaatgtaacttaaaattgaataaagatatagtaaagaaggta
tttgcaataggaatgacaccttttgctatggaagtagctataagtataactcacatgttt
acaaacaattctctaaaggtttatggtggagatttagctattggggctatgacagcactt
acatctattttattgatgtttatgatgcctgtgtttggattgaatcaaggtatgcaaact
ataatatcatacaattatggtgcaaaacaatatgaacgtgcaaagaaaactttaatatta
tctatcatagtgtcagttgtcatattgtcatttggatttttaatagtacaagttttccca
gaagtatttgtaggtatatttaataaagattcagatttgatggatatagcagtaagaggt
ataagcataaatctaattacattgcctataatggggatttctattgtaggacctgtgtat
tttcagtgtataagtaaagttaaacattcaatgtttttaactcttttaagacaatttatt
ttatttataccattaatcattgtacttccaattcaatttaatttagatggtgtttggttg
gcacagccagttgcagattttattgctatgataatcgtattattattcttaaaaagggaa
tttaaaacaagccgagtataa
DBGET
integrated database retrieval system
