Clostridioides difficile 630: CD630_06630
Help
Entry
CD630_06630 CDS
T00487
Symbol
tcdA
Name
(GenBank) Toxin A
KO
K11063
toxin A/B
Organism
cdf
Clostridioides difficile 630
Pathway
cdf02024
Quorum sensing
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
cdf00001
]
09140 Cellular Processes
09145 Cellular community - prokaryotes
02024 Quorum sensing
CD630_06630 (tcdA)
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02042 Bacterial toxins [BR:
cdf02042
]
CD630_06630 (tcdA)
Bacterial toxins [BR:
cdf02042
]
Type III toxins: Intracellular toxins
Others
Toxin A/B
CD630_06630 (tcdA)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TcdA_TcdB_pore
TcdA_TcdB
Choline_bind_3
Choline_bind_1
Peptidase_C80
TcdB_N
MLD
Gly_transf_sug
RING_CBP-p300
COMMD8_HN
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CAJ67494
UniProt:
Q189K5
LinkDB
All DBs
Position
795843..803975
Genome browser
AA seq
2710 aa
AA seq
DB search
MSLISKEELIKLAYSIRPRENEYKTILTNLDEYNKLTTNNNENKYLQLKKLNESIDVFMN
KYKTSSRNRALSNLKKDILKEVILIKNSNTSPVEKNLHFVWIGGEVSDIALEYIKQWADI
NAEYNIKLWYDSEAFLVNTLKKAIVESSTTEALQLLEEEIQNPQFDNMKFYKKRMEFIYD
RQKRFINYYKSQINKPTVPTIDDIIKSHLVSEYNRDETVLESYRTNSLRKINSNHGIDIR
ANSLFTEQELLNIYSQELLNRGNLAAASDIVRLLALKNFGGVYLDVDMLPGIHSDLFKTI
SRPSSIGLDRWEMIKLEAIMKYKKYINNYTSENFDKLDQQLKDNFKLIIESKSEKSEIFS
KLENLNVSDLEIKIAFALGSVINQALISKQGSYLTNLVIEQVKNRYQFLNQHLNPAIESD
NNFTDTTKIFHDSLFNSATAENSMFLTKIAPYLQVGFMPEARSTISLSGPGAYASAYYDF
INLQENTIEKTLKASDLIEFKFPENNLSQLTEQEINSLWSFDQASAKYQFEKYVRDYTGG
SLSEDNGVDFNKNTALDKNYLLNNKIPSNNVEEAGSKNYVHYIIQLQGDDISYEATCNLF
SKNPKNSIIIQRNMNESAKSYFLSDDGESILELNKYRIPERLKNKEKVKVTFIGHGKDEF
NTSEFARLSVDSLSNEISSFLDTIKLDISPKNVEVNLLGCNMFSYDFNVEETYPGKLLLS
IMDKITSTLPDVNKNSITIGANQYEVRINSEGRKELLAHSGKWINKEEAIMSDLSSKEYI
FFDSIDNKLKAKSKNIPGLASISEDIKTLLLDASVSPDTKFILNNLKLNIESSIGDYIYY
EKLEPVKNIIHNSIDDLIDEFNLLENVSDELYELKKLNNLDEKYLISFEDISKNNSTYSV
RFINKSNGESVYVETEKEIFSKYSEHITKEISTIKNSIITDVNGNLLDNIQLDHTSQVNT
LNAAFFIQSLIDYSSNKDVLNDLSTSVKVQLYAQLFSTGLNTIYDSIQLVNLISNAVNDT
INVLPTITEGIPIVSTILDGINLGAAIKELLDEHDPLLKKELEAKVGVLAINMSLSIAAT
VASIVGIGAEVTIFLLPIAGISAGIPSLVNNELILHDKATSVVNYFNHLSESKKYGPLKT
EDDKILVPIDDLVISEIDFNNNSIKLGTCNILAMEGGSGHTVTGNIDHFFSSPSISSHIP
SLSIYSAIGIETENLDFSKKIMMLPNAPSRVFWWETGAVPGLRSLENDGTRLLDSIRDLY
PGKFYWRFYAFFDYAITTLKPVYEDTNIKIKLDKDTRNFIMPTITTNEIRNKLSYSFDGA
GGTYSLLLSSYPISTNINLSKDDLWIFNIDNEVREISIENGTIKKGKLIKDVLSKIDINK
NKLIIGNQTIDFSGDIDNKDRYIFLTCELDDKISLIIEINLVAKSYSLLLSGDKNYLISN
LSNIIEKINTLGLDSKNIAYNYTDESNNKYFGAISKTSQKSIIHYKKDSKNILEFYNDST
LEFNSKDFIAEDINVFMKDDINTITGKYYVDNNTDKSIDFSISLVSKNQVKVNGLYLNES
VYSSYLDFVKNSDGHHNTSNFMNLFLDNISFWKLFGFENINFVIDKYFTLVGKTNLGYVE
FICDNNKNIDIYFGEWKTSSSKSTIFSGNGRNVVVEPIYNPDTGEDISTSLDFSYEPLYG
IDRYINKVLIAPDLYTSLININTNYYSNEYYPEIIVLNPNTFHKKVNINLDSSSFEYKWS
TEGSDFILVRYLEESNKKILQKIRIKGILSNTQSFNKMSIDFKDIKKLSLGYIMSNFKSF
NSENELDRDHLGFKIIDNKTYYYDEDSKLVKGLININNSLFYFDPIEFNLVTGWQTINGK
KYYFDINTGAALISYKIINGKHFYFNNDGVMQLGVFKGPDGFEYFAPANTQNNNIEGQAI
VYQSKFLTLNGKKYYFDNDSKAVTGWRIINNEKYYFNPNNAIAAVGLQVIDNNKYYFNPD
TAIISKGWQTVNGSRYYFDTDTAIAFNGYKTIDGKHFYFDSDCVVKIGVFSTSNGFEYFA
PANTYNNNIEGQAIVYQSKFLTLNGKKYYFDNNSKAVTGWQTIDSKKYYFNTNTAEAATG
WQTIDGKKYYFNTNTAEAATGWQTIDGKKYYFNTNTAIASTGYTIINGKHFYFNTDGIMQ
IGVFKGPNGFEYFAPANTDANNIEGQAILYQNEFLTLNGKKYYFGSDSKAVTGWRIINNK
KYYFNPNNAIAAIHLCTINNDKYYFSYDGILQNGYITIERNNFYFDANNESKMVTGVFKG
PNGFEYFAPANTHNNNIEGQAIVYQNKFLTLNGKKYYFDNDSKAVTGWQTIDGKKYYFNL
NTAEAATGWQTIDGKKYYFNLNTAEAATGWQTIDGKKYYFNTNTFIASTGYTSINGKHFY
FNTDGIMQIGVFKGPNGFEYFAPANTHNNNIEGQAILYQNKFLTLNGKKYYFGSDSKAVT
GLRTIDGKKYYFNTNTAVAVTGWQTINGKKYYFNTNTSIASTGYTIISGKHFYFNTDGIM
QIGVFKGPDGFEYFAPANTDANNIEGQAIRYQNRFLYLHDNIYYFGNNSKAATGWVTIDG
NRYYFEPNTAMGANGYKTIDNKNFYFRNGLPQIGVFKGSNGFEYFAPANTDANNIEGQAI
RYQNRFLHLLGKIYYFGNNSKAVTGWQTINGKVYYFMPDTAMAAAGGLFEIDGVIYFFGV
DGVKAPGIYG
NT seq
8133 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtctttaatatctaaagaagagttaataaaactcgcatatagcattagaccaagagaa
aatgagtataaaactatactaactaatttagacgaatataataagttaactacaaacaat
aatgaaaataaatatttacaattaaaaaaactaaatgaatcaattgatgtttttatgaat
aaatataaaacttcaagcagaaatagagcactctctaatctaaaaaaagatatattaaaa
gaagtaattcttattaaaaattccaatacaagccctgtagaaaaaaatttacattttgta
tggataggtggagaagtcagtgatattgctcttgaatacataaaacaatgggctgatatt
aatgcagaatataatattaaactgtggtatgatagtgaagcattcttagtaaatacacta
aaaaaggctatagttgaatcttctaccactgaagcattacagctactagaggaagagatt
caaaatcctcaatttgataatatgaaattttacaaaaaaaggatggaatttatatatgat
agacaaaaaaggtttataaattattataaatctcaaatcaataaacctacagtacctaca
atagatgatattataaagtctcatctagtatctgaatataatagagatgaaactgtatta
gaatcatatagaacaaattctttgagaaaaataaatagtaatcatgggatagatatcagg
gctaatagtttgtttacagaacaagagttattaaatatttatagtcaggagttgttaaat
cgtggaaatttagctgcagcatctgacatagtaagattattagccctaaaaaattttggc
ggagtatatttagatgttgatatgcttccaggtattcactctgatttatttaaaacaata
tctagacctagctctattggactagaccgttgggaaatgataaaattagaggctattatg
aagtataaaaaatatataaataattatacatcagaaaactttgataaacttgatcaacaa
ttaaaagataattttaaactcattatagaaagtaaaagtgaaaaatctgagatattttct
aaattagaaaatttaaatgtatctgatcttgaaattaaaatagctttcgctttaggcagt
gttataaatcaagccttgatatcaaaacaaggttcatatcttactaacctagtaatagaa
caagtaaaaaatagatatcaatttttaaaccaacaccttaacccagccatagagtctgat
aataacttcacagatactactaaaatttttcatgattcattatttaattcagctaccgca
gaaaactctatgtttttaacaaaaatagcaccatacttacaagtaggttttatgccagaa
gctcgctccacaataagtttaagtggtccaggagcttatgcgtcagcttactatgatttc
ataaatttacaagaaaatactatagaaaaaactttaaaagcatcagatttaatagaattt
aaattcccagaaaataatctatctcaattgacagaacaagaaataaatagtctatggagc
tttgatcaagcaagtgcaaaatatcaatttgagaaatatgtaagagattatactggtgga
tctctttctgaagacaatggggtagactttaataaaaatactgccctcgacaaaaactat
ttattaaataataaaattccatcaaacaatgtagaagaagctggaagtaaaaattatgtt
cattatatcatacagttacaaggagatgatataagttatgaagcaacatgcaatttattt
tctaaaaatcctaaaaatagtattattatacaacgaaatatgaatgaaagtgcaaaaagc
tactttttaagtgatgatggagaatctattttagaattaaataaatataggatacctgaa
agattaaaaaataaggaaaaagtaaaagtaacctttattggacatggtaaagatgaattc
aacacaagcgaatttgctagattaagtgtagattcactttccaatgagataagttcattt
ttagataccataaaattagatatatcacctaaaaatgtagaagtaaacttacttggatgt
aatatgtttagttatgattttaatgttgaagaaacttatcctgggaagttgctattaagt
attatggacaaaattacttccactttacctgatgtaaataaaaattctattactatagga
gcaaatcaatatgaagtaagaattaatagtgagggaagaaaagaacttctggctcactca
ggtaaatggataaataaagaagaagctattatgagcgatttatctagtaaagaatacatt
ttttttgattctatagataataagctaaaagcaaagtccaagaatattccaggattagca
tcaatatcagaagatataaaaacattattacttgatgcaagtgttagtcctgatacaaaa
tttattttaaataatcttaagcttaatattgaatcttctattggtgattacatttattat
gaaaaattagagcctgttaaaaatataattcacaattctatagatgatttaatagatgag
ttcaatctacttgaaaatgtatctgatgaattatatgaattaaaaaaattaaataatcta
gatgagaagtatttaatatcttttgaagatatctcaaaaaataattcaacttactctgta
agatttattaacaaaagtaatggtgagtcagtttatgtagaaacagaaaaagaaattttt
tcaaaatatagcgaacatattacaaaagaaataagtactataaagaatagtataattaca
gatgttaatggtaatttattggataatatacagttagatcatacttctcaagttaataca
ttaaacgcagcattctttattcaatcattaatagattatagtagcaataaagatgtactg
aatgatttaagtacctcagttaaggttcaactttatgctcaactatttagtacaggttta
aatactatatatgactctatccaattagtaaatttaatatcaaatgcagtaaatgatact
ataaatgtactacctacaataacagaggggatacctattgtatctactatattagacgga
ataaacttaggtgcagcaattaaggaattactagacgaacatgacccattactaaaaaaa
gaattagaagctaaggtgggtgttttagcaataaatatgtcattatctatagctgcaact
gtagcttcaattgttggaataggtgctgaagttactattttcttattacctatagctggt
atatctgcaggaataccttcattagttaataatgaattaatattgcatgataaggcaact
tcagtggtaaactattttaatcatttgtctgaatctaaaaaatatggccctcttaaaaca
gaagatgataaaattttagttcctattgatgatttagtaatatcagaaatagattttaat
aataattcgataaaactaggaacatgtaatatattagcaatggaggggggatcaggacac
acagtgactggtaatatagatcactttttctcatctccatctataagttctcatattcct
tcattatcaatttattctgcaataggtatagaaacagaaaatctagatttttcaaaaaaa
ataatgatgttacctaatgctccttcaagagtgttttggtgggaaactggagcagttcca
ggtttaagatcattggaaaatgacggaactagattacttgattcaataagagatttatac
ccaggtaaattttactggagattctatgcttttttcgattatgcaataactacattaaaa
ccagtttatgaagacactaatattaaaattaaactagataaagatactagaaacttcata
atgccaactataactactaacgaaattagaaacaaattatcttattcatttgatggagca
ggaggaacttactctttattattatcttcatatccaatatcaacgaatataaatttatct
aaagatgatttatggatatttaatattgataatgaagtaagagaaatatctatagaaaat
ggtactattaaaaaaggaaagttaataaaagatgttttaagtaaaattgatataaataaa
aataaacttattataggcaatcaaacaatagatttttcaggcgatatagataataaagat
agatatatattcttgacttgtgagttagatgataaaattagtttaataatagaaataaat
cttgttgcaaaatcttatagtttgttattgtctggggataaaaattatttgatatccaat
ttatctaatattattgagaaaatcaatactttaggcctagatagtaaaaatatagcgtac
aattacactgatgaatctaataataaatattttggagctatatctaaaacaagtcaaaaa
agcataatacattataaaaaagacagtaaaaatatattagaattttataatgacagtaca
ttagaatttaacagtaaagattttattgctgaagatataaatgtatttatgaaagatgat
attaatactataacaggaaaatactatgttgataataatactgataaaagtatagatttc
tctatttctttagttagtaaaaatcaagtaaaagtaaatggattatatttaaatgaatcc
gtatactcatcttaccttgattttgtgaaaaattcagatggacaccataatacttctaat
tttatgaatttatttttggacaatataagtttctggaaattgtttgggtttgaaaatata
aattttgtaatcgataaatactttacccttgttggtaaaactaatcttggatatgtagaa
tttatttgtgacaataataaaaatatagatatatattttggtgaatggaaaacatcgtca
tctaaaagcactatatttagcggaaatggtagaaatgttgtagtagagcctatatataat
cctgatacgggtgaagatatatctacttcactagatttttcctatgaacctctctatgga
atagatagatatatcaataaagtattgatagcacctgatttatatacaagtttaataaat
attaataccaattattattcaaatgagtactaccctgagattatagttcttaacccaaat
acattccacaaaaaagtaaatataaatttagatagttcttcttttgagtataaatggtct
acagaaggaagtgactttattttagttagatacttagaagaaagtaataaaaaaatatta
caaaaaataagaatcaaaggtatcttatctaatactcaatcatttaataaaatgagtata
gattttaaagatattaaaaaactatcattaggatatataatgagtaattttaaatcattt
aattctgaaaatgaattagatagagatcatttaggatttaaaataatagataataaaact
tattactatgatgaagatagtaaattagttaaaggattaatcaatataaataattcatta
ttctattttgatcctatagaatttaacttagtaactggatggcaaactatcaatggtaaa
aaatattattttgatataaatactggagcagctttaattagttataaaattattaatggt
aaacacttttattttaataatgatggtgtgatgcagttgggagtatttaaaggacctgat
ggatttgaatattttgcacctgccaatactcaaaataataacatagaaggtcaggctata
gtttatcaaagtaaattcttaactttgaatggcaaaaaatattattttgataatgactca
aaagcagtcactggatggagaattattaacaatgagaaatattactttaatcctaataat
gctattgctgcagtcggattgcaagtaattgacaataataagtattatttcaatcctgac
actgctatcatctcaaaaggttggcagactgttaatggtagtagatactactttgatact
gataccgctattgcctttaatggttataaaactattgatggtaaacacttttattttgat
agtgattgtgtagtgaaaataggtgtgtttagtacctctaatggatttgaatattttgca
cctgctaatacttataataataacatagaaggtcaggctatagtttatcaaagtaaattc
ttaactttgaatggtaaaaaatattactttgataataactcaaaagcagttaccggatgg
caaactattgatagtaaaaaatattactttaatactaacactgctgaagcagctactgga
tggcaaactattgatggtaaaaaatattactttaatactaacactgctgaagcagctact
ggatggcaaactattgatggtaaaaaatattactttaatactaacactgctatagcttca
actggttatacaattattaatggtaaacatttttattttaatactgatggtattatgcag
ataggagtgtttaaaggacctaatggatttgaatattttgcacctgctaatacggatgct
aacaacatagaaggtcaagctatactttaccaaaatgaattcttaactttgaatggtaaa
aaatattactttggtagtgactcaaaagcagttactggatggagaattattaacaataag
aaatattactttaatcctaataatgctattgctgcaattcatctatgcactataaataat
gacaagtattactttagttatgatggaattcttcaaaatggatatattactattgaaaga
aataatttctattttgatgctaataatgaatctaaaatggtaacaggagtatttaaagga
cctaatggatttgagtattttgcacctgctaatactcacaataataacatagaaggtcag
gctatagtttaccagaacaaattcttaactttgaatggcaaaaaatattattttgataat
gactcaaaagcagttactggatggcaaaccattgatggtaaaaaatattactttaatctt
aacactgctgaagcagctactggatggcaaactattgatggtaaaaaatattactttaat
cttaacactgctgaagcagctactggatggcaaactattgatggtaaaaaatattacttt
aatactaacactttcatagcctcaactggttatacaagtattaatggtaaacatttttat
tttaatactgatggtattatgcagataggagtgtttaaaggacctaatggatttgaatac
tttgcacctgctaatactcataataataacatagaaggtcaagctatactttaccaaaat
aaattcttaactttgaatggtaaaaaatattactttggtagtgactcaaaagcagttacc
ggattgcgaactattgatggtaaaaaatattactttaatactaacactgctgttgcagtt
actggatggcaaactattaatggtaaaaaatactactttaatactaacacttctatagct
tcaactggttatacaattattagtggtaaacatttttattttaatactgatggtattatg
cagataggagtgtttaaaggacctgatggatttgaatactttgcacctgctaatacagat
gctaacaatatagaaggtcaagctatacgttatcaaaatagattcctatatttacatgac
aatatatattattttggtaataattcaaaagcagctactggttgggtaactattgatggt
aatagatattacttcgagcctaatacagctatgggtgcgaatggttataaaactattgat
aataaaaatttttactttagaaatggtttacctcagataggagtgtttaaagggtctaat
ggatttgaatactttgcacctgctaatacggatgctaacaatatagaaggtcaagctata
cgttatcaaaatagattcctacatttacttggaaaaatatattactttggtaataattca
aaagcagttactggatggcaaactattaatggtaaagtatattactttatgcctgatact
gctatggctgcagctggtggacttttcgagattgatggtgttatatatttctttggtgtt
gatggagtaaaagcccctgggatatatggctaa
DBGET
integrated database retrieval system