Caldicellulosiruptor diazotrophicus: CaldiYA01_14010
Help
Entry
CaldiYA01_14010 CDS
T08057
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
cdia
Caldicellulosiruptor diazotrophicus
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Laminin_G_3
Glyco_hydro_43
GH43_C
aBig_2
SLH
3keto-disac_hyd
Laminin_G_2
EPL1
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BCS81441
LinkDB
All DBs
Position
complement(1452386..1456708)
Genome browser
AA seq
1440 aa
AA seq
DB search
MILSKRKFLVKVCAITVIFCIIFSFLIPALAYVDNESHWANLSAKKWVEREVLKGYPDGS
LKLSKNITIGEFLALLCRIFNYEYIPPELNQAIKEENWQKEFILKAAGAGLIDQEIVDVY
MLNGYITRQEVAYILAKAFDLPAGDKKVLEAFSDSQQIAEEYKDSIASLVQLGYMRGKPG
RKIDPLGYLTRGEAVKLLDNLVSDLKNKPGIYSGQVKGNIVVNTSDVQLNNMRLEGDLYL
TEGIGEGEVYLKNVDVKGRILIKGGGINSIKLENVNLEGQLIIDKKNGTVRVITIGETNI
PNVIVKSGAILEEEKISSKGFLNIKIDNNLPDSIVILNGQFENVEINGDRQEVKLESNTK
VVNLKATSNVRITGNGILENEPLIDKSKVVVNVKVVQKEKNEFKEEEGKKASEKQTDEKL
STNPIVTYIQTSSNQTSSTNQTQQGSNQQTSGSTGTSQQNNENQTTEESVYLPESPAFKN
VSVHDPSVIKVNDTYYIFGSHLAAAKSKDLMQWELIDSGVRNDNKIIPNVFTELAETFEW
AQTNTLWAPHVVQLKNGKFYMYYCACKGDSPLSALGIAVADNVEGPYRNLGIILKSGMKG
TSEDGTPYDATKHPNVVDPHVFYDKEGKLWMVYGSYSGGIFILQLDPETGLPLPGQGYGK
KLVGGNHSRIEGPFILYNPQTDYYYLFLSFGGLASDGGYNIRVARSKNPDGPYYDSEGHD
MIECKGKEGSFFDDASIEPYGVKLIGNFLFDTNPQNVNGPGYGYVSPGHNSAYYDPQTGK
YYLIFHTRFPGKGEQHEVRVHQLFFNEDGWPVVAPSPYVGEKAVKVKTQDIVGEYLYINH
GKDISPKIKGASIINLNNDGTVSGDVYGTWNLKGDYYGEIVLESNENGVKTQEIYKGVFV
KCWDPTTKSYVMTFSGLSQKGVSIWLKQINKSTLADVVINSISIPTTVGNEGISLPTIGY
LNVPIQWHSDNPDILSDSGLIISRPENSTKVVLTATVTYGGVTRTKQFEVLVTGSKFDPD
NDLSLIAYYPFEGNLNEATGKVGPGIVTGNRINNEGGNITFSEGIKGNSAVFDGESGIRL
PDDLIKDWTYTVSFWVYAEQLTQFTTTFFGAYNENSWISFTPRGWDGASSILWSGSDPWY
DGICSNNVKIGEWTHVAITVDNGIVKVYMNGRLVFEGSNFPDRFSKKPGGIFALGVNWWD
PPFKGKIDELRIYDRALLQDEIKVLAEDKVKEGGLIAWFKFEDNLQDSTGNFNEGVVIGN
KIDVPGGQISYGEGVVGKAVYLDGNSGVRLPNGLISSYEYTVSLWVYAEKLTMFTPTFFG
AMSQTKWISVVPYGHNGVDNSIMVWSGSERWIDGGTGVKINPNTWTHIAFTVKRGNLTVY
VDGEKKFEGTGVPNIFNSYDGIFTLGVNWWDAPFKGMIDELKIYDISLSQDEIKKLFQTK
NT seq
4323 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgattttatcaaaaagaaaatttttagtaaaggtttgtgccataacagtaatattctgc
ataattttttcgtttttaattcctgccttagcgtatgtagataatgaaagtcattgggca
aatttgagtgctaaaaagtgggtagaaagagaagtgttaaaaggatatcccgacggatct
ttaaaactcagcaagaatataacaattggagaatttttagcattactatgtagaattttt
aattacgagtatattcctccagaattaaaccaagcaattaaagaagaaaattggcaaaaa
gaatttattttaaaggcagctggggcagggttaattgatcaagagatagttgatgtttat
atgctaaatggatatataacaagacaagaagtagcgtatattttagcaaaggcttttgat
ttgcctgcaggggacaagaaagtattagaggcatttagtgattctcaacagatagctgag
gaatacaaagacagtattgcctcactagttcagctgggatacatgagaggaaaaccaggc
aggaaaattgatcctcttggatatttaacgagaggagaagcagtcaaattgttagacaat
ttagtgtctgatttgaagaacaaaccaggaatatattcaggtcaagtaaaagggaatatt
gtagtcaatacaagtgatgttcaactcaataatatgaggctggaaggtgatttgtattta
acagagggtattggtgagggtgaagtctatcttaaaaatgttgacgttaaaggtagaata
cttataaaaggtggaggaattaacagtattaaacttgaaaatgttaacttagaaggacaa
ttaattatagataagaaaaacgggacagtgagagttattacaataggagaaacgaatatt
cccaacgtaattgttaagagtggagctatcttagaggaagaaaaaatatcaagtaaagga
tttttgaatattaagatagacaataatctaccagattcgattgttattttaaatggacaa
tttgagaatgttgaaattaatggggaccgacaagaggtaaagcttgagtcaaatacaaaa
gttgtaaatttaaaagctacatctaatgtaagaattacgggaaatggcattttggaaaat
gaacctttaatagacaagagtaaagttgttgtaaatgtaaaggtagttcagaaagagaaa
aatgaatttaaagaagaagagggtaaaaaagcctctgaaaagcaaaccgatgaaaaatta
tctacaaatccaatagtgacttatatacaaacaagttctaatcaaacctcttctactaat
cagactcagcaaggtagtaatcaacagacaagtggtagcacagggacttctcaacaaaac
aatgagaaccaaacaaccgaggaaagtgtttatttgcctgaaagtcctgcatttaaaaat
gtctcagttcatgatccttctgtaattaaagtaaatgatacctactatatttttggttct
cacttagcagcagcaaaaagcaaagatttaatgcaatgggaattgattgattctggggtt
cgtaacgataataaaataatacccaatgtatttactgagcttgcagaaacatttgaatgg
gctcaaacaaacacattatgggctcctcatgttgttcaacttaaaaatggcaaattctat
atgtactattgtgcatgcaaaggagattctccactttctgcattgggcatagcagtggca
gataatgtagaaggtccatacaggaatcttggaattattttgaaatcaggtatgaaagga
accagtgaagacggaactccttatgatgcgacaaagcatccaaatgtagttgatccacat
gtattctatgacaaagagggtaagttgtggatggtatatggatcgtattcgggtggtatt
ttcattttacaactggatccagaaacagggttgccgttacctggtcagggttacggtaag
aagttagtagggggtaatcatagcagaatcgaaggaccgtttatactttacaatcctcaa
acagattattactacttattcttgagctttggtggtcttgcttctgatggggggtataat
attagagttgcacgttcaaaaaatcctgatgggccttactatgattcagaaggacacgac
atgatagaatgtaaaggaaaagaaggttcattttttgacgatgcttccattgagccctat
ggagttaaacttattggtaatttcctatttgatacaaatccacaaaatgtgaatggacca
ggttatggatatgtttcaccaggacataattcagcatattatgatccacaaacaggcaaa
tattatttaatattccatacaagatttccaggaaaaggagaacaacatgaagtaagagtt
catcaattatttttcaatgaagatgggtggccagttgttgctccttctccttatgttgga
gaaaaagcagtaaaagtaaaaactcaagatattgtgggagaatacttgtatatcaatcat
gggaaagatataagtccaaaaatcaaaggagcttctattatcaatctcaacaatgatgga
acagtaagtggcgatgtttatggaacatggaacttgaagggggattattatggtgaaatt
gtcctcgaatcaaatgaaaatggggtaaaaacgcaagagatatataagggtgtgtttgtt
aaatgttgggacccaacaaccaaaagttatgttatgacatttagcggactatcacaaaaa
ggagtttctatttggttaaaacaaatcaacaagagcactcttgctgatgttgtaattaat
agcattagtataccaacaactgttggaaacgaaggtatatcactaccaacaattggttac
ttgaatgttcctatccaatggcatagtgataatccagatattttatcagattccggatta
attatatcaaggcctgaaaattcaacaaaagttgttctcacagctactgtaacttatggt
ggtgtgacaagaacaaaacaatttgaagtacttgttacaggcagtaaatttgaccccgat
aatgatttaagtcttattgcttattatccatttgaagggaatctaaatgaggcaaccggt
aaggttggtccaggtattgttacaggaaataggataaacaatgaaggtgggaatattacc
tttagtgaaggaataaaaggtaattcagcagtttttgatggtgaatcaggaattagatta
ccagatgatttgattaaagattggacttatactgtttctttctgggtttatgctgaacaa
ttaacccagtttacaactaccttttttggagcatataatgaaaactcatggattagtttt
acaccacgtggttgggatggcgctagcagtatcctctggtcaggttctgacccatggtat
gatgggatatgcagtaataacgtaaagattggcgagtggactcatgtagcaattacagta
gataatggtatagtgaaagtttacatgaatggaagacttgtttttgaaggtagtaatttc
cctgatagatttagcaaaaaacctggcggtatctttgcgttaggtgtaaactggtgggat
ccgccatttaaagggaaaatcgatgaattaagaatatatgatagagcactcttgcaagat
gaaattaaagttttggcagaagataaagtaaaggaaggcggtttaattgcatggtttaaa
tttgaagataatcttcaggattctacgggtaatttcaatgaaggagttgtaataggcaat
aaaattgatgtaccgggtggtcagatttcttatggtgaaggagttgtgggtaaagctgta
tatttggatggaaattcaggtgttcgattgccgaatgggcttatttcaagttatgagtat
acagtatctctatgggtatacgctgaaaaactcacaatgtttacaccaacattttttggg
gcaatgagccaaacgaaatggattagtgttgtcccttatggtcacaacggtgtagataac
agtataatggtatggtctggaagtgaaagatggatagatggtgggactggtgtaaaaata
aatcctaatacatggacacatatagcttttacagtaaagagaggaaatttgacagtttat
gttgatggagaaaagaaatttgaaggaactggtgtacctaacatatttaattcttatgat
ggaatcttcaccttaggggtaaattggtgggatgctccatttaaaggtatgatagatgaa
ttaaaaatttatgatatttccttgtcacaagatgaaattaaaaaattgtttcaaacaaaa
tga
DBGET
integrated database retrieval system
