KEGG   Clostridioides difficile R20291: CDR20291_0133
Entry
CDR20291_0133     CDS       T00998                                 
Name
(GenBank) putative transcription antiterminator
Organism
cdl  Clostridioides difficile R20291
SSDB
Motif
Pfam: PTS_EIIA_2 PRD HTH_11 Mga HTH_DeoR HTH_Mga
Other DBs
NCBI-ProteinID: CBE01693
UniProt: A0A9R0CD51
LinkDB
Position
176126..178039
AA seq 637 aa
MICLNKRQENLLTTLLLKEEFINVNKIANDFECSERTIRNDCKYIDEWLSTFCNAYIKRK
PNIGIKFSGDGTDKILVNQKLRGEVKRVNSELHKQVEILNLLLCNNKKVTLNDLSNKLYI
NKNIVREEISKLSVALNNYNLNVSTKKGSGIYIEGDEKDIRIMLVSFLFKYIDKYRLNID
EIEYFHIVDIIIVKNIMLTIEEDMDIRLTDISFKQLMLFLLINIIRIRLGNSLKVSNTKK
ELKLKMLILDIEDELKSNLSIVLNYEEKLFIESLILGMNKQINSNNIKKSLYLNEELASY
TKKIINLVSEESGINFNNDILLYEQLICHLNVTMHQMKSNVYLENPLLDNIKTKFCFLFT
VISSSIEIELKGKQITEDEIGYLTLHFQTSLERKYSKRESNKKASIVCPFSFGVSMLLKV
KIEKRFDNIKIIETLREEDLKRDNFNKTIDFIIAFQEYENIQKPIFITTPLFTDEDENKL
KEFTNKIKEKDTSYKLMNRLMMSDYLIRELEHDDIYEAITYLTNLLIEKHYAEKEYLQSI
ITREKSYPTNVGKGILFPHGDMKYIKQSVLCFARLKTPIKIRNGKDIKIILLLAYKKDDD
RKVFRELFKEISNLTEDENMLDILSKCDIEKVKDILI
NT seq 1914 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
gtgatatgtttgaataaaagacaagaaaatttattaacaacattgctattaaaagaagag
tttataaatgttaataagattgccaatgattttgagtgttcagaaaggacaataaggaat
gattgcaaatatattgatgaatggttatctactttttgtaatgcttatatcaaaagaaaa
cctaatattggaattaaatttagtggagatggaacagacaaaatactggtaaatcagaag
ttgcgaggtgaagttaaaagagtaaatagtgagcttcataagcaagttgagatattaaat
ttactactttgtaataataaaaaagttactttaaatgatttatctaataagttgtacata
aataaaaatattgtcagagaagaaataagtaaattatcagtagcattaaataattataat
ttaaatgtctcgactaaaaaaggcagtggtatatatattgaaggggatgagaaagacata
agaataatgttagtatcattcttatttaaatacatagataaatacagattaaacatagat
gaaatagagtacttccatatagtagatataataattgtaaaaaacataatgcttactata
gaggaggatatggatataagacttacagatatatcattcaagcaattgatgctatttttg
cttataaatataatacgaataaggctgggaaattctttaaaagtatcaaatactaagaaa
gagcttaagctaaaaatgcttatattggatatagaagatgaattgaaatctaatttatcc
atagtattaaattatgaagaaaaattgtttatagaatctttaatattgggtatgaacaaa
caaataaatagtaataatattaagaaatctttatatctaaatgaagaattagcaagttat
acaaaaaaaattataaatttagtatcagaagaatcaggaataaattttaataatgatata
ttactttatgaacaattaatatgtcatttgaatgttacaatgcatcaaatgaaaagcaat
gtttacttagaaaatccacttttagataacataaaaactaaattttgttttttatttaca
gtaatatcaagttcaatagaaattgaattaaaaggaaaacaaataacggaagatgaaatt
ggttatcttacacttcactttcaaacctctctagaaagaaaatacagcaaaagggaatca
aataaaaaggcaagtattgtatgtccatttagttttggagtaagtatgctattaaaagta
aagatagaaaagagatttgataacataaaaattattgaaacattaagagaggaagattta
aaaagagataactttaataagactatagattttataattgcatttcaagagtatgaaaat
atccaaaaaccaatttttataacaacaccattatttactgatgaggatgagaataaactt
aaagagtttacaaacaaaataaaagaaaaagacacctcatataaacttatgaacagatta
atgatgtctgattatttaataagagagttagaacatgatgatatttatgaagctataaca
tatttaactaatttattaattgaaaaacattatgcagaaaaagagtatttacaatctatt
ataacaagagaaaagtcatatccaaccaatgttggaaaaggaatattattccctcatgga
gacatgaaatatataaaacaatctgttttatgttttgcaaggttaaaaacaccaataaaa
attagaaatggaaaggatataaagattatacttttattagcatataaaaaagatgatgat
agaaaagtatttagagaattatttaaagaaatatctaatttaacagaggatgaaaatatg
ctagatattctaagtaaatgtgacattgaaaaggtaaaagatattcttatataa

DBGET integrated database retrieval system