Clostridioides difficile R20291: CDR20291_1354
Help
Entry
CDR20291_1354 CDS
T00998
Name
(GenBank) putative drug/sodium antiporters
KO
K26937
MATE family, multidrug efflux pump
Organism
cdl
Clostridioides difficile R20291
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
cdl00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
cdl02000
]
CDR20291_1354
Transporters [BR:
cdl02000
]
Solute carrier family (SLC)
SLC47: Multidrug and Toxin Extrusion (MATE) family
CDR20291_1354
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
MatE
Polysacc_synt
TOM13
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CBE03848
UniProt:
A0A9R0CEA6
LinkDB
All DBs
Position
complement(1599564..1600889)
Genome browser
AA seq
441 aa
AA seq
DB search
MENLFTRKFTTFEFLKFVSPAIISMIFISLYTIIDGIFVSTLVGSDALASINIVLPIINL
VCGFGIMMATGGGAIVSIRMGENRQDEANSTFSFIVLFSLIVGISFTVISYFFIKEISIL
LGATDKLLPYCITYGKVMILCTPFYILKFIFNYFARTDGNSKFSLFLSVIGGVTNIILDY
VFIKYFGMGLLGAAVATAIGIILTCVLGIIYFLSNKSTLKLRKPKTDFRLIRDTMINGSS
EMVTELSTGITTFLFNVVALKLAGENGLAALTIVLYAHFLMTSVYLGFAAGVSPLISYNF
GAENSDKLKETFKHSLKFIFVSSLLVFIIALVFAPFIVRVFVSPDNTVFKLALQGLKIFA
FAFLFVGINIFASGFFTAFHNGKISAIISFSRAFVFIIIGIIILPPMLNMTGLWLTVPFA
EVITIFISILFIKKYKGRYKY
NT seq
1326 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaaaatttatttacaagaaaattcactacttttgaatttctaaaatttgtttctcct
gcaattatatccatgatatttatatctttgtacacaataatagatggcatctttgtatca
acattagttggttccgatgctcttgctagtataaatattgtactacctataattaacctt
gtttgtggatttggaataatgatggcaacgggtggaggtgctatcgtttctatacgtatg
ggtgaaaatagacaggatgaagccaactctacattttcttttatagttttgttttcattg
attgttgggatttcattcacagtaatctcatatttctttatcaaagaaatatctattttg
cttggtgcaacagataagttattaccatattgtataacttatggtaaagttatgatttta
tgtacaccattttatattttaaaatttatatttaactactttgcaagaactgatggaaat
tctaaatttagtttatttctatcagtcattggtggtgtaacaaatataatattggattat
gtatttattaaatattttggaatgggtcttttaggagctgcagttgcaactgctataggt
attattttaacttgtgttttaggtattatttacttcttatctaataaatctacactcaaa
ttaagaaaaccaaaaaccgattttagacttataagagatactatgataaacggttcttct
gaaatggttacagaattatctacaggaattacaacattcttatttaatgtagtagcttta
aaattagcaggagaaaatggacttgctgctcttactatagtattgtatgctcatttttta
atgacatcagtctatctaggattcgctgctggagtgtctccattaataagctataatttt
ggtgctgaaaacagtgataaattaaaagaaacatttaaacattctctaaaatttatattt
gtttcttctcttttagtgtttattattgctttagtatttgcaccatttattgttagggtt
tttgtaagtccagataacacagtatttaaactagccttacaaggattaaaaatatttgca
tttgcttttttgtttgttggtataaatatatttgcatcaggattttttacagcatttcac
aatggaaaaatttcagctattatatcttttagtcgtgcctttgtttttataatcatagga
atcataattcttcctcctatgttaaacatgactggattatggcttacagttccatttgct
gaggttataaccatatttatatctattctatttataaaaaaatataaaggtagatataag
tattaa
DBGET
integrated database retrieval system
