Clostridioides difficile R20291: CDR20291_1518
Help
Entry
CDR20291_1518 CDS
T00998
Name
(GenBank) putative permease
Organism
cdl
Clostridioides difficile R20291
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
MFS_1
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CBE04136
UniProt:
A0A9R0BK61
LinkDB
All DBs
Position
1788014..1789264
Genome browser
AA seq
416 aa
AA seq
DB search
MKSYTKAKWSVWGIITFSFVLVLFLRMSTAVVSDNLANELGFNSIQISNIASFCLYAYAF
MQIPAGILIDKYGARKISSLGIIMASLGSILFGLIQSIELAYISRVIVGAGTSVILLCIL
KIQGRWFNKSEFASATAKFSFVGNLGGVLATFPLVFLSELVGWRNSFLLIGIIGVVIGCF
IYIIVRDTPKEYGFNVDTEPYEKSEKVNIVDGIKSVIKNKSTWYNSMIMFSFVGLTSAFI
SLWGVRYIMDVYGVSKSFSAFIVSFFTYGFIFGSIIMDFVFAKIRSSKFNIIKFGAMIDL
FIWIVIVVVYQVKPPIIVLPISFFIMGCIVMSHLQVFNDAKYKNKEIYSGLATSVINTFE
FIGSGIINLIIAISLQVNSYNIVDGYKKGFVVFIVLSIITIVSSHIGVKNDDCKAI
NT seq
1251 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaagttatacaaaggctaagtggagtgtttggggtataattacattttcatttgtt
ttagtattatttttaaggatgtcaactgctgttgtttcagacaatttagcaaatgagtta
ggttttaattctatacaaatttcaaatatagcatccttttgcctatatgcatatgcattt
atgcaaatacctgcaggaattttgattgataaatatggagcaagaaaaattagcagtctt
ggaataataatggcaagtttagggtcaattttatttggtttgattcaaagtatagaatta
gcatatatttctcgtgtaattgtaggggcaggaacatcagtaatattactttgtatttta
aaaattcaagggagatggtttaataagtcagaatttgcttctgcaacagctaaattttca
tttgtaggaaatttaggtggagttcttgctacttttccacttgtgtttttgtctgaactt
gttggttggagaaattcatttttattaatcggtataattggtgttgtaattggatgtttt
atatatattattgttagagatacaccaaaagagtatggattcaatgtagatactgaaccc
tatgaaaagtcagagaaggttaatattgttgatggtattaagtctgttataaagaacaaa
tcaacatggtataattcaatgataatgttctcttttgttggtcttacaagtgcatttata
agcttgtggggagtaagatacataatggacgtttatggtgtgagtaagagtttttctgcg
tttatagtatcattttttacatatggatttatatttggttcaataattatggattttgta
tttgctaaaataaggtctagcaaatttaatataataaaatttggagcaatgatagatttg
tttatatggattgtaattgtagttgtataccaggtaaaaccaccaattatagttttacca
atatcattctttattatgggatgtatagttatgtcacatctacaggtttttaatgatgcc
aagtataaaaataaagaaatttattctggactggcaactagtgttattaatacttttgaa
tttataggaagtggaattattaatttgattatagctatctctttacaagtaaattcatat
aatatagttgatggatataaaaaaggttttgtagtatttatagtactaagtattataact
atagtatcatctcatataggggtaaaaaatgatgattgtaaggctatatag
DBGET
integrated database retrieval system
