Clostridium drakei: B9W14_00960
Help
Entry
B9W14_00960 CDS
T05484
Name
(GenBank) hypothetical protein
KO
K21449
trimeric autotransporter adhesin
Organism
cdrk
Clostridium drakei
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
cdrk00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
cdrk02000
]
B9W14_00960
Transporters [BR:
cdrk02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
B9W14_00960
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Dockerin_1
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AWI03133
UniProt:
A0A2U8DK90
LinkDB
All DBs
Position
complement(213060..215954)
Genome browser
AA seq
964 aa
AA seq
DB search
MADTALTVAGKYSLYNKTNGTTNNFVGTSAATDLNAVAAFANTDKTQIKFTISAGASVAG
FPQGGLANAGYILYATGVDDRATVANTIVAASPMEFNGTLTPDTAAANVVSATYNRGNGQ
ISLTFDKAVSGTPADDAVYVQVGTNKVLLKAADYVGIGGTGTITRTISPAQATIDAINAL
GDNPQIVLGDAAFTTSAAGTVTPVVTAVPTVSAVSYDDTTNRMTFTFSEPINVAKFATAL
GANKVKVQTTSGDTWANINGSLVTPVNSATVTVVVDQTTARALEAITIEQPKLRITLDGT
QNLENVTDIETAATTPVQFVEKDYSGIVTLKKTALSIVSTQYTEADHKLKVTFNKDVRVD
ADDSTKLSLYVNDTLAGVIGTDAATPLAIASEEITNDGKTLTYTLINTHANGTSQAEYSE
IETAGVKAGTDKVYLTVTAGAVTDQGGLSTFAVPVANKVPVTYVATPAAAPAASIRTADG
SNYVKVKFDQVVDKTTAETVSNYIAYLVSDSTVTFNFDSATLLSDQQTVYLHSATPLTLS
NSSYKIGIKNIAAKVGGAVMTSTYAYADSQALTTGVALAAPALTDSAITATNTTDQNTAF
IDNGAAGMNAGDTFVVTFDKPVVVNGNVSGVHDVIFTNNNNHDLGTGNITVTPGDYANQL
KVSLGTGYTAALGDKIGIKAGQTAIKFYDNTTNVGTTDENKQVLTAPTAATAAPAVKSAV
YADANNDGKVSAGDTLTVVFDQNLDPNGVAVASMTAGTAATDTFVLPAGTSVGDAATFAY
AGADSVTITLGGNGIDLDATAALSYLRGLTVKAGTNNPVRNTWTVVADGNGTAKTVTSAD
TTRPSITGATYSTTYDYTNGTAGAGTDKVIIVSFGEKVNAADMDAAAIANNFALSSGYSF
GTAPVAKVVNGQVVIKLDANAVFDAGITTINVVAGDTTQTAVDASGNKISRNASSASGYV
VTAQ
NT seq
2895 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gtggctgacactgcattaacagtagcaggaaaatactcattatataacaaaactaatgga
acaacaaataactttgttggaacaagtgcagcaactgacctaaatgcagtagcagcattt
gctaatacagataagactcaaattaaattcacaatttcagctggtgcaagcgtagcaggc
ttcccacaaggtggacttgcaaatgctggatatatattgtatgcaacaggtgtagatgat
agagcaacagttgctaataccatagtagctgcttctccaatggaatttaatggaacattg
acaccagatacagctgcagcaaatgttgtaagtgcaacttataacagaggaaatggacaa
atatctttaacatttgacaaagctgtttcaggaactccagctgatgatgcagtttatgta
caagttggaacaaataaagttctattaaaggctgctgattatgtaggaattggtggtaca
ggaacaataacaagaacaataagtccagcgcaagcaactatagatgcaatcaatgcatta
ggagataaccctcaaatagtattaggagatgctgcatttacaacttcagcagcaggcaca
gtaacaccagtagttacagcagtaccaacagtatcagctgtttcatatgatgatacaact
aacagaatgacatttacattctcagaaccaataaatgtagctaaatttgcaactgcttta
ggagcaaataaagttaaagttcaaactacatctggagatacatgggcaaacatcaatgga
tctttagtaacaccagttaatagtgccactgtaactgtagttgtagaccaaactactgct
agagcattagaagctataactatagaacaacctaaattaagaattacacttgatggaact
caaaatttagaaaatgtaactgatatcgaaactgcagcaactacaccagtacaatttgta
gaaaaagattacagtggaatagttacattaaagaagacagctctttcaatagtttcaacc
caatacacagaagctgatcacaaattaaaagttacattcaacaaagatgtaagagttgat
gcagatgatagtacaaaattatcattatacgtaaatgatacattagcaggagttatagga
acagatgcagctacaccattagcaattgcttctgaagaaataacaaatgatggaaaaact
ttaacttatacattaataaatactcatgcaaatggaacttctcaagctgaatattctgaa
atagaaacagcaggtgttaaggctggaactgataaagtttacttaacagttacagcagga
gcagttactgaccaaggcggtctttcaacatttgcagtaccagttgctaataaagtacca
gttacttatgttgcgacaccagcagcagcaccagctgcttcaataagaacagctgatggt
tcaaactatgtaaaagttaaatttgaccaggtggttgacaaaactacagctgaaacagta
tctaactatattgcatatttagtatctgattcaactgttacatttaattttgatagtgct
actttattatcagatcaacaaacagtatatctgcactcagctactccattaacattatct
aattcatcatataagattggtattaaaaacatagcagctaaagtaggcggagctgtaatg
acaagcacttatgcttatgcagattcacaagcattaacaacaggagttgctttagcagca
ccagcattaacagattcagcaattactgcaacaaatacaactgatcaaaatacagcattt
attgataatggagcggcaggaatgaatgctggagatacatttgtagttacatttgataaa
cctgtagtagttaatggaaatgtgtcaggagttcatgatgtaatattcactaacaataac
aaccatgatcttggaacaggtaacataacagtaacacctggagattatgctaaccaattg
aaagtttcacttggaacaggatatacagcagcacttggggataaaataggaattaaagct
ggacaaacagcaattaaattctacgataacacaactaatgtaggaacaactgatgaaaac
aaacaagtattgacagcaccaacagctgcaacagctgcaccagctgttaaatccgcagta
tatgcagatgccaataatgatggaaaagtaagtgctggagatactcttacagtagtattt
gatcaaaacttagatccaaatggagtagctgtagctagtatgactgctggaacagctgca
acagatacatttgtgttgccagcaggtacaagcgtaggcgatgctgcaacgtttgcttac
gcaggagcagattcagtaacaataactcttggtggaaatggtattgaccttgatgcaaca
gcagcattatcttacttaagaggtcttactgtaaaagcgggaacaaataatccagttaga
aatacttggacagtagtagcagacggaaatggaacagctaaaactgtaacaagtgcagat
acaacaagaccttcaataacaggagctacttacagtacaacttatgattatacaaacggt
acagcaggagctggaactgataaagtaataattgtatcatttggtgaaaaagtaaatgca
gcagatatggacgcagctgcaattgctaacaactttgctttatcaagtggatatagcttt
ggtacagctccagttgctaaagtagtaaatggtcaagttgttattaaacttgatgctaat
gcagtatttgatgctggaattactacaattaatgtagttgctggcgatactactcaaaca
gcagtagatgcatccggtaacaagataagcagaaatgcttcatctgcatcaggatatgta
gtaacagctcaataa
DBGET
integrated database retrieval system