Clostridium drakei: B9W14_10175
Help
Entry
B9W14_10175 CDS
T05484
Name
(GenBank) GGDEF domain-containing protein
Organism
cdrk
Clostridium drakei
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
EAL
GGDEF
HisKA_7TM
PAS_9
PAS
PAS_8
PAS_4
PAS_3
PAS_13
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AWI04845
UniProt:
A0A2U8DQW7
LinkDB
All DBs
Position
complement(2278187..2280937)
Genome browser
AA seq
916 aa
AA seq
DB search
MYEVLFDVSFIISIILLVFLYRVRNVNIAALLIKCTILVSFWILMEILSYYIRINEIAIL
FQKAKLISVILASPLYLLIIKEYVSKNQKNIYYSLLVFIVPILSLLSLISNKIPYKFISN
ARVSYTKGIPILSFSPNIGFYIHTIYSYSSILIGCYVLIMIAIKSPKLYRRQSALIFIGT
LISISMNFLFISSRFESFFMDTTSICILLTLIILYWGAFHMPKSIVVPIARDLLVENIKD
FIIVVDSSNKIVDINPAAIEFITFFKHKSKKINNKQEINFIGIKIHELLDFLPDIKRVDA
SNDPKNESTICLNFDNKTFYFTMYKSPILDTNKSQIGRLFMFHDVTNIQEYTNSLKRLNE
KLSISDRIISTTMEGVLITDSSGNIIKVNNSFEKISGYKEDELIGKNPRILKSGHHNKSF
YLDMWNDLLTNGYWKGEIWNKKKNGELYPKWMSITCLKKQGGMIENYIAISTDISKIKKT
EDKLQNLAYYDLLTGIPNRTLFYERLESALTRATNNKKAVALLFMDLDGFKVINDSLGHA
AGDLLLKEVATRIESSISKSDTVSRLGGDEFTVILENVNNHEDVKIVAESIIEKILLPYN
LLGREITLGVSIGIALAPYDESTVEGLVRKADAAMYDSKESGKGKYSFSSDEIERKNHEI
LEMQIKLNKALDNDEFNLYLQPQIIFVENKFKIIGAEALIRWKTIDGKIFTPDKFIPVSE
TNRMIIPIGNWILEEIFRIDKILKNNGLNIKLSINISSKQFENGNLVSKIKKLFKENNSK
NINLIIEITESFLLQDTESAIQSLLEIKKLGIEISIDDFGTGFSSLSYLSRLPVDYLKID
KSFIDDILSTNHKNLTSNIISMAKTLNLKTVAEGVETKDQINKLLEEGCDELQGYYFSKP
LIIDDFIKYAKQFYYD
NT seq
2751 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtatgaagttttattcgatgtaagttttataatttctataattttattagttttttta
tatagggtaagaaatgttaatattgcagcgttgttaattaaatgtaccatacttgtttct
ttttggattttgatggaaattcttagctattatattagaataaatgaaattgcaatacta
tttcagaaagcaaaacttataagtgttatacttgcttctccactttaccttttaataata
aaagagtatgttagcaaaaatcaaaaaaatatttactactcattattagtttttattgta
ccaatattatcattactatcgttgatttctaacaaaataccatataaatttatatcaaat
gcaagagtgtcttataccaaaggtattcctatactttcattttctccaaatattggtttt
tatattcatacaatttattcctattcaagcattttgattggatgctatgtccttataatg
atagcaataaaatctccaaaactataccgtaggcaaagtgcattgatttttataggcaca
cttatatctatttcaatgaattttttgtttattagttctagatttgaatcattttttatg
gataccacttcaatttgtatattattaaccttaattatactatattggggggcatttcat
atgcctaagtcaatagtagtaccaattgctagagaccttttagtagaaaatattaaagac
tttattattgttgtggattcttctaacaaaatagtagatatcaatccagcagctattgaa
ttcataacgtttttcaaacataaaagcaaaaaaattaataacaaacaagaaataaatttt
ataggaataaagattcatgaactattagattttttaccagatataaaacgggttgatgca
tcaaatgatcccaaaaacgaatctactatttgccttaattttgataacaaaactttttat
tttacaatgtataaatctcctattttggatacaaacaaatcacaaattggaagattattt
atgtttcatgatgtaacaaatatacaagaatacactaatagtctcaaacgcttaaatgaa
aaattatcaatttcagatagaataatcagtactacaatggaaggtgtgttaataacagat
agttcaggaaatattatcaaagtaaacaattcttttgaaaaaatatcaggatataaagaa
gatgagttaattggcaaaaatccgagaatacttaaatctggacatcataataaaagtttc
tatttggatatgtggaatgatttactcacaaatggttattggaaaggtgaaatttggaat
aaaaaaaagaatggtgaattatatccaaaatggatgtcaataacatgtttaaagaaacaa
ggtggtatgatagaaaattatattgctatttctacggatatcagtaaaataaaaaagaca
gaagataaacttcaaaatcttgcctattatgatttattaactggaataccaaatagaact
ttattttatgaaagacttgaaagtgcgcttacaagggcaactaataataaaaaagcagta
gctttacttttcatggatttagatggatttaaagttattaatgattcattaggtcatgca
gctggagatttacttctcaaagaagttgcaactcgaattgaatctagtattagtaaatct
gataccgtatcaagattaggaggtgatgagttcactgtaattcttgaaaatgtaaacaat
catgaagatgtaaaaattgtagcagaatctattattgaaaaaatattgcttccttataat
ttacttggacgcgaaataactttaggagtaagtataggaatcgcattagccccatatgat
gaatcaactgttgaaggattagtaagaaaggcagatgcagccatgtatgattcaaaggaa
tctggaaaaggaaaatattcattttcttcagatgaaattgaaagaaaaaatcatgaaatt
cttgaaatgcaaataaaacttaataaagctcttgataatgatgaattcaatttatatctt
caaccacaaattatttttgttgaaaataaatttaaaataattggtgctgaggcacttatt
cgatggaaaacaatagatggtaaaatatttacacctgataaattcattcctgtatctgaa
actaatagaatgataatacctatcggcaattggatattggaagaaatttttagaattgat
aaaatactaaaaaacaatgggcttaacataaaattatcaattaatatttcatcaaaacaa
tttgaaaatggcaacttagtttcgaaaataaaaaagcttttcaaagaaaataattctaaa
aatattaatttaataattgaaataacagaaagttttttattacaggatactgaaagtgca
attcaaagcttactagaaataaagaaattaggaattgaaatttcaatagatgactttggt
acaggtttttcttctctaagctatttaagccgtttacccgtagattatttaaaaattgat
aaatcctttatagatgatattctaagtacaaatcataaaaatttgacctcaaatattatt
tctatggcaaaaacccttaatctaaagacagttgcagaaggcgtagaaacaaaagatcaa
attaacaaactacttgaagaaggctgtgatgaattacagggatattattttagtaaacca
cttattattgatgactttatcaaatatgcaaaacaattttattatgattaa
DBGET
integrated database retrieval system