Clostridium drakei: B9W14_13685
Help
Entry
B9W14_13685 CDS
T05484
Name
(GenBank) hypothetical protein
KO
K13730
internalin A
Organism
cdrk
Clostridium drakei
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
LRR_4
LRR_8
LRR_9
LRR_1
LRR_6
Big_5
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AWI05509
UniProt:
A0A2U8DSB3
LinkDB
All DBs
Position
complement(3101298..3103349)
Genome browser
AA seq
683 aa
AA seq
DB search
MIKKFRLFIILGIMCTSLFLTNTVKAAKFIDDQTVESNKTWTLKFTGEVGFDDLTKNSIT
VTDNNGNKVGVEIKQGQDTKTLLVTAPQGGYIPGKSYILNIGANAHSKSGKPLKNEYRLH
FNIKSSYVITFKNNNLEKLIRNSINKPIGDIYKSDVENITNLDASSSNIDDITGIENLTD
LQILNLSQNQLSHVSVLRYLSYLRDLDLSQNEISDINELRGLNNLYYLNLNNNEISDISE
LKYFTYLYMLLLNGNEIIDIEPLQGLTNLQQLSLKNNRISSINALRGLTNLNLLYLGQNK
ILDYNPTRAYYSKILNKDFDLIDSTDDNVVIFKDGNLEKAVRSEINKPSGGIYKSDVEKI
VSLKPYAEGIQDISGIKNLTNLQFLDLSQSKINDISELKNLTKLETLLLNDNEISDIRSL
QNLTDLKQLDLEDNKINDITPLQYLNNLSELSLKNNRITNITKLKWLTNLKTLYLSKNQI
SDYSPVKGYYDNLIDKDFNMSDSTDSKDIVIFKDENLEKAVRDKINKEAGDIYITDVKNI
ISLNASHKNIKDISGIENLTSLQTLDLGDNQITDISVLSSLTNLEMLNLSYNEFSDISKL
KGLTKLETLNLNNNEIENISAIQILNNLKSLNLSNCKISNINPLKGLNNLKTLWVNNNEI
SDSDKEVLKEALSNCNIYYDSES
NT seq
2052 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgattaaaaaatttagattattcattatattaggtattatgtgtacaagcctattttta
accaatactgttaaagctgcaaaatttattgatgatcaaacagtagaatctaataaaact
tggactttaaaatttactggagaagttggatttgatgatttgactaaaaatagtattact
gtaactgataataatgggaataaggtaggtgtagaaattaaacaaggtcaggatactaaa
acacttttagtaacagctccacaaggtggttatataccaggaaaaagttatatattaaat
attggagctaatgcacattcaaaatcaggaaaacctttaaaaaatgagtatagacttcat
ttcaatattaaaagtagctatgtaattacttttaaaaataacaatttggaaaaattaata
agaaatagtataaataaacctataggagatatttataaaagtgatgttgaaaatattaca
aacttagatgcttctagcagtaatatagatgatattactggaatagaaaatttaactgat
ttacagattcttaatttatcacagaatcaactaagccatgtaagtgtattaaggtattta
tcttatttacgagatttagatttatcacaaaatgaaataagtgatattaatgaattaaga
ggattaaataatttgtattatcttaatttaaataacaatgaaataagtgatataagtgaa
ttaaaatattttacttatctatatatgctcttactaaatggtaatgaaataatagatata
gaaccattacaaggccttactaatttacagcagctttctttaaaaaacaatagaattagc
agtataaatgcattaagaggattgactaatttaaatcttctttacttggggcaaaataaa
attttagattataatcctacaagagcatattacagtaaaatcctcaataaggattttgat
ttaatagattctactgatgataatgtagtaatctttaaggatggaaatttagagaaagca
gtaagaagtgaaataaataagccatcagggggtatttataaaagcgatgttgaaaaaatt
gtgtctttaaagccttatgctgagggaatacaggatattagtgggataaaaaatttaact
aatttacagtttcttgatttatcgcaaagcaagataaatgatataagtgaattgaaaaat
ttaactaagcttgaaactcttttgcttaatgacaatgaaataagtgatataagatcttta
caaaatttaactgatctaaagcagcttgatttagaagataataaaattaatgatataact
ccattacagtatctaaataatttgagtgaactttccttaaagaataatagaattactaat
ataactaaattgaaatggttaactaatttaaagactctttatttgtctaagaatcaaata
tcagattatagtcctgtaaagggatattatgataatcttatagataaagattttaatatg
tcagattctactgattcaaaggatatagttatatttaaagatgagaatttagaaaaagca
gtaagagataagataaataaggaagcaggagatatttatataacagatgttaaaaatatt
atatctttaaatgcttcacataagaacataaaagatatcagtggaatagaaaatttaaca
agtttgcaaacccttgatttaggagataatcaaattaccgatataagcgtattaagtagt
ttaacaaatttggaaatgctaaacttaagttataatgaatttagtgatataagtaagcta
aaaggattaaccaaattggagactcttaatttaaataataatgaaattgaaaatataagt
gccatacaaatattgaacaatttaaaatctcttaacttgtctaattgtaaaataagcaat
ataaatccacttaaagggctaaataatttaaaaactctttgggtaaataacaatgaaata
agtgattctgataaagaagtattaaaagaagcattatcaaattgtaacatttattatgat
agtgaatcttaa
DBGET
integrated database retrieval system
