Candida dubliniensis: CD36_05250
Help
Entry
CD36_05250 CDS
T01140
Name
(RefSeq) protein transport protein sec61 alpha subunit, putative
KO
K10956
protein transport protein SEC61 subunit alpha
Organism
cdu
Candida dubliniensis
Pathway
cdu03060
Protein export
cdu04141
Protein processing in endoplasmic reticulum
cdu04145
Phagosome
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
cdu00001
]
09120 Genetic Information Processing
09123 Folding, sorting and degradation
03060 Protein export
CD36_05250
04141 Protein processing in endoplasmic reticulum
CD36_05250
09140 Cellular Processes
09141 Transport and catabolism
04145 Phagosome
CD36_05250
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
04131 Membrane trafficking [BR:
cdu04131
]
CD36_05250
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02044 Secretion system [BR:
cdu02044
]
CD36_05250
Membrane trafficking [BR:
cdu04131
]
Endoplasmic reticulum (ER) - Golgi transport
Others
SEC61 complex
CD36_05250
Secretion system [BR:
cdu02044
]
Sec (secretion) system
Eukaryotic Sec-SRP protein
CD36_05250
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SecY
Plug_translocon
TPR_TNPO3_IPO13_4th
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
8044728
NCBI-ProteinID:
XP_002417191
UniProt:
B9W7X0
LinkDB
All DBs
Position
1:complement(join(1198733..1200222,1200331..1200340))
Genome browser
AA seq
499 aa
AA seq
DB search
MSGFRLLDLVKFFLPILPEIEYPFEKIPFDEKIVFTVGSAIIFLFGQLPIYGLIPNGQFY
LLDPFSNFRSIFAMNKGTLLELGLLPIITSAFIWQLGAGLKLINVNFKLRIDRELFQTGQ
KLTSFIFSIVFAIGLIYSGYYDNAIRGYNPLEDGIPYGPYSLILLQITAWSWIVTLMVEI
FDKGYSFGSGILCFLAIQSSTNFIANLLGLENFPILNSNKFESYGALMNLIKNFSIFNPK
QTVYQIWHSFFRIQLPNLTQFYISLASILIVVALQNFRIELPIRSTKVRGMNNVFPIRLL
YTGGLPVLFAYSVVANIQVIGYLIHSILSKLGTSPIVISIIGNYVYNPISNELYLNSGIL
NYFASSSSIVQSIISQIKTTVYSATIIILAVWFANKWSYISGSSPKDISKQFKDQGISLA
GKRDISITKELSRVIPVASVSGAFILSVVALIGEFFGGLGYGVASIIGVTSSFAVLEEFM
TEYQQNGGGQFSNALASFQ
NT seq
1500 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagtggatttcgtcttcttgatttggtcaagttcttcttaccaatcttaccagagatt
gaatacccatttgaaaaaataccatttgacgaaaaaattgttttcactgtgggttcagct
attatttttttatttggtcaattaccaatttatggattaatacctaatggtcaattttat
ttattagatccattttctaattttagatcaatttttgccatgaataaaggtactttatta
gaattaggattattaccaatcattacttcagcatttatttggcaacttggtgccggatta
aaattaattaatgttaattttaaattaagaattgatcgtgaattgtttcaaactggtcaa
aaattaactagttttattttcagtattgttttcgctattggattgatttattcaggatat
tatgataatgccattagaggttataatcctttagaagatggtattccttatggaccttat
tctttgattttattacaaattactgcatggtcatggattgtcactttaatggtagaaatc
tttgataaaggttatagttttggatcagggattttatgcttccttgctatacaatcttca
actaattttattgccaatttattaggattagaaaatttcccaattcttaattctaataaa
tttgaaagttatggtgccttgatgaatttaattaaaaatttttcaatttttaaccctaaa
caaacagtttatcaaatttggcattcattttttagaatccaattacctaatttaactcaa
ttttatatttcattggcatctattttaattgttgttgcattacaaaatttccgtattgaa
ttgccaattagatctacaaaagttagaggtatgaataacgttttcccaattagattatta
tacactggtggattaccggtattgtttgcctatagcgtagttgccaatatccaagttatt
ggttatttgattcattcaatattatccaaacttggtacttcaccaattgttatttctata
attggaaattatgtttataatccaatttcaaatgaattatacttgaattcaggtatcttg
aattattttgcaagttcatcttcaattgttcaatccattatttcacaaattaaaactaca
gtttattccgccactataattattttggcagtttggtttgccaataaatggagttacatt
tcaggtagttcaccaaaagatatttccaaacaatttaaagaccaaggtatttctctcgct
ggtaaaagagacatttctatcaccaaagaattatcaagagtcattcccgttgcttcagtc
agtggtgcttttatcttgagtgtcgttgccttgattggtgaattctttggtgggttaggt
tatggtgttgccagtattattggtgtaacatcatcttttgctgttttggaagaattcatg
actgaatatcaacaaaatggtggtggacaatttagcaatgcccttgcttccttccaataa
DBGET
integrated database retrieval system