Candida dubliniensis: CD36_11850
Help
Entry
CD36_11850 CDS
T01140
Name
(RefSeq) pre-mRNA splicing factor, putative
KO
K12855
pre-mRNA-processing factor 6
Organism
cdu
Candida dubliniensis
Pathway
cdu03040
Spliceosome
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
cdu00001
]
09120 Genetic Information Processing
09121 Transcription
03040 Spliceosome
CD36_11850
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03041 Spliceosome [BR:
cdu03041
]
CD36_11850
Spliceosome [BR:
cdu03041
]
Complex B
U4/U6.U5 tri-snRNP components
U5 snRNP specific factors
CD36_11850
Complex C
U5 SnRNP specific factors
CD36_11850
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
PRP1_N
TPR_14
HAT_PRP39_C
HAT_PRP39_N
TPR_19
Fn3-I_PB4
Glyco_hydro_67N
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
8045375
NCBI-ProteinID:
XP_002417825
UniProt:
B9W9Q5
LinkDB
All DBs
Position
1:complement(2799737..2802472)
Genome browser
AA seq
911 aa
AA seq
DB search
MERKSFLDQEAPEGYVAGSARGAVGFRTSTSPDSFNRGIAIVQNEEDEEEDDNNNKSTPQ
LNEDGILSTNKRGKVDEEDEEADRIYNEIEKKLQFKKRKSPNNDNTKTKPTTIDNSSSQF
SDLKRQLANLTEDDWLNLPEPGDMTRKNKRTRLLEQQQQRMYSAPDTLISNSSSTTNTTN
FKSLSESRDKLLGSQLDNLLPSYIKNNGQSTSTTTTTTANEELQQSILNMTGVEQDSKYA
DLQKSRVILSSLRKSEPYKPSSWISSARLEEQEGKNLKLAKQYILEGCKKCPRNDEIWLE
NIRLNQSDIKLCKQLITNGLNYNPKSEKLWLKATELEINNINKRKVLMKGLEKLPNNNQL
WKQLIELENDQNMVKKLLSKAVQLCSQDWEFWSALLNISNYEESKKLLNQARKSIKEVKN
ISKVWITACQLEEREYGSNKIDINKLIKLMDKAMKEIPIDKMTKNDWYKLACDSEKENFQ
VTSKTIIISYLKLQGLDQSIFEDVDKFFTDGYIIVGKSILDYIVTTNSSNDITKWKRIFA
LVKKFNQEVSLSLLFTYYDKAISLNPQVPLFYLMYAKDKWQLSKDIPQARSILDSGESVN
PTDLSIKFAIIKLELKAGNLQNASKYIKAILDRTPMESEKFWYKYIHILRCLNSDIIILK
EVIQKALELFPNCWKLYLQNIEILEDINELEEAREIALVGVKKCPQCIYLWIKLSQIDEK
AKIIIRARSILDQAILANSNNPELWVYKIQFEKRIGNSSSSIQNLTNKAIKQFPNDPWLW
IINLSLISKMSQRKTIFLDALKATNNSNLILLIIGIFFWFDGKYSKSKNWFERSLQSDNT
NGDTWGWMYNYLKKFGTTKELDTFLIDYESKYDSINKGQFFNKINKDIKNYNKSPKEILD
IVAIEVLNYIK
NT seq
2736 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaaaggaaatcatttttagatcaagaggcacctgaaggatatgttgccggtctggca
agaggggctgttggatttagaaccagtacatctccagatagtttcaatcgaggtattgcc
atcgtacaaaatgaagaagatgaagaagaggatgacaataacaacaaaagcacaccacaa
ttgaatgaagatgggattttatctacaaataaacgaggcaaagtagatgaagaagatgaa
gaagcagatcgaatatataatgaaattgaaaagaaactacaattcaagaaaaggaaatca
cccaataatgacaatactaaaactaaacctactaccattgacaattcttctagtcaattt
tctgatttgaaacgacaattggcaaatttgaccgaagatgattggttgaatctacctgaa
cctggtgatatgactaggaaaaacaaacgaacaagattattagaacaacaacaacaaaga
atgtattctgctcctgataccttaatttccaattctagttctaccaccaatacaacaaat
ttcaaatccttatctgaatcaagagataaattattagggtctcaattggataatctacta
ccgtcatacattaaaaataatggccaatctacaagcaccaccaccaccaccacagccaat
gaggaattacaacaaagtattttgaatatgactggggttgaacaagattctaaatatgct
gatcttcaaaaaagtagagttatattatcatcacttcgtaaatctgaaccatataaacca
agttcatggattctgtctgcaagattagaagaacaagaagggaagaatttaaaacttgct
aaacaatatattttagaaggatgtaaaaaatgtcctagaaatgatgaaatttggttagaa
aatattcgattgaatcaatcagatattaaattatgtaaacaattaattaccaatggttta
aattataatcctaaatcagaaaaattatggttaaaagctacagaattggaaattaacaat
attaataaacgtaaagtattaatgaaaggtttagaaaaattgcctaataataatcaatta
tggaaacaattaattgaattagaaaatgatcaaaatatggtgaaaaaattattatcaaaa
gccgttcaattatgttcacaagattgggaattttggtcagcattattaaatatatctaat
tatgaagaaagtaaaaaactattgaatcaagctagaaaatcgattaaagaagttaaaaat
atatcgaaagtttggataactgcttgtcaattagaagaaagagaatacggttcaaataag
attgatattaataaattaattaaacttatggataaggcaatgaaagaaatccccattgat
aaaatgacaaaaaatgattggtataaattagcttgtgattctgaaaaggaaaattttcaa
gtcactagtaaaacaataattattagttatttgaaacttcaggggttagatcaatcaata
tttgaagatgttgataaatttttcactgatggatatattattgttgggaaatcaatatta
gattatattgtgactactaattcatctaatgatattaccaaatggaaacgaatctttgct
ttggttaagaaattcaatcaagaagtatcattatcgttgttatttacatattatgataag
gcaatttctttaaatcctcaagtacctttgttttatttgatgtatgccaaagataaatgg
caattatctaaagatatcccccaagctagatcgattttagattcaggtgaactggtgaat
ccaactgatttatcaataaaatttgcaataattaaattagaacttaaagcaggtaattta
caaaatgcttcaaaatatattaaagccatacttgatagaacacccatggaatcagagaaa
ttttggtataaatatattcatattttacgatgtcttaatagtgatataatcatattaaaa
gaagtcatacaaaaggcattagaattattccccaattgttggaaattatatcttcaaaat
attgaaattttagaagatattaatgaattggaagaagcaagagaaattgctttagtgggt
gttaaaaaatgtcctcaatgtatatatttatggataaaattatcacaaattgatgaaaag
gccaaaatcataattcgagctcgatcaatattagatcaagcaatattagcaaattctaat
aaccctgaactctgggtttataaaattcaatttgaaaaaagaattgggaactcatcatca
tccatacaaaatttaactaataaagccattaaacaattccctaatgatccttggttatgg
attattaatttatcattaattctgaaaatgtctcaacgtaaaacaattttcttagatgct
ttaaaggcaactaataattcaaatttaatattattaatcattgggatatttttttggttt
gatgggaaatattccaaaagtaaaaattggtttgaaagaagtttacaactggataatact
aatggtgatacttggggttggatgtataattatttgaaaaaatttggtacaacaaaagaa
ttggatacattcttaattgattatgaatccaaatatgattcaattaataaaggtcaattc
ttcaataaaattaataaagatattaaaaattataataaatcacctaaagaaattttagat
attgtcgctatagaagttttaaactacatcaaatag
DBGET
integrated database retrieval system
