Candida dubliniensis: CD36_16660
Help
Entry
CD36_16660 CDS
T01140
Name
(RefSeq) U1 snRNP protein, putative
KO
K13217
pre-mRNA-processing factor 39
Organism
cdu
Candida dubliniensis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
cdu00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03041 Spliceosome [BR:
cdu03041
]
CD36_16660
Spliceosome [BR:
cdu03041
]
Other splicing related proteins
Spliceosome associated proteins (SAPs)
Other SAPs
CD36_16660
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
HAT_PRP39_N
HAT_Syf1_CNRKL1_N
HAT_PRP39_C
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
8045712
NCBI-ProteinID:
XP_002418145
UniProt:
B9WAM5
LinkDB
All DBs
Position
2:340345..342531
Genome browser
AA seq
728 aa
AA seq
DB search
MSVTNLPKDLESQTITLFSKSSAISKLQQEVNSNPNNLQKWNQLFTELNKLIDTSTTDTD
NDELKKDIHNSYKALLSRFPYLTEYWKKWQSVESKLNGEETSQDILRMAVENYPNSISLW
CQYLTSILINGKDKTDTAELFRNLYKQALIHNGYDFNSHPIWNMAIEFETKQSKQSKELL
ELYLRVIKIPLYQYAQCYNQFSEINKQFDIQQIITSSDQLNQYVKEFGKNQLEDLSLLER
HQIIDDFTASIFSNTQKRVNKNWQFESLLETQEFTLKVGSDNSNIAKEKQIWINYLQQEI
DTYWTDPNKDDQFELVCNLFHRCLIPNCYDSEIWLKYLEFISNSNLPKQEKFDKQQEIYI
NINAKLIPLDNNETRLKYVELLIDHEKNQEANEYLFNWMKLFSGGSKKYYKSSYLQITKE
LFSLWIKLLDHREFIIIAESMINKYFNIHEKQQKKDKDEVNTKTTPNTEQNPNLSKLELT
ESLITSVISFLNDESICILTVLYLQQLQLQQQEQQQSETIKIRKFFNKFNHEKCFKTSIQ
FWKFYFQFELSNNHWKNLKSLINHIKFNTQLPKIIIDSFIEWMNEISNDNLINFLKLNDG
RSDETIIMKDLEISNSIFYNKTTIKRHAMKNNYILINNNNNNNNNNNIDKKRNSNGSEEE
FLRLTSKQIGHPGIFIDVVPQITNRLMLDNNGIDLTQENLSVPPLPVFKNVEKASQPIKY
PSTTTQTR
NT seq
2187 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtcagttacaaatttaccaaaagatttggagtcacagactatcacactatttagtaaa
tcatcagcgatttcaaaattacaacaagaagtaaattccaatcctaataacctccagaaa
tggaatcaattgtttaccgaattgaataaattaattgacacctccactactgatactgat
aatgatgaattgaaaaaagacattcataacagttataaggcattattgtctcgatttcct
tatttgacagagtattggaagaaatggcaactggtagaatcaaaattaaatggtgaggag
acttcacaagatattttacgaatggctgttgaaaattatccaaattccatatcattatgg
tgtcaatatttaacatcaatattaattaacgggaaagataaaactgatacagcagaattg
tttcggaatctttataaacaagcattaattcataatggatatgatttcaattcccatcct
atttggaatatggcaattgaatttgaaactaagcaactgaaacaaagtaaagaattactt
gaattatatttacgagttattaaaatcccattatatcaatatgctcaatgttataatcaa
ttttccgagattaataaacaatttgatattcaacaaattataacgtcatcggatcaattg
aatcaatatgtgaaggaatttggaaaaaatcaacttgaggatttatctttacttgaaaga
catcaaataattgatgatttcaccgcaagtatatttagtaatactcaaaagagagtcaat
aagaattggcaatttgaatccttattagaaacacaagaatttactttaaaagtgggcagt
gataatagtaatattgctaaagaaaaacaaatctggattaattatttacaacaagaaatt
gatacgtattggacagaccccaacaaggacgatcaatttgaattagtttgtaatttattc
catcgttgtttaattcctaattgttatgattcggaaatatggttgaaatatcttgaattt
ataagtaatctgaatttacctaagcaagaaaaatttgataaacaacaagaaatttatatc
aatattaatgctaaattgattccattagataataatgaaaccagattgaaatatgttgaa
ttattaattgatcatgaaaagaatcaagaagccaatgaatatttatttaattggatgaaa
ttatttagtggagggtccaaaaaatattataaatcatcatatttacaaataactaaagaa
ttatttagtttatggataaaattattagaccatcgagagtttataattattgctgaatca
atgataaataagtatttcaatattcatgaaaagcaacaaaagaaagacaaagatgaggta
aataccaaaacaactccaaatacagaacaaaacccaaatctttctaaacttgaattgaca
gaatcattaattacactggtgataagttttcttaatgatgaatcaatatgtatacttaca
gtattatatttacaacaactacaattacaacaacaagaacagcaacaatctgaaacaatc
aaaattcgaaaatttttcaataaatttaatcatgaaaaatgttttaaaacttctattcaa
ttttggaaattttatttccaatttgaattaagcaataatcattggaaaaatttaaaatct
ttaatcaatcatattaaatttaatactcaattaccaaaaattattattgattcatttatt
gaatggatgaatgaaatttctaatgataatttaataaattttttgaaattaaatgatgga
agatcagatgaaactataattatgaaagatttagaaatttcaaattcaatattttataat
aaaactacaattaaaagacacgcaatgaaaaataattatatccttatcaataacaataac
aataacaataacaataacaatattgataagaaacgaaatagtaatggcagtgaagaggaa
tttttacgtttgacaagtaaacaaataggtcatccaggaatattcattgatgttgtacct
caaatcacaaatcgattaatgcttgataataatggtattgatcttactcaagaaaattta
tcagtaccgccattacctgtatttaaaaatgtggagaaagcttctcaaccgataaaatat
ccatctactactactcaaactcgttaa
DBGET
integrated database retrieval system
