Candida dubliniensis: CD36_17060
Help
Entry
CD36_17060 CDS
T01140
Name
(RefSeq) rRNA biogenesis protein, putative
KO
K14792
rRNA biogenesis protein RRP5
Organism
cdu
Candida dubliniensis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
cdu00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03009 Ribosome biogenesis [BR:
cdu03009
]
CD36_17060
Ribosome biogenesis [BR:
cdu03009
]
Eukaryotic type
90S particles
Other 90S particles
CD36_17060
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
S1
S1_RRP5
OB_RRP5_4th
HAT_PRP39_N
HAT_Syf1_CNRKL1_N
Spt6_S1
HAT_PRP39_C
Suf
TPR_14
TPR_19
HAT_Syf1_CNRKL1_C
TPR_CcmH_CycH
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
8045748
NCBI-ProteinID:
XP_002418184
UniProt:
B9WAR4
LinkDB
All DBs
Position
2:complement(460949..466096)
Genome browser
AA seq
1715 aa
AA seq
DB search
MSDSSKSVLSNKEFSFPRGGSKPLSALEVKEISNEATKDVLFEQAESNKRSNSSKSEQPK
KKHKKSSKNKSKNDKNDNDEETTQSVLIETFNFKNLVSGSSVLGQIKTINKLDIGLALGD
NLTGYIPITSISPQITALIEKFEEQEQEEEEEESDNADGNQETKSATFKSKTEKEFPDLL
KIFKLGSWLKAKITTSNEDFKNKKRIELTIEPESVNESLEVDDLIVNNILQCSVKSIEDH
GIILDTGKPEYSGFISNKELTNAKIDVTTIVPGLVILCSIATKPSSRTINLKPIVATISA
KKSTVSTISSIDSIQPGVIVDALINDVTENGLVTKVYGLVDGTIALSQIQNFDLKELKHK
YAIGSTVKARVLAVLLKNGTKKLILSILPHVLQLGDDSSQTQALEAFPIGHVFDEVKVIG
NDKHYVYVSFGSSSLFGQIHQSKFDDNKTLLDYSIGSTHKSRVIGFNEVDNLLILSFESK
VIDAEYLNVRDVPIGKLLPNVEILKVLEDGVGINVKFFDEFKGFVPGNQMSDIKLVYPER
KFRVGTKTKGRLLNYNGKRALITFRKALVNLEDDEILSNIDQAEIGFKTNAIVEKFVPNG
CIVSFFGNLRAFLPKTEISETFVEDASSYLKVGQIVKVRILDINKEQKRLVVTLKQSSEL
SNAQKNEINKLVSGKSIVKTVIVEKTKDSVLVELEGSHLRGVIYDGQLSDGNYEQNRALA
KRLTIGESLEVLILDKDLKARTVIATAKKSLIEALKSKSFPVDFNDVTVNAVVKGYVKSV
TSLGLFVTFTGRLTGLILAKYVTKNAKEDLSKKFYKYQSINCRVLSVDKENERFLLALNN
SSSSFTKDDEQLIKPIDTTKKIVADYQPGETTKAVIRAVKGTQLNVQLADNLQGRVDITQ
CFNSIKDIKNLHQPLASRFQKGETVDVKVIGVHDAKNHTFLPITHRKSNRTTILELSLTN
PQINNKPLTDLKLKDFKQGDELLAFVNNIINGMVWVSISPSIKGRISMLDLTEDGSIFQD
IDNKLPIGNAINVKVKQVDLQHQILVLTARENFIEKFEDVKQDEIYPARIIKIKPNHVLV
ELGNNVIASSFLTDALDDYSEKLDHVFNVNDYVSAKVLDIDSINKRISVSLRTNKPTSDK
VINSVGDLTRGQVIKGFVKNISNNGVYVSLGRSIYALVRVSDLSDSYLKDWQNFFKPNQP
VIGKIVNCKQEGRILMTLKESEVNGDLKIMKTFDDLQIGDIFEGTVTSTTEFGVFVKLDG
TVNVSGLCHHSEISENDVDNVKSLFGTGDRVKVKILKIDPVKRQLSLGMKASYFISDSGK
EDNDEEDVAMEDASEGEEEEEEEDDDDDDDDDDDIMDVDDGEENDSDEEEQFANESQEKS
LSTGLSTNGFDWTASILDQVDEDEESSDDDTDFTDSSKKKSKKKSKTIVEDKTGDLNTRA
PQSTADFERLLIGNPNSSILWMNYMSFQLQLSEVDKAREIGERALKTINYREEQEKLNIW
IALLNLENTFGTDESLEDTFKKSIQYMDSFTMHEKLINIYKMSEKFDQAKQLFNRMTKKF
GKILNTWVLYGSFLLDQHSQDEMHEILAKALNILPKREHIDLVKKFAQLEFQKGDPEQGR
SLFEGLVADAPKRIDLWNVYIDQEIKQDSKNSEEDDTNIKSKVEDLFERVLSKKITRKQA
KFFFNKWLNYEEDKQDENMIARVKSKAAEYVQNNS
NT seq
5148 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtctgattcttctaaatcagtacttagtaataaagaattttcttttcctagaggtgga
tccaaaccattatctgctttggaagtaaaagaaatttccaatgaagcaaccaaagatgtt
ttatttgaacaagcagaatcaaataaacgatcaaattccagtaaatctgaacaaccaaag
aagaaacacaaaaagtcaagtaaaaataaatcaaagaatgataaaaatgacaacgatgaa
gaaactactcaatctgttcttattgaaacattcaactttaaaaaccttgttagtggatca
tcagtattaggtcaaatcaaaactattaataaacttgatattggtttagctctcggtgat
aatttgacaggttatattcctattacatctataagtcctcaaattacagcattaattgaa
aaatttgaagaacaagaacaagaagaagaagaagaagaaagtgataatgcagatggcaat
caagaaaccaagagtgccactttcaaatccaaaactgaaaaggaatttcctgatttattg
aaaatatttaaattgggatcttggttaaaagccaaaatcactacttcaaatgaagatttc
aaaaacaaaaagagaattgaattaactatagaaccagaatctgtcaatgaaagtttagaa
gttgatgatttgattgtaaacaatattttacaatgctcggtgaaatctattgaagatcac
ggtattattttagataccggtaaaccagaatattctggatttataagtaacaaagaattg
accaatgctaaaattgatgtgactaccattgttccaggtttagttattttgtgctcaata
gctacaaaaccttctagtagaactattaatttgaaaccaatagttgccactatttctgct
aaaaaatccacagtgtctacaatttcatcaattgattctatacaaccaggtgtaattgtt
gatgccttgattaatgatgttactgagaatggtttggtcaccaaagtgtatgggttagta
gatggaactattgcattgtcacaaatccaaaatttcgatttgaaagaattaaaacataaa
tatgccattggaagcaccgttaaggcaagagtattagcagtgttgttaaagaatggtacc
aaaaaattgattttatctatattgccacatgttttacaattaggtgatgattcttctcaa
acacaagcacttgaagcattcccaattggtcatgtgtttgatgaagttaaagtaattggc
aatgataaacactatgtgtatgtttcttttggatcaagttcattatttggacaaatacat
caatctaaatttgatgataataaaacattgcttgattatagtattggatctactcataaa
tctagagtcattggatttaatgaagttgataacttgttaatattaagttttgaatccaaa
gttattgatgctgaatatttgaatgttagagatgttccaataggtaagcttcttccaaat
gttgaaattttaaaagttttggaagatggggttggtattaatgttaaattttttgatgaa
tttaaagggtttgtaccgggaaatcaaatgtccgatattaaacttgtttatccagaaaga
aaattccgagttggaactaaaactaaaggtagattattaaattacaatggtaaacgtgct
ttaattacatttagaaaggcattggttaatttagaggatgatgaaattttgagtaacatt
gatcaagcagaaattgggtttaaaacaaatgctattgtggaaaaatttgttcctaatggt
tgtattgtatcatttttcggtaatttaagagcatttttacctaaaactgaaatttctgaa
acttttgttgaagatgctagtagttatttgaaagtgggacagattgtcaaagtcagaatt
ttggatattaataaggaacaaaaaagattagtcgttacattaaaacaatctagtgaactt
tcaaatgctcaaaagaatgaaattaacaaattagtttcaggtaaatcaattgtgaaaact
gtcattgttgagaaaactaaagattcagtgttggttgagttagaagggtctcatttacgt
ggtgtgatctatgatggtcaattatctgatgggaactatgaacaaaatagagctcttgcc
aaaagactcactattggagagagtttagaagttttgattttagataaagatttaaaagct
agaactgttattgctactgctaaaaaatctttaattgaagccttaaaatcaaagagtttc
cctgttgatttcaatgatgttactgtcaatgctgttgttaaaggttatgttaaatctgtt
actagtttagggttatttgttacttttactggtagattaaccgggttaatattggcaaaa
tatgtgaccaaaaatgctaaggaagatttatcgaaaaaattttacaagtatcaatccata
aattgtcgtgttttaagtgttgacaaagaaaatgaaagatttttgttggcattaaacaat
tcttcttcttcattcactaaagatgatgaacaattgattaaaccaattgatactaccaaa
aaaattgttgctgattatcaaccaggagaaaccactaaagctgtcattagagcagttaaa
ggtactcaattgaatgttcaattagccgataatcttcaaggaagagttgatattactcaa
tgtttcaattctatcaaagacatcaagaacttgcatcaaccacttgcttcacgtttccaa
aaaggtgaaactgttgatgttaaagttattggagttcatgatgccaaaaatcataccttt
ttgccaattactcatcgtaaatctaatagaacaactattttggaattatcgttaactaat
cctcaaattaacaataaacctttaacggatttaaaacttaaagattttaaacaaggtgat
gaacttttagcatttgttaataatattataaatggtatggtatgggtttctatttcacct
tctatcaaaggtagaatctctatgcttgatttaactgaagacggttcaattttccaagat
attgataataaattacccattggtaatgccattaatgttaaagtgaaacaagttgattta
caacatcaaattttagtattaactgcaagagaaaattttattgaaaaatttgaagatgtt
aaacaagatgaaatctatccagctagaattattaaaatcaaaccaaatcatgtattagtt
gaacttggtaataatgttattgcttcttcatttcttactgatgcattagatgattattca
gaaaaattagatcatgttttcaatgttaatgattatgtttctgctaaagttttagatatt
gattcaattaacaaaagaatttccgttagtttaagaactaataagccaacatcagataaa
gttataaattctgttggtgatttgactcgtggacaagtcattaaaggatttgttaaaaat
atttctaataatggagtttacgtttcattgggtagatccatttatgcgttagtaagagtt
tctgatttatctgattcttatttgaaagattggcaaaattttttcaaaccaaatcaacca
gttattggtaagattgttaattgtaaacaagaagggagaattttaatgacattaaaagaa
tctgaagttaatggtgatttgaaaattatgaaaacttttgatgatttacaaattggtgat
attttcgaaggtactgttacttcaactactgaatttggagtatttgtgaaattagatggt
actgtaaatgttagtggtttatgtcatcattcagaaatctctgaaaatgatgttgataat
gttaaactgttgtttggaactggtgatagagtcaaagttaagattttaaagattgatcca
gtaaagagacaattatcattgggtatgaaggcttcttattttattagtgattccgggaag
gaagataatgatgaagaagatgtggcaatggaagacgcttctgaaggagaagaagaagaa
gaagaagaagatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgacattatggatgttgatgat
ggcgaggaaaacgactctgatgaagaagaacaatttgcaaatgaatcacaagaaaagtct
ttgtctactggattatcaactaatggatttgattggacagcttctattttagatcaagtt
gatgaagatgaagaatcatctgatgatgatactgatttcaccgattctctgaaaaagaaa
tctaaaaagaaatctaaaactattgttgaagataaaactggtgatttaaacactcgagct
ccacaatcaactgctgattttgaaagattattaattggtaaccctaattcatcaatttta
tggatgaattatatgtcattccaattacaattgagtgaagttgataaagctagagaaatt
ggtgaaagagcattgaaaacaataaattatcgtgaagaacaagaaaaattgaatatttgg
attgcattattgaatttagaaaacacttttggtactgatgaatcattagaagatactttt
aaaaaatcaatacaatatatggattcatttactatgcatgaaaaattgataaatatttat
aaaatgtcggagaaattcgatcaagctaaacaattgtttaatagaatgactaaaaagttt
ggtaaaattttaaatacttgggtattatatggatcattcttgttagatcaacattctcaa
gatgaaatgcatgaaattttagcgaaagctttgaatattttaccaaaacgtgaacatatt
gatttagttaaaaaatttgctcaattagaatttcaaaaaggtgatcctgaacaaggtaga
tcattatttgaaggtttagttgcggatgctcctaaaagaattgatttatggaatgtttat
atagatcaagaaattaaacaagatagcaaaaacagtgaagaggatgacactaatattaaa
tcaaaagttgaagatttgtttgagagagtattgtcaaaaaagatcactagaaaacaagcc
aagttcttctttaataaatggttgaattatgaagaagataaacaagatgaaaatatgatt
gctagagttaaatcaaaagctgctgaatatgtacaaaataacagttga
DBGET
integrated database retrieval system