Candida dubliniensis: CD36_20950
Help
Entry
CD36_20950 CDS
T01140
Name
(RefSeq) pre-mrna-splicing factor, U4/U6-U5 snRNP complex component, putative
KO
K12844
U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein PRP31
Organism
cdu
Candida dubliniensis
Pathway
cdu03040
Spliceosome
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
cdu00001
]
09120 Genetic Information Processing
09121 Transcription
03040 Spliceosome
CD36_20950
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03041 Spliceosome [BR:
cdu03041
]
CD36_20950
Spliceosome [BR:
cdu03041
]
Complex B
U4/U6.U5 tri-snRNP components
U4/U6 snRNP specific factors
CD36_20950
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Nop
Prp31_C
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
8046118
NCBI-ProteinID:
XP_002418573
UniProt:
B9WBV4
LinkDB
All DBs
Position
2:complement(1361511..1363196)
Genome browser
AA seq
561 aa
AA seq
DB search
MSTDYEQDLLDDLDSSNDEQEELQETNNQVEQQDVDNSIDFNIQLQQLIESNSSNIINDL
IEPDIENLNDNDLIKLSKIYPLIPQLKQKIIQYSNEQELDYLELIASTLSNNNNNNFNDN
SQEYKFILLINELSTIINNEIDRFHTLIKLKYNLIFPELQSLIINKIDYIKLIKIFKQDL
SNIKSYESQMKLIINNEKVLVIIMAALHQVSNNNSNNLLSNQIMNKILLAINIIEQLNDL
LQLLSNFISDKLAKFAPNVSAIVGPITTSQLLIATGSLKQLALTPSCNIASLGVRDLSTK
KKNLDHNSHSKNVRQTGYIYHSELIKYIPIDIIRSVMRIISGKIVLAARIDLSKSNPKGE
LGEKYKQEILIKINKLLTPPQQTIDKSLPKPIEMKSKKRAGRKYQKLRAKFEMSELRKAQ
NKLQFGKQEDTIINGLGEEIGLGMIKSGGNGISISSGRIRKLPTGNNNNNNNNNNNGKSN
TTKNNLNVSKNMMNRLNEKKEINPIKAFDEFNLELFFKPEKTTLGTSSAITKTNNNNNNN
NDDDDKSTHSNKWLNGFTNKK
NT seq
1686 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtcaacagattatgaacaagatttattagatgatttagatagttctaatgatgaacaa
gaagaattacaagagacaaataatcaagtcgaacaacaagatgtggataattctattgat
tttaatattcaattacaacaattaattgaatctaattcttcaaatatcattaatgattta
attgaaccagatattgaaaatttaaatgataatgatttaattaaattatcaaaaatttat
ccattaattcctcaattaaaacaaaaaatcattcaatattctaatgaacaagaattagat
tatttagaattaatagcatcaacattatccaataataataataacaactttaatgataat
tctcaagaatataaatttattttattaattaatgaattatcaacaattattaataatgaa
attgatcgatttcatacattaattaaattgaaatataatttaattttcccagaattacaa
tcattaattattaataaaattgattatatcaaattaattaaaatttttaaacaagattta
tctaatataaaatcttatgaatcacaaatgaaattaattattaataatgaaaaagtatta
gttattataatggcagcattacatcaagtatcaaataataattccaataacctactatca
aatcaaattatgaataaaattttgttagccattaatataattgaacaattgaatgattta
ttacaattattatccaatttcatatcagataaattagccaaatttgctcctaatgtatct
gccattgttggtccaataacaacttcacaattattaattgctactggatcattaaaacaa
ttagcattaactccttcatgtaatattgcttccttgggagtaagagatttatccactaaa
aaaaaaaatttggaccataattctcatagtaaaaatgttagacaaacaggttatatatat
catagtgaattgataaaatatatcccaatagatataattcgatcagtaatgagaataatt
agtgggaaaattgttttagcagcaagaattgatttatctaaatctaatccaaaaggtgaa
ttaggtgagaaatataaacaagaaattttaattaaaattaataaattattaactccacct
caacaaacaattgataaatcattaccaaaaccaattgaaatgaaatctaaaaagagagct
ggaagaaaatatcaaaaattacgagctaaatttgaaatgtcagaattaagaaaagctcaa
aataaattacaatttggtaaacaagaagataccataataaatggattaggtgaagaaatt
ggtttaggaatgataaaatctggtggtaatgggatatctatatcatcaggaagaattaga
aaattacccactggcaataataataataataataataataataataatggtaaaagtaac
accactaaaaataatcttaatgtatcgaaaaatatgatgaatcgattaaatgaaaagaaa
gaaattaatcctattaaagcatttgatgaatttaatcttgaattgtttttcaaaccagaa
aagaccacacttggaacttcatcagcaattactaaaaccaataataataataataataat
aatgatgatgatgataaactgactcattctaataaatggttgaatggatttaccaataaa
aaataa
DBGET
integrated database retrieval system
