Candida dubliniensis: CD36_23320
Help
Entry
CD36_23320 CDS
T01140
Name
(RefSeq) exosome complex exonuclease, putative
KO
K03678
exosome complex component RRP45
Organism
cdu
Candida dubliniensis
Pathway
cdu03018
RNA degradation
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
cdu00001
]
09120 Genetic Information Processing
09123 Folding, sorting and degradation
03018 RNA degradation
CD36_23320
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
cdu03019
]
CD36_23320
Messenger RNA biogenesis [BR:
cdu03019
]
Eukaryotic type
mRNA degradation factors
3'-5' decay
Core exosome factors
CD36_23320
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RNase_PH
RNase_PH_C
DUF7108
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
8046343
NCBI-ProteinID:
XP_002418805
UniProt:
B9WCI8
LinkDB
All DBs
Position
2:1899731..1900726
Genome browser
AA seq
331 aa
AA seq
DB search
MSKELSLNQKNYLIQALKSNIRLSTSNSGGGSNGSRKFNQFRPIDIKLSNTRYGSVELSL
GKTKVMVNITSRITEPYQDRPFEGIMTINCEIPNHIKIQSNDNDNEDEFINLINRALDRA
IRRSNAVDLENLCIIAGEKVWELIIDLQVLNYDGNLIDSGCLAIITALLDFKKPDVTINN
NNTSSNSSTSGNIIIHDDEMKRPFIELSILHIPICLTFSLFNLGSKETNLKTNDIDQEIW
LLDGDVMEESCRDGYLIMTMNQNHELIQLSKIGGGINGGVSIDGQQLINLCHESIDEINR
LTNLVKSTVKNHQLNRYNNENYKLLESSADR
NT seq
996 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtcgaaagaattatctttaaatcaaaaaaactatttaatacaagcattaaagtcgaat
attcgattatcaacttccaatagtggtggtggcagcaatggatcacgaaaattcaatcag
tttcgaccaattgatatcaaattatcaaacactagatatggatcagtagaattatcatta
ggtaaaaccaaagtcatggtaaatattacatcaagaatcactgaaccttatcaagatcgt
ccatttgaaggaatcatgacaataaattgtgaaatacctaatcatattaaaattcaatca
aatgataatgataatgaagatgaatttataaatttaattaatcgagcattagatcgagct
atacgcagatcaaatgcggttgatttggaaaatttatgtattattgctggagaaaaagtt
tgggaattaattattgatttacaagtattaaattatgatggtaatttaattgatagtgga
tgtttagccataatcacagcattacttgattttaaaaaacctgacgtgacaatcaataac
aataatactagtagtaatagttccacaagtggtaatattatcattcatgatgatgaaatg
aaacgaccatttattgaattatcaatattacatattccaatatgtttaacatttctgtta
tttaatcttggatctaaagaaactaatttaaaaactaatgatattgatcaagaaatttgg
ttattagatggtgatgtcatggaagaatcatgtcgtgatggatatttaattatgaccatg
aatcaaaatcatgaattaattcaattaagtaaaattggtggtggtattaatggtggagta
tctatagatggtcaacaattaattaatttatgtcatgaatcaatagatgaaattaatcga
ttgactaatttggttaaatcaacggtaaagaatcatcaattgaatagatataataatgag
aattataaattattagaatcaagtgctgatagataa
DBGET
integrated database retrieval system
