Candida dubliniensis: CD36_44840
Help
Entry
CD36_44840 CDS
T01140
Name
(RefSeq) nuclear pore protein, putative
KO
K18720
nucleoporin NUP145
Organism
cdu
Candida dubliniensis
Pathway
cdu03013
Nucleocytoplasmic transport
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
cdu00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
03013 Nucleocytoplasmic transport
CD36_44840
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
cdu03019
]
CD36_44840
Messenger RNA biogenesis [BR:
cdu03019
]
Eukaryotic type
mRNA surveillance and transport factors
Transport factors
Nuclear pore complex
CD36_44840
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Nucleoporin2
Nup96
Nucleoporin_FG
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
8047962
NCBI-ProteinID:
XP_002420131
UniProt:
B9WGH7
LinkDB
All DBs
Position
4:complement(1159991..1163995)
Genome browser
AA seq
1334 aa
AA seq
DB search
MSFNFGSGSGSINTGNANGNSWGSSSGFGRRASIGGPTTTANTFGNTSNTSGGGLFGNSN
TNTTSGSGLFGNSSNNATNSTGGLFGNSANNTTSNATGSNLFGNSNNQANTGTTNLFGST
AKPSGTTNLFGNNNATSTTSNLFGTSTSNTNANGAALGNSSTQGGLFNNNTLGSSSGGLF
GNSGTSNGSLFGNSQQNNNLQAPSNQLTVNNNNPYSYSQVISNLQANTSNMPESITTSLF
TGIGKESSDKKRRFSYLEKSESHKPKSSLLSKLGQTFKFIRNGNTSATFESLKGLFTSND
VLKPKEKRIMLSAAAASSSSTPFVTPKAISRPSYKAIDARRVGSMKRLIIKSKPMKYHMI
DVNKVFNTKRRKVIDNKVTADRLLTASYPSDDDSDDENDDNEEIVSEKTFARYSYKTGNT
FEESETKSTTRIVEKEPPITKSEEKPSVELHDGYWSSPTIQQLSEMNVEQLSNLDNFIIG
RVGCGQIAYDFPVDLSQIYFNAQKQGISLEKELFGKVIEINPKVVLAYQNYPSKPQIGFG
LNVPATITLEGIEPRANLSVTEHINFLRQQIGMEFVTYDPITYVWVFKVKHFSIWGLIDE
DNNSQKDWIVMKRKQDAQELEALREYSQIYENEKYKQELKKQKLNEKTKVVPGGWEYTIP
PSDEPLNIKRRLVSDEISQQLIKYQQEHNTEELSAQVSDITIDSDRESAPTPKLVTYMDQ
LANFIPPGVDLNEIIDEKVYEPTVSNEVVFDSIQIRPNLPTSEDWLLQLELANQLTSALA
PYVAEPKKKSDKLNIERVDDILFSDFNKNVLKVSTPTKKLSVVEDMDESQDIYIDNISTI
FHKLLSKTVVGHRHGNVNDFPIIEKTTGFEFKDVITTPQEREEKDVFVLCSALFDKLTIN
QSNPEISAALMDNTRKKLLGDWLKNYNLSSVEKLLAENKNDPLEKTFIYMCSGDMIKAIE
TAIQTNNSHLSVVITLSDSNDAVVKSIAQNQLKNWKQLQVISSIPSAVVKIYQILAGDFE
PILEILPWNLGLALKLFYGDYNDIKKLINKFSSSIPIGDPVGDVLLAYVKGVDLESITSS
SLNIKLKWLFCKILADFNYDAITKEFGDYLSSIDYWKESALVFAHLTNDNDAADAISKLV
NSKISYIKSSTIDKEQYAIEVLKIPRPVIYKAVAIEKNNNEDFWGECEALIEVSLWEEAH
VTIVNELGPRTVISNSNQDKSQLQNVLSKFPENGLIISDWNKGAGIYEKYLVVLQNDNDL
SVIQFLLDNLPLSNIDSFHKRIALDIISKFIGNLIIENDKFNATDKSKILNLPLDDVNKK
YFELRLADLKKNIE
NT seq
4005 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtccttcaattttggatctggatctggatcaatcaatacaggcaatgccaatggaaat
agttggggttcatcttcaggttttggaagacgagcttcaattggtggtccaacaacaaca
gcaaatacttttggaaatacatccaatacaagtggtggtggattatttggtaatctgaat
actaatactacatcaggttcaggtttgtttggaaattcatcaaataatgcaacaaattct
acaggcggtctttttggaaattctgcaaataataccacgtcaaatgcaactgggtctaat
ttatttggcaattctaataaccaagcaaatacaggaaccactaatctatttggatcaaca
gcaaaaccatctggaaccaccaatttatttggaaataataatgccacatcaacaacctcg
aatcttttcggcacatctacttcaaacaccaatgcaaatggagcagcattgggtaattca
tctactcaaggcgggttgtttaataataatacattgggttcttcatctggtggacttttt
ggcaactctggaacttcaaatggtagtttatttgggaatagtcaacagaataataattta
caagccccatcaaatcaacttactgttaataataacaatccttatagttattctcaagtt
atttcgaatttacaagcaaacacttcaaatatgccagaatccatcactacttcacttttt
acaggaattgggaaagaatcatcagataaaaaaagaagattctcatatttagaaaaactg
gagagtcataaaccaaaatcatccctattaagtaaattaggtcaaacatttaaattcatt
cgtaatgggaacacatcagcaacttttgaatctttaaaaggattatttactagtaatgat
gtattaaagccaaaggaaaagaggatcatgctttctgcagcagctgcatcatcatcatca
acaccatttgttacccctaaggcaatttctagaccttcatacaaagcaattgatgctaga
agagttgggagtatgaaaagattgattatcaaaagtaaacctatgaaatatcatatgatc
gatgtaaataaagttttcaatacaaagagaagaaaagtgattgataataaggttactgct
gatagattattaacagcaagttatccaagtgatgatgacagtgatgacgagaatgatgat
aatgaagaaattgttagtgaaaagacatttgcaagatactcatacaagactggtaacact
tttgaggaatctgaaacaaaatctaccacaagaatagttgaaaaagaaccaccaatcact
aaaagcgaagagaaaccatcagtagaacttcatgatggttattggtcttcacctactatt
caacaattgtcagaaatgaatgttgaacaactttcgaatttagacaattttattattggc
agagttggatgtggtcagattgcatatgatttcccggttgatttgtcccagatatatttc
aatgctcaaaaacaaggtatatcattggaaaaagaactttttggtaaagttattgaaata
aatccaaaagtagtattggcttatcaaaattatcctagtaaacctcaaatagggtttgga
ttaaatgttccagcaacaattactcttgaaggcattgagccaagagctaatttgtcagtg
actgaacacataaatttcttgagacaacaaatagggatggagtttgtcacgtatgaccca
ataacttatgtgtgggttttcaaagttaaacattttagtatttggggtttgattgatgaa
gataataattcccaaaaggattggattgttatgaaaagaaagcaagatgctcaagaattg
gaggcgttaagagaatattcacaaatctatgaaaatgaaaaatataaacaggaattgaaa
aagcaaaaattaaatgaaaaaacaaaagttgttcctggtggttgggaatatactattcca
ccatctgatgaacctttgaatatcaaacgtagattggtttcagatgaaattagtcagcaa
ttgatcaagtatcaacaagaacacaacactgaagaactcagtgcccaagtaagtgatata
actatagattcagatcgtgaatcagcaccaacaccgaaattggttacttatatggatcaa
ttggcaaatttcattcctccaggtgttgatttgaatgaaatcattgatgaaaaagtttat
gaaccaacagtttcgaatgaagttgtttttgattcgatacaaattcgtccaaacttgcca
acttctgaagattggttacttcaattggaattggctaatcaattaacatctgctttagct
ccatatgttgccgaaccaaagaaaaaactggataaattaaatattgaaagagttgatgat
attttattttcagatttcaataaaaatgtattgaaagtttccacaccaacgaaaaaatta
agtgttgttgaagatatggatgaatcccaagatatatatattgataatatttcgacaatt
ttccataaacttttatctaaaacagttgttggtcatcgtcatggcaatgtgaatgatttc
cctatcattgaaaaaactactgggtttgaatttaaagatgtaatcactactcctcaagaa
agggaagaaaaagatgttttcgtcttatgttctgctttatttgataaactaactataaac
caatccaaccctgaaattagtgctgccttgatggataataccagaaagaaattattaggt
gattggttgaaaaattataatttgtcatcggttgaaaaacttttggctgaaaacaagaat
gatccattggagaagacattcatctatatgtgttctggtgatatgattaaagctattgaa
actgcaatacaaacaaataatagtcatttatcagtagtgataactttatctgattctaat
gatgcggtagtgaaatcaattgctcaaaatcaattgaaaaattggaaacaacttcaagtt
atcctgtctattccttcagctgttgttaaaatttatcaaatattagctggtgattttgaa
ccaattcttgaaatattaccttggaatcttggtttggccttaaaattgttttatggtgat
tataatgatattaaaaaattgattaataaatttagttcactgatacccattggggatcca
gttggtgatgttttacttgcatatgtcaaaggtgttgatttggaatctatcacatcaagt
tcattgaatattaaattgaaatggttattctgtaaaatattagcagattttaattatgat
gccataactaaagaatttggtgattatttgctgtcaattgattattggaaagaaagtgcc
ttagtgtttgcccatttaaccaacgataatgatgctgctgatgctattagcaaattggta
aattccaaaatactgtacatcaaaagttctacaattgataaagaacaatacgcgatagaa
gtattaaaaattccaagaccagttatatacaaggcagttgctattgaaaagaacaataac
gaagatttctggggtgaatgtgaagctttaatagaagttagtttatgggaagaagcacac
gttactattgttaatgaattaggaccaagaacagtgatatccaattcaaatcaagataaa
tcacaattacaaaatgtactttcgaaatttcctgaaaatggattgattatttctgattgg
aataaaggagcaggaatttatgagaaatatttggtggtattacaaaatgacaatgattta
tcggttattcaattcttactagataatttaccattgagtaatattgattcatttcataaa
agaattgcattagatattatatctaaatttattggcaatttaattattgaaaatgacaaa
tttaatgctacggataaatcaaaaatcttaaatttaccattagatgatgtgaataagaaa
tactttgaattaagattggcggatttaaaaaaaaacatagaataa
DBGET
integrated database retrieval system