Candida dubliniensis: CD36_72230
Help
Entry
CD36_72230 CDS
T01140
Name
(RefSeq) AAA-family ATPase, peroxisome biogenesis protein, putative
KO
K13338
peroxin-1
Organism
cdu
Candida dubliniensis
Pathway
cdu04146
Peroxisome
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
cdu00001
]
09140 Cellular Processes
09141 Transport and catabolism
04146 Peroxisome
CD36_72230
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
04131 Membrane trafficking [BR:
cdu04131
]
CD36_72230
Membrane trafficking [BR:
cdu04131
]
Autophagy
Pexophagy
Other pexophagy associated proteins
CD36_72230
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
AAA
PEX-1N
AAA_lid_3
AAA_16
AAA_22
AAA_14
Bac_DnaA
AAA_5
ABC_tran
RNA_helicase
ATPase_2
RuvB_N
NACHT
NB-ARC
AAA_24
AAA_18
AAA_7
AAA_25
IstB_IS21
AAA_33
nSTAND3
AAA_2
TIP49
Kinesin
ATPase
Sigma54_activat
AAA_30
Mg_chelatase
T2SSE
AAA_29
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
8048990
NCBI-ProteinID:
XP_002421441
UniProt:
B9WKC6
LinkDB
All DBs
Position
7:541679..544966
Genome browser
AA seq
1095 aa
AA seq
DB search
MDNHKAKVSYKTLKSNLVNLPSNLTNLLFTANIQVQDVIIEIVTTTTTTSNKSLIKRYAG
WSGMSSSDISNLEIDPIFAQSLNLIDKTPITVNLKLGNYESTNINLEPLTSSDWELVELH
AQSIEDKLLSQTRCVALNQVLVVYPSISTSAKLLVTDLGSTDHTFAKISAYCEIAIAPKV
REEKQHKDKTGSSNKSIASSKSTKKTPTSSSEDYSDLPSVLKRGISLPHKLYDGNETVNI
AGYFVYVDIKDELPQGFSSEYVAVSVIPGPNDKTSTKTLPITEDDDNDKNKNLKENKRII
AKLVDYKFGPSGNIGLSHNLSIALNIENQIGNIISLKPAIKNLPKRPTTFTIHPYIIHSK
KKEITISNNKKENKLAQQLTEIMYPDIASLPITNFMKIPIIANILPYGGLLKFRKNDEYN
AWIKPYNLDTKKPIKFEIGDEILRPSSFIQQEQKINNHNNGTEYEYGEKEGKEEEEEEDE
ELEAIGLDDTVEEIVDSFITSENTGTLIYGNSGSGKTLLLKLVARQLNQQYGYFTKYISC
DTIMNENFQNLSKNHFFKWIQVCSWNKPSILILDNIDKLMNIEMENMDNTKSNQLTEFFI
ANLTKIHHQLNSNLSILLSANSKDNINKLLLGSHLIENFHHLTPPDKSLRFEILEKYLIN
KLGLIIKVDLMDLVSETDGYLPNDLKILSDRIYHEVLFNSNNTNLQEVTEEHITKALTGY
TPSNLRGVKLQKSSINWSDIGGLKEAKNILLETLEWPTKYAPIFANCPLRLRSGILLYGY
PGCGKTLLASAIAGQCGLNFISIKGPEILNKYIGASEQSVRELFERAQAAKPCILFFDEF
DSIAPKRGHDSTGVTDRVVNQMLTQMDGAEGLDGVYVLAATSRPDLIDSALLRPGRLDKS
VICDMPNYEDRLDILKSITLKMDLSEDVNLHEIAEKTIGFSGADMQGLGYNAYLKAVHVT
LEELSQREQDEANNDDGNNIEKKENSIEFFQVGNSEKKLNTNEKIQLLHQIQQFMTKKDN
SDPKLKTGQDEVINKSKVLITHENFLASLKETKPSISHSEKIKLTKIYKEFVNDRDGNMP
NGTPSNEIGGRTTLM
NT seq
3288 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggataatcataaagccaaagtatcctataaaacattgaaatctaatttggtcaattta
ccatctaatttaaccaatttattattcactgccaacattcaagttcaagatgtcataata
gaaatcgtcaccaccaccaccaccacttcaaataagagtctcatcaaacgttatgctggt
tggtcaggaatgtcatcatctgatatttctaatttagaaatagatcctatatttgctcaa
tcattaaatcttattgataaaaccccaatcacggtgaatttaaaacttgggaattatgaa
tcaactaatattaatttagaaccattaacaagttctgattgggaattggtagaattacat
gctcaatctattgaagataaattattaagtcaaaccagatgtgttgcattaaatcaagtt
ttagtggtatacccaagtattagtaccagtgccaaattattagtgactgatttgggtagt
acggatcatacgtttgcgaaaatatcagcatattgtgaaatagccattgctcccaaagtg
agagaagaaaagcaacataaggataaaactggaagttccaataagagtattgctagttct
aaaagtacgaaaaaaaccccaacttcatcactggaagattattctgatttacccctggtt
ttaaaaagaggaatttcattaccacataagttatatgatggtaatgagacagtgaatatt
gcaggttactttgtgtatgtagatattaaagacgaattacctcaaggattcagtagtgaa
tatgtggcagtatcagtgattcctggtccaaatgataaaacatcaacaaaaacattacca
attacagaagatgatgacaatgacaaaaacaaaaacttgaaagagaataaaagaattatt
gccaaattggtggactataaatttggtccttcaggtaatattggattatctcataattta
tcaatagcattaaatattgaaaatcaaatagggaacattattagtttgaaaccagctatt
aaaaatttacctaaacgtccaacaacttttactattcatccttatattatacattcaaag
aaaaaagaaatcactattagtaacaataaaaaagaaaataaattggcacaacaattgaca
gaaatcatgtatccagatattgcatcattaccaatcaccaattttatgaaaatccctatt
attgccaatattttaccatatggagggttattgaaattccggaaaaatgatgaatataat
gcttggatcaaaccatataatttagatacgaaaaaacccataaaattcgaaataggtgat
gaaattttacgtcctagttcatttatacaacaagaacaaaagattaacaatcataacaat
ggtacagaatatgaatacggagaaaaagaaggaaaagaagaagaagaagaagaagacgaa
gaattggaagcaattggattagatgatactgttgaagaaattgttgattcatttattaca
tcagaaaatactgggactttaatatatgggaattctggtagtgggaaaacattattatta
aaattagtggcacgacaattaaatcaacaatatggatattttactaaatatatatcttgt
gataccattatgaatgaaaatttccaaaatttatcgaaaaatcattttttcaaatggatt
caagtttgttcatggaataaaccatcgattttaattttagataatattgataaattaatg
aatatagaaatggaaaatatggataatactaaatctaatcaattgacagaatttttcatt
gctaatttaaccaaaattcatcatcaattaaattctaatttatcaattttattatcagct
aattctaaagataatattaataaattattattaggatctcatttaattgaaaatttccat
catttaaccccaccagataaatcattacgatttgaaattttagaaaaatatttaattaat
aaattaggattaatcattaaagttgatttaatggatttagttagtgaaactgacggttat
ttacctaatgatttaaaaattttaagtgatagaatttatcatgaagtgttatttaacagt
aataatactaacttgcaagaagttactgaggaacatattaccaaagctttaactggttat
acaccatctaatttacgaggagttaaattacaaaaatcatcgattaattggtcagatatt
ggaggattaaaagaagcgaaaaatatattattagaaactttagaatggcccactaaatat
gcaccgatttttgctaattgtccattaagattaagatcagggattttactttatggatat
cctggatgtggtaaaacattattggctagtgctatagcaggtcaatgtggattaaatttt
atttctattaaaggaccagaaattttaaataaatatattggtgcttcagaacaaagtgtt
cgagaactttttgaaagagctcaagcagctaaaccatgtattttatttttcgatgaattt
gattcaattgctcctaaaagaggtcatgattctactggagtaactgatcgtgttgttaat
caaatgttgacacaaatggatggagctgaaggattagatggagtttatgtattagcagca
acttctcgaccagatttaattgattcagcattattaagaccaggtcgattagataaaagt
gttatatgtgatatgcccaattatgaagatcgattagatattttaaaaagtattacttta
aaaatggatttgagtgaagatgtgaatttacatgaaattgctgagaaaactattggattt
agtggagctgatatgcaaggattaggatataatgcttatttaaaagctgttcatgttaca
ttagaagaattatctcaaagggaacaagatgaagccaataatgacgatggtaataatatt
gaaaaaaaagaaaattccattgaatttttccaagttggaaattcagaaaagaaattaaat
actaatgaaaaaatccaattattacatcaaattcaacaatttatgactaagaaagataat
tcagatcctaaattgaagacaggacaagatgaagttataaataaatcaaaagttttaatt
actcatgaaaattttttggcatcattaaaagaaactaaaccatcaatatcccattcagaa
aaaatcaaattaacaaaaatttataaagaatttgttaatgatcgagatggtaatatgcct
aatggtactccaagtaacgaaattggaggtagaactacattaatgtaa
DBGET
integrated database retrieval system
