Candida dubliniensis: CD36_81100
Help
Entry
CD36_81100 CDS
T01140
Name
(RefSeq) U3 small nucleolar RNA-associated protein, putative
KO
K14772
U3 small nucleolar RNA-associated protein 20
Organism
cdu
Candida dubliniensis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
cdu00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03009 Ribosome biogenesis [BR:
cdu03009
]
CD36_81100
Ribosome biogenesis [BR:
cdu03009
]
Eukaryotic type
90S particles
U3 small nucleolar RNA-associated proteins
CD36_81100
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
UTP20_N
UTP20
UTP20_C
HEAT_MROH2B_C
YozE_SAM_like
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
8046998
NCBI-ProteinID:
XP_002419056
UniProt:
B9WD89
LinkDB
All DBs
Position
3:253604..261040
Genome browser
AA seq
2478 aa
AA seq
DB search
MSKLRTKTTESSRRHAFSSFRERVDSIKIEPSKKLTKRVYDYIDTEDQTDSYFLTTLEHW
KETNLSGNFTEFLNKIEQNCQSLPQLIYHQSTIYQALYDAIAKNDVHSIQPLLELMSQFI
HDLGSDFLPFYTKTLKLLMDLVLSVNPNDFQNNRNSSNVLEWAFNTLAFAFKYLSRNLAI
DLKPTFIELLPLLQLTKKTYISRFCAEALSFLIRKSNQESLNEIIQFSLYDQIDIILDND
AYCESLTILYSEAMKNTKGTFHSKANLIFSKIMENTLYKVDTKAQPKLISIISDIILDIL
NHGTVESCDKFYAMVTDYLNNLLEKHNADPSEIELLTTCQILSTLAFAESGKKISNWDIV
LETVDLLVAKINCNNNATRQELLESYIYLLVIVFRNADIQSLTIRHKKYFDSIYNTSEFL
TFTEASLSIAKSKVINFGIIKLLQNYINNCQDYDKEVEKLTYFLNNNDISSKLQIPQSLV
SQISNQINKDIKSKSFKSIHWKLLLLNFANNFQDINLQSLKELLFNLESGNKNLAAITLD
IISHKLKEFPDSQTHIDEITSYLETNFHKFDTSTKFLNAINNYIKVTKSGGDFLSNAITC
LHYPTHELRTNAIELISTLVVNESSTYLSQIRLIEQIPLNISTGRDITLRIRNLAMEFSK
EINPSDLDKKLIVNYFFGLLSNKFQPSWTAVYESLPLISSTCKSEIWQVAYKLLTLDYTN
DEDEDEENTEERSVVDFPIESTLIDWQPRNSRLLNNFESFENSYLAPYRNISQAINNNLE
RNAHFDSMVRSHVLNALKTIPSIVEKNAGKLIPIITHQPTIDEDELQNWSRKDRNELLEL
FAKFKNLRKIPESEELYDYLLDYLLTSKYVKVQQLALDVLFTWNNPSINKYKDNLKNLLD
DAIFSDEISNFIINGTNISTSNIIEPQDKPLIMKFVIRILFGRVQGSPKSNSKQGKKFAV
ISVLPSLTNSEIISFIELGANKIGYEGFFNGQIPKASLGLDQSELKKISGFINLLSEIYH
ILGANYNAALQTTIKPLIFSLVSAQNRIESTSLIDSIISEKMAKNIRSNGMRCLTELFTI
IGDDFDWNDYLSLIYDNLINPRMETFADENLQQPSAMLKLISFWIGQSNTLPFLYIDEFA
TTRAILSLLSKSSEAKESVITLVLDFTINALERKDNEIDEKYFTLLAFVVDSLLQYLPQT
IEMIYNKEVGSRAIKVLLLLISGKYIEDQDTKASLIKSLTIALEKNNNQIDLDDKANILV
SLSSLIDEYDCEFHEIQPLYEIICKLFKMFATRNVRETLVVVINTMGNKFKQIEPIAPII
TGLNAYSDRMSEYDFEKRLEAYRLVNEEMYKDLTPIQWLPLLYCALFFINDRDELAIRVN
AGYMLRRFVDCYSSIIIEPKEYVHLLKDIVLPNLKIGIRKENEDVQTEYILVLEHIVKHS
VNYTELNDMKVLIGQDDEEGEDNFFQSINHIQLHRRQRAIRRLRDYKDDLKDNSISHYIL
PIIEGYVTTKEDKHRNIGLEALETIGVLLKSVTWNQYKAIVKRYISNLNKSQDTLKQRVN
LMVAVSFALAQSVKENNKNLPEQQQELDQFILYEISPPLLKLLQIRDDETIVARAPLAEA
LTNFMLCITKDKIDGELPKILTSTCQVMRSRSEELRDAVRKTLGKIAISLGPNYLSFIFK
ELKTALSRGSQIHVLSFTVHYLLTCVTSILQHSDLDDCIEIVIGIVMEDIFGAAGQEKDA
EGYTSKMKEVKFKKSFDTAEIVASNVSLNQFGTIIEPIKLLLQEMISHKTQVKLDELLRR
LSFGLNHNQEASNIEILHLCYEIYMMSKENDEVNETKVSAKEQHFLTTLDRKVKKRVDKS
LYKQTMQRLSFELLRTAISRHDNLMSVTNLQGFIPLLEEGVKSENETVIIASLKILNIII
RLPFPDQGIFKACARRTLILIKDSPSTNSDICQAALKFLATTIRHNPEVTMKESAISYVL
TRIQPDLEEPNKQGLAFNFLKAVVSQHIMIPEIYDLMDNVAKLMIVNHSKEIRDMSRSVY
FQFLMEYDQGKGRLEKQFKYLVSNLTYPTEEGRQSIMELIHLIVVKAGKDLLNKLSSSFF
VALANVLISDVSSRCREMASSLITTILKKLDDTSSMEKYCSVWIKQSTNSLLKRCGLNIY
KLIITVRGFGKNKELDKIALDNILNIIEAARNTKDEQDSAGTTTTSDDVEWELVYSCLST
FSSMASIIKDRIFEYRKIWNGIINILLFPHSWIRLITCRLMTILLSNGSGDIEKYDLQNI
ATKLIHQLRAPSITSDLGTQITKNLVLIAMKWEKETYEWDGNLANDYLLSKICGIIKSEH
VHSIESKKSCIKLTAMFIQFTNQQRIIKISEMIISALYNYTDPTYATPDDELTNLSLEAL
ELVQEKIGTSEYTKLYSNIKVNVNVKRQERKAKRAQMAISAPDIAAKRKLKKHERVREKR
KHEKDINGYYKPKKKRTL
NT seq
7437 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgctgaagttgaggactaaaacaacagagtcgagtagaagacatgcattttcttcattc
cgtgaaagagttgattcaatcaagattgaaccaagtaagaaattaactaaaagagtgtat
gattatattgatactgaagatcaaactgattcatattttcttactacattagaacattgg
aaggaaaccaatttatcagggaatttcactgaatttttaaataaaatcgaacaaaattgt
caatcattacctcaacttatttatcatcaatcaaccatttatcaagcattatatgatgcc
attgccaaaaatgatgttcattcaatccaaccattacttgaattaatgtcacaatttatt
catgatttaggttcagattttttaccattttataccaaaacgttgaaattattaatggat
ttagtattactggtcaatcctaatgatttccaaaataatagaaattcttcaaatgtttta
gaatgggcatttaatactttggcatttgcatttaaatatttatcacgaaatttagccatt
gatttaaaaccaacttttattgaattattaccgttattacaattaactaaaaaaacttat
atttcccgtttttgtgctgaagcattatcatttcttatacgtaaactgaatcaggaatct
ttaaatgaaataattcaattttcattatatgatcaaatcgatataatattagataatgat
gcatattgtgaatcattaacgattttatatagtgaagcaatgaaaaacacaaagggtact
ttccattctaaagccaatttaattttctccaaaataatggaaaatacattatataaggtc
gatactaaagctcaaccaaaacttattagtattatatctgatataatacttgatatttta
aatcatgggaccgtggaatcatgtgacaagttctatgctatggtgacagactacttaaac
aatttacttgagaaacacaatgccgacccttcagaaatagaattattaaccacatgtcaa
atattatcgacgttagcatttgctgaatcaggtaagaaaattagtaattgggatattgtc
cttgaaacagttgatttattagttgcaaagataaactgcaacaacaacgccacaagacag
gaattacttgaatcatatatttatttattggttattgtttttagaaatgctgatattcaa
tcattaactattagacataagaaatattttgattcaatttataacacctcggaattttta
acattcactgaagctagtttatcaattgccaaatctaaagttatcaattttggaattatt
aagcttttacaaaattatatcaacaattgtcaagattatgataaggaagttgaaaaattg
acttatttcttaaacaacaatgatattagttccaaattacaaattcctcaatcattagtt
tcccaaatttctaatcaaataaataaagatattaaatcaaaatcatttaaatctattcat
tggaaattgttattattaaattttgccaataatttccaagatataaatttacaatcattg
aaagaattattgtttaatttagaaagtgggaataaaaatcttgctgcaattactttagat
atcatttctcataaattaaaagaatttcccgattctcaaactcatattgatgaaataact
tcttatttggaaactaatttccataaatttgatacatcaacaaaatttttaaatgcaatt
aacaattatattaaagtaaccaaatcaggaggagattttttatccaatgcaattacttgt
ttacattatccaacccatgaattacgtactaatgccattgaattaatttccactttagtt
gttaacgaactgtcaacttatttatcccaaattcgtcttattgaacaaattcctttgaat
ataagtaccggaagagatattactttgcgtattagaaatttggctatggaatttctgaaa
gaaataaacccaagtgatttagataaaaaattaattgttaattatttttttgggttgctt
tctaataaatttcaaccatcttggacagcagtttatgaatccttgccacttatttctagt
acttgtaaatcagaaatttggcaagtggcatataaattgcttacattggattatacaaat
gatgaagatgaagatgaagaaaatacagaagaaagaagtgtagttgatttccccattgaa
agtacattaattgattggcaaccacgtaattcacgattattaaataattttgaactgttt
gaaaattcatatttggcaccttatagaaacatttcacaagcaattaataacaatttagaa
agaaatgctcattttgatagtatggttagatctcatgttttaaatgctttgaaaacaatc
ccatcaattgttgaaaaaaatgctggtaaattaatccctattataactcatcaaccaaca
atagatgaagatgaattacaaaattggtcacgtaaagatcgtaatgaattacttgaatta
tttgctaaattcaaaaatttacggaaaatacctgaaagtgaagaattatatgattattta
cttgattatttattaactagtaaatatgtcaaagttcaacaattagctcttgatgtttta
tttacatggaataatccatctatcaacaaatataaagataatttgaaaaatttattagat
gatgctattttcagtgatgaaatttccaattttattattaatggtactaatatatcaaca
tctaatattattgaaccacaagataaacctttgattatgaaatttgtcattagaatatta
tttggtagagttcaaggatcacctaaaagtaatagtaaacaaggtaaaaaatttgctgtt
atatcagtattaccaagtttaactaattcagaaatcatatcatttattgaattaggagct
aataaaattggttatgaaggatttttcaatggtcaaattcctaaagcaagtttaggactt
gatcaatcagaattgaaaaaaattagtggatttattaatttattactggaaatttatcat
attcttggtgctaattataatgcagcattacaaactactataaaaccattaatattctcc
cttgtatcagctcaaaatagaattgaatcaacaagtttaattgattctataataagtgaa
aaaatggcaaaaaatattcgactgaatggtatgagatgtttaactgaattattcacaatt
attggtgatgattttgattggaatgattatttatcattgatatatgataatttaataaat
ccacgaatggaaacatttgctgatgaaaatttacaacaaccttcagccatgcttaaattg
atttcattttggattggtcaatccaatacattaccatttttatatattgatgaatttgct
actacaagagccatattatcattattaagtaaatcatcagaagctaaagaatcagttatt
actttagtattggatttcactattaatgccttggaaaggaaagataatgaaattgatgaa
aaatatttcactttattagcatttgtggttgattcattattacaatatttacctcaaact
attgaaatgatttacaataaggaagttggatctcgtgccataaaagttttattattgtta
atttctggtaaatatattgaagatcaagatactaaagccagtttaattaaatcccttact
attgctcttgaaaaaaataataatcaaattgatttggatgataaagcaaatattttagtt
tctttatcttcattaattgatgaatatgattgtgaatttcatgaaattcaaccattatat
gaaattatttgtaaattatttaaaatgtttgctacaagaaatgttagagaaactttagtg
gtggttattaacactatgggaaataaatttaaacaaattgaaccaatagcaccaattatt
actgggttaaatgcttatagtgatagaatgagtgaatatgattttgaaaaacgtcttgaa
gcttacagattggtgaatgaagagatgtataaagatttaaccccaattcaatggttacct
cttttatattgtgcattatttttcattaatgatcgtgatgaattggctataagagttaat
gctggttatatgttgagaagatttgttgattgttattcttcaattattattgagccaaaa
gaatatgttcatcttttaaaagatattgtgttacctaatttgaaaattggtattagaaaa
gaaaatgaagatgttcaaactgaatatattttagtgttggaacatattgttaagcattca
gtgaattatactgaattaaatgatatgaaagttttaattggtcaagacgatgaagaaggg
gaagataattttttccaaagtatcaatcatattcaattacatcgtcgacaaagggcaatt
agaagattacgtgattataaggatgatttgaaagataatagtatttctcattatatttta
ccgataattgaaggttatgtcactaccaaagaggataaacatcgaaatattgggttagaa
gcattagaaacaattggagttttacttaaatcagttacttggaatcaatataaagctata
gtgaaacgatacattagtaatttgaataaatctcaagatacattaaaacaacgtgtgaat
ttaatggttgccgtttcatttgccttggctcaatcagttaaagaaaacaataaaaattta
cctgaacaacaacaagaactagatcaatttatattatatgaaatttcacctccattgttg
aaattattacaaatacgtgatgatgaaaccattgttgctcgtgctccattggcagaagca
ttaactaattttatgttatgtattaccaaggacaaaattgatggtgaattaccgaaaatt
ttaactagtacatgtcaagttatgagatcaagatcggaagaattaagagatgccgtgagg
aaaactttaggtaaaattgctataagtttaggtccaaattatttgagttttattttcaaa
gaattgaaaactgccttatcgagaggttctcaaattcatgttttaagttttacagtacat
tatttattaacttgtgtcacatcaattttacaacattctgatcttgatgattgtattgaa
attgttattggaattgttatggaagatatatttggagctgctggtcaagaaaaagatgct
gaaggttataccagtaagatgaaagaagttaaattcaaaaaaagttttgatactgcagaa
attgttgcatctaatgtatcattaaatcaatttggtactataattgaaccgattaaattg
ttattacaagaaatgatttctcataaaacccaagttaaattagatgaattacttcgaaga
ttatcatttggattaaatcataatcaagaagcttccaatattgaaatattacatctttgt
tatgagatttatatgatgtctaaagagaatgacgaagttaatgaaactaaagttagtgcc
aaagagcaacatttccttactactttagatcggaaagtgaagaaacgggtagataaatcc
ctttataagcaaaccatgcaaagactttcatttgaattattaagaacagcgatttctcgt
catgataatttaatgtcagtgacaaatttacaaggatttatcccattgttagaagaagga
gtcaaatcggaaaatgaaactgtgataattgcctcattgaaaattttaaatataattatt
cgtttaccattccctgatcaaggaattttcaaagcttgtgctagaagaacattaatatta
attaaagattcaccttcaactaatctggatatatgtcaagcagcattaaaatttttagct
actactattagacataatcctgaagtaaccatgaaagaatcagccattagttatgtatta
accagaattcaacctgatttagaagaacccaacaaacaagggttagcttttaattttttg
aaagcagttgtatctcaacatataatgattccagaaatttatgatttaatggataatgtt
gctaaattaatgattgttaatcattcaaaagaaattagagatatgtcaagaagcgtttat
ttccaatttttaatggaatatgatcaaggtaaaggaagattagagaaacaatttaaatat
ttggttagtaatttgacttatcctacagaggaaggtcgtcaatcaattatggaattaatt
catttaattgttgttaaagctggtaaagatttattaaataaattatcatcatcatttttt
gtggcattagcaaatgttttaatatcagatgtatcatcaagatgtcgtgaaatggctagt
tcattaataactacaattttgaaaaaattggatgatacaagtagtatggagaagtattgt
ctggtttggataaaacaatcaaccaatagtcttttgaaaagatgtggtcttaatatttat
aaattgattataacggttcgaggatttggtaaaaataaagaattagataagattgctttg
gataatattttgaatataattgaagcagctagaaatactaaagatgaacaagactctgcc
gggaccaccaccactagtgatgacgttgaatgggagcttgtttattcttgtctttctaca
ttcagtagtatggcatccattatcaaagatagaatttttgaatatcggaaaatttggaat
ggaattattaatattttattatttcctcattcttggattagattaatcacttgtcgatta
atgacaattcttctttctaatggttctggtgatattgagaaatatgatttacaaaatata
gcgactaaattgattcatcaattacgtgcaccatcaatcacttctgatttaggtacacaa
atcaccaagaatttagtattaattgctatgaaatgggagaaagaaacttatgaatgggat
ggaaatttggctaatgattatttattatcgaaaatttgtggtataattaaactggaacat
gttcattcaattgaatctaaaaaatcatgtattaaattaactgccatgtttattcaattc
accaaccaacaaagaattatcaagatttcggaaatgattatatcagcattatataattat
actgatcctacttatgctacaccagatgatgaattaactaatttatctttagaagcttta
gaattagttcaagaaaaaattggtacaagtgaatatactaaattatattctaatattaaa
gtcaatgttaatgttaaacgacaagaaagaaaggctaaaagagcacaaatggcaatatcg
gctccagatatagctgctaaaagaaaattaaagaaacatgaaagagtaagagaaaagagg
aaacatgaaaaagatattaatggttattataaaccaaagaaaaagagaaccttataa
DBGET
integrated database retrieval system
