KEGG   Candida dubliniensis: CD36_81370
Entry
CD36_81370        CDS       T01140                                 
Name
(RefSeq) DNA repair and TFIIH regulator, putative
  KO
K15075  DNA repair/transcription protein MET18/MMS19
Organism
cdu  Candida dubliniensis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:cdu00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03036 Chromosome and associated proteins [BR:cdu03036]
    CD36_81370
   03400 DNA repair and recombination proteins [BR:cdu03400]
    CD36_81370
Chromosome and associated proteins [BR:cdu03036]
 Eukaryotic type
  Centrosome formation proteins
   Spindle formation proteins
    CD36_81370
DNA repair and recombination proteins [BR:cdu03400]
 Eukaryotic type
  SSBR (single strand breaks repair)
   NER (nucleotide excision repair)
    Other NER factors
     CD36_81370
SSDB
Motif
Pfam: MMS19_N MMS19_C New_glue Ipi1_N
Other DBs
NCBI-GeneID: 8047024
NCBI-ProteinID: XP_002419082
UniProt: B9WDB5
LinkDB
Position
3:complement(319707..323222)
AA seq 1171 aa
MVEHNIPILINQYIAASSGNDEEAVSNYIFELSNLITNDELSLLQFIQHLGPSLTSDKDL
IRSKSIECLSKTIISLSDSKLTKQDINVLMEFLLNKLIDNDQICLQYSLMGINSLICKKN
FLADTNIEKILQNLYKNYDPKKNLAKIRFETFQILLNLLNQFNQYLKSSIQLTNLYIKTF
IHIASGEKDPRNLLLSFELNSKINENFQFLVDNNELHQQFITDLFDICFCYFPISFKPPS
NDPYKITSEQLKVALRKTIASQSKFASEAFPNLIEKLTSTNPTIRNDTLKTLQLCIENYS
NNDPTIIEQYWMTIWNALKFEILHNDIRSNFNPTNNTIVALDYDEIDDNDEFKPLVLTLV
ILNQLIMKLPQPEIMLHTVVEELKPNLEIIKEKSIKSSLILSSLGSTSIENLNYIVDFLF
QYQVWGKFLNIDKKEEPNQKQEIDTNDDISLNIAKQRDLIDSIGFVLTAYQVLKPTTTNC
HLLDYKDYILIFLGQLLNITSNLEKTLKCKIIQQLIKLIKLPGFLNINELELILGNYFKD
FFLLGTTTTTSSSSSSAGKKKDVILQEIINGLIEVSQDSQITSMTIEFIINPILNQLLNN
DDTEIDIETFQFQLEIVGDLCINYQILEVISIRLLNKLSLIINNQSNDNLQLYKLIINLF
IESIKKIESIQQFLTNSWYKHFIPKFMENLLIILPVKKSFFDDNDYKSDNYELFEIVGDL
LGLIIKFIDVSKHQEILDQLNQAFITNNDQTNENYGLGPFKYPSNLLIEPTNYINIYNKI
LSSIDKSCVFKTNIDQQVIELVINLIYKIGSKDEYLRLQYLQTLCLLINKFIKNVDIDII
ESILKLKLLEEFNHKEFPITEKDFISFEIFIWILKGLIIKLDKLGINYLNQLLELFVITK
NYKFKQLIGKSLQILFIDLKIFTNEKITSTTTTTTTTTTTTNSVDTSSNDLKSSNQLISK
VKNLQIKSLYKQHIFVIILPYLINNDDSNNFGTDNDFNLKFNSLSLIIENLSINGNNNIL
INQLSEILPITLYSLIKIPIDSNSNSNLLASLIILNIILKEEEKEEKEKEKDINNTNLSL
LTKDNIIELIPILIKLITTTTTNRKSKSKSNSSNIDIKILSLKNLKLIIEKFDDIINKSK
LLNDLLPGLDDKKRVVRKLTIDLRQLLYDSK
NT seq 3516 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atggtggaacataatatacctatattaatcaatcagtatattgctgcttcttcagggaat
gatgaagaagcggtatcaaattatatttttgaattatccaatttgattaccaatgatgaa
ttatcattattacaattcattcaacatttaggaccttcattaacttctgataaagattta
attcgtagtaaaagtattgaatgtttatccaagacgattatttccttatcggattcaaaa
ttaactaaacaagatattaatgtattaatggaatttttattaaacaaattaattgataat
gatcaaatatgtttacaatattcattaatggggattaattcattaatttgtaaaaaaaat
ttccttgctgatacaaatattgaaaaaattttacaaaatttatataagaattatgatcct
aaaaagaatttagcaaaaatccgatttgaaactttccaaatcttattgaatttattaaat
caatttaatcaatatttaaaatcttctattcaattaacaaatttatatataaaaacattt
attcatattgcatctggggaaaaagatcctagaaatttattattatcatttgaattgaat
agtaaaatcaatgagaatttccaatttttggttgataataatgaattacatcaacaattt
ataaccgatttatttgatatttgtttttgttatttcccaatttcatttaaaccaccaagt
aatgatccttataaaatcacttcagaacaattaaaagtagcattaagaaaaactattgca
tctcaaagtaaatttgcttctgaggcattccccaatttaattgaaaaattaacatcaact
aatccaaccattagaaatgatactttaaaaactttgcaattatgtattgaaaattattct
aataatgatccgacaattattgaacaatattggatgacaatttggaatgcattaaaattt
gaaattttacataatgatattcggagtaattttaatcccactaataataccattgtggca
ttagattatgatgaaattgatgataatgatgaatttaaaccattagtgttaactttagtt
atacttaatcaattgattatgaaattacctcaaccagaaatcatgttacatactgtggtt
gaagaattaaaaccaaatttagaaattattaaagaaaaatcaattaaatcaagtttaata
ttaagttctttaggttcaacttctattgaaaatttgaattatattgttgattttttattt
caatatcaagtatgggggaaatttttaaatattgataaaaaggaagaaccaaatcaaaaa
caagaaattgatactaatgatgatatttcattgaatatagctaaacaacgtgatttaatt
gatagtattggatttgtattaactgcttatcaagttttaaaaccaacaacaactaattgt
catttattggattataaagattatattttaatatttttaggacaattattgaatattact
tcaaatttagagaaaacattaaaatgtaaaattattcaacaattaattaaattaattaaa
ttaccgggatttttaaatattaatgaacttgaattgatattagggaattatttcaaagat
tttttcttgttaggaacaacaacaacaacatcatcatcatcatcatcagcaggaaagaag
aaggatgttattttacaagaaattattaatggattaattgaagtttcacaagatagtcaa
ataacttcaatgacaattgaatttattattaatccaatattaaatcaattattaaacaac
gatgatactgagattgatattgagactttccaatttcaattagaaattgttggtgattta
tgtattaattatcaaattcttgaagttatttccattagattattaaataaattatcatta
ataattaataatcaatctaatgataatttacaattatataaactcattattaatttattt
attgaatcaataaaaaaaattgaatcaattcaacaatttttaactaattcatggtataaa
cattttataccaaaatttatggaaaatttgttgatcattttaccagtgaagaagtctttt
tttgatgataatgattataaaagtgataattatgaattatttgaaattgttggagattta
ttaggattaattataaaattcattgatgtatctaaacatcaagagattttggatcaattg
aatcaagcatttattaccaataatgaccaaacaaatgaaaattatggactaggaccattt
aaatatcctctgaatttattaattgaaccaactaattatatcaatatttataataaaatt
ttaagttcaattgataaatcttgtgttttcaaaaccaatattgatcaacaagtgattgaa
ttagtgataaatttgatttataaaattggtagtaaagatgaatatttacgattacaatat
ttacaaacattatgtttattgattaataaatttatcaaaaatgttgatattgatattatt
gaatcaatattgaaattgaaattattagaagaatttaatcataaagaatttccaattact
gaaaaagattttatttcatttgaaatatttatatggatattaaaaggattaattattaaa
cttgataaattaggaattaattatttgaatcaattacttgaattatttgttatcactaaa
aattataaatttaaacaattaattggtaaatcattacaaattttatttattgatttaaaa
attttcaccaatgaaaaaatcaccagcacgacgacgacgacgacgaccaccaccaccacc
accaatagtgttgatactagtagtaatgatttaaaatcttcaaatcaattgatttcaaaa
gttaaaaatttacaaattaaatcattgtataaacaacatatatttgtcattattttacca
tatttaattaataatgatgattccaataattttggtactgataatgattttaatttaaaa
tttaattcattatcattaattattgaaaatttatctataaatggtaataataatatttta
attaatcaattatcagaaattttaccaattacattatattcattaattaaaatccctata
gattcaaattcaaattccaatttattggcatcattaataatattaaatataattttaaaa
gaagaagaaaaagaagaaaaagaaaaagagaaagatatcaataatacaaatttatcatta
ttaactaaagacaatattattgaattaataccaattttaattaaattaatcactaccacc
actaccaatagaaaatccaaatccaaatccaattcatcaaatattgatatcaaaatatta
agtttaaaaaatttgaaattaataattgaaaaatttgatgatattattaataaatcaaaa
ttattgaatgatttattacctggtttagatgataaaaaaagagttgttagaaaattgact
attgatttaagacaattattatatgattccaaataa

DBGET integrated database retrieval system