Candida dubliniensis: CD36_82710
Help
Entry
CD36_82710 CDS
T01140
Name
(RefSeq) structural maintenance of chromosomes protein, putative
KO
K06669
structural maintenance of chromosome 3 (chondroitin sulfate proteoglycan 6)
Organism
cdu
Candida dubliniensis
Pathway
cdu04111
Cell cycle - yeast
cdu04113
Meiosis - yeast
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
cdu00001
]
09140 Cellular Processes
09143 Cell growth and death
04111 Cell cycle - yeast
CD36_82710
04113 Meiosis - yeast
CD36_82710
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03036 Chromosome and associated proteins [BR:
cdu03036
]
CD36_82710
09183 Protein families: signaling and cellular processes
00535 Proteoglycans [BR:
cdu00535
]
CD36_82710
Chromosome and associated proteins [BR:
cdu03036
]
Eukaryotic type
Sister chromatid cohesion proteins
Cohesin complex
CD36_82710
Meiosis-specific proteins
Cohesin complex and associated proteins
CD36_82710
Proteoglycans [BR:
cdu00535
]
Extracellular matrix (ECM) proteoglycans
Basement membrane proteoglycans
CD36_82710
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SMC_N
SMC_hinge
AAA_21
AAA_15
GAS
AAA_29
ABC_tran
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
8046684
NCBI-ProteinID:
XP_002419201
UniProt:
B9WDN4
LinkDB
All DBs
Position
3:630609..634307
Genome browser
AA seq
1232 aa
AA seq
DB search
MYIKKIIIQGFKTYKNTTTIDLLSPHCNVVVGRNGSGKSNFFAAIRFVLSDAYTHMSREE
RQGLIHEGSGTVMSAYVEIIFDNADGRFPINKPEISIRRTIGLKKDDYSLDGKSATRSDI
MNLLESAGFSRSNPYYIVPQGRITSLTNSKNHERLNLLKEVSGANVFENKLKESMKEMNQ
SNLKRTRIDETLVSIEERLKDLQIESSDLKNFQKLDKLKKILEFNIFDREYNELNESLEE
LEEKHQSILQESKQDLIELEKREKLCVELQDSINELKISAKVLKLEKEQSDLDCDQLLKI
IAEKEIKLRELSLNNELSKEQYIHINEQIDNLQLEIHQHKQEISHYKPELNKLQQEESNL
KQQLLEISSKQRALYSKQNRFSKFINKKDRDSWLNNEIAKLKRQIIDKDQEMRHISNEVK
TRESSLEELSESIKKLNDSLNDEEHIKTLANLKTTINDSKQQITQLVDQRKVLWRDEIRL
KSVHDSLTNDLTNATNVVNQTMDRAQAQGIAAVKQIAQRLNLSDRVYGTVAELFNVNDKY
KTAAEVIAGNSLFHIVVDTDVTAATIMEELIRNKSGRVTFVPLNRIDNIEIEYPDSHENQ
CLPLIKKLKYNEQVYKAIKHIFGKTLVVSELSKGGELSRKYKLSCITLDGDRVDTRGVLS
GGYRDYKNSRIDALKIQARKKQELEKTNRELIKVTEEIESINSRLNKLNNELQLNVRDLD
RLSVSKEPIKIELSQLNNKKFNLDQEISSLKSNLHNLQNTKNSIKVNLKQYELELNSEFT
QVLTEKEQNELDELSKLAIELESKLDNIVTRSSELDTKISGIESEVINNLQPKLNKYRQQ
QQQQQKQQQQHEQKNFNSKTTNLEYEELQQELESLHIQLDTSQSRNLQIVENLTKINEEI
NNCEQELIRANNQQIKIIKNIEKFSKQTNNLLNQKSIKLQMKDDANQKIRQLGVLPEEAF
QSNKYDQYNSNQLLYKLNDINQELTKYSHINKKAIEQFNLFNKQKEDLLIRRIDLNNSKS
SIENLIINLQQQKNNAIKKSFNQVAKSFKQIFEKLVPRGTGNLIMQKKNDNPDSDNNSDD
DIDNYSGVAISVSFNSKNDEQQRIEQLSGGQKSLCAIALIFAIQNCDPAPFYLFDEIDSN
LDTQYRISVAKLIYQLSRNNTNNNDNEGRNQGAQFICTTFRPELLQLSGDKFYGVTFSNK
VSSVNEINKEEAMSFVEGQQQQQQQLQQQQQV
NT seq
3699 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtatatcaagaagatcattattcaaggattcaagacctataaaaacactactacaatt
gatttactttctcctcattgtaatgttgttgttggtcgtaatggatcagggaaatcaaat
ttctttgctgccattagatttgtattgagtgatgcatatactcatatgtcaagagaagaa
agacaagggttgattcatgaaggatctggtacagttatgtcagcctatgttgaaattatc
tttgataatgccgatggtcgtttcccaataaataaaccagaaattagtattagacgtaca
attggattgaaaaaagatgattattctttagatgggaaatctgctactcgatcagatatt
atgaatcttttagagagtgccggattttctcgatcaaatccttattatattgtacctcaa
ggtagaattactagtttaaccaattctaaaaatcatgaacgattgaatttattgaaagaa
gtgagtggagccaatgttttcgaaaataaattgaaagaatcaatgaaagaaatgaatcaa
tcgaatttgaaacgaacaagaattgatgaaactttggttagtattgaagaacgattaaaa
gatttacaaattgaaagttctgatttgaaaaatttccaaaaattagataaattgaaaaaa
attttagaatttaatattttcgatagagaatataatgaattaaatgaatcattggaagaa
ttagaagaaaaacatcaatcaatattacaagaaagtaaacaagatttaattgaattagaa
aaacgagaaaaattatgtgttgaattacaagattcaattaatgaattgaaaatttctgcc
aaagttttgaaattagaaaaagaacaatctgatttagattgtgatcaattattgaaaatt
attgctgaaaaagagatcaaattacgagaattgtcattaaataatgaattatctaaagaa
caatacattcatattaatgaacaaattgataatcttcaattggaaatacatcaacataaa
caagaaatttctcattataaaccggaactaaacaaattacaacaagaagaatcaaattta
aaacaacagttattggagataagttcaaaacaaagagcattatactctaagcaaaataga
tttctgaaatttatcaataaaaaagatcgtgattcatggttgaataatgaaattgcaaaa
ttgaaacgacaaatcattgataaagatcaagaaatgcgtcatatttccaatgaagtgaaa
actagagaatctagtttagaagaattatcggaatcaataaaaaaattaaacgattcctta
aatgatgaagaacatatcaaaacccttgctaatttgaaaacaactattaatgattcaaaa
caacaaatcactcagttggtggatcaaagaaaagttttgtggcgtgatgaaattagattg
aaaagtgttcatgattcattaaccaatgatttgaccaatgccactaatgtagttaatcaa
actatggatagagctcaagctcaaggtattgctgcagtaaaacaaatagctcaacgattg
aatttatctgatcgtgtgtatggaactgttgctgaattgtttaatgttaatgacaagtat
aaaacagcagcagaagtcattgctggtaattctttatttcatattgttgttgatactgat
gtcactgctgctacgataatggaagaattaattcgtaataaatccggtagagtgacattt
gttccattgaatcgtattgataatattgaaattgaatatcctgattctcatgaaaatcaa
tgtcttccattaataaagaaattgaaatataatgaacaagtttacaaggccatcaaacat
atttttggtaaaactcttgttgttagtgaattactgaaaggtggtgaattatctcgtaaa
tataaattgagttgtatcacattagatggtgatagagttgatactagaggggttttatca
ggagggtatcgtgattataaaaattctcgtattgatgcccttaaaatccaagcaagaaag
aaacaagaattagagaaaactaatagagagttaataaaagtgacagaagaaattgaatca
ataaattctcgattaaataaattgaataatgaattacaattgaatgttcgagatttagat
cgattatcagttagtaaagaaccaattaaaattgaattatctcaattgaataataaaaaa
ttcaatttagatcaagaaatatcatcattaaaatctaatttacataatttacaaaacaca
aaaaattcaattaaagtgaatttgaaacaatatgaattggaattgaatagtgaattcact
caagttttaactgaaaaagaacaaaatgaattagatgaattatctaaattggccattgaa
ttagaatctaagttagataatatagttactagatcatcagaattggatactaagatttca
ggaatagaaagtgaagtgattaataatttacaaccgaaattaaacaaatatcgtcaacaa
caacaacaacaacaaaaacagcaacaacaacacgagcaaaaaaattttaatagcaagacc
accaatttagaatatgaagaattacaacaagaattagaaagtttacatattcaattagat
actagtcaactgcgtaatttacaaattgttgaaaatttaactaaaatcaatgaagaaatc
aataattgtgaacaagaattaattcgagctaataatcaacaaattaaaatcattaaaaat
attgaaaaatttctgaaacaaactaataatcttttaaatcaaaaactgattaaattacaa
atgaaagatgatgctaatcaaaaaattcgacaattgggagttttacctgaagaagcattt
caatcaaataaatatgatcaatataattcaaatcaattactttataaattaaatgatatt
aatcaagaattaacaaaatattctcatataaataaaaaagctattgaacaatttaattta
tttaataaacaaaaagaagatttattaataagaagaattgatttaaataattctaaatca
tcaattgaaaatttaattattaatttacaacaacaaaaaaataatgctattaaaaaatct
tttaatcaagttgctaaatcttttaaacaaatatttgaaaaattagtacctcgaggtaca
ggtaatttaattatgcaaaagaaaaatgataaccctgattctgataataattctgatgat
gatatagataattattcaggagtggctatatcagtatcatttaattctaaaaatgatgaa
caacaaagaattgaacaattatcaggtggtcaaaaatcattatgtgccattgcattaatt
tttgctatacaaaattgtgatccagctccattttatttatttgatgaaattgattcaaat
cttgatactcaatatcgtattagtgtggctaaattgatttatcaattatcaagaaataat
accaataacaatgacaatgaaggaagaaatcaaggggcacaatttatttgtactactttt
agacctgaattattacaattgagtggtgataaattttatggagtaacatttagtaataaa
gttagttcagttaatgagatcaataaagaagaagcaatgtcatttgttgaaggtcaacaa
caacaacaacaacaactacagcaacaacagcaggtgtag
DBGET
integrated database retrieval system
