Clostridium diolis: F3K33_14840
Help
Entry
F3K33_14840 CDS
T06237
Name
(GenBank) efflux RND transporter permease subunit
Organism
cdy
Clostridium diolis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ACR_tran
MMPL
SecD_SecF_C
AMP-binding_C_2
DUF7536
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QES74023
LinkDB
All DBs
Position
complement(3327572..3330664)
Genome browser
AA seq
1030 aa
AA seq
DB search
MNIANVSIKRPVFITVIMLVFAIVGMVCYERLVVNDMPEAENASVSVSITETGGSPTDIE
TNVTKTVEDAVGKISGVSHITSTVTEGSSRTNIQFDLDKDPEVAAQEVRDKVSSIRGLPS
DIDTPIISKFDSSATSILSVAVYGLDDNQQLSDVVDNIEKKLYTVSGIGSVNISGEDTRE
IHIKLDNNKLLKYGLATTDVSNAIKKDNVDQSTGKITDKDNEISVKISSKIKKVDDFKNI
LIANKNGTEIRVKDIAEVEDGVADRSSYAYYDGKPAIGIDIVKQSGSNTVQLADDVKKTL
TKLKSSLPKGVHVDIVSDDSVSIQSTIDSVLETMRDGCILAVVIVFLFLNEWESTLISAT
TLPISIITTFVCMKVKAFSLNTMTLMALSVAVGLLIDDAIVVIENIVRHLHMGKSPREAA
REATSEIGFAVIATTSAVISVFLPVSMVSGTIGRYFFQFGLTVVFSMAVSLFISFTLVPM
LSSKMLRLKRNKKENILSKFFKGFNSKFDILAHKYSRLLVMSLHHRLIIIIVAGVMFAGS
LTLISSLGFTMMPSTDNNQVTVSANFDSGITLDNASEKAKQIESIIKKYPEVSGMYTTVS
KNSSSIKIELTDKNKRKENSRDFARKLSGNLQNIPGAQVSVAAASMASGGRSSKDATFEL
VGDNREELQAFGQKVKEELAKESGVREISSNDKSGLPEIALEVNRDKAADLGVSSSDAAT
TLKTLFSGTTVTKYDDGKNRDDVVLYLQKDQRASLDNLKQVYVSGSNNKLVPLSEVTDEV
FETASAQLTRYDRLAELQISCNISGSASGTFMNTFMKKIQTQMNMPEGISVSLGGAGGSM
TSSLGSLEQAMAMAALFLYLVMAAQFESFVDPISILFSLPLAIIGAVLGLFVCKTQLSLM
SIIGIIMLMGLVAKNGILLIDAAKQRINEGMEREEAIKQSGLIRLRPIVMTTLAMIFGMI
PLAVSKGMGSEMRAPMAEAVIGGLVTSTILTLFVVPIMYTVFDDLKRKFRKKIHSKESQG
TEDMNGNISL
NT seq
3093 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gtgaatatagcaaatgttagtattaaaagaccagtatttataacagttatcatgttagtt
tttgcgattgtgggtatggtatgttatgaaagattagttgttaatgacatgccagaagct
gagaatgcatcagtttcagtttcgattacagaaacaggaggatctccaacagatatagag
acaaatgttacaaaaactgtagaagatgcggttggaaaaatttcaggagttagtcatata
acatcaactgtgacagaaggaagttcaaggactaatatacaattcgatttagataaggat
ccagaagttgcagcgcaagaagttagagataaagtttcaagtattaggggattaccaagt
gacatagatacacctattatttctaaattcgattcatcagcaacatcaattttatctgtt
gctgtttacggactagatgataaccaacaattatcagatgttgttgataatattgaaaag
aaactgtacacagtgtctggtattgggtcagtaaatatatctggtgaagatacaagagaa
atccatataaagttagataataataagcttttaaagtatggacttgcaacaactgatgta
tcaaatgccattaaaaaagataatgtagaccaatctacaggtaagattactgataaagat
aatgagatttctgttaaaataagcagcaagataaaaaaagtagatgattttaaaaatatt
ttaatagcgaataaaaatggtacagaaattagagtaaaagatattgcagaagttgaagac
ggagttgcagatagaagcagttatgcatattacgatggaaagccagcaattggtattgat
atagttaagcaatctggttcaaatactgttcaattggcagatgatgtaaaaaagacattg
actaagcttaaatcctctttaccaaaaggggtacatgttgatattgtaagtgatgactca
gtatcaatacaaagcactatagatagtgttttagaaactatgagggatggttgtatacta
gcagttgtcatagtattcttatttttaaatgaatgggaaagtacccttataagtgcaaca
acacttccaatttcaataataacaacttttgtttgcatgaaagtaaaagctttttctcta
aatacaatgactttaatggcattatcagttgcagtaggacttttaatagatgatgctata
gttgttatagaaaacattgtgcggcatttgcatatgggaaaatcaccaagagaagcagct
agagaagcaacttctgaaataggctttgccgtaatagctacaacatcagctgttatctct
gtattcttaccagtatcaatggtaagtggaacaattggaagatacttctttcaatttgga
cttacagttgtatttagtatggcagtttcattatttatatccttcactcttgtgcctatg
ctgtcatctaaaatgctaagactaaaaagaaataagaaagaaaatattcttagcaaattc
tttaagggatttaatagtaagtttgatatcttagcgcataagtattcaaggcttttagtt
atgtctcttcatcatagactaataattataatagttgcaggagttatgtttgcaggaagt
cttacacttatttcatctcttggatttactatgatgccatcaacagataataatcaagtg
actgtaagtgcaaattttgattcaggtataacattagataatgcatcagaaaaagctaaa
caaattgaaagtattattaagaaatatccagaagtcagtggtatgtatactactgtttca
aaaaatagttcatcaattaaaatagaactaacagacaaaaacaaacgtaaagaaaattca
agagatttcgctagaaaacttagtggaaatctacagaacataccaggagcacaagtgtca
gtagcagctgcctctatggcaagtggtggaagatcatcaaaagatgctacttttgagctt
gttggagacaatagggaagagcttcaagcttttggacaaaaagtaaaagaagaattggct
aaagagtctggggtaagagaaataagtagtaatgataaatcaggtcttccagaaatagct
ttagaagttaatcgcgataaagcggcagatttaggagtaagcagttcggatgctgcgact
acgttaaagactttatttagtggtacgactgtaactaaatatgatgatggaaaaaataga
gatgacgtagtattgtatttacaaaaagatcaacgtgcaagtcttgacaatcttaaacaa
gtttatgtttcaggttcaaataataagcttgttccgctatcagaagtaacggacgaggtt
tttgaaacagcgtcagcacaattgactagatatgatagacttgcagaattgcagatctct
tgtaatatttcgggttcagcttcaggtactttcatgaataccttcatgaaaaagattcaa
actcaaatgaatatgccagaaggtatttcagtatctttaggaggagctgggggatctatg
acaagcagccttggaagtttagaacaagcaatggctatggctgcattattcttatattta
gttatggcagcgcagtttgaaagctttgttgatcctatatctatactattctctttgcca
cttgcaatcattggagctgttttaggcttatttgtttgcaaaactcaattaagtttaatg
tctattataggaataataatgcttatggggttagttgcaaagaatggaatattgcttata
gatgctgctaaacaaaggattaatgaaggcatggaaagagaagaggctatcaagcaatca
gggttaataagattgcgaccaatagttatgactactttagctatgatctttggaatgatt
cctcttgccgtatctaagggtatgggttctgaaatgcgtgcaccaatggcagaagctgta
attggtggattagttacttctacaattttaacattatttgtagtaccaatcatgtataca
gtttttgatgatttgaaaagaaagtttagaaaaaagattcattctaaagaatcacaagga
acagaagatatgaatggaaatataagtttataa
DBGET
integrated database retrieval system
