Cyanobacterium endosymbiont of Epithemia clementina: P3F56_02780
Help
Entry
P3F56_02780 CDS
T09382
Name
(GenBank) hypothetical protein
KO
K09800
translocation and assembly module TamB
Organism
ceec
Cyanobacterium endosymbiont of Epithemia clementina
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ceec00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
ceec02000
]
P3F56_02780
Transporters [BR:
ceec02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
P3F56_02780
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WGT68023
LinkDB
All DBs
Position
838555..844488
Genome browser
AA seq
1977 aa
AA seq
DB search
MSQSPLPPDSPSNYWIRLLKIAKNPYNVAIGLASVTIIIISYTGLRLFLQKYLPPWLEKQ
VSYLINRPVDIDELQGFSLTHLCLGSTSVPQTSDHPNQLTASRVVVHFDIIAVLFKRTLV
IKIVPEDVEVELHQYSEGDLLRGEITDEIIPLKLDLAFDITNVEINVFPQGTNNLFTTTL
NGQARYSEVKKAKWDYDLDLALLGSEISLEGETVIDTKESQVKIAISKLDFSQLMPLVIN
PHVQLDQGDIEANINLNFPSTERLSETKAKGTVNLGNFKGKTNFFEKPLQVFANISFQKK
KIFIKKTQVNLGNITTSLYGQYDWNTGFDLEANISGLSEKNIEQVYPIELPIEVKGELQA
KLNLIGTLNAPFLRGRIKNKEIIEVAQTKLEKITIDFQSNLDNFLLKNLSVIPEVGGWIT
AQGMAKPKIIQSLMNGKSIDWNNIPFELVFKTELPSQKLVNDYYKLPITVNLNNLEVQGD
INGSFANPKGLIKWNTAGSLNKANTEIISQGNILIDKNNVILKNIELVTQRGRVIINASG
NLESKKWQAYLNSNSLDLTPFTSVICSVRNIKCPDNIFLKNANLNIRGRLNKLWKKSFNF
SSNLALVLDDGNIIINSQLKQTKFTTSATGLQLPLSLLSANIFIPITLKKYQFNLSGNIE
EILQKSTIDINAIKGHSNLEVEIAKSLLNAQVTWQNGSLKGNAELRYLSLNQFLPQLAIP
VQLTNSKITFIGSLQSLLSLGKTPNFNDFQLNADTQFKIADGTITAISKLNQGQITVNAI
ATPLLVTNLLPQVSIPIKVKKTEINLIAYLPDLLAFDLNTVQGNAQIELGIAEKEITTSI
KLINNQWKTNIIIDQLILSTWKNKLFANKEIEPIDAEIDLSGTLESLFSPNSIIPIQANN
FLVKIGEQNIKANGNITLTNLLNNPDIASVNLNIETQADLRILPIAELLSKIPINKQLLP
QAINLAGKGKFKGHLVGQNILTSPLFNSNFQLKGNLTLSNLTFNELNFEPILKGEIDLVT
GQNISLDLRGKKDVITAILTSCSQQKCLLPYIPYSFEISQKYRNYFPITVKGNRQGDRLV
ANIQNFPLKQLKLSPISNYGLTDYLGGRVNLNLEIDSLTLTGRGKLDIINPNLGEVFGDK
LQINWVYQNDYISFKNTTLILGKSNYIISGQVALKTGKIQGNLKVDKGYIQEILTALKIS
NFDSLSRFLKFKKDSSTHFKQVIPKPVGDVNALLSEQVNQLWENDQKIREIAIERQASKL
PRELDIKGKFNGEISLSGTLKAPEITFQFEGESWEWTSQLPTPSIINPLGFVLEDSPVIH
LEKLEIKGKIENGIVNINPMIKLKESLIKANLNLTYDNNKFDLQPSTFSLNNLTLDTIRS
LITIPGDLNGSINMAGNLTGSLIKPEINGIFDLEKVVINARLLRKSFQGNFAYKNAQLEL
QIDKPDFIRAYARLPLPIEINNDNRFKINVLLETEAFSLLEILTQEQVSWVDGEGKIALD
MSGKITINDEVKVSFDPNSRSIIDLNLITIKSYLLPNTLTLNGKVAIQNGRIKVNKLTGK
IGEITINTMGVLPLFNSSLKNIDSTIPLSITLTQDQVTFNNLYQGIANALILIKGTVFSP
IIEGEIQLNQGKIIVPDFISNIYEQPESPIVKEWIRRISPLEEVVILPKFNDFRVSIKEV
AIEQKTISPKFVFNVSGNLSLSGQLASFSLPGLLAIKPSGTVYINNGKVDIPVTRVFISR
QSNNTITFLPQKGLLNPYINLEFKLYILNIALRAINANEVADDIVQSGRSQSVEITLGIK
GDANQLLPNLGTKLEELCKLRPDNYRPIPQTSAIDPNKLRQLANCIKVNNLGTNSVRDLL
QSPIVSFSSSPRLSSSELLTLFGKQLPNLVEQLQQQNSAQLVEAGLPQVAVVLFPFLQDW
LFELNEATNQVGKEWGIENLRLYPVLEKVYELEDDSIIRFSYDYSFNEVIIRYENKF
NT seq
5934 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagtcaatcgccgcttcctcctgattctccgtcaaactattggattcgtctgctaaaa
atagctaaaaacccgtataatgtcgcgattgggcttgcttctgtaaccattattatcatt
agctacacagggttacgtctttttcttcaaaaatatcttcctccttggttagaaaaacaa
gttagttacttgattaatcgtcctgttgatattgatgaacttcaaggtttttctctaact
catctttgtctaggatccacttctgtgccacaaacctctgaccatcctaatcaacttacg
gccagtcgtgttgtcgttcactttgatatcattgctgttttattcaaacgaactttagtg
attaaaattgtacctgaagatgttgaagttgagctacatcaatattccgaaggagattta
ctcaggggagagataacagatgaaattattcctctaaagttagaccttgcttttgatatt
acaaatgttgaaattaatgtctttcctcaaggtacaaataatctatttacaacaacttta
aatggacaagcaaggtatagtgaagttaagaaagcaaagtgggattatgatcttgattta
gctttgcttggtagtgaaatttctctcgaaggagaaacagttattgataccaaagaaagt
caggtaaaaatagctatttctaagttagattttagtcaactaatgcctcttgttatcaat
cctcatgttcaattagatcaaggagatatcgaagcaaatatcaatctcaattttccttct
actgaaagattatctgaaaccaaagctaaagggacagttaacttaggtaatttcaaagga
aaaactaatttttttgagaagcctttgcaagtctttgccaatatttcttttcaaaagaaa
aaaatttttattaaaaaaactcaagtaaatttaggtaatattaccactagtttatatggt
caatatgattggaatactggatttgatttagaagccaatattagtgggttaagcgagaaa
aatattgagcaagtatacccaattgaattgcctatagaagttaagggagaattacaagct
aaattgaacttaataggaacgcttaatgccccttttttaagaggaagaataaaaaacaaa
gaaattatagaagtcgctcaaactaaacttgagaagattactattgattttcaaagtaat
ttggataattttttattgaaaaatttatcagttatccctgaggtcggggggtggattact
gcccaaggtatggctaaacctaaaattattcaatctcttatgaatggcaagtcaattgat
tggaataacattccttttgaattagtttttaagactgaactgccaagtcaaaaattagtt
aatgactattataaattaccaataacagtaaatttaaataacctagaagtacaaggggat
atcaatggaagttttgctaatcctaaaggcttaataaaatggaatacagctggaagttta
aataaagccaatactgaaattatcagtcaaggcaatattttaatagataaaaataatgtc
attcttaaaaatatagagttagtgacgcaaagagggagagtaattataaatgctagtggg
aatttagaaagtaaaaaatggcaagcttacttaaattctaactctctagatttaactcca
tttacttcagtaatttgtagtgtaagaaatataaaatgtcccgataatatttttctaaaa
aatgccaatcttaacataagaggtcgccttaataaactttggaaaaaatcgtttaatttt
tcatctaatttggccctggttttggacgacggtaatattattattaatagtcagttaaaa
caaactaaattcacaacatcagcaacgggattacaattacctttaagtctattatcagct
aatatttttattccaattacattaaaaaaatatcaatttaatttatcaggaaatatagaa
gaaattttacagaaatcaaccattgatattaatgcaattaaaggtcattctaatttagaa
gtagaaatagctaaaagtctcctgaatgctcaagtaacctggcaaaatggatctcttaaa
ggaaacgctgagctgagatatttatctctcaaccaatttttacctcagctagcaattcct
gttcaattaactaatagtaagattacctttataggtagtctacaatcgctactatctttg
ggtaaaactcccaattttaatgactttcaactaaatgctgacacacagtttaaaattgct
gatggaaccattacagctattagtaaattaaaccaaggacaaataactgttaatgcgata
gctacccctctattagttactaatcttttacctcaagtatctatccctattaaagtcaaa
aaaacagaaattaatttaatagcttatttacctgatttactagcttttgatttaaatacg
gtgcaaggtaatgctcagatagaactcggaattgctgaaaaagaaattaccacatcaatc
aaacttattaataatcaatggaaaactaatattattattgatcaactaattttatcgacc
tggaaaaataaattatttgcaaataaagagattgaaccaattgatgcagaaatagaccta
tcaggaactttagaatcgttattctcgcctaattccataattcccattcaagctaataat
tttttagtaaaaataggagagcaaaacataaaagctaatgggaatataaccttgactaat
cttctcaacaatcctgatattgcttctgttaatttaaatattgagacccaagctgatttg
agaattttacctattgcagaattgttgtcaaagattcctattaacaaacaacttttacca
caagctattaatttagcaggaaaaggtaaatttaaaggtcatttagttggacaaaatata
ttaacttctcctctatttaatagcaattttcaattaaaaggaaatttaactttatcaaat
cttacatttaatgaattaaattttgaaccgattttaaagggagaaattgatttagtaaca
ggacaaaatatttcacttgatttgcgaggaaaaaaagatgttattactgctattttaact
tcctgttcacaacaaaaatgtttgctaccttatattccatactcttttgaaataagccaa
aaatatagaaattattttccaatcactgttaaaggaaatcgtcagggtgatcgcctagtt
gctaatattcaaaactttcccttaaaacaattaaaattatccccaattagtaattatggt
ttaaccgactatttaggaggaagagttaatcttaatttagaaattgattcattaacttta
acaggtagaggaaaactagatattatcaatcctaatttaggtgaagtttttggagataaa
ttgcaaattaattgggtttaccagaatgactatatcagttttaaaaatacgaccttaatt
ttaggaaaaagtaactatattattagtggtcaagtagcattaaaaacaggaaaaattcaa
ggaaatctaaaagtagataaaggttatattcaagaaatcttaaccgcactaaaaatttct
aattttgacagtctctcacgatttttaaaatttaaaaaagattcttcaacacattttaaa
caagtgattcctaaaccagttggggatgtaaatgcactgctttcagagcaagtcaatcag
ttgtgggaaaatgatcaaaaaattagggaaattgcgattgaaagacaagctagcaaatta
ccacgagaattagacattaaaggtaaatttaatggagaaatatccttatcaggaactctc
aaagccccagaaataacctttcaatttgaaggagaaagttgggaatggacatctcaacta
ccaaccccatctatcattaatcctttaggttttgtcctggaagattctccagtaattcat
ctcgaaaagttggaaattaaaggaaagatagaaaatggaattgttaacataaatcctatg
atcaagctcaaggaaagtttaattaaagctaatcttaacttaacttatgacaacaataag
tttgacttgcaaccttcaacttttagtcttaacaatctaactctagatacaatacgtagc
ttaataactattcctggggatcttaatggcagtattaatatggcaggcaacctcactgga
agcttaataaaaccagaaattaacggaatatttgatttagagaaagtagtcattaatgcc
cgattacttagaaaaagtttccaaggtaattttgcctataaaaatgcacaattagaacta
caaatagataagccagattttattcgagcttatgctcgccttcccttacctattgagata
aataatgataatcgatttaaaataaatgttctactagaaactgaggcattttctctacta
gaaattctaactcaagaacaagtaagttgggttgatggagagggtaaaatagctcttgat
atgagtggtaaaatcactattaacgatgaagtaaaagttagtttcgatcctaacagtcgg
tcaattatagatttgaatttaattacaattaaaagttacttgttgccaaatactttaact
ttaaatggtaaagtagctatacaaaatggcagaattaaagtaaataaattaacaggtaaa
attggagaaataactattaacactatgggggtactccccctatttaattcatcacttaag
aacattgacagcaccattcctttaagcattactttaacccaagatcaagtaacctttaat
aatttatatcaaggaattgctaatgcattaattcttatcaagggaacagtttttagtcct
ataattgaaggagaaatacagttaaatcaaggtaaaattatagttcctgattttatttct
aatatttatgagcaaccagaatcaccaattgtaaaagagtggataagaaggattagtccc
ctagaagaagttgttattcttccaaaatttaatgactttagagtttcaattaaagaagtt
gcaattgagcaaaaaactattagcccaaaatttgtttttaacgttagtggaaatttaagt
ttaagtggtcaattagctagtttttctctaccaggattacttgctataaaaccatcggga
acagtttatatcaataatgggaaagtggatattcctgtaactcgtgtttttatctctcgt
caatctaataatactattacttttttgccacaaaaagggttgttaaatccctatattaat
ttagaatttaaactttatatattgaatattgctttaagagcaattaatgcgaatgaagtt
gctgatgatattgttcaaagtggtcgttcccaatcagtggaaataactctaggaatcaaa
ggagatgctaaccaattacttcctaatctcggcactaaattagaagaactttgtaaacta
aggccagataattatcgtcctattccccaaacttcagccattgatcctaataaattgaga
caattagctaactgtattaaggtcaataatttaggtactaattccgttcgagatttgcta
caatctcctattgtttctttttctagtagtcctcgtttaagtagtagtgagttactaaca
ctttttgggaaacaacttcctaatttagtcgaacaattacagcaacaaaattcagcccaa
ttagtagaagcaggactacctcaagtagcagtggtcctgtttccctttttacaagattgg
ctttttgagcttaatgaagcaactaatcaagtaggaaaagaatgggggatagaaaatttg
cgcttatatcccgtcttagaaaaagtctatgaacttgaagatgattcaataattcgtttt
tcctatgattattcatttaatgaagtaatcatccgttatgagaataaattttaa
DBGET
integrated database retrieval system
