Cyanobacterium endosymbiont of Epithemia clementina: P3F56_10130
Help
Entry
P3F56_10130 CDS
T09382
Name
(GenBank) translocation/assembly module TamB domain-containing protein
KO
K09800
translocation and assembly module TamB
Organism
ceec
Cyanobacterium endosymbiont of Epithemia clementina
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ceec00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
ceec02000
]
P3F56_10130
Transporters [BR:
ceec02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
P3F56_10130
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TamB
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WGT67521
LinkDB
All DBs
Position
3028759..3034701
Genome browser
AA seq
1980 aa
AA seq
DB search
MTTNPPNSPLKPPKKNNLLTRLASFARRPSTLIMSGVLLILGMTTYYGINYFVCKKLSPL
LSKEFSKLLEREVKIGEVESFFFNRISVGRSYILTTNTDTDYAEAEKIAISFNPLPIFIG
RPLIIDITIKKSNLFIEQDQTGEWIKLPKIKEEELNLPISLDAKIRFKDADITVHPYGFK
ESLSLETDGQADYNYQSNENQQFSYAFEVSVLNSEINIEGKTNIKSWKTQAQLQVYKLGL
AELVSLIPNLPITLKSGQLNSNLNLSIPSLEEIERFTGSGEFNISTIEANIKSLKTPLKV
NLGLDFQGKNVQLQNIEISLGKLITKITGVINWEQGYNINIDINPVFLEDLLAIVFLKLP
LKLKGEIQGKIKLSGGIKNPILTGTIKNTEFLLIDQVIIKTFTSNFKANLDQFILEKVQI
IPAAGGKIVARAKVEPGVLKEIKETKKTDWKKIPFFLAFEVELPTEELVTPYFQKKQGIS
LGKITTKGAITGTLGNPLGKIEWQSPNLINNSKEQISGKGKILLSGREISLEETILKSAE
GYITINGLGNLKDKKWNIALTANTFSLSPFLMITCSVTTCTDQVSRQSVTLTKSNIKLSG
KLDDFHLVKIHGQGNLTVNVNGGIIAVSSRIANENIKSVVSISEISLNPYIANLAVPIKV
TKSYFDISGSLSKILDNFTLNINHLQAKGNSQLTIDGSPVNATIDLSNGILQTVVRTGKI
PLDEIVPNLFVNAKLIKSSFTLTGNLNSILTSLKTNLVFNSLKANVDAHFIVEDSLVSIN
GKLRNGQINGLVNLGELYLNKIVTTLPIPVKVIGGNIKFSSQLTPLLSTKPDVSSVKLIA
NLQLSAAQGHINTTTRLHNNWWTTNINVSNLNYALILEKIIPQASPIQTSNLNAEINFSG
SIVDFLAGKKIIPVQVNNIAVQADGQILNAKGNLQLSNLLSNPDIANVNLSVNASSNFDQ
LPLTQLVSIIPLDRKFLLGELSLKGHGKFTGKFLGNNLLTSSTYPGNLQLLGDLKFTNLV
FNDQVFEEILTGTIKISSKEKITLNLEGKEDKITAILIPCTQKNCFAPYFPASFELRQTA
GEQSPIIVQGMLEDDHLTTKIEVLPLKLARISLGRQYGISGYLSGSVSGQLEIDTSTLEG
RGTLTIDKPRLGFIEGRQLTAKVQYKNNVAFLHNASLKLGRSDYNVQGSLNLQSLALQGK
LTVNDGRVEDLLTALNFTNFERVLDVIKFQPPDYTTAKAIPPQSIGDAQAAIAEQVKLLG
VIDQKIRQLAALRKAGGIPTELDIRGRFNVDVALGGTFLDPTVNLKFMGDKWEWHPQQPF
PDIVPPLGLVILDEQFIPINSVEVQAKSVNGIVAVECARILLKNTLFTLQGDFSLQNIDS
KWKVQHLSVDTVGNFVKLPVDIGGFVDMSGTLGGTPIQPEIQGQFAFEKGAFQGRSLGKN
LQGQFSYQDGRFRLATADASFVHLAVNIPFPITPDNNVFNIEAKLDTDALKLVSVLTGEQ
VILIGGEGQINAQVQGRINLFNGLRVNDLNAQGKVLLSEAIFQSAALPKPLTISGEINLD
DQAIKISQLQGTFAQSNLIIAGVLPLFKSQPQIENPLTVAIEKGTIDLEGLYSGGIEGSI
FVMGNALKPLVGGVVRLADGKVFIPKTPEVATGLPNAALTQSSRTSRQVFFSQENIPFIP
ELLDFRVIIQNLSVETLPLFQFEFGGDLIVNGSLNNLTSLKPQGNVILNRGQINFLETRF
LLERRNLNQIVFYPDKGLLNPDLDLQLRTIVSGVSETSKDFRAADTTEIPDDSLNKVERI
DINLALKGSLTQLIPSFYKDKSELCLIKNPLQPIRTKTTWSVEELNLLKNCLTFLAENSK
ENLDEQLLSNPVINLTSSPPQSQGQIVRLLGKQIFVLAESLQGQSTEQLIQFGVVQLVLP
MLFQTFIYDIESAISETTKSTDWRLLPFLETIYELEDKVFIKFYYDYILNEFRIRYEKRF
NT seq
5943 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgacaactaatcctccaaattcaccattaaaaccgcctaaaaaaaataatttattaact
agattagctagttttgctaggcggccttctaccctgataatgagcggagtgttgctaatc
ttggggatgacaacctattatggaattaattattttgtctgtaaaaaactatcacctctc
ctttctaaagaatttagtaaacttcttgaaagagaagttaaaataggtgaagtcgaaagc
tttttttttaatagaatcagtgttggacgttcttatattcttacgactaatacggataca
gattatgctgaagctgaaaaaattgctatcagttttaatcccctaccaatctttattggt
agacctttaattattgatattactatcaaaaaatctaatctttttatcgaacaagatcaa
acaggagaatggatcaaattaccaaaaattaaagaagaagaacttaatcttccaattagt
cttgacgctaagattcgtttcaaagatgcagatattacagttcatccttacgggtttaaa
gaatctctatctctcgaaacagacggacaagcagattataattatcaatccaatgagaat
caacaatttagttatgcttttgaagttagtgttctaaacagtgagattaatatagaagga
aaaaccaatattaagagttggaaaacccaagcacaattacaggtttataaacttgggtta
gctgagttagtttctttgattcctaatttacctatcaccctcaaaagtggacaattaaat
agtaatttaaatctttctattccttctttagaagaaatagaaagatttacaggatcagga
gaatttaatatctctaccattgaagcaaatattaaatccttaaaaactcctcttaaagtt
aacttaggtttagattttcaaggaaaaaatgttcaattacaaaatatagaaattagtcta
ggaaaattaattactaaaattactggagtaattaattgggagcaaggttacaatattaat
attgatattaatccagtttttctagaagatttacttgctattgttttcctcaaattacct
cttaaattaaagggagaaattcaaggaaaaattaaacttagtggggggattaaaaatcct
attttgactggaacaattaaaaatacagaatttctgctaatcgatcaggttattattaaa
acatttacaagcaattttaaagctaatttagatcaatttatcctcgaaaaagtccaaatt
attcctgctgctggtggaaagattgtagctagggcaaaagtagaaccaggagttctaaaa
gagatcaaagaaacaaaaaaaactgattggaaaaaaatccctttcttcctcgcttttgag
gttgaactacccacagaagaattagttactccttattttcaaaaaaaacaaggtattagt
ttaggaaaaattacaactaaaggtgcaattactggaactttagggaacccattgggtaaa
atagaatggcagtccccgaatctaattaacaattcaaaagaacaaatttcaggaaaagga
aaaattttattgtcaggacgagaaatttcacttgaggaaacaattttaaagtctgcagaa
ggatacattactattaatgggttaggaaatttaaaagataaaaagtggaatatagctttg
acagctaatactttttctcttagcccatttttaatgattacttgttcggttactacctgt
actgatcaagtttctcgtcagtcagttactcttactaagagtaatataaaattatctggt
aagttagatgatttccatttagtaaaaattcatggacagggaaatttaactgttaatgtt
aatggtgggataatcgccgttagtagtcgtatcgctaatgagaatataaaatccgttgtt
agtatatcagaaatttctcttaatccctatattgctaatttagcagtccctatcaaagta
acaaaaagttactttgatatatcaggttcgttaagcaaaatcttagacaatttcacttta
aatattaaccatctccaagcaaagggaaattcacaattaacgattgatggcagtcctgtc
aatgcaactatagacttaagcaatggaatactacaaacagtcgtgagaactggtaaaatt
ccccttgacgaaattgttcctaatttattcgttaatgccaagttaattaagagtagtttt
actttaacaggaaatctaaattccatccttacatctctcaaaacaaacttagtttttaat
agtttaaaagctaatgtagatgcacattttatcgtagaagatagtctagttagtattaac
ggaaagttaagaaacggtcagataaatgggttagttaacctcggtgaattataccttaat
aaaattgttactaccctacctattcctgtaaaagttatcggtggtaacatcaaattttcc
agtcaattaacacctttactttctactaaacctgacgtaagtagtgtcaaattaatagct
aatctacagctttctgctgcccaaggtcatatcaataccactactcgattacataataat
tggtggacaacaaacatcaatgtatctaatctcaattatgctctaattttagaaaaaatt
attccccaagcgtccccaatacaaacttctaatcttaacgcagaaattaatttttctggc
agtatagtagattttctagcaggaaagaaaataattcctgttcaagttaataatattgcc
gttcaagccgatggacaaattttgaatgccaaaggaaatctgcaattgtctaatcttttg
agcaaccctgatattgccaacgtcaacttatcagttaatgccagttctaactttgatcaa
ttacccttaactcaattagtttccattattcccctagatagaaaatttcttctcggagaa
cttagcttaaaaggtcatggaaaatttactggaaaatttttaggtaacaaccttttaact
tcttctacatacccaggtaatctccaattattaggggatttaaaattcactaatttggtc
tttaatgatcaagtttttgaagagatattaacaggaactattaagatctcttcaaaagaa
aaaatcactctgaatttagaaggaaaagaagataaaattactgcaatcttaataccttgt
acccaaaaaaactgttttgctccttattttcccgcttcttttgaattacgtcaaactgcc
ggagaacaatcccctattattgtccagggaatgttagaagacgatcaccttaccacaaaa
attgaagtattacctctaaaattagctagaatttctctaggtcgacaatatggcatctct
ggttatctttcgggttcggttagcggccaactggagattgatacttccactctcgaagga
cgagggactctaaccattgacaaaccaaggttaggatttattgaagggcgacaactcacc
gcaaaggtccaatataaaaataatgtggcttttttacacaatgcaagcctcaaattaggg
agaagtgattacaatgtgcaagggtcacttaatctgcaatcattagccttacaaggaaaa
ttaacggttaatgatggtcgcgttgaagatctgttgaccgccttaaactttaccaacttt
gaacgggtcttagacgtaattaaattccaacccccagactatactacggctaaagccatc
cccccacaatctatcggagatgcccaagcagccattgctgaacaagtaaaattattaggg
gttattgatcaaaaaatacgccaattagctgctctccgtaaagcaggaggaattcctacc
gaattggatattcgcggtcgcttcaatgtcgatgttgccctaggaggaactttcttggac
cccactgttaacctaaaattcatgggggataagtgggaatggcatcctcaacaacccttt
cccgacattgtgccacccttggggttggtgatattagatgaacaatttattcccattaac
tctgtggaagtccaagccaagtcagtcaatggaatagttgcagttgaatgcgccagaata
ctactaaaaaatacattattcactttacagggggatttttccttacaaaacattgattct
aagtggaaggtgcaacacttatccgttgatacagtaggtaactttgtgaaacttcccgtc
gatattggtggttttgttgatatgtcaggaactctaggcggaacccctattcaaccagaa
atacaaggacaatttgcctttgaaaaaggagcatttcaagggcgatcactaggaaaaaat
ctgcaaggacaatttagctatcaagatggtcggtttcgactcgctactgctgatgcgtct
tttgtgcacttagcagttaatattccttttcctattacccccgataataatgtatttaac
attgaggcaaaattagacacagacgcactaaaattagtaagtgttttaactggggaacaa
gtaatcttaattggcggagaggggcaaatcaatgcccaagtccaaggacgcattaatctt
ttcaatggactgagagttaatgatttaaacgcccaaggaaaggtgctcctaagtgaagct
attttccaaagtgccgctttgcccaaacctttaactatcagcggagaaattaacctcgat
gatcaagccataaaaatttcccaactacaaggaacttttgcccaaagtaacttgatcatt
gccggagtcttacccttatttaagtcccaaccccaaattgagaaccccctcaccgttgct
attgagaaaggaactattgatttagaaggattatatagtggaggaatagaaggaagtatt
tttgttatgggaaatgcccttaaacctttggttggtggtgtggttcgtttagctgatgga
aaagtctttatacctaaaaccccagaagtcgccacaggcttgcctaacgctgccttaact
caatcgtcaagaactagtcgtcaagtgtttttctctcaagaaaatattccttttatccct
gaattactggattttagagtaattattcaaaatttgtcggtagaaactctgcccctattt
cagtttgaattcgggggagatttaatagttaatggctctttaaataatttgactagcctg
aagcctcaaggaaatgttatcctcaatcgaggacagattaattttcttgaaacccgtttt
ttgcttgaacgtcggaaccttaatcaaattgttttttatccagacaaaggattattaaat
cccgatcttgatctacaactacggacgattgtctcaggagtttctgagacctcaaaggac
ttccgtgcggctgatactactgaaattcctgatgatagtttaaataaagtagaacgaatt
gatataaatttagctcttaagggatctttaactcagttaattcctagtttttacaaagat
aaatcagagttgtgcttgattaaaaatcctctacaaccaatccgtactaaaaccacctgg
tctgtggaagaattaaaccttttaaaaaactgtttgacttttctggctgagaacagtaaa
gagaacttagatgaacaactcctaagtaatccagtgattaatttaaccagtagtcctccg
cagagtcaaggacaaattgtccgcttgttaggaaaacaaatatttgttttagctgaatct
ttacaaggacaaagtactgagcagttaattcaatttggcgttgttcagttagtattgcca
atgctatttcaaacctttatttatgatatagagagtgccataagtgaaactactaaaagt
acagattggagacttttaccattcttagaaactatttatgaattggaagataaagtgttt
attaaattctattatgattacattcttaatgaatttcgaattcgctatgaaaaacgattc
tag
DBGET
integrated database retrieval system
