Cellvibrio sp. KY-GH-1: D0C16_07705
Help
Entry
D0C16_07705 CDS
T06422
Name
(GenBank) DUF4347 domain-containing protein
Organism
ceg
Cellvibrio sp. KY-GH-1
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DUF4347
fn3
Big_9
Ig_DSCAM-DSCAML_C
Big_5
OmpA_membrane
TSP_3
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QEY15865
UniProt:
A0A5J6PBF5
LinkDB
All DBs
Position
complement(1801852..1808895)
Genome browser
AA seq
2347 aa
AA seq
DB search
MSWTISKKPSSARLSSEKFPLKKWKAFSSLLLGGLIAFPCFAAERQEFIYVDSHVQDYQK
FINELPDSSSVVVLDPARNGIAQIAEHLSGYRGNVDAIHLVSHGKAGAVQAGDIWLSAEN
VQANHRSLARIGHALGPNGDFLIYGCQTAAGARGDSLMNQLASLTGADLTASTNFTGSAS
KGGDWALESQTGAIEAQVLASADYNHVLATLSAGDMVVVGWSALNDTITFASLVDIPAGT
VIKITDKGWDQATGAFTTSTTGDGVITWTTSSSISAGDLFTLYLGGSDAATTLTDVTNGG
ADLSADISTSTYTVTDPMTIAGDGVFIYQDADNNPFFIFGLNNTSSTNIDGTNWGTVASP
TLTNSMIPDGFGSQNSLTNGTDAVGITGGASQTDNVQYTGATTSASRATWLSRFADVANW
SGDNTGTITTSIGTSNGSAVTMTPPVPTVTDARISISGATGTGGAYKIGDTVTATWNNTA
GGDNNTGITGVTVDFSQFGGGAAVVASDSSNTWTATYTITAGAVDSTNRNVSVTATNAAG
STTTADTTNATADNVAPTVTDGRISISGASGTGGAFKIGDTVTATWNNTAGGDNNSDTIS
SVTVNFTQFGGGAAVAASNSSGTWTATYTVVAGAIDNTNRNVTVTATDNAGNTTSTSDTS
NATVDNIAPSVTSITPAGGAVSSDTSVDFIVDFSESVSNVSTDDFTRVVTGSAAGTIASV
SAASGDPITVTVGGISGSGTLKVNLNGSTNIVDDAGNSIAAYSSGTTHTVNILTAPDAPT
IGTATAGDGQVDVTFTAPGSNGGSAITTYTATASPGGATGNCAGPAACTITVGSLTNGTA
YTFTVTATNAIGTSTASGASGSATPKANQTITFANPGAQNFGSTPTLSATATSSLTVSFT
SSTTGVCTITSGGALTFVTAGSCTIDADQAGNGATNAAPTVSRTFTVNAIVPGAPTIGTA
TAGDTQADVTFTAPVNTGGTVITGYTVTSNPGGLTGTGGASPITVTGLTNGIAYTFTVTA
TNSAGTGAASAPSNSVTPKAAQTITFANPGTQTYGTAPNLSTLGGGASSTSGLTIAFSSS
TTGVCTITTGGILTFVTAGTCTINANQAGNSIYLPAPQVSRSFTVNPAAPAAPTIGTATA
GDTQASVAFTAPADTGGSSITGYTVTVSPPDVAPVNGASSPIVVNGLTNGQAYTFTVTAD
NVAGTGPASGASNSITPKATQTITFANPGAQNFGATPTFSATSDSGLTPTFTSSTTGVCT
ITGVGAVTFVTAGTCTINADQAGDSSYLAATQVTRSFAVNAVVPGAPTIGTATAGNTQAT
VTFTAPASNGGAAITGYTVTSNPGGITRAATASPFTFTGLTNGTSYTFTVTATNSVGTGA
ASAASNAVTPSLPPNSAPVIAQGGSVSVTMSEDGTPTPFSLSLSATDADSDPLTWSITSV
ALHGGASVSGGSVSYVPTANYHGSDSFVVQVSDGSASATTTVNVTVSPVNDLPVIFGVPT
TSVDQDTAYSFTPTASDLDTGDVLTFSISNKPTWASFNTATGALTGAPAGTDSGKTLGIV
ISVSDGTASASLPAFDIEVISTIDPLQPIVTAPADLELNATGLYTPVTLGELLGGGPNTN
PVEIEQILKTIAKDGVSGNNCCTTVVVGLGETKLLSLSPGRHEIKWRATNAVGVTGEATQ
IVNIKPLVSLSPSQIAIRGSEVSFGVWLNGPSPVYPLTIPWVVDASSTATAAEHSAVSGS
VTFTQAGQVEVVVPVTLANVTGFTDSKLVIALGDGINAGATNKHVIDIRQGNVPPVVSLS
IRQGGVNTSLVTPAGGPVTVTATVTDANKNDTHTFDWSATSGLADTDGNQADASRTFDPA
GLAGSHQLQVNVTDSGGANVQASAYFRVVASLPVLDVNTDTDQDGIGDSLEGTGDTDDNG
IPDYLDNMPSPNILPQQSNTTNAYLIECDPGVRCGLGLFARSGNSGGVQILDQEIGTLDD
LVIDPAFEPVGGVFDFAIRDLPTPGQSVRVVIPQRVAIPANAVYRKYQRGRWVTFISDAD
NAVHSAAGSPGYCPPPGSADWTSGLTAGHMCVQLTIEDGGPNDDDGLVNSAVVDPGAVSE
AKVIVPPEPPKPPVQVNSKGSGSVGGVWIALLGGLLMFRRIKHRHWLALVALLASHSQAQ
TAEGFYMRADVFSVESTQEEEDFAGALNDAGHEFSIGKYDTDRTGFQLAVGYEWNSFTYT
QLGYLDLGEVRVDLLLDGDADQGAFATDLADEYPITATGATLVQGLKFGVGEQVKLGFEA
GVYLWDGDVDVNGVPFAIAEDSGTDPLAGVLLDLPLGGNFTLGVGLRRVFFDKQEVNLYS
FGSSYHF
NT seq
7044 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtcgtggactatttccaaaaaaccatcttcagcacgtttatcaagtgagaaatttccg
ttaaaaaaatggaaagccttttctagcttgttactgggaggattgatcgctttcccttgt
tttgctgcagaacggcaagaatttatctacgtcgattcacatgtgcaggactaccagaaa
tttattaatgagctgcctgattcatccagtgtggtggttcttgatccggcgagaaatggt
attgcgcagatagcagaacacctctccggttatcgcggtaatgttgatgccattcattta
gtttcacacggaaaggcgggtgctgtgcaggctggtgatatctggttgtcagcggaaaat
gttcaggctaaccatcgcagcctagccagaattggccacgcacttggcccgaacggcgat
ttccttatctatggttgccaaacggcggcgggcgctcgcggtgattccctgatgaatcaa
ttggcgtcattgaccggtgcagaccttacagcgtctacgaattttacgggcagtgcctcc
aaggggggggactgggcactggaatctcaaactggcgccattgaggcacaggtattagct
agcgctgactataaccatgttttggcaacactgagtgccggtgacatggttgtcgtcgga
tggagcgccctgaacgacaccatcacctttgcatccctggttgacatacctgcgggaacc
gtaatcaaaattactgacaaaggctgggaccaagctaccggcgcctttacgacgagtact
acaggtgatggagttattacttggacaaccagtagttctatcagtgcaggtgatttgttc
actctctatttagggggatcggacgcggctacgacattgacggatgtgaccaatggcggc
gcagatcttagtgccgatatttccaccagcacctatacagtcacagaccctatgactatt
gcaggcgatggagtttttatttaccaggatgcagacaataaccccttttttattttcgga
ttaaacaatacctcaagcaccaatattgatggtaccaactggggaacagttgcctcaccg
accttaactaattcaatgattcccgatggttttggcagccaaaactctttaaccaatggc
accgatgccgttggcataacaggtggagcatcgcaaaccgacaatgtgcaatacacaggt
gcgaccacctcagccagccgagccacatggttgtcgcgcttcgccgatgtcgccaattgg
agcggggacaataccggaacaatcaccaccagcattggtaccagtaatggtagtgcggta
accatgactccgcctgtaccgacagtgaccgatgcccgcataagtatttccggcgctacc
ggtaccggtggcgcttataaaattggcgataccgttaccgcaacctggaacaacaccgcc
ggtggtgataacaataccggcattaccggggttacggtagatttctcccaatttgggggc
ggtgctgctgttgtggcatccgatagcagcaatacctggaccgcgacttacacaattacc
gccggtgctgttgattccactaaccgaaatgtcagtgtgacagccaccaacgccgctggt
agtacgacgaccgccgatactactaacgccacggctgacaatgtagcgcccacggttacc
gatggtcgtatcagcatttccggcgcttccggaacaggtggggcttttaaaattggcgat
actgtcaccgcgacctggaacaatactgccgggggggataacaacagcgataccatcagc
tcagtcactgttaatttcacccaatttggtggcggcgctgcagtggcggcatccaatagt
tccggcacttggacggcaacctatacggtagttgccggtgctatagataacaccaaccgc
aatgtgacggtgaccgcaacagataatgcgggcaatacgacatcaacgtcagatacttct
aacgcaactgtcgataacattgcaccaagcgtgaccagcataacgccagcgggcggagct
gtatccagtgataccagcgtggatttcatcgtggatttcagtgagtcggtcagtaatgtc
tccaccgatgatttcacccgcgtagtaaccggatcagcagcaggtaccatcgccagcgta
tcggcagcatctggcgatcctattacggtgacggtaggcgggatttccggaagtggtacg
ctcaaagtcaatttaaatggatctaccaacatagtggacgatgcgggcaatagcattgcc
gcttactccagtggaaccacccacacggtgaatatcctgaccgcgcctgatgcccccacc
attggtacagccaccgctggagatggacaggtagatgtcaccttcaccgccccaggcagt
aacggcggttcggcgattaccacatacactgcaacggctagccctggcggtgctactggc
aactgtgctggcccggcggcttgtacgattacagtaggttcattgactaatggtacggct
tacaccttcaccgtaactgcaactaacgctattggtaccagtacggcctcgggggcttcg
ggttcggcaacgccaaaagctaatcagaccatcacctttgctaatcccggtgcgcaaaac
tttggttcgacgcccacattgagcgcgaccgctacgtccagcttaaccgtcagttttacc
tcctccacaaccggggtttgtaccattacctccggcggcgccttgacctttgttaccgca
ggttcttgtactatcgatgccgaccaggcgggcaatggggcgaccaatgctgcgcctacc
gtcagccgtactttcacggtaaatgcgatagttccgggtgcgccaacgattggcactgca
accgccggcgatacccaggcggatgtgacttttacggcaccggttaacaccggcggcact
gtgattactggctatacagtgacttccaacccgggtggtcttaccggaacagggggagcg
tcgccgattaccgtgaccggattgaccaacggtattgcttataccttcaccgtaacggcg
accaactcggcgggtaccggtgcagcttctgcgccatctaactccgttacgccaaaagcg
gcacaaaccatcacttttgctaacccgggaactcagacttacgggaccgcgccaaacttg
tcgacattgggcggaggtgcgtcatctacgtcgggtttgaccatcgcctttagttcatcc
accacgggtgtttgtaccatcactaccggtgggatactgacctttgtgacggcgggtacc
tgtaccatcaatgcaaatcaagcgggtaattcgatctacctgccagcgcctcaagtaagt
cgctcgtttacggttaacccagctgcacccgctgcgccaactatcggcacggctaccgct
ggtgacacccaggcgagtgtggcatttactgcaccggcggatactggcggctcatccatt
accggctatacagtgactgtcagcccgccggatgtagcgccagtgaacggtgctagctcg
cccatagtggtgaacggattaaccaatggacaggcttacacctttaccgtaacggcggat
aacgtggcgggtaccgggccggcgtcgggagcatccaactcgatcacgcctaaagcgacc
caaacgattaccttcgctaaccctggtgcgcaaaactttggtgcgacaccaacatttagc
gcaacctcagattccggtttgacccctacctttacatcgtcaaccaccggtgtttgtaca
attaccggtgttggcgcagtgacttttgtaacagccggtacctgtacgattaatgcggat
caggccggcgatagcagctatctggcggcaacccaagtgacacgcagctttgctgtcaac
gcggtagttcccggcgcacccacaatcggtactgcaacggctggtaatacccaggccacg
gtaactttcactgcgccggcttctaatggtggagcagcgattaccggttacacggtaacc
tctaacccaggcggcattacccgtgcggcgaccgcatcaccatttacctttaccgggctg
accaatggcaccagctatacctttacggtaacggcaaccaacagcgttggtaccggtgct
gcatcggcagcgtcgaacgccgttactccatccttgcctcccaactctgcgccggtaatt
gcgcagggcggttcggtgagtgtgaccatgagtgaagatggaacaccaacaccatttagc
ctgagcctgagtgcgacagatgcggatagcgacccgttgacctggagcatcaccagtgtt
gccctgcacggcggcgcgagtgtgtccggtggcagtgtgagctatgtgccaacggcaaat
taccatggcagcgacagttttgtggtgcaggtgagtgatggcagtgccagtgcaactacc
acggtgaatgtcaccgttagcccggtgaacgacttaccggtgattttcggtgttcctacc
accagcgtggatcaagacacagcctacagtttcacaccaacggcgagtgatctggacacg
ggtgatgtgttgacctttagcatcagcaataaacccacctgggccagctttaacactgca
actggcgccttgactggagcaccggcgggcacagacagtggtaaaacgctcggtatagtg
attagtgtgagtgacggcaccgctagtgcatcactgccggccttcgatatagaagtcatc
tcgaccatagatccattgcagccaatcgttacagcaccggcagacctggagctaaacgcc
accgggttgtatacccctgttactctcggggaactgctgggtggtgggccaaacactaac
ccggtggagattgagcagattctgaagaccattgctaaagatggtgttagcggaaataac
tgttgtaccaccgtagtggtggggctcggtgaaaccaaactcctgtcgttgtcacccggc
cgccatgaaatcaagtggagggcgactaatgctgtgggggttaccggcgaggccactcag
atcgtcaatatcaaaccgctggtatccctcagtccgtctcagatcgctatccgggggagc
gaggtatcgttcggagtgtggctcaatggcccatcgccagtatacccgctgaccataccc
tgggttgtggatgcctcatccacggcgaccgcggcggagcatagcgcggtgagcggctcc
gtgacctttacccaggcgggtcaagtcgaggtggtggttccggtgacccttgcaaatgta
acgggctttaccgatagcaaactggttatcgctttgggtgacggaattaatgcaggagcg
actaacaagcacgttatcgacatccgccaaggtaatgtgccgccggtggtgagcttgagt
attcgccagggcggagtgaataccagcctggtaactccggcgggtgggcctgtaaccgta
acggcgacagtgactgatgccaacaaaaatgatactcacacctttgattggtctgccact
agtggcttggcagatacggatggtaaccaggccgatgccagcagaacctttgatcctgct
gggctggctggcagccatcaattacaggtcaatgtaactgattcgggtggtgcaaatgtg
caggcatcagcgtacttccgtgttgtggcctcgcttcccgtactggatgtaaatactgat
accgatcaggacggcattggtgacagcctggaaggcactggcgacacagatgacaacggt
atccctgattatctggacaacatgccgtcacccaacatattgccgcaacaaagcaatacc
actaacgcttacctgattgagtgtgatccaggtgttcgttgtggtctggggttgttcgct
cgtagtggtaattccggtggtgtacaaattctggatcaggaaattggaaccttggatgac
ttggtcattgaccctgcctttgagcctgttggaggtgtgtttgacttcgctatccgcgat
ttgcctacaccagggcagtccgtacgcgtagttattccgcagcgcgtcgcgattcctgcc
aatgcggtgtaccgtaagtatcagcgtggtcgctgggtaacatttatctcggacgctgat
aacgctgtgcattctgcagcaggtagccccggatattgtccaccacctggttcggcggat
tggacgtctggtttaacagcaggtcatatgtgtgtgcaattaaccattgaagatggcggc
cctaacgacgacgacggcttggttaactcggcagttgtagaccctggcgctgtgagcgag
gcaaaagttatagtgccgccagaaccacccaaaccgcctgtccaggttaactccaagggc
agcgggagtgttgggggtgtatggattgcgcttttaggaggtttattaatgttcagacgg
attaagcatcgccattggttggcgttggttgcacttcttgctagccatagccaagcgcaa
acggcagaaggtttttacatgcgcgctgacgtgttttcggtagagtctacccaggaggag
gaagatttcgccggtgcgctcaatgatgctggtcatgagtttagtatcggcaaatacgat
actgatcgcaccggctttcagctggcggtcggctacgaatggaacagctttacctacacc
caactcggttatcttgatttgggtgaggtgcgcgtcgacttattgctcgatggcgacgcg
gatcagggggcctttgcgaccgatttggccgacgaataccccatcaccgctaccggagca
accttggtgcaggggttgaagtttggtgttggtgagcaggttaagctcggctttgaagcg
ggggtttacctttgggacggtgatgtagacgttaacggcgttccttttgcaatcgctgaa
gattccggtactgacccactcgccggtgtactgctggatttacccttgggtggtaacttc
actttaggggttggcctgcgtcgtgttttctttgataaacaggaagtaaacctgtattcc
ttcggtagcagctaccacttttaa
DBGET
integrated database retrieval system
