Cellvibrio sp. PSBB006: CBR65_09325
Help
Entry
CBR65_09325 CDS
T04891
Name
(GenBank) hypothetical protein
KO
K02674
type IV pilus assembly protein PilY1
Organism
cell
Cellvibrio sp. PSBB006
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
cell00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02044 Secretion system [BR:
cell02044
]
CBR65_09325
02035 Bacterial motility proteins [BR:
cell02035
]
CBR65_09325
Secretion system [BR:
cell02044
]
Type II secretion system
Pilin secretion/fimbrial assembly protein
CBR65_09325
Bacterial motility proteins [BR:
cell02035
]
Pilus system
Pilus assembly proteins
CBR65_09325
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
T4P_PilY1
PQQ_3
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ARU27612
UniProt:
A0A1Y0FVX1
LinkDB
All DBs
Position
complement(2247610..2251995)
Genome browser
AA seq
1461 aa
AA seq
DB search
MSWQKFFGIVNHKFGLSLMTGLLSIITTHGVMSAPAQDPLFLAQPVRPIMMLNMSRDHQL
FFKLYDDYSDITNATGGVRDGRADTTYIHAYDYYGYFDSAKCYVYNSNQNRFNPTRFADD
DKYCNFSGNTNSGSEWSGNFLNWATMTRMDAVRKILYGGMRSSDGDTADLTVLERAFLPQ
DAHSFAKYYNGTDIDKLTPFDSSNSVTMGADNNNSGITICNTTEPTDRDNLSQEDTGLPR
MRVARGNYSLWASNERWQCRWGTASNDNDPDSSGIKAHTSSPEGSGDNSRRLGSSDFRTR
VRVCVAGLIGDENNENCAAYNGKWKPIGLLQEYGATGLIQFGLMTGSYVNNKSGGVLRKQ
IGVMTDEINANGTFVRPDNDETHYGIIQTLDLLRIYGYRFDDGTYHNGGHGVDSGGSDGC
LWSRSSFNNGHCTNWGNPQSEIFLESLRYLSGQSVSEDFSADDSDRIEGLNTAAWGTPPI
TNDNYCAPLSVIQFNASTSSFDGDELDAEDIGLADVSAATNVVGTAEGINNQSYFIGSNG
TNTDQLCTAKTVANLANASGTCPDAPRLEGSYKIAGLAHYARTTGIPLEGVTRGTGRQKV
RTYGVALAPAVPRVIVKVPGTGGSSGVAEKTVTILPACRNINSTLTTPANCALVDFKIVD
QQFDVEVNDETANTGKLYVNWEDSEQGGDFDQDMWGVIDYVVTNTEVTVTTQVIAQSTGD
PMGFGYVISGTTNDGFHVHSGVNSFTYGESCTTTDGSRCTCRTSGTAGPCNSSHADARHQ
EYTIGTSTAKLLEQPLYYAAKWGGYVDDAATNEQIAAASPETYFFATDPRQLEASLRNAF
ASVADSIGSASAVATNSTRLSEGSFLYQARFNSKDWSGELLAYEFDEQGEVDGQAISTND
TLHSGVINSTTRTVFTYDGAEKVNFEWANLSDTQKNYLQDGGSEELGQSRVNWLRGAVVD
GLRVREKSGNNERLMGDIVNSSPVYLGGTDMRYDRLPGTAGSSYRTFLAAKRERTPHVFV
GANDGMLHALNATNLQETFAYVPAGVYPKLASITKVGYGRGGTGNPHQYLVDGPIAIGDA
YLDGEWKSIIVGTLGAGGKGVFGLDVTNPASPEVLFEINNIPNLGFVTGSPFIVPLKSGD
GIRWAAVFGNGYEAGSSSLFWVDLESGEANAIIASASGSGLSAPELLPNTSGVVVAAYAG
DLNGYMWKFDLSDADSDNWDAVALFRAMTPGQNPQPQPITAPPTLGLNAVKNNSVMVYFG
TGQYAYQSDNTANVPVQSFYAIVDKGEQVTGRESLHQKTIVAANGNRTIANNEVSWSTVD
GWYMDFPTQGERITTKPLLLFDKLIFASLIPSAIPCEFGGSSWIMEVPAVGDKYTSHTIL
DGNVFNQFLILGDLGFGVLNPQDPSQEPGEGGEVGEGEVTSCGSGEFPAKILAVGSNGEL
TSEDGCGSIAMLGRMSWRQLR
NT seq
4386 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagttggcaaaagtttttcggaatcgtcaatcataagttcgggttgtcattgatgacg
ggcctcttatccatcataacaacacatggtgtgatgtctgctcctgcccaagacccgttg
ttcctggcgcaacctgtgcgtccaattatgatgttgaacatgtcacgtgaccatcagtta
ttttttaagctttatgatgactattcggatatcactaatgctacgggtggggtgagagat
ggaagggcggatacaacttatatccacgcctacgactattatggatattttgatagcgcg
aagtgttacgtttataactcgaatcagaatcgcttcaatccgactcgattcgcagatgat
gataagtattgcaatttttcgggcaacaccaattcgggaagcgagtggagtggtaatttt
ttaaactgggcgactatgacacgaatggacgctgtacgaaaaattctatatggcggcatg
agatcatctgatggcgatacggctgacttaactgtgctagagcgagcctttttgccgcag
gatgcccactcatttgcaaaatattataacggcaccgatattgataaattaactccattt
gactcaagtaacagcgtcactatgggtgccgataacaataattcaggtatcactatttgt
aatacaacagagccaacagatcgtgacaatttatcacaggaggacacaggcctgcctcga
atgagagttgcgcgaggcaactattcgttgtgggcaagtaacgaaagatggcaatgccgg
tggggtacagcaagcaatgacaacgacccagattcaagtggtattaaggcgcatacatct
agtccggagggtagtggagataacagtcgacgtctaggcagtagcgacttcagaactcga
gttagggtatgtgtggcgggcttgatcggtgatgaaaataatgaaaattgcgctgcgtat
aatggcaagtggaaacccattgggctcttgcaagaatacggggcgactggcctgattcag
ttcggcttgatgactgggtcttatgtaaataataagtcgggtggtgtgctgcgcaaacaa
attggtgttatgacagacgaaataaatgcgaatggcacttttgttcgtccggacaatgac
gaaacacattatggaataattcaaacattggatttgctgcggatatatggctaccgcttt
gacgatgggacctatcataacggtggtcatggcgttgattcaggcggaagcgatggttgt
ttatggtcccgcagctcatttaataatgggcattgcactaactgggggaatcctcaaagt
gaaattttcttggagtcactgcgatacttatcaggtcaatcggtaagtgaggatttttca
gcggatgattctgatcgtatcgaaggtcttaatacggcagcatggggaacgccgcccatt
acaaatgataactattgtgctccactgagtgttattcaatttaatgcatctaccagttca
tttgatggggatgaactggatgcggaggatatcggtttggcggatgtgtcggcagctacg
aacgttgttggtaccgccgagggaataaataatcagagttactttattggcagtaatggc
accaatacagaccagttatgtacagctaaaactgtcgcaaatttagccaatgcaagtgga
acctgtccggatgcccctcgcctagagggtagttacaaaatagcaggtttggcgcattac
gcgagaactactggcattccgctggagggtgtaacccgaggtacagggcggcaaaaagtg
agaacttatggcgttgcattggcccctgctgtacctcgagtaatcgtcaaagttccaggc
actggtggttcaagtggggtagctgaaaaaactgtcactattttacctgcttgtcgcaat
atcaattcaactttgacaacaccagctaactgcgcattggtggatttcaaaattgtagat
caacagtttgatgttgaagttaatgatgaaacagctaatacaggcaagctatatgttaac
tgggaggatagtgaacagggaggcgacttcgaccaggacatgtggggcgtaattgattac
gtggtaactaacacggaggtaactgttacgacccaggtaattgctcaatctactggcgat
ccaatgggtttcggttatgttatcagcggcacaacaaatgacggcttccatgtgcactcg
ggcgtaaacagctttacctatggtgaaagctgtacaaccacagatggatctcgctgtacc
tgtcgtacatctggcactgctggtccctgcaatagttcacatgctgatgcgcgccatcag
gaatacacgataggaacatctaccgccaagctactggagcaaccgttgtattatgctgcc
aagtggggtggttatgttgatgatgcggcaacaaacgaacaaattgctgcagcttcacca
gaaacatacttttttgcaactgaccccaggcaactggaggcatcactccgtaatgcattt
gcaagcgtcgcagatagcattggttcagcatctgctgttgcgacaaattcaacccggctt
agtgaaggatcgtttttatatcaagctagattcaatagcaaagattggtctggagaatta
ttggcatatgaatttgatgagcagggtgaagtggatggtcaagctataagtacaaatgac
acgttgcattctggtgttattaatagtacgactcgaacagtttttacctatgacggagca
gaaaaagtaaatttcgaatgggctaaccttagtgatacacagaagaactacttacaagat
ggtggctcggaagagcttggtcagtcgagagttaattggctgcgtggcgcggtagtagat
ggtttgcgagtgagggagaagtcgggaaataatgaacgcttgatgggtgatatcgttaat
tcaagccctgtttatttgggcggaacggatatgcgttatgatcggttacctggcacagca
ggttcttcttatagaacgtttttagcagccaaaagagagcggacacctcacgtgtttgtc
ggggcgaacgatggaatgttgcacgcacttaacgccaccaatttacaagagactttcgct
tatgttcccgctggtgtataccccaagcttgccagcattaccaaggtcggatacggtcga
ggcggtacaggtaatccgcaccaatatctcgtcgacgggcctatagcaattggcgatgct
tatttggatggtgagtggaaaagtataatcgttggaacgctcggtgccggtggtaagggt
gtgtttgggttagatgttactaaccccgcctctcctgaggtgctttttgaaattaataac
atacccaacttaggttttgtaaccggtagtcctttcattgtgcctttaaagagcggcgac
ggaattcgatgggccgcagtatttggaaatggctatgaagcgggttcatctagtttattt
tgggtcgacctcgaaagtggtgaagctaacgcgattattgcatctgccagcggcagtgga
ctgtcagctccggagctattgcccaacactagcggtgtggtggttgcagcttatgccggg
gacttaaatgggtatatgtggaaatttgatctttcagatgccgattccgacaactgggat
gcagtagcattgtttcgagctatgacgcctgggcaaaatcctcaaccccaacccataact
gcacctcctacgttagggcttaatgcagtaaagaataactctgtaatggtttattttggt
acgggccagtacgcctaccaaagtgacaatactgctaatgtacccgtacaaagcttttat
gcaatagtcgataaaggcgagcaggttacaggccgtgaaagccttcatcaaaaaactata
gtggctgcgaacggtaatcgcacaatagcaaataatgaggttagctggtctactgttgat
ggttggtatatggactttcctacacaaggggagcgcattactaccaaacctttactgctt
ttcgataaattaatctttgcctcgttgatcccttcagctataccttgtgaatttggtggt
agtagctggattatggaagtgcctgcggtgggtgataaatatacgagtcacacaattctc
gacgggaatgtttttaatcagttcctgattcttggagatttaggcttcggtgttcttaat
ccacaagatccgtcccaagagcctggcgaaggtggagaagtcggagaaggagaagtaaca
tcatgtgggtcaggagagttcccggcgaagattttagcggtaggctcaaacggggagctt
actagtgaagatggttgtggaagtatagcaatgctgggccgtatgtcttggcgacaacta
cgttaa
DBGET
integrated database retrieval system