Cyanobacterium endosymbiont of Epithemia turgida: ETSB_0570
Help
Entry
ETSB_0570 CDS
T03622
Name
(GenBank) hypothetical protein
KO
K09800
translocation and assembly module TamB
Organism
ceo
Cyanobacterium endosymbiont of Epithemia turgida
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ceo00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
ceo02000
]
ETSB_0570
Transporters [BR:
ceo02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
ETSB_0570
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TamB
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BAP17411
UniProt:
A0A077JEU8
LinkDB
All DBs
Position
857482..863415
Genome browser
AA seq
1977 aa
AA seq
DB search
MSQSPLPPDSTSNYLIRLLKIAKNPYSVAIGFASVTIIIIGYTGLCLFLQKYLPPWLEKQ
VSYLINRPVDIDELQGFSLTRLYLGSTSVPQTSKHPNQLTASRVVVHFDPVAVLFKRTLV
IKVVPEDVKVELHQYSEGDLLRGEITDEIIPLKLDLTFDVTNVAINVFPRSTNNLLVTTI
NGQVKYSEVTKAKWDYDLDLALLGSKIFLEGTTVIDTKESLVKLAVSKFDFSRLMPLIIN
SPIQLDQGNIEADLNFNFPSLERLSETKAKGEVSLDNIKGKIKSFQEPFQIAANFIFLKN
KIVIKKTQVNLGNITTSLSGQYDWTTGFNLEANISGLSGKNIWQISQIKLPIKVKGELQA
KLNLIGTFNAPLLSGKIKNKQIIEIAQTKLKNITIDFQSNLDNFLLKDLLIIPEVGGWIT
AQGIAKPKIIQSLINGKPIDWNDILFELVFNTELPGKKLVNDYYKLPREVKLNPLKIQGN
ITGNFANPKGLIEWNTAGRLNRTNTQIISKGNILIDKNNVYIKNIELATQRGRLSINGSV
NLESKKWQAYLNSTLLDLTPFTSTICSVKLIKCPDNIFLKTAKVKIRGNLNEPWKKSVDL
SSNLALVLDDGNLIINSQLQQAKFTTSVTGLEIPFNLLLSNIFIPVTLRKYQLNLSGNIE
EILQESTIDVNAIKSDSNLEVEIAKSPLNVQVTWQNGFFKGNAELRSLSLNQFVPQLAIP
VQLINSKINFLGSLQSLLSLSKTPNFNDFQVNADMQFKLADGTITAISKLNQEQITVNAI
AIPLSVPNLLPQFFIPIKVKKININLIANLPDLLAFDLNTVQGSGQLELGVAKKEITTSI
KLINNKWQANIIANQLSLSSWKNQLSTKTIIEPVDAEINLSGTLESLLSSDSIIPIEANN
ISIKIGQQNIKANGNLILTNLFNSPDITSINLNVETQADLKFLPITKFLSKIPIYKQLLP
QAINLAGKVKFKGNIVGKNLLTSSIFDGNLKIKGNLILSNFAFNKLNFESILKGEINLVT
GKKISLDLRGKKDVITAIFTSCSQQNCLLPYIPHFFEISQKYENLSPITIKGNLKGDRLV
ANIQNFPLEELKLFPISDYGLTDCLGGKVNLDLEIDSLTLTGRGKLDIINPNLGEVFGDN
LQINWVYQNDYITLTNTTLKLGQSSYNIGGEIALKTGEIQGNLRVDKGYVQELLNILKIS
DFDSILRFIQFKKDFLTHFKQVIPQPVGNINTLLSEQVNQLWENDQKISKIAIEKQGSKL
PRELDIQGEFNGEISLSGTLEAPKITFQFEGENWEWISQLPTSSIINPLGFVLEDSPVIS
LEKLAIKGNLENGIININPMIKLNESLIQANLNLTYDNNQFDLQPSTFSLNNLTLETVRN
LIAIPGDINGSIDIAGNLTGSLIKPEINGIFSLEKVVINARLLRQSFQGNFTYSNAQLEL
QIDKPDFIQAYAHLPLPIKINNDNRFKINVLLGTEAFSLLEILTQEQVSWVEGKGKIDID
LSGKITVNNEVKVSFDPNSQSILDFNSIIFKSYLLPDTLTLNGKIAIQNRKIEINELIGK
IGEITVNTTGVLPLFYSSLEDTDSAIPLSVTLNTNKINSNNLYQGITNALINIKGTVFSP
VIEGEIQLNQGKFIVPNFIFNFSKKTESLILEQWIRRISYLEEVVILPKFNDFRVSIKEV
AVEQKNISPKFVFNVSGNLSLSGQLTSFSLPGLLALKPSGKVYINSGKVDIPVTRVFIPR
QSNNTITFLPQKGLLNPYIDLEFKLYILNIALRAINLNEVADDIVQSGRSQSVEITLGIK
GDANQLLPNLGAKLEEVCKLRLDHYRPIPQTSAIDPNKLRQLANCIKINNLGTNSIQDLL
QSPIVSFSSSPRLSRSEFLTLLGTQLPNLVEQLQQQNSAQLVEAGLPQVAVVLFPFLQDW
LFDLNETTNQVGKEWDIGNLRLYPVLEKVYELEDNSLIRFSYDYSFNEVIIRYENKF
NT seq
5934 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagtcaatcgcctcttcctcctgattctacgtcaaactatttgattcgtctgctaaaa
atagctaaaaacccgtatagtgtcgcgatcggatttgcttctgtaaccattattatcatt
ggctacacggggttatgtctttttcttcaaaaatatcttcctccttggttagaaaaacaa
gttagttacttgattaatcgtcctgttgatattgatgaacttcaaggtttttctctaact
cgtctttatctaggatctacttctgtaccacaaacttctaagcatcctaatcaacttacg
gctagtcgtgttgttgttcattttgatcccgttgctgttttattcaaacgaactttagtg
attaaagttgtacctgaagatgttaaagttgagttacatcagtattctgaaggagattta
cttaggggagagataacagatgaaattattcctttaaagttagaccttacttttgatgtt
acaaatgttgcaatcaatgtctttcctcgaagtacaaataatcttctcgtaacaactatc
aatggacaagtaaagtatagtgaagttacgaaagcaaagtgggattatgatcttgattta
gccttgctcggtagtaaaatttttctcgaagggacaacagttattgatactaaagaaagt
ttagtaaagttagctgtttctaagtttgattttagcagattaatgcctcttattattaat
tctcctattcaattagatcaaggaaatatcgaagcagatctcaattttaattttccttct
cttgaaagattatctgaaactaaagctaaaggtgaagttagcttagataatattaaggga
aaaattaaatcttttcaagaaccttttcaaatagctgctaattttatttttttaaaaaat
aaaattgtgattaaaaaaactcaggtcaatctaggcaatattactactagtttatccggt
caatatgattggactactggatttaatttagaagctaatattagtggtttaagcgggaaa
aatatttggcaaatatcccaaattaaattacccataaaagttaagggagaattacaagct
aaattgaatttaataggaacatttaatgctcctttgctaagtggaaaaataaaaaataaa
caaataatagaaatagctcaaactaaacttaagaatattactattgattttcaaagcaat
ttggataattttttattaaaagatttattaattatccctgaagtcggggggtggattact
gcccaaggtatagctaaacctaaaattattcaatctcttattaatggtaagccaattgat
tggaacgatattctttttgaattagttttcaatactgaactaccaggtaaaaaattagtt
aatgactattataaattgccaagagaagtaaaattaaatcccttaaaaatacaagggaat
ataactgggaattttgccaatcccaaaggtttaatagaatggaatacagctggacgtttg
aacagaaccaatactcaaattatcagtaaaggtaatattttaatagacaagaataatgta
tatattaaaaatatagaactagcaacccaaagagggagattaagtataaatggtagtgta
aatcttgaaagtaaaaaatggcaagcttacttaaattctactcttctagatttaactcca
tttacttcaaccatttgtagcgtaaaattaataaaatgtcctgataatatttttctaaaa
actgccaaagttaaaatacgaggtaatcttaatgaaccttggaaaaaatcggttgattta
tcatctaatttagccttagtattagacgacggtaatcttattattaatagtcagttacaa
caagctaaatttacgacatcagtaacgggattagaaatacctttcaatttattattatct
aatatttttatcccagttacattaagaaaatatcaattaaatttatcaggaaatatagaa
gaaattttacaggaatcaaccattgatgttaatgcgattaaaagtgattctaatttagaa
gtagaaatagctaaaagtcctctgaatgtccaagtgacctggcagaatggattttttaaa
ggaaacgctgagctgagatctttatccctcaatcaatttgtccctcagctagctattcct
gttcaattgattaacagtaagattaacttcctaggtagtctacaatcgctattatctttg
agtaaaactcccaactttaatgactttcaagtaaatgctgacatgcagtttaagctcgct
gatggaactattacagctattagtaaattaaaccaagaacaaataactgttaatgcgata
gctatccctctatcagttcctaatcttttaccacaattttttattcctatcaaagttaaa
aaaataaatattaacttaatagctaatttacctgatttactagcttttgatttaaataca
gtgcagggtagtggtcagctcgaactcggagttgctaaaaaagaaattaccacatcaatt
aaattaattaataataaatggcaagccaatattattgctaatcaactaagtttatcaagc
tggaaaaatcaattatcaacgaaaacaataattgaaccagttgatgcagaaataaactta
tcaggaactttagaatcgttattatcatctgactctataattcctattgaagctaataat
atatcaataaaaataggacaacaaaatataaaagctaatggaaatttaatactaactaat
cttttcaacagtcctgatattacttctatcaatttaaatgttgaaacccaagctgattta
aaatttttacctattacaaaatttttatctaaaattcctatttataaacagcttttaccc
caagccattaatttagcaggaaaagtaaaatttaaaggtaatatagttggaaaaaattta
ttaacttcttctatatttgatggcaatttaaaaataaaaggaaacttaattttatcaaat
tttgcctttaataaattaaattttgaatcaatcttaaagggagaaattaatttagtaact
ggaaaaaagatttcccttgatttacgaggaaaaaaagatgttattactgccatttttact
tcctgttcgcaacaaaactgtttgctcccttatataccacatttctttgaaatcagccaa
aaatacgaaaatttatctccaatcactatcaaaggaaatcttaaaggtgatcgcttagtt
gctaacattcaaaacttccccttagaagaattaaaattgttcccaattagtgattatggt
ttaactgattgtttagggggtaaagttaatcttgatttagaaattgattcattaacttta
acaggtagaggaaagttggatattattaatcctaacttaggtgaagtttttggagataac
ttacaaattaattgggtttatcagaatgactatataactttaacaaataccactttaaaa
ttaggacagagtagttataatattgggggagagatcgcattaaaaacaggagaaattcaa
ggaaatttacgagtagataaaggttatgttcaagaacttttaaatatactaaaaatttct
gattttgacagtattttacgatttatacaatttaaaaaagattttttaacacattttaaa
caagtaattcctcaaccagttggcaatattaatacgctactttcagagcaggtcaatcag
ttgtgggaaaatgatcaaaaaatcagtaaaattgctattgagaaacaaggtagcaaatta
ccacgagaattagatattcaaggtgaatttaatggagaaatttccttatcaggaactctt
gaagctccaaaaataacctttcaatttgaaggagaaaattgggaatggatatctcaacta
ccaacttcctctatcattaatcccttagggtttgttctcgaagattctccagtaatttct
ctcgaaaagttagcaatcaaaggaaatctagaaaatggaattattaacataaatccaatg
attaaacttaatgaaagtttaattcaagctaatcttaacttaacttatgacaacaatcag
tttgacttacaaccttcaactttcagtcttaacaatctaactttagaaacagtacgtaac
ttaatagctattcctggggatattaatggtagtattgatatagcaggaaacctcactgga
agtttaatcaaaccagaaattaatgggatattttctttagaaaaagtagttattaatgct
cgattacttagacaaagttttcaaggtaattttacttatagtaatgcacaattagaacta
caaatagataagccagattttattcaagcttatgctcatcttcccttacctattaagatc
aataatgacaatcgatttaaaattaatgttctactaggaactgaagcattttctctatta
gaaattttaactcaagaacaagtaagttgggttgaagggaagggaaaaatagatattgat
ctgagtggtaaaattactgttaacaatgaagtaaaagtcagttttgatcctaatagtcag
tcaattttagattttaactcaataatatttaaaagttatttattgccagacactttaact
ctgaatggaaaaatagctatacaaaatagaaaaatagaaataaatgaattgataggtaaa
attggagaaataactgttaatactaccggagtactaccattgttttattcatcgcttgag
gatactgatagtgccattcctttaagcgttactttaaacacaaataagatcaactctaat
aatttataccaaggaattactaatgccttaataaacattaagggaacagtttttagccct
gtcattgaaggagaaatacagttaaatcaaggtaagtttatagttcctaattttattttt
aatttttctaaaaaaacagaatcactaattttagaacagtggataagaagaattagttac
ctggaagaagttgttattcttccaaaatttaatgactttagagtttcaattaaagaagtg
gcagttgagcagaaaaatattagccccaagtttgttttcaacgttagtggaaatttaagt
ttaagcggtcaattaactagtttttctttgcccggattacttgctttaaaaccgtcagga
aaagtttacatcaatagtggaaaagtggatattcctgttactcgtgtttttatccctcgt
caatctaataatactatcacctttttaccacagaaagggttattgaatccttatattgat
ctagaatttaaactttatatattgaatattgctttaagggcaattaatcttaatgaagta
gctgatgatattgtccaaagtggtcgttcccaatcagtagaaattaccctaggaataaaa
ggagatgccaaccaattacttcctaatcttggtgccaaattagaagaagtttgtaaacta
cggctagatcattatcgtcctattccccaaacttcagcaattgatcctaataaattaaga
caattagctaactgtatcaagatcaataatttaggaaccaattcaattcaagacttactc
caatctcccattgtttctttttctagtagtcctcgtttaagtaggagtgagtttctaacg
cttttggggacacaacttcctaatttagtcgaacaattacaacaacaaaattcagcccaa
ttagtggaagcaggactacctcaagtggcagtggtcttgtttcccttcttacaagattgg
ctttttgaccttaatgaaacaacgaatcaagtgggaaaagaatgggacataggaaatttg
cgcttatatccagtcttagaaaaagtttatgaacttgaagataattcactgattcgtttt
tcctatgattattcatttaatgaggtaatcatccgttatgagaataaattttaa
DBGET
integrated database retrieval system
