Cutibacterium equinum: O6R08_09915
Help
Entry
O6R08_09915 CDS
T09514
Name
(GenBank) polymorphic toxin-type HINT domain-containing protein
Organism
cequ
Cutibacterium equinum
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RHS_repeat
PT-HINT
DUF6531
Intein_splicing
Hom_end_hint
AXH
Tox-REase-5
Vint
Hint
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WCC79770
LinkDB
All DBs
Position
complement(2171862..2177717)
Genome browser
AA seq
1951 aa
AA seq
DB search
MANSDDYDLDKLSGMSPVAYDFGVASETRSVLRAAASALRGQRGARAAARNKGSEGFEGY
YAELFEANGTQQLNDLDEIASNLDDAATKIDTLDQAARDENKRRADAAAWAQRRKDRGDF
AQFFTDVLHTDDMPEPNFSEKLDGPTAWAPATPPPPRKALEGQRSAYGTSAGNTDNLQSF
SRQTASLNDSMLPHPGKVDAALAAFARSCSWVTFDASSVAAALTAWNKANVDEITWADRV
RELFVNAGGTGMAVPNSALDAALQASGISSSRDDIVVDPPTAMGGQPTSGFADDPVNAAT
GNFVEPQVDLGFTGGSATLEWGRVYNSMSQVCGAFGPGWSSLAESRLVVTDESARWVQAD
GRHIVFGRMGEGWGRAQCENLWLEQPTGMGGVAFLIRDNDGGSFAFSQAGRPVFQDRGLG
SRVAFTYSEDRLVRLEHEFGRAVELVWSQDGRRVVEALASDGRRVGYVYDEQERLVESTG
DTATHRYEWNEQGLMRRVVDADGVVEVDNTYDGQGRVVTQRSPHGRLSRYSYLGGRVTVV
CDEDGARANTYVHDGKGRLVGVVDAEDHRQSASWDRFGNQVMVTDREGRTVVRSFDTRGH
VIAEQTVSGARIEQDFDEQDRLIEVRVINDDQVSVTEMVYQGDNRNPARIVDPVGGVTVL
EWDGSLLTKVVDPTGVTLTMGYDAHGDLVSTTNAAGHTARLERDEQGRVVAAITPLGHTT
RYRYDERGMCVERIDPDGAVWRFEYSAGGRLLATVDPLGGRVEVERDEAGEESATIDELG
RRVERRVDDLGNLTRVELPDGSAWQFSYDAMSRMQSMKDASGGVWQFSYDAEGTLKATTD
ATGGVRRYETNQMALPTAYLDDGKREEAVYDRLGRMVCHINADATSTKTRYDLAGLPVEI
IDEAGGVTSIERDLAGRPVAVTQPMGQTFRYEYDECGRWAATISTGGDRYEMIYDADGRI
EGEVWPTGERVTTTFDECGRAVARREPGRGLTRLKYDKLGRVVWSQDSWYGTRRFRYDAA
GQMSEVVNAAGGVTHFAYDELGRIGEVTDPMGGVTRHTYDPMGRLLTSTDPLGRVTRYSY
DAAGRVTRRVDGAGASMSWVYDSAGRQVEEWVNDTLLAATTRDFVGRTTTIVEGDARHEL
RFDVRGNLLWRGRGDQGVRWEYDQNSRRTCMIRPNGQSTSYEYDANNRVSAFIQEGLGRV
VIDRDSLGRIVSVFTDGLYASWEYADGAVVRQRVERNGFISESVITRDENGRVVADKTDG
ITTFYSYDQTGQLVRAQTSEGLVTTWEYDANGRMVIEDAAGTVSRFTYDAASQLVSVTNP
DGTTTYAYDDAGRRVREQGPAGERRFTWDPRGFLDSITQINHDGDKVAAQTQRLWVDALG
ELARVDQDSVWWDSSSFMPTLVQYGARSVVTEAGITGMVDGPDASWLPPQWSARDHGGNP
MDPWAVATNVGVSAQGSLLVQGMEWMQARVYDPATRGFLSTDPLPGVAGAGWSGNPYAFA
GNDPVNFSDPLGLRPLTDEDLKGYRDAARSPLAKAADAAGGWLKNNWEYVAGGAMVAAGG
VLMATGVGGPLGGVLLGAGIDTIAQKATTGSVTWGEVAVSGAAGLVGGGLGAAAGKWAAG
KAATCLGKNVVSGLTEGAIDGGIGQAGAYWAGPGPHTLRGGLKAVAVGAAGGGLVGGGAG
ALSTVTDVSRHGCFVAGTQVLMADGTSKNIEDVVAGDMVAAYNPETGHTEPGEVTDTYIH
DQVATWQVTTESGTVTTTAVHPFYVDGKGWVEAQDLRAGDQLYDETGNLVTVVSIQATGQ
IATVYNFTVKDLHNYYVADDSSWILAHNGTATGCGLGGPGEWGPSKNHGSANARAYELQI
TGRPEGYYVNGVEFDGYQNGELLDAKGLGYEKLLTADWSRARGPLVKTARRQLEAAGSTP
IHWIFAEEEAARAARKIIPEEIKISHVPFLR
NT seq
5856 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggccaattccgacgactacgatctcgacaagttgtccggcatgtcgcccgtcgcctat
gactttggcgtcgcgtctgagactcgctcggtgctgcgtgctgccgcatcggcgctccgc
ggccagcggggggcacgggcagctgcgcgtaacaagggttctgagggcttcgaagggtat
tacgcagaacttttcgaggccaacgggacccagcagttgaatgacctcgacgagatcgct
agcaacctcgacgatgcggctactaaaatcgataccctagatcaggcggcccgcgacgaa
aacaagcgccgtgccgacgccgccgcttgggcgcagcgtcgcaaggaccgaggcgacttt
gcccagttcttcactgatgttctccacactgacgacatgcctgagcctaacttctctgag
aagctggacggtccaacggcctgggcgccggctacgccgccgccgccgcgaaaggcgctt
gagggtcaacgtagtgcatatgggacatctgcgggtaacaccgacaatttgcagtccttt
agcaggcagactgccagcctgaatgactcgatgcttccccacccggggaaggtagatgcg
gcgctggccgcctttgcacgatcctgctcgtgggtgacttttgatgcttctagtgtcgcc
gccgctcttaccgcgtggaacaaggcgaacgttgacgagatcacgtgggccgacagggtg
cgcgagctttttgtgaatgctggcggcacgggcatggcggtgcccaatagtgcgctggat
gcggctctgcaggctagcggcatctcgtcgtctcgcgacgacatcgtcgtcgatcctccc
accgctatgggtggccagccgacgtcggggtttgctgatgatccggttaatgcggcgacg
gggaattttgttgagccgcaggtggatttgggtttcactggtgggtcggcgacccttgag
tggggccgtgtgtataactctatgtcgcaggtgtgtggggcttttggtcctggctggtcg
agcctggctgagtctcgcttggtggttacggacgagtcggcgcgttgggtccaggctgac
gggcgtcatatcgtgtttggtcgcatgggtgagggctgggggcgcgcccagtgtgagaat
ttgtggcttgagcagccgactggcatgggcggcgtggctttccttatccgtgacaatgat
ggcgggagtttcgcgttcagtcaggcgggtcggccggtcttccaggatcggggtcttggc
tcgcgtgttgccttcacttattccgaggatcgcctcgttcgcctggagcatgagttcggt
cgggcagtcgaactggtgtggagccaggatggtcgccgcgttgtcgaggcattggccagt
gatggtcgccgggtcggctatgtctacgatgagcaggaacggctggttgagtccactggt
gataccgctacgcatcggtacgagtggaacgaacaaggcttgatgcgccgtgtcgttgat
gctgatggtgtggtcgaggtggacaacacctatgacgggcagggccgtgttgtcactcag
cgttccccacatggtcgcctctcgcgctactcctatttggggggccgggtgactgtggtc
tgtgacgaggacggtgcgcgcgctaacacctatgtccacgatggtaagggtcgcctggtc
ggcgtcgttgacgctgaggatcaccgccagtcggcgtcgtgggatcgctttggtaatcag
gtcatggtcactgaccgtgagggtcgtaccgtggtgcgtagttttgacactcggggacat
gtcatcgctgagcagaccgtgtcgggtgcccgcatcgaacaggactttgacgagcaggac
cgcctcatcgaggtccgcgtcatcaacgacgatcaggtttcggtgaccgagatggtctat
cagggcgataaccggaacccggcgcgtatcgttgacccggtcggcggggtcacggtgctg
gaatgggacggttcgctgctgaccaaggttgttgatcccaccggtgtgaccttgacgatg
ggctacgacgcccacggtgacctggtctctactacgaatgctgcgggtcacaccgcacgg
ttggagcgcgacgaacagggccgggtcgtggcggcgatcacgccgctggggcataccacc
cgttaccgctacgacgagcgcggcatgtgcgtcgagcgcatcgaccccgacggcgcggtg
tggcgtttcgaatattccgctggtggccggctgttggcgacggtcgatccgctgggtggg
cgtgtggaggttgagcgtgacgaggctggcgaggagtcggccacgatcgacgagctggga
cggcgagtggagcgtcgggttgacgatctgggtaacttgaccagggtcgagttgccggat
ggttcggcctggcagttctcctacgacgcgatgtcgcggatgcagtccatgaaggatgct
tctggtggggtgtggcagttctcctacgacgctgagggcacgttgaaggccaccaccgat
gccactggcggtgtgcggcgctatgaaactaaccagatggccctgccgaccgcctacctt
gatgacggcaagcgcgaagaggcggtctatgatcgtctcgggcgcatggtctgccatatc
aacgccgatgccacgtccactaagacccgctacgacctggcgggtctacctgtcgagatc
attgacgaggcgggcggtgtcacctcgattgagcgtgaccttgccggtcgtcctgtagcc
gtcacccagccgatgggccagactttccgttacgagtacgacgagtgtggtcgctgggct
gcgacgatctcgactggcggtgaccgctacgagatgatctacgacgccgacggtcgtatc
gagggtgaggtctggccgactggtgagcgcgtcacgacaaccttcgacgagtgtggtcgt
gcggtggcgcgtcgggagccagggcgcggcttgacgcggttgaagtacgacaagctgggc
cgggtcgtgtggtcgcaggattcctggtacggcacgcgtcgcttccgctacgacgcggcg
ggccagatgagtgaggttgttaacgccgccggtggtgtgacccacttcgcctacgatgag
ctgggccgcatcggcgaggtcaccgatccgatgggcggggtgacccggcacacctacgat
ccgatgggtcgtctgctgaccagcaccgatccgctggggcgggtcacgcggtactcctac
gatgcggctggccgcgtcactcggcgtgttgatggtgcgggggcgtcgatgtcgtgggtc
tacgattcggctggtcgccaggtcgaggagtgggtcaatgacacgctgctggctgccacc
acccgtgatttcgtcggtcgtacgacgacgatcgtggagggtgatgcccgccacgagttg
cgcttcgatgtccgcggtaacctgctgtggcgtggtcgcggcgaccagggggtgcgctgg
gagtatgaccagaatagtcgtcgtacctgcatgatccgcccgaatgggcagtccacgtcg
tacgagtatgatgcgaacaatcgggtcagcgccttcatccaggagggtctgggtcgggtg
gtcatcgaccgtgattcgctgggacgcatcgtcagcgtcttcactgatgggctgtatgcc
tcatgggagtacgccgacggtgccgtggtgcgccagcgggtcgagcgcaacggcttcatc
agcgagtcggtgatcacccgtgacgagaacggtcgggtcgtggcagacaagactgacggc
atcacgactttctactcctacgaccagaccggtcagctggttcgggcccagaccagcgag
ggcttggtcaccacgtgggagtatgacgctaacggccggatggtgatcgaggatgcggct
gggacggtgtcgcggttcacctatgatgccgcctcgcagctggtgtcggtgaccaatcct
gacggcacgaccacctacgcttatgacgatgccggtcgtcgtgtgcgcgagcaggggccg
gcaggtgagcgtcgtttcacgtgggatccgcgtggcttcctggattcgatcacgcagatc
aaccatgacggcgacaaggtcgccgcgcagacacagcggctgtgggttgacgcgctgggt
gagcttgctcgcgtcgatcaggacagcgtgtggtgggactcgtcgtcgttcatgccgacg
ctggtccagtacggggcgcgctcggtggttaccgaggctggtatcactggcatggtcgat
ggccctgacgcctcgtggcttccgccgcagtggtcggcgcgtgaccacggcggcaacccg
atggatccgtgggcggtcgcgacgaacgtgggtgtgtcggctcaggggtcgttgctggtc
cagggcatggagtggatgcaggcgcgtgtctatgatccggccacgcgtgggtttttgtcg
actgatccgttgccgggtgtggctggtgctggctggtcgggtaatccgtatgcgtttgcc
ggtaatgatccggttaatttttctgacccgttagggcttcgcccgctcactgatgaagat
cttaagggttatcgcgatgcggcccggtctccgttggccaaggctgccgatgctgctggt
ggctggttgaagaacaactgggaatacgtcgctggtggcgcgatggttgctgccggtggt
gtgctcatggccacgggtgtgggcgggccactgggcggtgtcttgctgggtgctggtatc
gacacgatcgcgcagaaagctaccacggggtctgtcacgtggggcgaggttgcggtctcg
ggtgctgccggcctggtcggtggcgggttgggggctgcagctggcaagtgggccgccggt
aaggcggcgacgtgtctgggtaagaacgtggtttctggtctgacggaaggtgctatcgac
ggtggtatcggccaggctggggcctactgggccggccctggcccccataccctgcgtggc
ggtttgaaggctgtggcggtcggtgctgctggtgggggcctggtgggtggtggcgcgggt
gccctgtccacggtgaccgatgtgtcccggcacggctgtttcgtggccggtacccaggtg
ttgatggctgatggcacctcgaagaacatcgaagatgttgttgccggtgacatggtcgcc
gcgtacaacccggaaacgggccacaccgagcccggtgaggtcactgacacctacattcat
gaccaggtcgcgacctggcaggtgacgactgagtcgggcacggtgaccaccaccgccgtg
cacccgttctacgtcgatggtaagggctgggtcgaggcccaggacctacgagccggcgac
cagctctacgacgagactggtaatctcgtcaccgtcgtgtcgatccaggccaccggccag
atcgccacggtctacaacttcacagtcaaagacctacacaactactacgtagccgacgac
agcagctggatcctagcacacaacggaaccgctaccggttgtggtctcggtgggcctggg
gagtgggggccatcgaagaatcacggcagtgcgaatgctcgagcctatgagttgcagatc
acgggtcggcctgaaggctattatgtcaatggtgtcgagtttgacggttaccaaaatgga
gaactccttgatgccaaggggctcggatatgagaaattactaaccgcggactggagtagg
gctcgtggcccgctcgtgaaaacggcccgccgtcagctagaggcggcggggtcaacgccc
atccattggatatttgccgaagaagaggctgctcgggcggcgcgtaagatcattcctgag
gagattaagatcagtcatgtcccttttcttcggtag
DBGET
integrated database retrieval system