Cyanobacterium endosymbiont of Rhopalodia gibberula: RGRSB_0144
Help
Entry
RGRSB_0144 CDS
T05747
Name
(GenBank) Non-specific serine/threonine protein kinase
Organism
cer
Cyanobacterium endosymbiont of Rhopalodia gibberula
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SNF2-rel_dom
DUF3670
Helicase_C
ResIII
DEAD
ERCC3_RAD25_C
Ribosomal_L27e
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BBA78765
LinkDB
All DBs
Position
231404..234568
Genome browser
AA seq
1054 aa
AA seq
DB search
MPTLHGSWINKLDESFLFIWGETWRSNYPDRALNKSVNLHLFLLNKLELIDLLKSKNLEF
SPKIEETWTSQIINLPSTTIQSKNIDVPYLSSQLESSDFNISKNSLFLKNWKIQGFCLKD
IEIINFFRQLPLGFSDNHENYLGEDLKFWSHIYRWSLDLLTRGKFLPGLTSLKEKNPQSQ
WYLILDSTIDQTRLSKFSKLMPIGCLAYLKGTESEVDIKTNFLESQQLILDFLRNIINIY
IRSFSQSSSLLNQDLLIQRWLKSLTEIDPSFTAYQNTLKRLENALYNWSLSIQEYLVTST
NITLGVNQFRVCFYLESPNSKAINLADTYWNLKYYLQALDDKEILVDSQTIWENPVEQLS
WGERTIEKPQETLLKGLGLASRLYSPIAESLQESQPLCCKLNPIQVYEFIKSSATILEDN
GLGVILPSSLAREKEETRLGISIEAEVKSKKDERLSLQSLLNYKLQLVIGRQIISQKEFE
RLLYQKSPLVEINGEWITLQPSDIQAVKTVFNDSCNQLKFSVEDALRLSIGDNKMIAKLP
VINFKTSGVLQKLINNFTNNQSIEIINNPPGFEGELRPYQKRGVSWLVFLEQWGLGACLA
DDMGLGKTPQLLAFLLHLKAQEMLREPVLLVCPTSVLNNWEREVKKFSPTLSTLIHHGEK
RKKGKSFTKIVKSKHLVITSYPLVYRDTEILEQVEWKGLVLDEAQNIKNPQAKQSQAVRR
LKTEFRVALTGTPVENRLSELWSILDFLNPGFLGNQRFFQRRFAEPIEKYGDRESVQILR
SLVRPFILRRLKSDQNIIQDLPEKQEINVFCGLSPEQGRLYQELVDNSLYELESKTGIQR
QGIIFSLLIKLKQICNHPAQFLKEKQLRIPERSGKLMRLEAMLEELIEEDDRALIFTQFS
EWGKLLQSYLQKRFSQDVLFLYGATRREKRQEMIDRFQNDPNGPAIFILSLKAGGTGLNL
TRANHVFHVDRWWNPAVENQATDRAFRIGQKRNVQIHKFICTGTLEEKINDLLENKKQLA
EQTVDAGENWLTKLDTEQLRTLLLLDRKAIIDEE
NT seq
3165 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcctactctacatggaagttggattaacaaactagatgaaagttttttgtttatttgg
ggagaaacttggcgaagtaattatcctgatagagctctaaataaatcagttaatttacat
ctttttcttctaaataaattagagttaattgatttattaaaatctaaaaacttagaattt
tctcctaaaatagaagaaacatggactagtcaaattattaatctacctagtactacaatt
caaagtaaaaatatcgatgttccttatctatcttctcaattggagtcgagtgattttaac
atttctaaaaattctctttttctaaaaaattggaaaatacaaggtttttgtttgaaggat
atagaaattatcaacttttttagacaattgcccttagggttttcagataatcatgaaaat
tatttaggtgaagatttaaaattttggtctcatatttatcgatggagtctcgatttatta
accaggggaaagtttttgccaggacttacttctctaaaagagaaaaatcctcaaagtcag
tggtatttaatcctagatagtactatcgatcaaactcgactttctaaatttagtaaacta
atgccaattggatgcttagcttatcttaaagggactgaatctgaggtagatatcaaaaca
aatttcttagaatcacaacaattaattttagattttctcagaaatatcattaatatttat
atacgttcattttctcagtctagttctctgcttaatcaagatttattaattcaacgatgg
ttaaaatctttaacggaaatagatcctagttttaccgcttatcaaaatactcttaaaagg
ctagaaaatgctttatataactggagtttatctattcaagaatacttagttacttcaacc
aatataaccttaggagttaatcaatttagagtatgtttttatctagaatctcctaactca
aaagctatcaatttggccgatacttactggaatctaaagtattatttacaagccctagat
gataaagaaattttagttgattctcagactatttgggaaaatcctgttgaacaattatca
tggggagagagaactattgaaaagccccaagaaactttattaaaaggattaggattagcc
tcccgcctttattcccctatcgcagaaagtttacaagaaagtcaacctttatgttgtaaa
cttaatcccattcaagtctatgaatttattaaatcgagtgcgacaatcttagaagataat
ggattgggtgttatcttaccttctagtttagccagagaaaaagaagaaacccgattagga
attagtattgaagctgaagttaaatcgaaaaaagatgaacgtttaagcctgcaaagttta
ctaaattacaaactacaactagtaattggtcgacagataatttcccaaaaggagtttgaa
agattgttgtatcaaaaatctcctttagtagaaattaatggggaatggataaccttacaa
ccgtctgacattcaggcagtaaagacagtttttaatgactcctgcaatcaactaaaattc
tcagttgaagatgctttgcgcctcagtataggggataacaaaatgattgctaaacttcct
gttattaatttcaaaacatctggagttttacaaaaattaatcaataattttacaaataat
caatcaattgaaataatcaataatcctccaggatttgaaggagaattgcgtccttatcaa
aaaagaggtgttagttggttagtttttcttgaacaatggggattaggagcttgtttagcg
gatgatatgggactaggaaaaactcctcaattgcttgcatttttactccatttaaaagca
caagagatgttaagagaaccagtattattagtttgtcccacctccgtattaaataactgg
gagcgagaagttaagaaattttctcctaccttatcaactttaattcatcatggagaaaaa
cgaaagaaaggaaagtcctttactaaaatagtaaagagtaaacatttagtgattacaagt
tatcctctcgtttatcgagacactgaaatcttagaacaagttgagtggaaaggactagtt
ttagacgaagctcaaaatattaaaaatccccaagctaaacagtctcaggcagttcgtaga
ttaaaaacagaatttcgagttgctttgacaggaacacctgtggagaatcgcttgtcagaa
ttatggtcaattttggattttttaaacccaggatttttaggaaaccagcgattttttcag
cgtcgttttgctgaacctattgaaaaatatggagatcgggagtctgtacaaatcttacgg
tcactagtgcgtccttttattttaagacgcttaaaaagcgaccaaaatattatacaagat
ttgcctgaaaaacaagaaataaatgtattttgtgggttatcccctgaacaaggtagactc
tatcaagaattagtagataattctctttatgaacttgagagtaaaaccggaattcaacgt
caaggaataattttttcattattaataaaacttaagcaaatttgtaatcatccagcacaa
ttcttaaaagagaaacaactgagaatacctgagcgttctggtaaactgatgaggttagaa
gcgatgttagaggaattgatcgaagaagatgatcgcgctttaatttttacccaattttct
gagtggggaaaactattacaatcttatttgcaaaaaagattttctcaagatgttctattt
ttatatggtgcaactcgtcgagagaaacgacaagaaatgattgatcgctttcaaaatgat
cctaatgggcctgccatttttattctttccttaaaagcagggggaaccggattaaattta
actcgtgctaatcatgtctttcatgttgatcgttggtggaatcctgcagtagaaaatcaa
gcaacagatagagcatttcgtatcggacaaaaacgaaatgttcaaattcataaatttatt
tgtacaggaacgttagaagaaaaaattaatgatttactagaaaataaaaaacaattagcg
gaacaaactgttgacgcaggagaaaattggctaactaagttagacactgaacaattaaga
actttattattgcttgatcgtaaagcaattattgatgaagagtag
DBGET
integrated database retrieval system