Cyanobacterium endosymbiont of Rhopalodia gibberula: RGRSB_1307
Help
Entry
RGRSB_1307 CDS
T05747
Symbol
bicA
Name
(GenBank) putative bicarbonate transporter
KO
K03321
sulfate permease, SulP family
Organism
cer
Cyanobacterium endosymbiont of Rhopalodia gibberula
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
cer00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
cer02000
]
RGRSB_1307 (bicA)
Transporters [BR:
cer02000
]
Other transporters
Electrochemical potential-driven transporters [TC:
2
]
RGRSB_1307 (bicA)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Sulfate_transp
STAS
HCO3_cotransp
DUF5638
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BBA79758
UniProt:
A0A2Z5SYV0
LinkDB
All DBs
Position
complement(2030709..2032379)
Genome browser
AA seq
556 aa
AA seq
DB search
MQITNRIHFRNLRGDIFGGVTAAVIALPMALAFGVASGAGAIAGLWGAVIIGFFAALFGG
TPTLISEPTGPMTVVMTAIVTKMIAHNPEHGLAMSFTTVVLAGIFQIIFGLLKLGKYVTL
MPYTVISGFMSGVGLILIILQLGPFLGHVNPKGGVIEALKALPSFVTTLSPTETVLGLLT
MAILYLVPSKLKKFVPSQLIALIAGTLITIFFLSEANIRIIGKIPTGLPQLHFPVFFLDQ
INEMLMDGLVLGMLGCIDALLTSVIADSLTQTHHDSDKELIGQGIGNLVSGLCGGLPGAG
ATMGTVVNIQAGGRTALSGLSRAFILLIVVLWAAPLTKNIPLAVLAGIALKVGIDIIDWK
FLKRAHRLSVKAAVIMYGVMLLTVFYDLITAVGIGVCMANILTIQHLADIQSDLVKAIDT
ADDKTLLCDTSRRLMEKANRRIMLLDLSGPMSFGAAKAITQRQAILDNYDALIIDLKGVP
LLGVTATLAIEKMIDEAAKKSIEIYIVGANIKIKERLQKFDIFQRVPLQNRFDNRVAALH
LAVAKLKGETLKEINE
NT seq
1671 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcaaattactaatcgcattcactttagaaatttacggggcgatatctttggcggagtt
accgcagctgtgattgccctccccatggcacttgctttcggagtagcttcgggcgcagga
gcgattgccggactatggggggcagtaataattggcttttttgctgccctatttggcgga
acacctaccttaatttctgaacctacaggtccgatgacagtagtgatgacagccattgta
accaagatgattgcacacaatccagaacatggcctagccatgtcctttactacagtagtg
ttagcagggatttttcagatcatcttcggtttgttaaagttgggaaaatacgtcaccctc
atgccctatacggtaatatcggggtttatgtcaggagttggactaatcctcatcattctt
cagttaggaccatttttgggtcatgtaaaccctaaagggggagtcattgaggcattgaaa
gcattaccttcttttgttaccaccctaagtccaactgaaacagttttaggattgttgaca
atggccattctttacttagtgccctctaaacttaaaaagtttgttccctcccaattaatt
gccctcatagcaggaactttaattacaattttctttttatcggaagcaaatattcgtatc
attggcaaaattcctacgggacttcctcagttgcattttcctgtctttttcctcgaccaa
attaatgaaatgttgatggatggtcttgttttagggatgcttggttgtattgatgcttta
ttaacctctgtcattgctgatagcttaactcaaactcaccatgactctgataaagaacta
atcggtcaaggaattgggaacttggtttctgggctgtgtgggggacttcctggggcaggg
gctaccatgggaacggtagttaatatccaagcagggggacgcaccgctttatctggtttg
agtcgggcttttattttgctgattgtagtactttgggctgctcctttaaccaagaatatt
cccttagcggttttagctggtattgcccttaaggtggggattgatattattgactggaaa
ttcttaaagcgcgctcacagactttcagttaaagcagcggttattatgtatggggtaatg
ctgctaactgtattttacgacttaattacagcagttggtattggagtgtgtatggctaat
attttaactattcaacatctagcagatattcaatctgatttggttaaagcaattgataca
gcggatgataagaccctactatgtgatacaagcagacgtcttatggaaaaagctaacaga
cgaattatgctcttagatttgagcggtcctatgagttttggagccgcaaaagcgatcact
caacgacaggcaattctagataattatgatgctctgattattgatttaaagggcgtcccc
ttattgggagtaacagcaactttagctattgaaaaaatgatcgatgaggccgctaagaag
tcaatagaaatttatattgttggggctaatatcaaaattaaagaacggttacaaaagttt
gacatttttcaacgcgttcctctacaaaatcgctttgataatcgggtagctgccttgcat
cttgcggttgctaaactcaaaggagaaacgctgaaagaaattaatgaatag
DBGET
integrated database retrieval system
