Cellulosilyticum sp. WCF-2: EKH84_13910
Help
Entry
EKH84_13910 CDS
T06333
Symbol
mutS
Name
(GenBank) DNA mismatch repair protein MutS
KO
K03555
DNA mismatch repair protein MutS
Organism
cew
Cellulosilyticum sp. WCF-2
Pathway
cew03430
Mismatch repair
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
cew00001
]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03430 Mismatch repair
EKH84_13910 (mutS)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
cew03400
]
EKH84_13910 (mutS)
DNA repair and recombination proteins [BR:
cew03400
]
Prokaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
MMR (mismatch excision repair)
Mismatch and loop recognition factors
EKH84_13910 (mutS)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
MutS_V
MutS_III
MutS_I
MutS_IV
MutS_II
AAA_27
IF-2
AAA_14
AAA_29
AAA_22
DUF5100
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QEH69423
LinkDB
All DBs
Position
complement(3108074..3110821)
Genome browser
AA seq
915 aa
AA seq
DB search
MLKTQVTPMMAQYLTIKEENPDCLLFFRLGDFYEMFFEDAKTCSRELEITLTGKDCGLEE
RAPMCGVPFHSAETYISRLVEKGYKVAICEQIEDPKQAKGLVKRGVIRIVTPGTILEGAT
VSEGKNNYITSIVGMAGSYGLSVCDVTTGEWLTTTIIGDQSKRKLLDELAKFAPVECLLS
ETLYQDDEIREFMRTRFNCLTEQIPAHTLDTTLAQRILLKHFNILSLGGIGLSEDGVETL
ATASLLAYLQETQKTDLSHLMTLSIYNVDAFMLLDIATRRNLELTETLREKRRKGSLLWV
LDHTKTAMGSRYIRKCIEQPLINAEEINHRLDATKELKEAPLLRADLFEALDHIYDIERL
MSKVSFGTCNAKDMIALKQSLEVLPTIKGLLVDCQAPGLISLNRQLDDMSDLYQLVDKAL
IEEAPISVREGNMIKTGYNEEVDHLRQVKTEGASWLMEIEAREKEKTGIKNLKIKYNKVF
GYFLEVTQSYNHLVPDYFIRKQTLSNCERYITEELKKVEEEVLGADDKLNLLEYQLFTEI
RDAVLKEMPRLLTTSAQIAALDMFCSLADVADTYGYVKPEMTTGYNLCIEKGRHPVVEKM
LGEQHFIANDVILEEEHAEMMLLTGPNMAGKSTYMRQVALIVLMAQIGSFVPADSATIGV
VDRIFTRVGASDDLASGQSTFMVEMMEVANILHHATKNSLLILDEIGRGTSTLDGLSIAW
SIIEHITTEIGAKTLFATHYHELTVLEETMPNLKNYCIAVKEIGEDIIFLHQIVKGSVDH
SYGIQVAKLAGVPGAVLERAKAILKQLDSGEKQVIIPPSVQGTLGQLSEKVDKIKDVVKE
QVITTEAYQINETEVTSKKASKDHKEKQNGFGQLNLFDQGEHEVITALKEADLMNTTPFK
ALELLYELQRKVKSL
NT seq
2748 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgttaaaaacacaagtaacgcctatgatggcgcagtatttaactataaaagaagaaaac
ccagactgcttactttttttcagactaggggatttttatgaaatgttctttgaagatgct
aaaacttgttcaagagaattagaaattactttaacaggaaaagattgtggcttagaggaa
agggcacctatgtgtggtgtaccttttcattcagcagaaacgtatatttcacgtttagta
gaaaaaggttataaagtagctatatgtgagcaaattgaagatcctaagcaagccaagggc
ttagtaaaacgcggcgttattcgtattgtaacacctgggactatattagaaggtgccaca
gtaagtgagggtaaaaacaactatatcactagcattgttggtatggcaggaagctatgga
ttaagtgtttgtgatgtgacaacaggtgagtggcttacgacgactattataggagatcaa
agtaagcgaaaattactagatgaattagcgaaatttgcacctgtagaatgcttattatca
gaaactctctatcaagatgatgagattcgtgaatttatgcgtacacgttttaattgctta
actgagcaaataccagcccatactttagatactactttagcacaacgtattttactgaaa
cattttaatattttatctttaggtggaattggcttaagtgaagacggtgtggaaacttta
gctacagctagtttgcttgcttatttacaagaaacgcaaaaaacggatttatctcacttg
atgacgttatctatttataatgtggatgcttttatgttattagatatcgccacaaggcgt
aatcttgaattaacagaaacgttgcgtgaaaaaagaagaaaaggttcccttttgtgggta
cttgatcataccaaaacagctatgggttctcgttatattcgaaaatgtatagagcagcct
cttattaatgcagaagaaattaatcatcgtctagatgccacaaaggaacttaaggaagct
cctttattacgtgcggatttatttgaggcattagatcatatttatgatattgaacgttta
atgagtaaagtttcttttggaacgtgtaatgctaaagatatgattgctttaaaacaatct
ttagaggtactgccaactattaagggtttattagtagactgccaggcgccagggttaatc
tcccttaaccgtcagttagatgacatgagtgatctttaccagctagttgacaaggcactt
atagaggaagcacctatttctgtgagagaaggaaacatgattaaaaccggctataatgaa
gaagtcgatcatttacgtcaagtcaagaccgaaggtgcttcttggcttatggaaatagaa
gctagagaaaaagaaaaaacaggtattaagaatcttaaaataaaatacaataaagttttt
ggatactttttagaagtgacacagtcctataatcatttagtacctgattactttattcgc
aaacaaaccctttctaactgtgaacgctatatcacagaagagctgaaaaaagtagaagaa
gaagtattaggtgcagatgataaacttaatttattagagtatcagttatttacagaaata
agagatgcagttttaaaagagatgccacgtttattaacgacttcggctcaaattgcagct
ttagatatgttttgttctttagcggatgtagcagatacttatggatatgtaaagccagag
atgacaactggctataatctttgtattgaaaaagggcgtcatccagttgtagaaaaaatg
ttaggagaacaacactttattgccaatgacgtcattttagaagaagagcatgccgagatg
atgctattaacagggcctaatatggctggtaaatccacttatatgcgtcaagtagctctg
attgttttaatggctcaaataggaagctttgtgccagcggattcagcaactattggtgtt
gttgatcgtattttcacacgtgtaggtgcttcagatgatttggcatcaggacaaagtacc
tttatggtggaaatgatggaggtggcaaatattttgcatcatgcaacaaagaatagctta
ctcatcttagacgagattggaagaggaacaagtacattagatggtttaagtattgcttgg
tctattatagaacatattacgactgaaataggtgcaaaaactttatttgccacccattat
catgagctcactgttttagaagaaactatgccaaatcttaagaactattgtattgcagtt
aaagaaataggagaagatattattttccttcaccaaatcgtaaaaggtagtgttgaccat
agctatgggattcaagtggctaagttagcgggtgtacctggtgctgttttagagcgtgca
aaagctattttaaagcaactggatagtggtgagaagcaagtgattataccacctagtgtt
caagggactttggggcagctatctgaaaaggtagataagatcaaggatgtagtaaaagaa
caggtaataacgacagaggcttatcagatcaatgaaacagaagttacatctaaaaaagct
tctaaagaccataaagaaaaacaaaatggttttggccaacttaatttatttgatcaaggt
gaacacgaggtcattactgctttaaaagaagcggatttaatgaatacaacaccatttaaa
gctttagaacttttatatgaattacaaaggaaggttaaatctctttaa
DBGET
integrated database retrieval system