Cellulosilyticum sp. WCF-2: EKH84_20965
Help
Entry
EKH84_20965 CDS
T06333
Symbol
secD
Name
(GenBank) protein translocase subunit SecD
KO
K12257
SecD/SecF fusion protein
Organism
cew
Cellulosilyticum sp. WCF-2
Pathway
cew02024
Quorum sensing
cew03060
Protein export
cew03070
Bacterial secretion system
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
cew00001
]
09120 Genetic Information Processing
09123 Folding, sorting and degradation
03060 Protein export
EKH84_20965 (secD)
09130 Environmental Information Processing
09131 Membrane transport
03070 Bacterial secretion system
EKH84_20965 (secD)
09140 Cellular Processes
09145 Cellular community - prokaryotes
02024 Quorum sensing
EKH84_20965 (secD)
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02044 Secretion system [BR:
cew02044
]
EKH84_20965 (secD)
Secretion system [BR:
cew02044
]
Sec (secretion) system
Prokaryotic Sec-SRP core components
EKH84_20965 (secD)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SecD_SecF_C
SecDF_P1_head
SecD_1st
DUF7060
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QEH70722
UniProt:
A0A5B9YHB9
LinkDB
All DBs
Position
complement(4613399..4615576)
Genome browser
AA seq
725 aa
AA seq
DB search
MKAKKYTFFIIVAIIIGLLILAVFGAPHVKGAKEMRFGIDIRGGVEAIYEPVDLDRAATS
DELNAARSVIETRLDNKNILDREVTIDKKNGRIIVRFPWKSDEAEFNPEKAISELGETAR
LTFRDSEGNILIEGKDVKSSRAVMNQQTNQYMVQLVFNAEGAKLFEEATAKLIGQQLFIF
MDETYISGPMVNQKISGGEGVIEGTFTLDQAQDLAEKISSGALPFSMTATSHNTISPSLG
SGALKVMVMAGITAFALICLFMLVFYRLPGFISCIALTLQLAVQILALSVPQFTLTLPGI
AGIILSLGMGVDANVIINERIGEELRSGKSLPLALKSGYSRAFASVFDGNITTAIVAIIL
MALGSGTMLSFGYTLLVGIVLNFIAGIYTTHKLLLSLINFKAFRNIKLYHLPKERKTIPF
YKKRWGLYSISIVLMVIGIVSCFINGIALDTTFKGGAMLTYTYTGDLNVEDVSRLATSTL
NRNVTGQITEDLGNKQQKIVLSLAGTDSLNAKDQVKLDEALDKAYAANKLELSESYMVEP
YIGKETLIRSIMSLVIALALIVVYVWVRFKKIGGLSAGAMALVALGHDILVIFFTFVVLR
IPLDTNFIAVALTIIGYSINDTVVIYDRIRENMALNSKNMEVLMDDSLTQTLTRSINTSV
TTSISVLIMYIFAYVFGIESIKVFALPMMMGVLSGCFSSVCLAGPLWVSWKNSKKFNKGA
HVKTA
NT seq
2178 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gtgaaggcaaaaaaatatacgttttttattattgtagccattattataggattattaata
ttagctgtatttggagctcctcatgttaaaggagctaaagaaatgcgttttggtattgat
attagaggtggtgtagaagctatctacgaacctgttgatttagacagagcagcaacctca
gatgagcttaatgcagctagaagtgttattgaaacaagattagataataagaacatacta
gatagagaagtaacaattgataagaaaaatggtagaatcattgtaagattcccatggaag
tctgatgaagcagagtttaaccctgaaaaagctatatctgaattaggtgaaacagctagg
ctaacctttagagatagtgaaggtaatattcttatcgaaggtaaggatgtaaaaagtagc
cgtgctgtaatgaatcaacaaaccaatcagtatatggtacagttagtatttaatgcagaa
ggcgcaaagctttttgaagaagcaacggcaaaactgattggtcaacaacttttcattttt
atggatgaaacttatatttctggacctatggtaaatcagaagatttcaggaggggaaggc
gttatcgagggtacatttaccctagatcaggcacaagacttagcagagaaaattagttca
ggtgcactaccattctctatgactgctacaagccataacacgattagcccaagccttgga
agtggggccctaaaagtaatggttatggcaggtataacagcgtttgcacttatttgttta
tttatgcttgtcttttatagattaccaggctttataagttgtattgctttaacgctgcag
ttagcggtgcagattttagctctttctgtgccacaatttactttaaccttaccaggtata
gcaggtattatcttatccctaggtatgggggtagatgctaacgttatcattaatgagcgt
attggagaggaattaaggtcaggaaaatctttaccattagcgcttaaatcaggttatagt
agagcttttgcttctgtatttgatggtaatattacaacagctattgtagccattattcta
atggcattaggttcaggaacaatgctatcttttggttatacactattagtcggaattgta
cttaacttcatagctggtatctatacaactcataagttattactttctttaattaatttc
aaagcgtttagaaatatcaagctttaccatttaccaaaggaaagaaaaacgattcctttt
tacaagaagagatggggactttacagtatttctattgtattaatggttattggtattgta
agttgtttcattaatgggatagcattagatacaacctttaaaggtggagcaatgcttact
tatacttatacaggcgacttaaatgtagaagatgtatctagacttgcaacaagtacctta
aatagaaatgtaacaggacagatcacagaggatttaggaaataaacaacaaaagattgtt
ttaagcttagctggtacagatagcttaaatgcaaaagaccaagttaaattagatgaagct
ttagacaaagcttatgcagctaataaattagagctatcagaatcttatatggtagagcct
tatatcggtaaagaaactcttattagatcaatcatgtctttggtgatagcacttgcatta
attgttgtttatgtttgggttcgttttaagaagattggtggtttatcagctggagctatg
gcacttgtagctttgggacatgatatattagtcattttctttacattcgttgttttaaga
attccactggataccaacttcatagcagtagccctcactattatcggttactcaattaat
gatactgttgttatttatgaccgtatccgtgagaatatggcacttaatagtaagaatatg
gaagtactaatggatgacagtttaacacaaaccttaacacgttctattaataccagtgta
acaacaagtattagtgttttgattatgtacatttttgcttatgtttttggtattgaatct
attaaagtttttgcacttcctatgatgatgggtgttttaagtggttgcttctcttcagta
tgtttagctggtccactttgggtatcttggaagaatagcaaaaagtttaataaaggtgca
catgtaaaaacggcttaa
DBGET
integrated database retrieval system