Kaistella faecalis: LL667_04270
Help
Entry
LL667_04270 CDS
T08247
Name
(GenBank) OmpA family protein
KO
K03286
OmpA-OmpF porin, OOP family
Organism
cfae
Kaistella faecalis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
cfae00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
cfae02000
]
LL667_04270
Transporters [BR:
cfae02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
LL667_04270
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
OmpA
TSP_3
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UFK98577
LinkDB
All DBs
Position
complement(897507..898946)
Genome browser
AA seq
479 aa
AA seq
DB search
MKLNLTSFALALVLPTAIFAQDSVAVSTEGYPNTFSSGSANVSPFTQESKRFNDWAVSVG
AGIPLVQSADLTSIKNGNGKNVFGYSAYLSIDKAITHAFGLNLQYDRGETRQGWFNTKTD
NATGNTFQDVGARTQYDAISILGDLNFSNLLRRVDNKSPYRWALHGYAGVGTLAYRAYLE
DAAGQRLMTEIKPFKLGSMFGQAGAGLKYKVNRKIDIEGRVMYFVTGDDEFDGGGAQYSP
INQREEQVSDNFFNATLGLSLKLGKHQSHLMWHDPLQEIYYKLDVLADRNQDVEVCKKGD
ADNDGVCDDWDRQLDTPAGARVDGAGVALDTDLDGVIDLYDKCVTVPGPVENNGCPTGGT
VTDNTRTLEGIEFDLDSDRILPSNTPILNNAVNYINSSSGTYNVIGGTDTRASDAYNQNL
SERRANTVKNYLIDNGVEAGKLEAIGRGEKDLKYPECDPATKCPEWKNRANRRVYFEAK
NT seq
1440 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaactaaatttaacaagctttgctttagcactggttttacctactgctatctttgca
caagactccgttgcagtttctactgaaggatatccaaacacattttcttcagggtctgca
aatgtatctccgtttactcaggagtccaaacgattcaatgactgggctgtttccgtagga
gcaggtatcccattggtgcagtctgccgacttaacttccatcaagaatgggaatggtaaa
aatgtattcggatattctgcttatttaagtattgataaagcgattacccatgctttcggg
ctgaatcttcagtatgacagaggcgaaacccgtcagggatggtttaatacaaaaacagat
aacgctaccggtaatacgtttcaggatgtaggagcgagaacccaatacgatgctatttcg
atcctgggagaccttaacttttctaatctattaagaagagttgataataaatctccatac
agatgggctttacatggttatgcaggtgtcgggactttggcttacagagcttatctcgaa
gatgctgccggacaaagattgatgactgaaattaaacctttcaaattggggtctatgttc
ggtcaggcaggtgcaggcttgaaatataaagtaaacagaaaaattgatattgaaggacgt
gtaatgtactttgtaaccggagatgatgaatttgacggcggaggtgcacagtacagcccg
atcaatcagcgtgaagagcaggtttctgataacttctttaatgctacccttggtttgtct
ttaaaattaggaaaacaccagtctcatttgatgtggcacgatccgcttcaggaaatctat
tacaagcttgatgttttggctgacagaaaccaggatgtagaagtttgtaagaaaggagat
gctgataacgacggtgtatgtgatgattgggacagacagcttgatactcctgcaggagca
agagttgatggtgcaggtgtagcgcttgatacagatttagatggagttatagacctttac
gacaaatgtgttacagtacctggtcctgttgaaaataacggttgtcctacaggtggtaca
gttacagataatacaagaactcttgagggaattgaatttgatttagattccgacagaatt
cttccttctaacacgccaatccttaataacgctgtaaactatatcaactcttcatccgga
acatacaacgtgatcggaggaacagatacgagagcttctgatgcttacaaccagaatctt
tctgaaagaagagcaaatacggtgaagaactatctgatcgataacggagtagaagcaggt
aaattagaagcaattggtagaggtgaaaaagaccttaaatatccagagtgcgatccagct
acaaaatgtccggaatggaaaaacagagcaaacagaagggtttacttcgaagctaaataa
DBGET
integrated database retrieval system
