Clostridium felsineum DSM 794: CLFE_009070
Help
Entry
CLFE_009070 CDS
T08216
Symbol
recD2_1
Name
(GenBank) ATP-dependent RecD-like DNA helicase
Organism
cfb
Clostridium felsineum DSM 794
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
MTES_1575
AAA_12
AAA_11
AAA_19
AAA_30
nSTAND3
nSTAND_NTPase5
UvrD-helicase
DUF559
ResIII
PhoH
DEAD
NAT10_TcmA_helicase
CbiA
MeaB
NPHP3_N
Viral_helicase1
2OG-FeII_Oxy_4
AAA_25
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
URZ14894
LinkDB
All DBs
Position
947753..951808
Genome browser
AA seq
1351 aa
AA seq
DB search
MDTKIKVKELFSYLLSIKNMNEDVIRDVGKYDKLYWKNQLKNNKNIVVNLDNSQEIWLEV
KKDNKELYDSFFQLYLRIQKNNENIEIVCGNYMLSWNGDNKKIFHPIFTTKMELSFDAEA
GRFLLKPYDNKTSLELDMFSGMTIPNMDEIIKVKEEFEKSCLDVREMKNVRDILYKIAHY
LSAEINPKGEIQKNVTSISSIKASKYPVFYNEAVVVVRKTDNRLWNKELCNIIDSIDENY
PIPAPIKALVETRKIEEDSEEAQNWQKINDNLLFPLHYNEEQKEIVKKLSDNFGVVVQGP
PGTGKSHTIVNLVCHLLANGKRVLVTSQTGRALRVLSDKIPEEIKPLCISLLGDDTKALK
DLDDSVRKITENLSLNPNDISKEIKPLENELMFCRKYQEKTYNKIKELECIENKKLSIGG
KAMTLMEIAKWVNKNEKELNWIEDEIPIDLQCPFTNQQFGHFIYLLNSMNIEDLKKVTLS
LKILDEIPDYEKIITNFQNYTVKDHSKDKSNLKGWVINYKAEVNIDHDKLIQLIDKAENK
MEEIEKGWLKNVMICYYFSDVERPEIKNLFVRSSEYIRRLSDIQTIIVSHKITMPEKMDI
DKLAKDFKSIYVQAKNKGKINKLFKFRHRNLNYIFNECAVDGENLQFGDKIEILKLFLEK
IDIQNKLMELWNKNVKKFKGEEIKKFDAATFIRLESQIKDIGDIVNWNANYKNKILLNME
NITFLNKMDWHKKETYTKIKKGIISIKNISEYEKAKTFLNGLVKLSRNNYGMECMAEAIE
SRDIKKIKKAYSEIQRLKSMVGTVKEINSLKNGIEKIAPIFVSKLLNSEKRSKYKNLNAA
WRWKQMNDILEKSHKLKTENLEEIIENEKIKERVLIRRIVSKKAWLNEIKSTTDLQKRSL
YAWLQAVKRIGRGTGKFVLKYRKMAQMEMEKCKDCIPVWIMPLNKVIENIGLNSNLFDVV
IFDESNQSDIFGISALFRGKRAVIVGDDKQISPQAVGIEEESVDELIKRHLKGIPHSQWF
DLQTSLYNTALRVFPDRLLLREHFRCVPEIIGFSNNVSYSNEIIPLRYPKANEAFSDPVK
VVRVKDGLKDNMRQTNENEAKAIVSSIIACCSSSKYDNMNMGVISLLGEQQAELIESMLR
RRLGEKEMLKRKILCGDAFSFQGDERDIMFLSLVVSNGSKISALTREADLRRFNVAASRA
RNQMWVFSSVDEDKLSDNCVRTKFLRYCLDPSLNKNKIDKDKMVLADDFEKDVFNNIKER
GYNVKPFEDLRKYKVDFIIEDASNRIAIACDSGNHNDLENWERQRERQMALERVGWKFYR
LKGSEFYRNPKLTMDALCGKLENMGIKSIIT
NT seq
4056 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggatactaaaatcaaagtaaaggaattattttcttacttattgagtataaaaaatatg
aatgaagacgtaataagggatgttgggaagtatgataaattatattggaaaaatcagctt
aaaaataataaaaatatagttgtcaatctggataattctcaagaaatatggttggaggtt
aaaaaggataacaaagaattatatgattccttttttcaactttatttgaggatacaaaaa
aacaatgaaaatattgagattgtatgcggtaattatatgctttcatggaacggagataat
aaaaagatatttcaccctatatttacaacaaagatggaattgagctttgatgcggaagct
ggtagatttttattaaaaccttatgacaataaaacaagtcttgaattggatatgttttcg
ggaatgacaattcctaatatggatgaaataattaaagttaaggaagaattcgaaaaaagc
tgtctagatgtacgcgaaatgaaaaatgttagggatatcttatataaaatagcacattat
ttgagtgctgaaataaatcctaaaggtgaaatacagaaaaatgtaacttcaattagcagt
ataaaagcttctaaatatcctgtgttttataatgaagctgttgttgttgtaagaaaaact
gataataggctttggaataaggaattatgtaatattatagatagcatagatgagaattat
ccaattccagccccaataaaagctcttgttgaaactagaaaaatagaagaggatagcgag
gaagcacaaaactggcagaaaataaatgataatttgctatttccacttcattacaacgaa
gaacagaaggaaattgtaaagaagctttcggacaattttggcgttgttgttcaaggacct
cctggcactggtaaaagtcatactatagtaaatcttgtttgtcatcttttggctaacgga
aagagagttttagtaacaagtcaaacaggaagagcattaagagtgctttcagataagata
cctgaagaaatcaagcctctatgtattagtcttttaggtgatgatactaaagcgctaaag
gaccttgatgattctgtaagaaaaataacagaaaacttatccttaaatcccaatgacata
agcaaggaaataaagcctttagagaatgaactcatgttttgtagaaagtatcaagagaaa
acttataataaaataaaagaactagaatgtatagaaaataaaaaactcagcataggggga
aaggcaatgacccttatggaaatagcaaaatgggtaaataaaaatgaaaaagaattgaat
tggatagaagatgaaattccgatagatttacagtgcccatttactaatcaacagtttgga
cattttatatacctattaaatagtatgaatatcgaagatttaaagaaagttactttatca
ctaaagattctggatgaaatcccggattatgaaaaaataataacaaatttccagaattac
acggttaaagatcatagtaaagataaaagtaatttaaaaggatgggtcataaattataag
gctgaggtcaatatagatcatgataagcttatacagttaattgataaggctgaaaataaa
atggaggaaatagaaaagggttggcttaagaatgtaatgatatgttactattttagtgat
gtagaaagaccagaaataaaaaatctgtttgttagaagcagtgaatatatacgtcgtctt
tcagatatacaaaccataattgtgtcacataaaataacgatgccagaaaaaatggatata
gataaattggcgaaggattttaagagcatatatgtacaagctaaaaataaaggcaaaata
aataagctattcaaatttagacataggaatttaaattacatttttaatgagtgtgcagtg
gatggggagaatcttcagtttggcgataaaatagagatattaaagttatttctagaaaaa
atagatattcaaaataaattaatggagctttggaataaaaatgttaaaaagtttaaaggt
gaggagataaaaaaatttgatgcagctacttttataagacttgagagtcagataaaggac
attggtgatatagttaattggaatgctaattacaaaaataaaatattgcttaatatggaa
aatataaccttcctaaataagatggattggcataaaaaagaaacctacacaaaaataaaa
aaaggcattattagtattaaaaatatttctgaatatgaaaaggcgaaaacatttttaaat
gggttagttaaactgtcaagaaataattatggaatggaatgcatggcagaagctattgag
agcagggatataaaaaagataaaaaaagcctattcagaaatacaaagacttaagagtatg
gtaggaacagtgaaagaaataaattcacttaaaaatggaatagagaaaatagcacctata
tttgtaagcaagcttttgaattcagaaaaaagaagcaaatataagaatttaaatgctgct
tggagatggaagcagatgaatgatatattagaaaaatcacataagctgaaaacagaaaat
cttgaagaaataattgaaaatgagaagattaaggagagagttcttataaggagaatcgta
tctaagaaagcttggctcaatgaaattaaaagtacaactgatcttcaaaaaagaagcctg
tatgcatggcttcaagctgtaaaaagaatagggagagggactgggaagtttgtgttaaag
tatagaaaaatggctcaaatggagatggaaaagtgtaaggattgtattcccgtgtggata
atgcctttaaataaggttatagagaacattgggctcaattctaatttatttgatgtggta
atatttgatgagagcaatcaaagtgatatatttggtataagtgctctttttagaggtaaa
agagccgttatagtaggtgatgataagcaaataagtcctcaagcagttggaattgaagag
gaaagtgttgatgaattaataaaaaggcatttaaagggtataccgcactctcaatggttt
gatctacaaacaagtctctacaatactgcacttagagtatttcctgataggcttctctta
agagaacactttagatgtgtacctgaaataataggatttagtaataatgtaagttattct
aatgaaataataccacttaggtatcccaaggcaaatgaagcttttagtgacccggtaaag
gtagtaagggttaaagatggacttaaagataatatgagacaaactaatgaaaatgaagct
aaagcaatagtttcatctataatagcatgctgttcaagttctaaatacgataatatgaat
atgggagttatatctctacttggagaacaacaagctgaattaattgaaagtatgcttaga
cgtagattaggtgaaaaggaaatgcttaaaagaaaaatactttgtggagatgctttttca
tttcagggggatgaaagagatataatgtttttatctttagttgtttcaaacggcagtaaa
atttcagcattaactcgtgaggctgatttaagaaggtttaatgttgcggcaagtagggcg
agaaatcaaatgtgggtattttcatcagtagatgaggacaagctaagtgacaattgtgtt
agaacaaaatttttaagatattgtctggatccttcattgaataaaaataaaattgataag
gataaaatggtacttgcagatgattttgaaaaggatgttttcaataacataaaagaaaga
ggttataatgtaaaaccttttgaagatcttagaaaatataaagtggattttataatagag
gatgcatcaaataggattgctattgcatgtgatagtggaaatcataatgatttagaaaat
tgggaaagacagagagagagacagatggcacttgaaagggtaggttggaaattctataga
ttaaaaggaagtgaattttataggaatcccaagcttactatggatgccctttgtggtaag
cttgaaaacatgggtataaaaagcataatcacttaa
DBGET
integrated database retrieval system
