Clostridium felsineum DSM 794: CLFE_025890
Help
Entry
CLFE_025890 CDS
T08216
Symbol
yxdM_3
Name
(GenBank) ABC transporter permease protein YxdM
KO
K02004
putative ABC transport system permease protein
Organism
cfb
Clostridium felsineum DSM 794
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
cfb00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
cfb02000
]
CLFE_025890 (yxdM_3)
Transporters [BR:
cfb02000
]
ABC transporters, prokaryotic type
ABC-2 type and other transporters
Putative ABC transporter
CLFE_025890 (yxdM_3)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
FtsX
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
URZ16542
LinkDB
All DBs
Position
complement(2715433..2717385)
Genome browser
AA seq
650 aa
AA seq
DB search
MTLYSIILKNIKGNLNKFIMYYLSNVFVVMVFFIFANFILNPNVKSIKTMGQMGAVTTEV
MYGCEIIILIFTLVFTKYSVSSFLKSREKEFGLLSMFGLTKKEIRRYVMAENLIVALLSI
LTGLLLGILFSKLFFMAVSVILHLNSELPLLISIKAVVLTVICFLILFQGTEAVVSFKIK
SNNIIELLKGERKADPIPRFSKKKAIGAIILIVAGYVLAVVSYQIIIFTMFIILGLTVWG
TYLLYSQFSVYFASKLQSNKKVFYRGINMITLAQIIYKLRDNAKILFTVSILSAVTLTAS
ASVYSFQKTIEKEMFLNYPQDISFIENGEFSHEIISPAKVKDSLKNSDNVVENKVLLIKA
SVNETFKTSVSKYGSKNEKDFYIMKSSDYNRLASEEGKDLIDVEKNEAVIRSYNFDIKEN
EKSFDDNNYINLNIDGKNIKYKLKQEIGGGIINEDKGSTNTLILNDKDFKKLKENVKSNG
LSVYYGYNVKYFEKSEKSIKKLKLEISKDVRDRFIVRTLRYSKSMQAMAVFFFIGTFISV
LFFIATGSILYFKLFNEIQKDRREFVALKKLGVSIEEVRKIISRQCFIMFFLPFVIAFLH
TAFAIKALSNILGTSLSGYLMLIVGIYLALQTVYFNFARYMYTKQINNWV
NT seq
1953 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaccttatatagtattattctaaaaaacataaagggaaatttaaataagttcataatg
tattatttaagtaatgtatttgttgttatggtattttttatatttgctaattttattctt
aatcctaatgtaaaaagtataaaaactatggggcaaatgggagcagttactacagaggta
atgtatggttgcgaaattataatacttatttttactttggtttttactaaatattctgtt
tcaagttttttaaagtcacgagaaaaggaatttggacttttgtctatgttcggtttaact
aaaaaggaaataagaagatatgtcatggctgaaaatcttattgtagccttgctttcaata
ttaacaggacttttacttggaatattattttcaaagctattttttatggcggtttcagta
attttacatctaaattcagagcttccattattaatatcaataaaagcagtagtacttact
gttatatgctttttaatactgtttcagggaacagaagcagttgttagcttcaaaattaaa
agcaataatattatagaacttttaaagggagaaagaaaagcagaccctatacctaggttt
tctaaaaagaaagcaataggagctataattctcattgtagctggttatgttttagcagtg
gtatcctatcaaataataatatttactatgtttattattttagggctgacggtatgggga
acctaccttctttattctcaatttagtgtatacttcgcgagtaaacttcaaagtaacaaa
aaggttttctatagaggaataaatatgataaccttagctcaaataatatacaaattaaga
gataatgcaaaaatactctttacagtatcaatactttcagcggtaacgcttacggcatct
gctagtgtatattcctttcagaaaactattgaaaaggagatgtttctgaattacccacag
gacataagttttattgaaaatggtgaattttctcatgaaataatatcaccagctaaggtt
aaggatagccttaaaaatagtgataatgtagtagaaaacaaagtactccttataaaggcc
agtgtaaatgaaacttttaagaccagtgtttcaaagtatggtagcaaaaatgaaaaagat
ttttatattatgaaaagcagtgattataatagactagcaagtgaagagggcaaagattta
attgatgttgaaaaaaatgaagcggtaattcgttcgtataattttgatataaaggaaaat
gagaaaagctttgatgataataactatataaacttaaatattgatgggaaaaatataaaa
tataaacttaaacaggagataggagggggaataattaacgaggataaggggagtacaaat
actcttatattaaatgataaggattttaaaaagcttaaagaaaatgtaaaatctaatggt
ttaagtgtatattatggatacaatgtgaagtactttgaaaagtcagagaaatctataaaa
aaattaaaattagaaatttcaaaggatgtgagagatagatttatagtaagaacattgaga
tatagtaaaagtatgcaagctatggcagttttcttttttataggtacttttatttcagta
ttattttttatagcaacaggaagtatcctttatttcaagttgtttaatgaaattcagaag
gacagacgtgaatttgtagcccttaaaaaattgggagtatcaatagaagaagtaagaaag
attattagcaggcaatgttttataatgttctttttaccttttgtaatagcatttttgcat
acagcctttgcaattaaggcattaagtaatattctaggtacaagtcttagtggatatttg
atgcttatcgtaggaatttatttagcacttcaaacggtatattttaactttgcaaggtat
atgtacactaagcaaataaataattgggtataa
DBGET
integrated database retrieval system
