Clostridium felsineum DSM 794: CLFE_038080
Help
Entry
CLFE_038080 CDS
T08216
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
cfb
Clostridium felsineum DSM 794
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ChW
RHS_repeat
CBM_4_9
Integrase_DNA
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
URZ17753
LinkDB
All DBs
Position
complement(4070627..4077550)
Genome browser
AA seq
2307 aa
AA seq
DB search
MRKIKRNISFGLIVFLITAMFHITIYGQTVDISSLIKGQSNQNNQTEKKQKKNVSKITKE
LEEQRTENTKRYQKEDGSYEIAEYGTAVHYKENNKWKDIDNTLKTSDDSGFLENKQNGFK
IKISKESDKKKLVDVKKDKYEFSWNLEDIKEVEGEVASEASNKIASEVNESVDREIKANK
ELARESAPEQQKDKAILVNNEKIKTLKNIISGINFKDAFQDTDLQYVLKGSDIKENIILN
KYTDNCEYKFNLNIKNMIPKLQKDNSIIFYDSTDKSKEIFKINAPVMYDSKGKTSSNIKV
SLTQDKDTCVLKLTPDTKWLKSKKRAYPVTIDPSVRTSLDKNSIHDTFVASNDTANKAQN
QYLRVGSVPQIGTTRTYIKFDLPQLSSGDMIVSAGLNLEYNPQVSKGSNNQVNVHKVNQD
FNPDNLSWGTQPSYDSHVEALSVINSTQQDWIYWDITSIAKQWYTSGNNYGLMLEEDNSS
NYTSFWSDNIDDDYSKARPQVSFTYINNSGIENYWTYHTQAIGRAGTSYLNDYNGNLVLK
HDDISMSGSRLPIAINHIFNSNDRGDNINYGNGWRLNVSQKIEQQTIEGQPWYKYTDEDG
TKHYFLDSGGAELQDELNLGLTLKKNPDGSCSISDKKNNTIKFNSRNNDLEQITDANGNV
TVFVSDNVNNKRVLTEVVDPSGRVVKLSYGANGNLASIVDTSGRTTSYSYDGAGNLTGIT
YPDGKTSSYSYDGNHNLINVTDYDGYKVDYSYYGALPYRVSSIAEGNTDGTAGDKLDISY
GNNNTTFTDEKGRNNEYMFDDRGKTLSVKDIDGSAEYYQYGDTTNVSKLTSESKLQKTVE
NLLTNHELEATDGWGFNSDGGSGTSSFSTENHYLGNQSIKIDKTDNVQRQYADQWNNLTK
GETYTFSAYVKTYNVSNTNGKGAVISFYYKDKNGVYQSIDSKAISGTNDWQRLNVTFTLP
NDASDTNVLTRVGVLEESGTAYFDSLQLETGSVSNRYNLIENGDLSGTISVPNKWGTTGT
SGTDSLTTINDSDHPDNLNNTVYSVSGAYGASKRLCQSVNVSGDSGDIYSFGAWGKGYSV
PSGTFQIQLAFVDGNSAQWVTLEFNKNYDKWQYISGKAIAKQKYSRIDIYYLYENNANTA
YFDGAQLYKEDFDQSYQYDSKGNVLSTAEIAKKDSTFQFQYNGNNDLEQSVAPKGGSFKY
EYDSKHNVTRATTGENTSYNFGYDASGNPTTAKVGDGTDYLQSKATYTDSGNYIKSLTDS
LGNTTTYNYDETKGLLNSTTDPKGNTTNNSYDGMDKLTSTSTTADGQNVSNSYEYTNDAI
SKINHNGFSYNFAYDPLGNNTSVSVGNQNLTQNIYEPRTSVLLKSNYGNGQSVSTDYDNL
DRKTADLVGGDNSVGVSYSGQVQNIGWQNPVSDYSEAGTEGQSLRLEAMKVKLNNALPGM
KIKYQAHVQNVGWQDWVYDGQEAGTENQGLRMEAVKIELEGAPKGYIVRYQVHVEGIGWM
DPVQDGETAGTVGKGLRIEAIRISVEKPRYTYKYDAAGNLAQENDNVNDVVNSYTYDLED
KLVKSSDSNGNEINYNYDKNNNLASLKDKVNGVNHETDYTYDKDNKLTASKYGSNEFDNS
YDTLSRRTASTINTGTSKYNISYEYLPGAQTSNTGVTYDAHVENTGWQNPWVNDGQTAGT
EGKGLRMEALKVKLTNPTSGMRIKYQAQVQNIGWQPWVYDGDEAGTEGQNLRMEAVKIEL
EGAKSGYHIYYQAQVQNKGWTDVVSDGQTAGTEGQGLRLEALRIYIVKPDVDSKDSSKIG
TVDNNGNKTSYTYDGNGNIETVTEAGKTIKYTYNELEELKREDNGVLNKTEVYNYDAGGN
LLSKTEYPYTTGDLPAAGSTINYGYGDSSWKDKLTNYNGVNISYDAVGNPLNDGRYSYTW
EQGKQLAAMLGNGQNISYKYNEDGARTEKTVNGVTTKYHLDGDKVTYETDGTNQIYYTYD
SSDQLISMNLNGSDYYYIKDATGIIIGLIDKSGTQVVSYTYDSFGKLIAIDGSLKDTVGQ
INPYRYKSYRYDSETGLYYLQSRYYNPEWGRFINADSITANQGELLSGNMFAYCENNPVN
KADVDGNIGIIMDGDQTVFVVPAGIGGVSKASAYETPSRPASRPASRPVSRPSNSSGTRK
VIHKVNSYTGDKKAAPVESGLDSVTAGLSKWGISKKYVLFPPETFPEAIRGRVGAMYASA
KMSKFCGPLSAAASVLGMVDDGLNYKHKYQRLLIDGAGIALGVIATVLLPEGILGAVLCM
GASYVIGAGEEWAKKKYAGGDNDLIKE
NT seq
6924 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagaaaaattaaaaggaacatttcttttgggttaattgtatttttgataacagctatg
tttcatattacaatttatggacagacagtggatataagtagtcttattaaaggacaaagt
aatcaaaataaccaaactgaaaaaaagcaaaagaagaatgtaagtaaaatcacaaaagaa
ttggaggaacaaagaaccgaaaatacaaaacgatatcaaaaggaagatggaagctatgaa
atagcagaatatggtacagcagttcactataaagaaaataataagtggaaggatatagac
aatactttaaaaacttctgatgatagtggctttttagaaaataagcaaaatggttttaaa
atcaaaatatctaaggagtcggataaaaagaagcttgttgatgtgaaaaaagataaatat
gaattctcttggaatttagaggatattaaagaggttgaaggagaagtggcttcagaagct
tctaataaaatagcctctgaggttaatgaaagtgtagatagggagattaaagctaataaa
gaattggcaagagaatcagcccctgaacagcaaaaagataaagctattttagtaaataat
gaaaaaataaaaaccttaaaaaatataatttcaggtataaattttaaggatgcctttcaa
gatactgatttacagtatgttttaaaaggaagcgatataaaagaaaatattatattaaat
aagtatacagataattgtgagtacaagtttaatttaaatataaaaaatatgatacctaag
cttcaaaaggataattcaatcatattttatgattcaacagataaatcaaaggaaatattt
aaaataaatgcacctgtaatgtatgatagtaaaggaaaaacaagctcaaatataaaggtt
agtttaactcaagacaaggatacttgtgtattaaaactaacaccagatacaaaatggcta
aagagcaaaaaaagagcatacccagtaactattgacccatctgttagaacatctcttgat
aaaaatagtatacatgatacttttgttgcttcaaatgatacagctaataaagctcaaaat
caatatctcagagttggaagcgtacctcaaattggaacaacaagaacatacattaaattt
gatttgccacagctttcctctggagatatgattgtttcagctggacttaatttggaatat
aatcctcaggtgagtaaaggctcaaataatcaggtaaatgtacacaaggtaaatcaagat
tttaatccagataacttatcttggggaactcaaccaagctatgattctcatgtagaagct
ttgagtgtaataaattcaacacagcaggattggatttactgggatataacgagcattgca
aaacaatggtatacaagtggaaacaattatggactcatgctagaagaggataatagcagc
aattatacttctttttggtcagacaacattgatgatgattattcaaaagcaagaccacag
gttagttttacctatattaataacagtggtatagaaaattattggacttaccatactcaa
gctataggaagagcaggaacctcatatttaaatgactataatggtaatttggttttaaag
catgacgatattagtatgagtggaagtagattacctattgctataaatcatatttttaat
agcaatgataggggagataacattaactatggaaatggttggaggcttaatgtaagtcaa
aaaattgagcagcaaaccatagagggtcagccttggtataaatatacagatgaagatggt
acaaagcattactttctggattcaggaggagcagagcttcaagatgaactaaatttaggt
ttaaccttaaagaaaaatccagatggttcttgttcaatatcagataaaaagaataacaca
ataaaatttaattcgagaaataatgatttggaacaaattactgatgcgaatggaaatgta
actgtatttgtttctgataatgttaataataaaagagtgcttactgaagtagtagatcca
tcaggtagagtagtaaagttaagttatggagctaatgggaacctagcttcaattgtagat
acttctggaaggacaacctcctatagctatgacggagctggaaatttaactggtataact
tatccagatggaaagacatcttcttatagctatgatggaaatcataatcttataaatgtt
accgattatgatgggtataaggtagactacagctattatggagccttaccttatagggtt
agcagtatagcagaaggaaatacagatggtacagctggagataaactggatattagctat
ggaaataataatactacctttacagatgaaaagggaagaaataatgaatatatgtttgat
gacagaggaaaaactctttcagttaaagatattgatggcagtgcggagtattatcaatat
ggtgatactacgaatgtaagtaaattaacctctgaatcaaagctgcaaaaaacagtggaa
aatttacttaccaatcatgaattggaagctacagacggttggggctttaatagtgatggc
ggcagcggaacaagctcctttagtacagaaaatcattatcttggaaatcaaagtataaag
atagataaaacagataacgtacaaagacaatatgcagatcagtggaataacttgactaaa
ggcgaaacttatactttttcagcctatgtaaaaacctataatgtatcaaataccaatggt
aagggtgcagttataagcttttactataaggataaaaatggcgtatatcaaagcattgat
tcaaaggctattagtggtactaatgattggcaaagacttaatgtaacctttactcttcca
aacgatgcttcggatactaatgtacttacaagagtaggggtattagaggagagtggtact
gcgtattttgacagtcttcagcttgaaacaggaagtgttagtaacagatataatctaata
gaaaacggtgatctttcaggtacaattagtgtaccaaataagtgggggaccacaggtaca
agtggaacagatagcttaaccacaattaacgattcagatcatccggataatttaaacaat
actgtgtattcggtaagtggagcttatggagcttcaaaaaggttgtgtcaatctgttaat
gtaagtggagattctggagatatatattcctttggagcttggggaaagggttactcagtt
ccaagtggtacttttcaaattcaattggcatttgttgatggcaattctgcccaatgggta
acacttgagtttaataagaattatgataagtggcagtatattagcggtaaggctatagca
aaacaaaagtattctagaatagatatatactatctttatgagaataatgcaaatacagca
tattttgatggtgcacagctttataaagaagattttgatcaaagttatcaatacgactca
aaagggaacgtactatctacagcagagattgcaaagaaggattcaacttttcagtttcag
tataatggaaacaatgatttagagcagtctgttgctccaaaaggaggctcctttaagtat
gaatatgacagtaaacataacgttacaagagcaacaacaggagaaaatacaagttacaac
tttggctatgatgcaagtggtaatcccacaactgcaaaagtaggggatggaacagattat
cttcaatctaaagcaacgtacacagacagtggaaattatataaaatccctcacagatagt
ttaggtaataccactacttataattatgatgaaacaaagggacttttaaacagcactaca
gacccaaaaggaaacactactaataacagctatgatggtatggacaaactaacaagtact
agtactacagcagatggacaaaatgtaagcaatagctatgaatatactaatgatgctata
agtaaaatcaatcataatgggtttagctataattttgcatatgatccattaggaaataat
acttctgtatcagttggaaatcaaaatttaactcaaaatatctatgaacctagaaccagt
gtgcttttaaaatctaattatggaaatggacaatcagttagtactgactatgataatcta
gatagaaaaacagcagatttggttggtggagataattcagttggagtaagctattcaggt
caagttcaaaatataggctggcaaaatcccgtaagtgattacagtgaagcaggaacagaa
ggacaatctttgagattagaagctatgaaggttaaattaaataatgcactgccgggaatg
aaaataaaatatcaggcacatgtacaaaatgtaggctggcaggattgggtgtatgatgga
caggaagcaggaacagaaaaccaagggcttagaatggaagcagtaaaaatagagcttgaa
ggcgcaccaaaaggttatattgtaagatatcaagtacatgtagaaggtataggttggatg
gatccagtacaggatggtgaaaccgcaggaactgtaggaaagggcttaagaatagaagct
ataagaatatcagtagaaaagccaagatatacctataagtatgatgcagctggaaatctt
gcacaggaaaacgataatgtcaatgatgtagttaacagctatacttatgatttagaagac
aagctagttaaaagctcagactctaatggaaatgaaataaattacaattacgataaaaat
aataatttagcctcattaaaggataaggtcaatggtgtaaatcatgaaactgattatact
tatgataaagacaataaattaacagcctcaaaatatggtagtaatgaatttgataacagc
tatgacactttgtctagaagaacagcaagcactataaatacgggaacctcaaaatataat
attagttatgaatacctgccaggggcacaaacctcaaatacaggtgtaacctacgatgct
cacgttgaaaatacaggttggcaaaatccttgggtaaatgatggacaaacggcaggaaca
gaaggtaaaggacttagaatggaagctcttaaggtgaagcttaccaatccaactagtgga
atgagaataaagtatcaagcacaagtgcaaaacataggttggcagccttgggtgtatgat
ggagatgaagcaggaacagaggggcaaaaccttagaatggaagcagttaaaatagagctt
gaaggtgcaaaaagcggatatcacatatactatcaagcacaggtacaaaataaaggatgg
acagatgtagtaagcgatggacaaacagcaggaacagaaggtcaaggactaaggcttgaa
gctttaagaatatatatagtaaaaccagatgtggattcaaaggattcttcaaaaatagga
acagtagacaataatggaaataaaacaagctatacctatgatggcaatggaaatattgaa
acagtaactgaagctggaaaaacaataaagtatacctataatgaattagaagaattaaaa
agagaggataacggggtactaaataaaacagaggtttataactatgatgcaggtggaaac
ttgcttagtaaaacagaatacccatatactacaggagatttaccagcagcaggcagtacc
ataaattatggctatggagattcaagttggaaggataagcttacaaattacaatggagta
aacataagctatgatgctgtaggaaatccattaaatgatggaaggtacagttacacctgg
gaacagggaaaacaactggcagctatgttaggtaatggacaaaatataagctataaatat
aacgaagatggagctagaactgaaaaaactgtaaatggagttacaacaaaatatcattta
gatggtgacaaggtaacctatgaaacagatggaactaatcaaatatactacacctacgat
agttctgatcagcttataagtatgaatttaaatggcagtgactactattacattaaagac
gcaacaggaattataataggattaattgacaaatcaggtacacaggtggtaagttatact
tatgacagcttcggcaagctaatagctatagatggaagcttaaaggatacagtaggacaa
ataaatccatatagatataagagttacagatatgatagtgaaacaggattatactatttg
caaagcagatattacaatccagaatggggaagatttataaatgcagattcaattactgca
aatcagggagaattgttgtcaggtaatatgtttgcatactgtgagaataatcctgtaaat
aaagctgatgtagatggaaatataggaataataatggatggagatcaaacggtatttgta
gtgccagcaggcattggaggagtaagcaaagctagtgcttatgaaacacctagtaggcca
gccagtagaccagctagcagacctgtaagtaggccatccaacagtagtggaacgagaaag
gttattcataaagttaatagctacacaggagataaaaaagcagcaccagttgaatcaggt
ttagatagtgtaacagcagggttatctaagtggggaattagtaaaaaatatgttctcttt
ccgccagaaacctttccagaagcaataagaggtagagtaggagctatgtatgcttcagca
aaaatgtcaaagttttgtggaccgctttctgcagcagcatcagtgctgggtatggtagat
gatggcttgaattataagcataaatatcagaggttacttatagatggtgcgggaattgcg
ttaggtgtaattgcaacggttcttttaccggaaggaatacttggagcagtgttatgtatg
ggagcttcttatgttataggagcaggtgaagagtgggcgaaaaaaaagtatgctggtgga
gataatgatttaataaaagaataa
DBGET
integrated database retrieval system