Ctenocephalides felis (cat flea): 113367515
Help
Entry
113367515 CDS
T08578
Name
(RefSeq) 3'-5' RNA helicase YTHDC2-like
KO
K20099
ATP-dependent RNA helicase YTHDC2 [EC:
5.6.2.6
]
Organism
cfel
Ctenocephalides felis (cat flea)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
cfel00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03041 Spliceosome [BR:
cfel03041
]
113367515
Enzymes [BR:
cfel01000
]
5. Isomerases
5.6 Isomerases altering macromolecular conformation
5.6.2 Enzymes altering nucleic acid conformation
5.6.2.6 RNA 3'-5' helicase
113367515
Spliceosome [BR:
cfel03041
]
Other splicing related proteins
Spliceosome associated proteins (SAPs)
RNA helicase-like proteins
113367515
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
HA2_C
DEAD
R3H
Helicase_C
OB_NTP_bind
HA2_N
Ank_2
AAA_22
YTH
nSTAND3
ATPase
T2SSE
AAA_19
SRP54
PhoH
NPHP3_N
NACHT
FtsK_SpoIIIE
AAA_23
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
113367515
NCBI-ProteinID:
XP_026464901
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
1319 aa
AA seq
DB search
MPPKKKRNQKPQIGEHVRIAVDIKLQQFLNNHEQTELEFPNSLSSVERAYIHILVKDHGL
KSKSKGKGDQRFLTIYKRDRSTIIQSDCSFNLTKASYQAIVNLLTTYPLSLKEKTDVKSE
TNSLRSGNPKVQHNKDFLTNPGRLNNGFALVPTLSYNPELKSFRDSLPISQYKSEILDLI
NGHQVILVSGETGSGKTTQIPQFILDEASTKNQCCRIICTQPRRISAVSVCERVAYERGV
QVGQDVGYQIRLESRVSPQTGLIYCTTGVLLRTLMGSNKSFSNITHVIIDEIHERDKFTD
YLLIVLRDSLPKNPSLKLILMSATMDTKVFTKYFNNCPFIEIPGRLFPVKSYFLEDILQI
TNYSNKDMQRIMRSLSNQNKKNDDWASQFRNMHLNESHGSESEPEPENDLKDIMDQSLAE
LWMNGSPHYYGQILHLILNENVSVNYQHRSIGCTILMVCAGRGFVDQTEHILSLGANTKL
RSNNNWTAYDWAQNFGQKECADLIVAYSGSLKMSNEIDNIQRNIQSDEVKKLLEAYSYSF
NSDDEVDHDLILHVIKFLHSNQDDGGILVFLPGYEDIVNLRDLIIRDEKLQERPYQLFIL
HSNMQTIDHKQVFKKLIGIRKIILSTNIAQTSVTIDDVVYVVDSGKVKEISFDGISNTTC
LRANWVSKACAMQRAGRAGRVRPGLCFHLFSSARYNEVMKPFTTPDILRTPLQELCLQTK
LLAPVEMSIADFLQKAIDSPPAMITKQAVALLKTMGALDNSEELTELGMHLVNTPLEPRL
SKMIMYGVIFKCLDPILTIACCLAHKEPFVIPTQTFEKRTLANVRKDFSGGTFSDHMMLL
QIFQAWQKSRQGKYERQFSTKNFVNSATMEQILNTRTQLLGHLRASGFVKAKGHYDIKYL
NVNSDNWPLIKAAMVASSYPSMCRLDREYMTLRTQNETKVGFHPSSSLKTEINFKHKPSA
AQVEFLNKVPSEWMIFEEKSRVGPWCFIRIVTFVSPITVALFGGPIRNTSSMITKTPVVE
LSSESDSESEHNSNRTNNTKTFAVDDWARFEFDDKTADCIYDLRRKWNALFLRRLINPSK
AMSAADEAVLNTVIKVLTEEDLKAGFVQPVGIGQRPLSTEDMTPAVYQNFSNKDTCSAKN
NISWRDRQSKPSFNRNNDRICNVKYSKYFLYKMDHGKDGTTMYRYKQIFTVNQKFAMLFH
RILQNHGRVYIIFLSANKMNFDGVAEVKSSVSGNDRNVQLNWLSRLHVPIAGSGFGTTVN
VSVVSDGIELEDEFGKTLMDYLINYKPSIIILLKNIMYRRIKIIILGFFLLCKVFIYSV
NT seq
3960 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcctcctaagaagaaaagaaatcagaaaccgcaaatcggcgaacatgttagaattgct
gtagatattaaattacaacaattcttaaataaccatgaacaaactgaattagaatttccc
aatagtttgtcttcagttgaaagggcttatattcacattttagtgaaagatcatggtctt
aaatcaaaatctaaaggaaaaggggatcaacggtttttaacaatttataaaagagatcgt
tcaacaattatacaatcagattgtagcttcaatttgaccaaagcctcatatcaagcaatt
gtcaatttgctcacaacataccctctttcacttaaagaaaaaactgatgttaaatcagaa
accaactctctaagatccggtaatccaaaagttcaacataataaagactttttaaccaat
cctggtcgactaaataatgggtttgctttagtacctactttgagttataatccagaatta
aaatcttttcgtgattctttacctatatcacagtataaaagtgaaatattagatctaata
aatggccatcaagttattttggtttctggagaaactggttcaggcaaaacgacccaaata
ccacaatttatattggacgaagcaagtactaaaaatcagtgctgtcgtattatttgcaca
cagcctagaagaatatctgcagtatcggtatgtgaaagagttgcttatgaaagaggcgta
caagttggtcaagatgttggttatcaaatcagattggaatcacgagtcagtcctcaaaca
ggtttaatctactgcactacaggtgtactattaaggacattaatgggttcaaacaaaagt
ttttctaacataacgcatgttataattgatgaaatacatgaacgtgataaatttactgat
tatttgctaatagtgcttcgagatagcttgcctaaaaatccatcactgaaactcattctt
atgtcagctacaatggatacaaaagtgtttacaaagtattttaataattgcccttttatt
gaaattcctgggcgtttatttccagtaaagtcttactttttagaagacattcttcaaata
accaattactcgaataaagatatgcaaagaattatgaggtcacttagtaatcaaaataag
aagaatgatgattgggcatcacaatttaggaacatgcatttgaatgaaagtcatggcagc
gaaagtgaaccagagcctgaaaatgatttaaaagatataatggaccaatccctggcagaa
ctttggatgaatggatcccctcattactatggacaaattctacatcttatcctaaatgaa
aatgtctctgtaaattatcaacatcgatctataggttgtactatattaatggtttgtgct
ggaagaggatttgttgatcaaacagaacacattttgagtttaggtgctaatacaaaatta
cgttcaaacaataactggactgcctatgattgggcccagaactttggtcaaaaagaatgt
gcagatcttattgttgcatatagcggtagtcttaaaatgtcaaatgaaattgataatatt
caaagaaacatacaaagtgatgaagttaagaaacttcttgaagcttattcatactctttt
aattctgatgacgaagttgatcatgatttaatattacatgtaattaaatttttacattct
aaccaagacgatggtggaattcttgttttcctgccaggatatgaagacatagttaattta
cgagatttaataattagagatgaaaaattgcaagaaaggccttatcaattatttattctt
catagcaatatgcaaactattgatcacaaacaggtgtttaagaaattaattggaattagg
aaaataattctgtctactaatattgcacaaacttctgttaccatagatgatgtagtatat
gttgttgattccggaaaagtgaaagaaatttcttttgatgggattagtaatacgacatgc
ttaagagcaaattgggtatcaaaggcttgtgctatgcagagggcaggaagagcgggtcgg
gttcgtcctggtttatgctttcatttattctctagtgcacgttataatgaagttatgaaa
ccatttactacgccggatatattgcggactcctttgcaggaactatgcttgcaaacaaaa
ctcttagcaccagtggaaatgtccattgctgatttcttacaaaaagcaatcgattcacct
ccagctatgattacgaaacaagcagtggcgctgttaaaaactatgggtgctttagacaat
tctgaagagctaacagaattaggaatgcatttagtgaatactcctttagaaccgagatta
tcaaaaatgattatgtatggagttattttcaagtgtctcgatcctatattaactattgct
tgctgcttagcacacaaagaaccatttgtaataccgacacaaacatttgaaaaacgaacc
ttagcaaatgttcgtaaagatttttcagggggaactttcagtgatcatatgatgttattg
caaatttttcaggcatggcaaaaatcaaggcaaggcaaatatgaacgtcagttctccaca
aaaaattttgttaattctgcaacaatggaacaaattctcaacactcgcacacaattatta
ggacacctgagagcttctgggtttgtcaaagcaaaagggcattatgatataaagtattta
aatgtgaactctgataattggcctcttattaaagcagctatggttgctagttcatatcct
tcaatgtgcagattagatagagaatatatgacactgcgcacacaaaatgaaacaaaggtt
ggctttcacccttcaagcagtttaaagactgaaatcaatttcaaacataaaccatcagca
gcccaggttgaatttttgaacaaagttccttcagaatggatgatctttgaagaaaaatcc
agagttggtccttggtgttttattcgaattgttacatttgtttcacctataactgtggca
ctttttggtgggccgatcaggaacacttcatctatgattactaaaactcctgtggttgaa
ctttcaagtgaatcagacagtgagtctgaacataattcaaatagaactaataatacaaaa
acatttgcagtggatgattgggctcgctttgagtttgatgacaaaactgcagattgtatt
tatgatttaagaagaaaatggaatgccttatttttaagaaggttgatcaacccatcgaaa
gctatgtcagcggctgatgaagctgtgttgaatactgttattaaggtattaactgaagaa
gacttaaaagcaggttttgtgcaaccggtgggtattggacaaaggcctttatctacagaa
gacatgactcctgcggtgtaccaaaatttctcaaacaaggatacatgtagtgctaaaaat
aacatatcatggagagacagacaatctaaacctagctttaatagaaataatgatagaatt
tgtaatgtcaagtattctaaatactttttgtataaaatggatcacggcaaagatgggacc
actatgtatagatacaagcaaatatttactgttaatcagaaatttgcaatgttgtttcat
agaatcttacagaatcatggtcgtgtatatatcatatttttatctgcaaacaaaatgaat
tttgatggtgtagctgaagttaaaagcagcgtctcgggcaatgatagaaatgttcaacta
aactggttgagtcgcttacatgtgccaattgcaggcagcgggtttggaacaactgtgaat
gtttctgttgtaagtgacggcattgaacttgaagatgaatttggaaaaactttgatggat
tatttaattaattacaaaccctctatcataattctgctgaaaaatattatgtacagaaga
attaaaattataatactcggattttttctgttatgtaaagtatttatttatagtgtataa
DBGET
integrated database retrieval system
