Ctenocephalides felis (cat flea): 113375402
Help
Entry
113375402 CDS
T08578
Name
(RefSeq) collagen alpha-5(IV) chain-like
Organism
cfel
Ctenocephalides felis (cat flea)
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Other DBs
NCBI-GeneID:
113375402
NCBI-ProteinID:
XP_026471123
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
2886 aa
AA seq
DB search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NT seq
8661 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaataatatacataatttgttacatgttgatcttaattatggagcgtcctttgtaatt
tactccaaaggtggagggtttggcggttttggtggatccggaagccctggaggtcccgcg
ggtccgataggatttggtggtccaggtggcataggaggtccgagtggctcgggcggtcca
ataggtttaggtgggccaagcggtttcggtggcctaagtggacctggtggtcctagcgga
cccagtggtcccaatgggcctagtggtcccggtggtccaacgggcttaggtggctcgaaa
ggtcctggcggttttggcattcaaagtatcccaagcagctttggaactcctggaaaatta
ctgggtagcacaggaattggtgggtttgaaaagcctggagaacccggtgcaataggatat
ggtggtcctggtgcaataggaggaccgagaggcgcggtcgatgcaagaggtccaggagga
ttagttggtccaagtggacaaggtattccaaacagttttggtggcccaagaggtgccggt
aaaccaagtggacccagtgggctaagaggacctggtggtccaagcggaccaagtgggcca
caaagacacggtggtacaacaggtttaggtggcccgaaaggtcctggtggtcctggcagt
atcccaagcagctttgtaactcctaataaattaccgggtagcacaggacccgttttcggc
accaaagattcaaaaataccgggtggtcaaaaaggtccaactggctttggaagtcctgca
aaaacgggcttcccatctgaaagtggtcaatataggccagataagtataatccggatgaa
agtgggcaatataaacctaataatgatggtcaatatattcatcaagctggaccagatgga
ccaggagcaccagattacatacatcaagagggtccaggtggcgggtttggcggttccggt
ggattcggaagtcctggaggaaccagaggtccaacaggatttggtggtccagatggcata
ggtggttcaagtggattaggtggtccaaaaggtccaggtggtccaaaaggtccaggtggt
ccaaaaggtccagatggtccaaaaggtccaggtggtccaaaaggtccaggtggtccaaaa
ggtccaggtggtccaaaaggtccaggtggtcccagaggacctggtggtctaagcggacca
ggtggtcctacaggatttggcggtccaggtactataggagtttcgaaaggtgctggcggt
ccaaaggaaccaggtggttcaagtagacctggtagtctaaccgaaccacgaggtcccagt
ggtccaacaggttccggaagtttgagaagtccagatggtcctggaattcaaggtattcga
agtagctttggaactcctggaatttcacctggtagcacaggtagcccaggtagcccagtt
gttacaggtagtcaaagcagacctaataacgtttttggcacgaaagactcaacaacactg
ggtggtcaaaaaggtccaagtggctttggaagccctgcaagcacaggtgcagcaactgaa
ggtggtcaatatagaccagataggtataaaccggatgaaagtgggcaatataaaccggat
aatgatggtcaatatgttcaccaagctgggccagatgggccaggagcacaagattacata
cgccaagaaggtccaggtggcgggtttggcggtttcggcggatctggaagacctggagga
cccgggggtccgactggattcggtggtgcagaaggtccaagaggcgcgggcggtacaaaa
ggtccaggcggatcaagtggccttggtgctccaagcggcctcggtggtctaaaaggtcct
agtggtccaagaggtcctggtggtccaagtggacccagtggtctaagaggtcccggtggt
ccaagtggacccagtggtccaagtggacccagtggtccaagtggacccagtggtcaaaga
ggtcccggtggtccaagaggtcccggtggtccaagtggacccagtggtccaaaaggtccc
ggtggtccaagtggacccagtggtccaagaggtcccggtagtccaaaaggacctggctat
ggaactcctggaatattaccgggtagcatacgaagtcctgttggtcaaagtggtctaggc
aaacctggtgacgtatttgtcacgaaaggttcaagaacaccgggtagtcaaataggtcca
agtggcgttggtagtcccgcaagatcaggcaccccatctgagagtggtcgatatacgcca
gataagtttaaatcggatcaaagtggacaatatgtaccagataatgacggtcaatacgtt
catcaagctggaccagatggaccaggagcacaagattacatacatcaaaagggtccagat
ggcggctttggcggttacggtggattcggaagacctggagaacctggaggtccgatagga
tttggtgggcctgggggtccgaagggcgttggcgattcgagaggatcggatggtccaaaa
ggaccatatggtccaagtggtttgggtggtccaaaaggtccaggtggtccaaaaggtcca
ggtggtccaaaaggtttaggtggtccaggtggtccagaaggtcctggtggtccgaaaggt
ccaggtggtccaaaaggtccagttggtccaaaaggaccaggtagtccaagtggactaggt
ggttcaacaggtttaggtgtcccaaaaggttcagttggtcctggcattcaaggtatcccg
agcagctttggaacttttggaaaattaccgggtagcacaggaattggtagatctgaaaga
cccggagaatccgctgagagaggcgtggccggtccaaaaattccaggcggttcaagtgga
ctctctcgtccaagcgggcaaggtggtccaacaggttttggtggttcaagaggttccggt
gttccaagtggccccggcggattaagaggtccaggtggccttggcgttcaaggcatccca
tctgagagtggtcaatatagaccggataaagttaaatcggatcaaagtgggcgatataaa
tccgataatgacggtcaatatgttcatcaagttggaccagatggaccaggggcacaagat
tacatacatcaaggtggtccaggtggcggatttggcggttacggtgcacctggaaaatct
gagggacccggtggtccgtcaggattgggtggacctggaggtccaaagggcgttggtagc
gcgggagggccaaaaggtccaggtggtccaagaggatccggtggttcaagcggacccggt
gggccaagcgggcccagtgggccaagaggacccggtgggccaagaggacccggtggtcca
agcggacccagtagtccaacaggtacggaaggttcaaaagttccaggtggtcttgccatt
caaggtgttccaagcagctttggatatcctggaaaatttccgggtagcacagaaagcata
gttggtctaggtggtccaaatataccaggtgctccaaaaacacctagtggtccatttgct
caaaatattccaggcagtgctcggagtccaccgagtagcacaaaaagcccttttggcaca
gtcgatggcggcagaccaggagcccttggaggcttcggcggccctgaagctccaggttta
gttggcccctatggtcagagtaagccaagtagaccagatggtttaggcggtaccatccag
agagggtatcttccagtgaaggacggttctagatctccaggagcctcaactggagtaagg
ccagaagatttacgaggttcaagtggcccaggtggcgggtttggcagttttggtccaggt
ggttcaagcggaccaggtggtacaagaggacccagcggtccaagtgggcccggcggacct
agcggacctagcggaccaagcggtccgagcggatccagcggtctcagcggacccggcggt
ccaaaaggaccaagcggtcctagcggacccagcggtcctagcggtcccagcggacccagc
ggtcctagcggtctcagcggtcccagcgggcccggcggtccaaaaggaccaagcggtcct
agcggacccagcggtcccagcggtcccagcggacccagcggtcctatcggtctcagcggt
cccagcgggcccggcggtccaaaaggaccaagcggtcccagcggaaccagcggactcagg
ggtcccagcggacccggcggtccaaaaggaccaagcggtcctagcggacccagcggtccc
agcggatccagcggtcccagcggacccggcggtctaaaaggaccttatggtccaataagt
tctggaggcccaaaaggtccgggcggtccagtgactcaaggcataccaagtagttttgga
agtattggaaaattaccgagcagtggaggaagcttatttggttcaggtggtcagggcaga
cctggtgacgttttcggtacgaaaggttcagaaacacctgttggtcaaaagggtctaagt
ggctttgcaactcctgtaaaaacaggtgacgggtttggcagttttggtgtcccgggaaga
tctgatggaaccggaggtcctaaaggatttggtagttttggtggcataggaggttcgata
agtacgggcggtctaaaaagtcaaagtggtttaagcggaccaggtggtacaaaaggaccc
agtggacccagtggacccagcggtctccgcggacccagcggacccagcggtccaaaagga
ccaagcggtcctagcggtcccagcggtctcagcggtcccagcgggcccggcggtcccagc
ggaccaagcggtcccagcggaaccagcggactcaggggtcccagcggatccagccgtcca
agtggacccagccgtccaagtggacccagccgtccaagtggacccagcggtccaagtgga
cccagcggactcaggggtcccagcggacccagcggtccaaaaggaccaagcggtcctagc
ggatccagcggtcccagcggtcccagcggacccggcggtgcaagaagacctcatgttcca
ataagttctggaggcccaaaaggtccaggcggtccagtgactcaaggcacaccaagtagt
tttggaagtattggaaaattaccgagcagtggaggaagcttatttggttcaggtggtcaa
gggagacctggtgacgtttttggtacgaaaggttcaggaacaccggttggtcaaaagggt
ctaagtggctttgcaactcctgtaaaaacaggcgccccttctgaaagtggtcaatataga
ccagataggtataaaccggatggtagtgggcaatataaaccggacagtgatggtcaatat
gttcatcaagctggaccagatggaccgggagcacaagattacgtacatcaggggggtcca
ggtggtggttttggtggttccggtggaccgggaggtccaacaggattaggtggtcctgga
ggtcctaaaggcgttgatggttttggtggcataggtggtccaaggggtacgggtggtcca
aggggcccgggtggtccaaagggcccgggaggtccaaaaggtccgggtggtccaagtgga
ccaggtggtccaagtggaccaggtggtccaagtggaccaggtggtccaagtggaccaggt
ggtccaagtggactaggtggcccaagcttgccaggtggtcaacgcggagcaggtgcccca
agcaaaccaagcggttctagcggacccggtatttcaactggattaattgatttaagcaga
ccagggagttcatttggaccaggtccaagcggacccgtgagttcgagcggatttgctggt
ccaagcaaacccggtcagggtggaccaggtagaccagatggtttaggcggtaccattccg
agggggtatcttccggtaaaagatggtcctagatctccaggggtctcagcaagtgtaaga
ccagaagattcacgaggtccaagtggcgcaggtggcgtattcggcggtttcggtgcaggt
ggttcaagtggattacgtggaccagtgggtacaagcggttccggtggtccacgaggcccg
aaagatccgcgaggtcctgacggttctggaatccagggtattccaagcagcttcggaagt
gctggaaaattaccgagtagcacgggaagccttattggacaaggtggtcaaagcaaacct
ggtgacgcttttggcacgaaaggttcaggaacaccgggtggtctaaaaggtggcgggttt
ggcggttacggtggattcggaagacctggaggacctgggccgataggatttggtggacct
ggtggacccggtggacctggtggattaagtggtcaaagcgtacccgccggttcaagagga
cccagtgttccaagcggacccggaggtccaagcgggcccggaggtccaagcggacccgga
ggtccaagcagacccggaggtccaagcggacccggaggtccaagcgggccccgaggtcca
agcggaccaggtggcctaggaggacctagtggtccaggaggacctagtggtccaggagga
cctagtggtccaggaggacctggacgcccaggaatattcgttagcccaggaggacccggt
agtccaagcgggcctggaggcccaagacaaattggtggtccaggaggacccggtggtcta
agcgggcctggaggcccaagaggaattggtggtctaggaggacccggtggtttaagcggg
cctggaggccctagaggaattggtggtgctgtaggacccagtggttcaagcggaccgagt
ggttcaagtggactaggtggtcaaagcgtacccggtggttctagaggacccagtgggtca
agcgcgcctggtggcctaagagaacccagtggctcaggggcacccggtagctcagtgggt
cgcggtggcccagggggactcggtggcccagggggacttggtggctcaggaggacccggt
agtccaagaatacccggtggtccaggaggacccggtggcccaggaggacccggtggccca
ggaggacccggtggcccaggaggacccggtggcccaggacgacccggtggcccaggagga
cccggtagcccaggaggacaaggtggcccaggaggacccggtggcccaagaggacccggt
ggcccaagaggacccggtggcccaggaggacctggtggtccaagcggactaggtggtcaa
agccgacaaggtggctcattcgaaccaggtgtctcaagcgcgcctagtggtccaagagga
cccagtggtccgagcgggcttggaagcctaggaggagttggtggtccaggaggacccagt
ggtccaattgggcccggtggtccaattgggcctggtggtttaagcgggcccggaggccca
agaggagtcggtggtctaggaggacccggtggtccaagcggattgagtggtgcaagccga
acgagtggtccaggcggactaggtggtcaaagcagaccaggtggctcaattggaccaggt
agtcaaagcgtgcccgttttaggttctagagggtctagtgggccaagcgcgcttggcggt
ctgagaggacccggtggccaaacaggaccaagtggtccaacaggtttaggaggaccgaac
gcttttagtggctctagcattcaaggtaccccaagcagctttggaagtattggaaaagta
ccgagtggtccaagaggacccggtagtccagaaggagccagtggctcaagtggatctgga
ggtcaatatggattaattggaccaagcggaccaggtggtccaagcagttcaggtggtcca
agcgggcttggtagaccaagtggtccgagaggatccggtagtttaagtggacctgatggt
ccttatggaccaagtggtcctagcagaccaagcggctcagttggatcaggtggtaaaagc
gtacctggtggttcaagaggacccagtggtccagcaggcttaggaagcccgaacgttcct
ggtggtcctggcattcaaggtatctcaagcagctttggaagttttggaaaattaccgagt
agcacaggaagcctagttgttccaggtggttcaaaaatcaccgatgttgcaaaaacatct
aaggctccaggagatttatccgctttttcacaaggggcaagaggacccgcagtttctggg
ggaaaagatctatgtcactttggcggcccaggaggatcaacttcaaacagttttgacggt
ggattcattttcactccgcccacgtctggcgataaatgtttgccacctttatctgtgaaa
ccaatcaccgtaccaaaaattacaacatcaacttgcccgtgctatctggttggtcctgaa
agtagtgatactaaactagctgcctttaatagaccgtctggcacgcctgcatttagttca
attcgtcctgaaaatttgccgccaggcgcagttataggttttctgccggttgtgttcttc
ccgtattgtccggatggtaacacgaaaggaccagagccgactacactgcaaccgctgttt
ccatcagctatacccataccatatccttgcggccaatgtaacagtggcagcgcgagaaat
caaagatcagctggaaacgacagctttatgaaagtactgaatcaatcaggcgtcggtata
gcatttgtcgaaagctcttag
DBGET
integrated database retrieval system