Clostridium fermenticellae: D4Z93_00150
Help
Entry
D4Z93_00150 CDS
T06956
Name
(GenBank) collagen-like protein
Organism
cfer
Clostridium fermenticellae
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
BclA_C
A_ENA
Collagen
C1q
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AYD39065
UniProt:
A0A386H096
LinkDB
All DBs
Position
complement(30895..32178)
Genome browser
AA seq
427 aa
AA seq
DB search
MSQPSFPSISPSITREDAINVILSSIAMEELGLSHIINAEGEKIQYTLGTIPGVTSPSST
IDDIIAVNDSVRETMNSVVQNQSLLKSKMQNALNSSTMQGVTGPTGPTGPTGPAGGATGP
TGATGPAGATGDTGATGNTGATGATGVTGPTGDTGPTGDTGATGPTGPTGADGDTGATGA
TGATGPTGPTGETGPTGATGPTGDTGLTGDTGPTGATGPTGATGPTGETGPTGETGPTGE
TGPTGETGPTGDTGPTGDTGPTGATGPTGDTGPTGATGPTGATGPTGATGENVTETTAFA
ANTSGTAITVLAAGTPVPLPNSQIISSDISIDSSNTVFTINTAGRYRISYNVNITASLLL
STRLIINESSNTASTIVPILSLSNFSNEILIDLTAGSTVYLQLFGLAGIATLLGNSTGAS
LMIVRLS
NT seq
1284 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtcacaacctagttttcctagtattagcccatctataacaagagaagatgccatcaat
gtaattctttcatcaattgctatggaagagctcggactaagtcatataataaatgctgaa
ggtgaaaaaatacaatacaccttaggaacaattcctggagtaacaagtccatcatcaaca
atagatgatataattgcagttaatgacagtgtaagggaaacaatgaattctgtcgtacaa
aatcaatcattactgaaatctaaaatgcaaaacgccctaaactcgtcgactatgcagggt
gtaactggccctactggtcctactggccctactggccctgcaggaggtgcaactggtcct
actggtgctactggtcctgctggtgctaccggcgatactggtgctaccggcaatactggt
gctactggagctactggtgtaactggtcctactggtgatactggccctaccggcgatact
ggtgctactggtcctactggccctactggtgcagatggtgatacaggtgctactggagct
actggagcaaccggtcctactggtcctaccggtgagactggccctactggtgctaccggc
cctactggtgacaccggtcttactggtgatactggccctactggtgctaccggtcctact
ggcgctactggtcctactggtgagactggccctaccggtgagactggccctactggcgag
actggccctaccggtgagactggccctactggtgataccggtcctactggtgataccggt
cctactggtgccaccggtcctactggtgatactggccctaccggtgctactggtcctact
ggggctactggtcctactggggctactggcgaaaatgttactgaaactacagcctttgca
gcaaatactagtggtactgcaataacagtattagcagctggtactccagtcccacttcca
aattctcaaattatatcttcagacattagtatagattcatcaaatactgtctttacaata
aatacagcaggacgttatagaatatcatataatgtcaatataactgcatctttgctctta
agcacaagactcatcataaatgaatcatctaatacagcctccacaatagtaccaattcta
tcgttatcaaacttttcaaatgagatactgatagatttaaccgcaggatcaacagtatat
ttacaattatttggtttagcgggtatagccactttattgggtaatagtaccggtgcttca
ctaatgattgtacgtttaagctaa
DBGET
integrated database retrieval system
