Clostridium fermenticellae: D4Z93_11965
Help
Entry
D4Z93_11965 CDS
T06956
Name
(GenBank) DNRLRE domain-containing protein
Organism
cfer
Clostridium fermenticellae
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RHS_repeat
CBM96
Laminin_G_3
CBM_4_9
DUF5591
Ribosomal_L1
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AYD41191
UniProt:
A0A386H619
LinkDB
All DBs
Position
complement(2591700..2598815)
Genome browser
AA seq
2371 aa
AA seq
DB search
MYDKNKKLSKKIKLILDGENDSYILTLIPDSNWLEDEEREYPIVIDPTVITEQNKESIFD
SYVSSAAPTTNYTGDVILKVGNDTYSGVTRSYIRFKLPTDKLTTGDMVIAGYLDLWLAGQ
NDNACQINVHKVLNDWSDLSITWNNVPSIDDSKIQDYNLVKGDWGEPMTWDVTRVVKEWL
SSGVNYGIMLKNSDETVGYNQFLSSNVSEYDEYGNHLAEARPRIRIDYINNSGLEDYWTF
HNQTAGRAGTGYVNDYNGNLIFVHNDLAMDGNKMPLTLNHIFNSNDRNSSRGYGLGWRLN
LNQKVDFVTIGEGEFYVYTDEDGTKHYFYYDASTATYKEQLGSDLTFTKNSDNSYIIKDK
NGGTLEFVPGGYLYKIKDKNDNTITLSYDGVILKKITDGAGRVTTLDVLSNGYLVGIIDP
GGRRTSFAYNGIQLSKITYPDGKYSVFYYDNNNNLIEAVNYDNYMLNYSYYTEAPYRISG
IEEFGTDGIAGRRLGIEYNYNTTTFTDAKGRKNIYQFTDYGTTASIQDNSGSAEVYKYYN
SNKYDKTAPNLYNKLNLTSKMQKFTKNYLKNHGAEKENSDWTPGNFEGKEINASFTTEEA
YIGQRSLKIVKNDISSRDFYRQYVTSLSRGKDYVFSAYIKTMDITKVNNKGAGLFVVYQD
TSGNYNTIEGNMYIQGSNDWVRQELKFVLPYDTDLSTVSISAGIIEETGTVYLDCLQLED
GDIPSRYNLIENADFSYDEVTPPGWTKDSQSDNNDRVVNTDNGKAYEIIGGSGKQKYLLQ
EFTMSGKTGDSFIASAWAKGDSVPLNDPNLDIDKVRRFSLEVGLKKTDDTGTDWFLVSFN
EDLNTWQYVSNIIVAKNDYKKVSLYMEYYNNLNAAYFTNVQFYKEEYGESYSYDDRGNIV
SAASLAKQKSSFEYNDDNDLIKATMPTSGTFKYEYDSKRNVTKAISAMQIPYTFTYDSSG
NVLTSTAGKTDGDNSLFMQSTASYSISGNYTKSVTDGKDSSVINHYDEKKDLLLGVTDPK
GNKITYNHDDMDRLVSTSKFLLDPGSRNLEKFPLNTNTEGSKGTKTLEENAVFDKDDSGK
TAFASFDAGINLLTNSSFEDGTNLWQLSDWDNSTGKWRIVSDGVNGSSCLECYDSDGLTN
GSATNSVAYQVITFETALTSPKTYTLSAYAKRIGTDNPRLGVMCLDSNGLEITGGYQNYE
KPIDPNEWIRINNFLTLPAGTKSFYVILRSAVRDSNKIRFDSVQLEENNICTPYSPGTRT
SSKLYYDLGLDKKSGTMAVWFNTKGSGTRIIFSNENATVLFNLYINDDNKMVLNSLKGDG
STQNIITADDLTISTDTWYFTALKWQWTVNQSNYTGTLNCTLYINDKIYTGSSGDFRDFT
GVITAAGSNVYSKYELNGFIESFAYSRNALSDGDIKLLYNRSMPEDTGNIVTNSYSYKDD
RIETITHNGFNYKFEYDALGNNSKVYVGDQNLVANNFDRSTGNLLDSTYGNNQSVSLEYD
NLDRIIARRFMGETRYIYKYDGNENLAYHEDKVNNKNYRYIYDLSDRLVRIEELDPENPN
NINYTKFSRDKEDNETGIYQKINGKLYETRYEYDGDDKPTQVLYGDGIDDNEDAEYFPFM
GDATGSKGTLPVEQNAVYGIDEDGKSVLYAYPGTKVVYDLGISRNNGTMTAWANISSGGR
GSRLIIANEGTDRNLLNVYVDDNNKLNLGIMDSSSNFKSVITTEEELIPNQWYFTAVVWA
FDEVNLHCSLYLNGKAYKKDVAAADFRDFTGVKTAVGSNISGDYILKGLVKRFSFTPKEL
TDPEVLKMYHGSRVKYEYDTRLGSLSKKITSIGLKNFDVYYSHESGSKLHSTTDRITTIQ
NKDHPINYKYDENGNIVNISEVSVFSGERENISYYYNELNELVEEDNDALNKKITYTYDE
GGNIKSKVEIPRGSGGNGTTITYSYDSVWKDKMINYNGKQITYDEIGNLKTYNGCSCEWE
EGRQLKSISGNGKDIVYKYNDSGIRTEKSVNGVTTKYYLAQDKITFEDNGSDRIYYTYDS
QDNLISMNLNGEEYYYIRNVQGDIIGLFDNTTAQVVSYVYDTWGRLISIKDADGVDITGD
TAHAGYKNPYRYRGYRYDNETGLYYLNSRYYNPEWGRYINADAAAGGTGVLLSHNVFAYS
MNNPVNMTDPSGCLPRWLSRAAAAVKRHVTAVYRKVVNVVTKAKAYVSKKVAQVKITVRK
IVANVKSAYHSLTSSQVRNVGKSTAATWAEGKASSALKGVRDYIPIVTNRSLRRAGQEIL
APVKGASFLRGIGQIERIGVIGGAMTVDSVWEDFHSGYTSTEAIGRGALDISAAAVTIAI
GWSNPVGVAVGSAMIFGTAAEIAKNLIWKND
NT seq
7116 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtatgataaaaacaagaaattaagtaagaaaatcaaattaatattagatggggaaaat
gactcctacattttaactttaataccggattctaattggttggaggatgaagaaagagaa
tatcctatagtcattgatccaacggtaataacagaacagaataaagaaagtatttttgac
agttatgtatcttcggcagcaccaactacaaattatacaggtgatgttattctgaaagta
ggaaatgatacttattccggagttacaaggagctatattagatttaagcttccaacggac
aagctaacgactggagatatggtgattgcaggatatttagatctatggttggccgggcaa
aacgataatgcctgccagattaatgtgcacaaggttttaaacgactggagtgatttaagt
ataacttggaataatgtaccttccatagatgacagtaagattcaggattataatttggtt
aaaggcgactggggagaacctatgacctgggacgtgacaagggtagtaaaagaatggctt
tcttctggtgtaaactatggaataatgctcaaaaacagtgatgaaactgtgggatacaat
caatttttatcctcaaatgtaagtgaatatgatgaatatggaaaccatcttgcggaagca
agacctagaataaggatagattatataaataattcgggacttgaagattactggacattt
cacaatcaaactgcaggaagggcaggaacaggatatgttaatgactataatggaaattta
atatttgtgcataatgatttagctatggatggaaataaaatgcccctgaccttaaaccat
atattcaacagcaatgatagaaacagcagcagggggtacggtcttgggtggagattaaat
ttaaatcagaaggttgattttgtaacaataggtgaaggcgagttttatgtgtatacagat
gaagatggaactaaacactatttttattatgatgcatccacagcgacgtataaagagcag
cttggatcggatttgacttttaccaaaaattcagataacagttatattataaaggataag
aacgggggaactttagaatttgtcccgggaggatatttgtataaaataaaagataaaaat
gataataccataacacttagttatgatggagtcatattaaagaaaattacagacggcgca
ggtagggtaaccaccctggatgtattaagcaatggatatcttgttggaattatagatcca
ggcgggagaaggaccagttttgcctacaatggaatacagctgtctaaaataacttacccc
gacgggaaatactctgttttttactatgacaataataataatttaattgaggcagtaaat
tatgataattacatgctgaattattcatattatactgaagccccatacagaatatcggga
atagaagaattcggtacagatggaatagcagggagaagacttggaattgaatataattac
aatacaaccacattcacagatgcaaaaggcaggaagaatatatatcaatttactgattac
ggaactacggcaagtatacaagataatagtggaagcgcggaggtatataagtattataac
agcaataaatatgataaaacagccccaaatctatataataaattaaacttgacatcgaag
atgcagaaatttactaaaaattatttaaaaaatcacggggcagaaaaagaaaattctgac
tggacaccgggaaattttgaaggaaaagaaataaatgcatcttttactacagaagaagct
tatataggacagagaagtttaaaaatagtaaagaatgatataagcagcagggatttttat
aggcagtatgtaactagcttgagcaggggaaaagactatgttttctcagcctatattaag
acaatggatattacgaaggtgaataataagggtgccggtttatttgtagtatatcaggat
acttcaggaaattataatacaatagagggcaatatgtatatccagggaagtaatgactgg
gtaaggcaggaattgaagtttgtacttccatatgatacagatctttctactgtaagtatt
tcagccggaataatagaagaaacaggtactgtgtatttagattgtttgcagcttgaggac
ggagatatcccaagcagatataacctcatagaaaatgcggatttttcatatgatgaggta
actcctccagggtggacaaaggattctcaatcagataacaatgacagggtagttaatacc
gataatggaaaggcatatgagataattggcgggagtggaaagcaaaaatatttactgcag
gaatttactatgtcaggcaaaacaggtgacagttttatagcatcagcatgggcaaaggga
gattcggtacctttaaatgatcctaacttagacatagacaaagtaagaagattttctctt
gaggtaggacttaagaaaacagatgatacagggactgactggtttttagtatcctttaat
gaagatttaaatacctggcagtatgtatcaaatattatagtggctaaaaatgactataaa
aaggtctctctgtatatggaatattacaataacttaaatgcggcatactttacaaatgtt
cagttctataaagaagaatatggagagagctatagttatgatgacaggggaaatatagtt
tctgccgcaagtttagcaaaacagaagagcagctttgaatacaatgatgacaatgacctt
ataaaagccaccatgccgacgagcggaacttttaaatatgaatatgacagcaaacgtaat
gtaacaaaagcaatttcggcaatgcagataccatatacttttacctatgacagtagtgga
aatgtccttacatctacagcaggcaaaacggatggagacaattcgctttttatgcagtct
accgcaagttacagtataagtgggaactataccaagtctgttacagatggaaaagatagt
tcggtaataaatcattatgatgaaaagaaagatttgctacttggggttacagatcctaag
ggaaacaaaatcacttataatcatgatgatatggataggcttgttagtacatcaaagttt
ttgctggatcccgggagcagaaacttagagaaatttccattaaacacgaatactgaaggc
agcaagggaacaaagactttagaggaaaatgcagtatttgataaggacgacagtggaaaa
acagcatttgcatcctttgacgcgggaataaatttgcttacaaattcctcttttgaagat
ggaactaacttgtggcagttgtcagattgggataactccacaggaaaatggaggattgtt
tcagatggtgttaacgggagcagctgccttgaatgttatgattcagatggtcttacgaat
ggaagtgcaactaattcagttgcctatcaggtaatcacctttgaaacagcgctaaccagc
ccgaaaacttataccttaagtgcatatgcaaaaaggattggtactgacaatcctagactc
ggtgtaatgtgtctggatagtaatggccttgaaattacaggtggatatcaaaactatgaa
aaaccaatagatccaaatgagtggataagaataaataatttcttaactctcccggcaggg
acaaagagtttctatgttatattaaggagtgccgtaagggacagcaataaaattagattt
gattcagtacagctggaggaaaataatatatgcacaccgtacagcccggggacacgtaca
agttcaaaactgtactatgatttaggactggataaaaaatcgggaactatggcagtatgg
tttaatacaaaaggcagtggcacgagaataatcttttctaatgaaaatgccacagtttta
tttaacctttatataaatgatgataataaaatggtactgaattctttaaaaggtgacggt
agcacccagaatattattactgcagatgatttgacaatttcaactgatacctggtatttt
acagctttaaaatggcagtggacagtgaaccagtcaaattataccggtactttaaactgc
actttgtatataaatgacaaaatttataccggttcgtcaggtgactttagagattttaca
ggtgtaataacggcagctggtagtaacgtatatagcaaatatgaattgaacggatttata
gaaagctttgcttacagcagaaatgcactttcagacggggatataaaactgctttataat
agatccatgccggaggatacgggaaatatcgtaacaaatagttacagttataaagatgac
aggatagaaaccataactcataatggttttaactataaatttgaatatgacgcccttgga
aacaacagcaaagtttatgtgggagatcaaaatttggtagccaacaattttgacagatcc
acaggaaatctcctcgattcaacatatggcaacaaccaaagtgtatctctggagtatgac
aatttagacaggataattgcaaggagattcatgggtgaaacaaggtatatctataaatat
gatggaaatgagaaccttgcctatcacgaagataaagtcaataacaaaaattacagatat
atctatgatttatcggacagattagtgagaatagaagaactggacccggaaaatccaaat
aatataaactatactaaattttcaagggacaaagaggacaatgaaacgggaatatatcag
aaaatcaatgggaaactgtatgaaaccaggtatgaatatgacggggatgacaaaccaaca
caggtactatatggtgacggcatagatgacaatgaggatgcagaatacttcccgtttatg
ggagatgccacgggaagtaaagggacactgccagtagagcaaaatgccgtgtatggaata
gatgaagatggaaaatccgtactttatgcttatccggggacaaaggttgtatatgacctt
ggaataagcagaaataatggaactatgacagcctgggcaaatataagctcggggggaaga
ggttcgaggctaataattgcaaatgaaggaacagatagaaaccttttaaatgtgtatgta
gacgataataacaagctcaacttaggtataatggacagttcaagcaattttaaaagtgta
ataacaactgaggaggaattaataccaaatcagtggtattttacggcggtagtatgggca
tttgatgaagtaaacttacactgcagcttatatttaaatggaaaggcctacaaaaaagat
gtggctgcggcagactttagagattttacgggagttaagacggcagtcgggagcaatata
agcggggactatatattaaaggggcttgtaaagagatttagttttaccccaaaagaacta
acagatccggaagtactcaaaatgtatcacgggagcagggtaaaatatgaatatgatacg
aggctcgggagtctgtcaaaaaagataaccagcatagggcttaaaaattttgatgtttac
tacagtcatgaatccgggagtaaactgcattcgacaacagacaggataaccaccatacaa
aataaagaccaccctataaactataagtatgatgagaatggaaatatagtaaacatttca
gaagtatctgttttctcgggagagagggaaaatatatcatattactataacgaattaaat
gaattagttgaggaagacaacgatgcactaaacaaaaaaataacttacacctatgatgag
ggcggaaatataaagagtaaggtggaaataccccgcggatcaggtggaaatggaacaact
ataacttatagctatgatagtgtctggaaagataagatgataaattataatggaaaacag
ataacgtatgatgaaatagggaacctcaagacctataatggctgcagctgtgaatgggaa
gagggaagacagctgaaatcaatatctggaaatggaaaagatatagtatataaatataat
gattcgggaataaggacagagaaaagtgtaaatggagttaccacaaagtattatcttgca
caggataaaattacctttgaagataatggttcagataggatatactatacttatgatagc
caggacaacttaataagcatgaatttaaatggagaagaatactactatataagaaacgtc
cagggggatataatagggctgtttgataatactaccgcacaggtagtaagttatgtttat
gatacctggggcaggcttataagtattaaggatgcagacggagttgatataacaggtgat
acggcacatgccggatataaaaatccttatagatacaggggatatagatatgataatgaa
accgggctttattacttaaactccagatactataaccctgagtggggaaggtatataaat
gcagatgctgcggcagggggtacaggagtattattatcccataacgtatttgcatattcg
atgaataaccctgtcaatatgacagacccgagtggctgcttacctcgatggctcagcagg
gcggcagctgcagtgaaaagacatgtgacggcagtttacaggaaagttgtaaatgttgtg
accaaggcaaaagcatatgtgtcaaagaaagtggcacaggtaaagattaccgtgaggaag
atagtagcaaatgttaaatcagcatatcatagtttgacaagtagtcaggtaagaaatgtt
ggaaaaagtactgcggctacatgggcagaaggtaaagctagttcagcattaaagggagtt
cgtgattatataccaatagtaactaatagatccttaagacgtgccggacaggaaattttg
gcaccagtgaaaggtgcatcatttttgagaggcattggtcaaattgaaagaattggtgta
attggtggagctatgactgttgattctgtatgggaagattttcatagcggatatacttct
actgaagcaattggacgaggtgctttggatatatcagctgctgcagtgacaattgctatt
ggatggtctaatccagtaggagtggctgttggaagtgcaatgatttttgggacagctgca
gaaattgcaaaaaatttaatctggaaaaatgattaa
DBGET
integrated database retrieval system