Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40: CFF8240_0478
Help
Entry
CFF8240_0478 CDS
T00430
Name
(GenBank) surface layer protein SapA12
Organism
cff
Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DUF4214
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ABK82270
UniProt:
A0RN90
LinkDB
All DBs
Position
complement(468408..471737)
Genome browser
AA seq
1109 aa
AA seq
DB search
MLNKTDVSMLYITIMGMASEGDGNKYWLDYANNNSLGVSSLANIMLDSPGAAKFFGDSLL
AGNEKDFVTKIYSIALGNTSDVDGINYWTKAITGGGEFTDSKGNVISVASLSKGDLIGAM
INSMVNGGSAESKAIFEAKAAASDYFADATLGKDISGLDEGTTSKLISEINSASDLDKVK
SEIDGLKESIDEAGLNKIALTTENDTITGTEGGDLISGVVGTAAESTLNPGDKIDGGAGN
DVLKVDLKNNFKGLKDDGYIKNIEKLSLTNSSVSNRTFDAKGIDGLQTVALSGEKGISVT
NLANIVDVEVNGFKGTNFNVDSIYADKVLDGSADVQNLKVNGVGAKGASVAITADKIETL
NLNTTGSQSFVSADVASISVKGNANLSLATGAKTTTLDASSFGGALDADLSTSASVTSIK
GGNGNDKITIKDVAVNVAIDGGAGNDELVIKGSTADTLQPTLTNIEKVTIDGNTKDLTLS
LKKAQSVTELSFKNIAKTVTESNGNVETVNILANNATDKAVTINDESLKTINFSDVDDKG
ASVAAKGKIVADKATELTINSNKVTLASDAVVQAANATKIDINAAKDTVGLTLGGVAKLT
DLTVNNKGAFALTGANATDLDSVKNLSVNTEGAFSIATATSLKNLNNLSLNGVSADLNSV
NVGTATLASLEANINVSGEFKLGTTTAKGDVDFNIENVGALTLGAITSSTGNASVIISSA
TGNVTLGAVSATQGNLTLNAGNTLGNITIGALKGDIVSVDLGGVLGTINSDANNKVSITS
NEVTYVGSEISKNVVEITAAAGGTDLNAQVIGGAAADDALTIIGKGDTQTITASGDLSGG
TLTLTLTEATKLSSLDISGVKGITGNVAIELGKAVQGNKTDVSVQGSDAAEQITYTSAAS
LTDIKISGDLGAGANTITVTPDTAAADLKTIDLSGLSATGGTLASTITLVAANTAITSVK
GSLGADTITVVSANKAVAIDLGKDTAIDKVDVSSTKISDKSNDASIKADLVSITNALSGD
QIVLKGATSIKDRGDLSGEANLLAALGKLGESKDGTLADTTAEVFTYKGNTYVVDAAGDA
AFANNDILIELTGIVTFNDTVDANTITVA
NT seq
3330 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgttaaacaaaacagatgtttcaatgctttatatcactattatgggtatggcaagtgag
ggtgatggtaataagtattggttagattatgccaataataatagtttaggagtttcaagt
ttagctaatattatgcttgatagtccaggggcggctaaattctttggtgattctctttta
gcaggtaatgaaaaagattttgttactaagatatatagtatagctttaggtaatactagt
gatgttgatggcattaattattggactaaggcaataactggcggtggagaatttactgat
agtaagggtaatgttattagtgttgctagtttaagcaagggtgatttaataggtgctatg
attaactctatggttaatggcggtagtgctgagtctaaggctatatttgaggctaaggca
gctgctagtgattactttgccgatgctactttgggtaaggatattagtggattagatgag
ggtactacttctaagttaattagcgagattaatagtgctagtgatcttgataaggttaag
agtgagattgatgggttaaaagagagtatagatgaggctggtttaaataagatagctctt
actactgagaatgatactattactggtactgagggtggagatcttattagtggggtggta
ggtactgctgctgagagtactttaaatcctggggataagatagatggtggtgctggtaat
gatgtgcttaaggtagatttgaagaataacttcaaaggcctaaaagatgacggctacatc
aaaaatatagaaaaactatctttaactaatagtagtgtttcaaacagaacattcgacgct
aaaggtatagatggattgcaaacagttgcgttaagtggcgaaaaaggaattagcgttact
aatcttgctaatatagtagatgttgaagttaacggatttaaaggaactaatttcaatgta
gattctatatatgcggataaagtgcttgatggttcagctgatgtgcaaaatttaaaagta
aatggtgttggtgctaaaggtgctagcgtagcaataactgccgataagatagaaactcta
aatttaaatactacaggaagccaaagctttgtaagtgctgatgtggcaagtatatctgta
aaaggaaacgcaaatctatctttagcaacaggagcaaaaactactactttagatgcttct
agcttcggtggagctttggatgcagatttaagcacatcagctagtgttactagtattaaa
ggtggaaatggtaatgataagataactataaaagatgttgcagtaaacgtagcaattgat
ggtggcgctggaaatgacgagctagttatcaaaggaagcactgctgacacacttcaaccg
actttaacaaatatagaaaaagttactatagacggtaatactaaagatttaactctatca
ttgaaaaaagctcagagcgtaacagagttaagctttaaaaatatagctaaaactgttact
gagtcaaacggaaacgtagagacagttaatatcttggcaaataatgctactgataaagca
gtaactatcaatgacgagagtttaaaaacaattaacttttcagatgttgatgataaggga
gctagcgtagcagcaaaaggtaaaatagtagccgataaagcaaccgagcttacaattaac
tcaaataaagtaacattagcaagtgatgccgtagttcaagctgcaaatgctacaaaaata
gatataaacgcagctaaagatactgttggtttaactcttggcggtgtagctaaattaact
gatttaaccgtaaataataaaggtgcgtttgcattaacaggcgcaaatgctacagatctt
gattcggtaaaaaatcttagcgtaaataccgaaggagcatttagcatagctactgctaca
agcttgaaaaacttaaataacttaagcttaaacggagtttctgctgatttaaacagtgtt
aacgtaggaactgctactttagcatctttagaagcaaatataaatgtaagcggagagttt
aaactaggaactactactgcaaaaggcgatgtagactttaatatagaaaatgttggagca
ttaactttaggagctataacttcatcaacaggaaatgctagtgtgattatctcttcagct
actggaaacgttactttaggagccgtatcagcaactcaaggtaatctaactctaaatgca
ggaaatactctaggaaacattactataggagctcttaaaggtgatatagtaagcgtagat
ctaggtggtgttttagggactataaatagtgatgctaataataaagtatcaattacttca
aacgaagttacttatgtaggttcagagattagtaaaaacgtagtagagataactgccgca
gccggcggtactgatttaaatgctcaagtaataggtggagccgctgcagatgatgcatta
acaataataggtaaaggcgatactcaaactataaccgctagcggagatttaagtggtgga
actttaactcttactttaacggaggctactaaactaagtagtttggatataagcggggtt
aagggtataacaggtaatgttgcaatcgaactaggtaaagcagtacaaggtaataaaaca
gatgtaagcgtacaaggtagcgacgctgctgaacagataacatatacttcagctgcgagt
cttacagatataaaaatatctggcgatctaggagcaggagctaacactataaccgttact
ccagacactgctgcagcagatttaaaaactatagatctaagcggattaagcgctactggc
ggaactcttgctagtacgattactcttgttgctgcaaatacggctattacttctgttaag
ggtagcttaggtgccgatactatcacagtggtatctgcaaataaagcagtagctatagat
ttaggaaaagatactgcgatagataaggtagatgtaagctcaactaaaatatcagataag
tcaaacgatgcctctataaaagctgatttagtaagtataactaacgctttatccggagat
caaatagtactaaaaggtgctactagcataaaagatagaggagatttatctggcgaagct
aatttgttagctgcattaggaaaattaggcgaaagcaaagatggaactttagctgatact
actgctgaagtatttacttataaaggaaatacttatgtagtcgatgctgcaggagatgct
gcatttgccaataatgacatattaatagaattaacaggtatcgttacatttaatgacact
gttgatgctaatacaatcacagtagcttaa
DBGET
integrated database retrieval system