Cornus florida (flowering dogwood): 132274961
Help
Entry
132274961 CDS
T11641
Name
(RefSeq) heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 1
KO
K14411
RNA-binding protein Musashi
Organism
cflo Cornus florida (flowering dogwood)
Pathway
cflo03015
mRNA surveillance pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
cflo00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
03015 mRNA surveillance pathway
132274961
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
cflo03019
]
132274961
Messenger RNA biogenesis [BR:
cflo03019
]
Eukaryotic type
mRNA surveillance and transport factors
Transport factors
Other transport factors
132274961
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
RRM_1
RRM_7
RRM_PARP14_3
RRM_11
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
132274961
NCBI-ProteinID:
XP_059632315
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
464 aa
AA seq
DB search
MDSDQGKLFIGGISWETTEDVLKDYFGNYGEVFQTVVMRDKLSGKPRGFGFVVFTDPSIL
DRVLQDKHVIDGRTVEAKRALSREEQQTSKAGNPNTGRNVGGGGNFRTKKIFVGGLPPTL
TEDGFRQYFEAYGSVTDVVVMYDQSTNRPRGFGFISFDTEDAVDRVLHKTFHDLNGKQVE
VKRALPKDANPGGGGRSMGGGTGGGTGSGGYQGYGASGGNSSTYDNRMDSNRYMQSQSTG
GRFPPYGSSGYSAPGYGYGPASNGIGYGAYGAYGSANPGYGGPAGAAYGNPNAPNAGYGS
GPSGAPRSSWSTQTPSGYGSVGYGNAAPWGAAAGGPGSGGPISAPTGQSPGGAAGYGSQG
YGYGGYGGSDGSYANPAAYGAVGGRAGSTPNSSASAGGGELQGSGGGYMGGGYGDPSGNS
GYGNPGWRSDPSAASGNYSNGPHGGQVGYGGGYGGAPTRQAQQQ
NT seq
1395 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggattcagatcaagggaagctttttatcggaggtatctcttgggagacaacagaggat
gtgttaaaggactattttgggaactatggtgaggtttttcagactgtggtgatgagagat
aagctcagcggaaagccgagagggtttgggttcgtggtcttcacagatccttcgatcctt
gatagggttcttcaggacaagcacgttatcgatggaagaacggttgaggcgaagagggcc
ttatcaagagaggaacagcagacctccaaagctggaaaccctaatactggtagaaatgta
ggtggtggtggaaatttcaggaccaagaagatatttgttggaggattgcctcccactctg
actgaggatgggtttcgtcagtattttgaagcctatggtagtgtcactgatgtagtagtg
atgtatgatcagagcaccaaccgacctcgcggatttggatttatttcctttgatactgaa
gatgcagttgatagggttctccacaagaccttccatgatttgaatggtaagcaagtagaa
gtgaagcgggctcttcctaaagatgccaatcctggtgggggtggccgttccatgggtggt
ggtacaggaggaggtactggcagtggaggttatcagggttatggtgcttctggtggcaat
tcaagtacgtatgataatcggatggattccaacaggtacatgcagtcccaaagtactggt
gggaggtttccaccttatggttcttctggttatagtgcacctggatatgggtatggtcct
gccagtaatggcattggttatggtgcttatggtgcttatggtagtgccaatcctgggtat
ggtggccctgctggtgcagcctatggaaacccaaatgcccctaatgctggttatggaagt
ggtccatcaggggcaccaagaagttcgtggagcactcagactccctctggatatggtagt
gtgggctacgggaatgctgctccttggggtgctgctgctggtggtcctggtagtggtgga
cctatttcagcgcctacgggtcaatctcctggcggagctgctgggtatgggagtcaaggt
tatggttatggtgggtatggtggaagtgatggatcctatgcgaatccagctgcatatggt
gctgtcggtgggcgtgctgggagtaccccaaatagcagtgcttctgctggtgggggagag
ctacaagggagtggtgggggctatatgggaggtggctatggtgatcccagtgggaattca
gggtatggaaatccaggatggagatctgatccttcagcagcttctgggaattattcaaat
gggcctcatggtgggcaagttggatatggtggtgggtatggtggtgctccgaccaggcag
gctcaacagcagtga
DBGET
integrated database retrieval system
