Campylobacter fetus subsp. testudinum pet-3: CR44_02380
Help
Entry
CR44_02380 CDS
T03583
Name
(GenBank) S-layer protein
KO
K21449
trimeric autotransporter adhesin
Organism
cfp
Campylobacter fetus subsp. testudinum pet-3
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
cfp00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
cfp02000
]
CR44_02380
Transporters [BR:
cfp02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
CR44_02380
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DUF4214
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AJB45109
LinkDB
All DBs
Position
complement(466008..468827)
Genome browser
AA seq
939 aa
AA seq
DB search
MLNKTDVSMLYITIMGMASEGDGNKYWLDYANSNSLGVSSLANIMLDSPGAAKFFGDSLL
AGNEKEFVTKIYSIALGSTSDVDGINYWTKAITGGGEFTDSKGNVINVASLSKGDLIGAM
IDSMVNGGSAESKAIFEAKAAASDYFADATLGKDITGLDEGTTSKLISEITSASDLDKVK
GEIDALKSELPNPGSTYDLTEGNDNLKGTDLDDTFNGTTYVGNGTNKSTLSAFDKIDGGA
GRDTLNAIFTANNNVAADTKLEQSEIDKSLKGVANVENINIVSDLETNGDFVFNGYEKVG
FNVLGDIASFTTDASKGVNVGTTGTITALTANGTGKVDVAAKEITALTADTATSVNLTAT
NGTITLTSANATTSVNLKTSGTAKNATITAANAAKNITIDATGVAIITSATAVENLTVKN
ATNVTLSGDMDKLATVTLDNAALTAAIDVKSASTLNLINSNVAGQNISTAAKDVTVNLSG
ATAKVKLNATAVTDQTVTLKANATDNSLEFVSATSKTTSVTASGSGKTLVIKGAEVETLV
NIDTTAFNGAADVSFGKTSQGGIFSVKTGAGDDKIEFVGTTLNAGSAIDGGAGNDTIAMK
SAALTSANFAMIKNIENVAISDAVATADLSSSGFKNIIITTKETGSNVDLTINKDQVINF
TAADAGSAKLITVKLNDATGANDVVKIVLDAAAKDNNITLGTAATDKALVIDAGIETLNI
TSLVKTTSPESTANSVNAKLTDVTSIIIDGDANITLGHAGTAATDYKNVSMIDASALKAG
LTFDASAITLGASATIKGGSGADSITVKGGNIVVDLVAGGDDTITLKKGAEKTDIATINN
FNAGDKINIADAKKGAFTFNKITMNSDANLDDYIAKAVVGDGSTNSAVSYFHHNGYTYVV
VDGTVGSTFDKTNDTIIKLSGTLDLKLDGDNVLVNDSVI
NT seq
2820 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgttaaacaaaacagatgtttcaatgctttatatcactattatgggtatggcaagtgag
ggtgatggtaataagtattggttagattatgccaatagtaatagtttaggagtttcaagt
ttagctaatattatgcttgatagtccaggggcggctaaattctttggtgattctctttta
gctggtaatgagaaagagtttgttactaagatatatagtatagctttaggtagtactagt
gatgttgatggtattaattattggactaaggctataactggtggtggagaatttactgat
agtaagggtaatgttattaatgttgctagtttaagcaagggtgatttaataggtgctatg
attgactctatggttaatggtggtagtgctgagtctaaggctatatttgaggctaaggct
gctgctagtgattactttgctgatgctactttgggtaaggatattactggattagatgag
ggtactacttctaagttaattagtgagattactagtgctagtgatcttgataaggttaag
ggtgagattgatgctttaaagagtgagttacctaatccaggtagtacttatgatcttaca
gagggtaatgataatttaaagggtactgatttagatgatacttttaatggaacaacatat
gtaggtaatggtactaataagagtactcttagtgcatttgataagattgatggcggtgcg
ggaagagatacgttgaatgcgatatttactgcaaataacaacgtggctgccgataccaaa
cttgaacaatctgaaattgataaatcactaaaaggtgttgcaaacgtagaaaatatcaat
atagtttcagatctagaaacaaatggtgatttcgttttcaacggttatgagaaagtagga
tttaacgtacttggcgatatagctagctttactaccgacgcatctaaaggtgtaaatgta
ggaacaacaggaacgataactgctttaaccgcaaatggaacaggcaaagtcgatgttgca
gccaaagaaatcactgctcttacagcagataccgcaacaagtgtaaatttaactgctaca
aacggcactatcacattaaccagcgcaaacgctactactagcgtaaatttaaaaacaagt
ggaacagctaaaaacgctacaatcacagccgcaaatgcagcaaaaaatataacaatagac
gcaacaggggttgcaattataacttcagctacagctgtggagaatttgacagttaaaaac
gcaactaacgtaacgctaagtggcgatatggataaacttgcaacagttactcttgacaat
gctgctttaactgctgcaatagatgtaaaatctgcaagtacattaaatttaataaattca
aacgttgctggacaaaacatctctacagcagcaaaagacgttactgtaaatttaagcgga
gctactgctaaggttaaattaaacgcaactgctgttacagatcaaactgtaactcttaaa
gctaatgccacagacaatagtcttgaatttgttagcgcaacttcaaaaactacgtcagtg
actgctagtggtagtggaaaaactttggttataaaaggtgccgaagtagaaactctagtt
aatatagatactactgcgttcaatggcgctgcagatgttagctttggaaaaactagtcaa
ggtggcatatttagcgtaaaaacaggtgcaggtgatgataaaatagagtttgtaggtaca
actttaaatgcaggttcagcaatcgatggtggtgctggaaatgatactatagctatgaaa
tcagctgctttaactagtgcaaatttcgctatgatcaaaaacatagagaatgttgctatt
agcgacgccgtagctacagctgatcttagctcttctgggtttaaaaatatcatcataact
actaaagaaaccggctctaatgtagatttaactataaataaagaccaagtaattaatttt
actgcggcagatgcaggttcagctaagcttattacagtaaaactaaatgacgcaacaggt
gctaatgatgttgtaaaaatagtattagatgctgccgccaaagataataatataacttta
ggcacagcagcaaccgataaagctcttgtaatagatgcgggaatagaaactcttaatata
acttcgttagttaaaactacaagccctgaaagtacagcaaatagcgtaaatgctaaattg
acagatgttacatctataattatagatggagatgcaaatattactttaggtcatgctggc
actgccgcaactgattataaaaatgtttctatgatagatgcaagcgctcttaaagctggg
cttacatttgatgcaagcgctataacattaggagctagtgctactataaagggtggctcg
ggagctgatagtataactgtcaaaggtggaaatattgttgtagatttagttgctggtgga
gacgatactataactcttaaaaaaggtgccgaaaaaacagatattgcaaccattaataac
tttaatgctggcgataagataaatatagctgatgccaaaaaaggtgcttttacatttaat
aaaattacaatgaatagcgatgctaatctagatgattatatcgctaaagcagtagtagga
gatgggtcaacaaactctgctgtaagctatttccatcacaatggatatacttatgtagta
gtcgatggaacagttggttctactttcgataaaactaatgatacaattatcaaactttca
ggtacgctagatcttaaacttgatggagataatgttttagttaatgatagcgtaatctaa
DBGET
integrated database retrieval system
