Campylobacter fetus subsp. testudinum pet-3: CR44_06980
Help
Entry
CR44_06980 CDS
T03583
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
cfp
Campylobacter fetus subsp. testudinum pet-3
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Peptidase_S8
Autotransporter
PATR
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AJB45954
LinkDB
All DBs
Position
complement(1402922..1406449)
Genome browser
AA seq
1175 aa
AA seq
DB search
MKRCICIVTAFVLQVFAISDLELINTQSAYDEGITGNGIKIGIIDGAVRGDHPSLSGKLI
EQIYSKDKYGAYTPDFTIDTHGSHVAGIMVGNYINASSPHGVAYDASIYAAQITGYNKIG
TLTPPNIYDFFADKDLSVINNSWNSNMYPIVSMQGSTYYVKSLSTMNANFFIRQAYGNSK
PSEDLSRLSKDKNTLVVFASGNEGIISPGLFGTLPYYDESLRSWLVVGALDSANVSKDSS
AKIIINSKGSPEFSNGLKGIQNYSLVAPGTNINNVNSPYMIRPSFGRVDRNLYTKKSGTS
MAAPMVSGAAALVAQKFPFLNGKEIADVLLSTANRDYQAPKVVIKETNGLDSDRNSPYFG
TKRNYYTVFYIDNPIPKKDDGSIDEDQIKIDLMSAGYDRALVSGLSQLNNSRYPTLSSHI
LVDGGYAAVWEIKKEDMFGQGILDVKKAMGGLAVLDANRLSNSDIVQNYKQESSAVYYKL
DTKGMDAEFSNDISQRKWDSSTHNAGALNLPVGLDDLNVGFIKNGNGVLRLTGKNSYLGA
TIVRQGGLNISKKADNSGGFISSNVYVENTASLSGDGVIDRNLYNDGIVRPGNQDLSDLT
VNGTYEQSSTGTLQLDFGDKKNSKLIAADYNIQGKLEYIPLPAFYTSGSYVSIDLGGLKA
HLNDFSSVEVAGNNAINFVAVLDGDKTSINKPDLPQIDINEQNKDNSADQKPDQNPNPDP
VLPEPDKDPKPDNPTHPIDPAPKPSDKEENISGSTQDEVNKPSQNQDKNPNLNNNHSDKN
PNSNNNLIVTPTIKPDAYNRPNSDIGAALREIRSMVNLDKRYQDYFAFLDNADSKNFDKA
LKTIESIDYMSNTAQIVSGHHQFNQNSMLFALNPASQGLSLARNFETEPILLASLASDIA
IDLGINSYDEKRYIWYMSPSYKKINADNYSGKSYGLNFTIGAKPSDNSQLTFNTSYLESK
LNFEDSSSKSKYVNFGSNYILDLDSVKILSGASLGFGRNTMQRGLFGSSEILSGSYNNFL
ASAEFGLAKDFKLNSFTITPLSYFSYSYIFQDSFNESGSVFAKSYDKIKHDSTSITAGVN
LSYDLDKFNVDTKLSGFVIYEYRLSGKDLENRAKFRDFQNQTFTQRYALNRDLIYLGFSS
QFDYTNSFFMRFELINEIAKDQYNFNILANLGFKF
NT seq
3528 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaggtgcatatgtatagttacagcgttcgtgttgcaagtttttgctataagcgat
cttgaacttataaatacacaaagcgcttatgatgagggaattactggtaatggtatcaaa
ataggcattatagatggcgctgttagaggtgatcatcctagcttgtctggtaaattaatt
gaacaaatttactcaaaagataagtatggagcttatacgcctgattttactatcgatact
cacggtagccatgtagctggcattatggtaggaaattacataaatgcttcaagtcctcac
ggagtagcttatgatgctagtatttatgctgcgcagataactggttataataaaataggc
actctaaccccgccaaatatatatgacttttttgccgataaagatcttagcgttataaac
aatagctggaattcaaatatgtatccgatagtaagtatgcaaggaagtacttattacgta
aaatcgctaagtacgatgaacgctaatttttttatccgccaagcttatggaaattcaaaa
ccgtctgaagatctatcaaggctatcaaaagataaaaatactttagttgtttttgcttct
ggaaatgaggggattatctctcctggtctttttggtacgcttccttattatgatgaatct
ttacgttcgtggctagtagttggtgctttagatagtgctaacgtatcaaaagatagcagc
gcaaagatcattataaactctaaaggatctccggagtttagcaacgggctaaaaggaata
caaaactactctttagttgcaccaggaacaaatatcaataacgtaaattcgccatatatg
ataagaccttcttttggtagagtcgatagaaatctttatacgaaaaaaagcggaacttca
atggctgctcctatggtaagtggtgcagcagctttggttgctcaaaaatttccgttttta
aacggtaaagagatagctgatgtgctactaagcacggcaaatagagactaccaagcccca
aaagtcgtcataaaagagactaacggtcttgatagtgatagaaatagcccgtattttggc
actaaaagaaattactatactgtattttatatagataatcctataccaaaaaaagatgac
ggaagcatagatgaagatcaaatcaagattgatttgatgagtgctggttatgatagagcg
ttagtttctgggttatcacaacttaataatagcagatatcctactttatcatctcatata
ttagtcgatggcggatacgcagcagtatgggagataaaaaaagaagatatgttcgggcag
ggaattttggatgtaaaaaaggctatgggcggacttgcggttcttgatgcaaatcgttta
agcaatagcgatatagttcaaaattacaaacaagaatctagcgccgtgtattataaatta
gatactaaaggaatggacgcagagtttagcaatgatatctcgcaaagaaaatgggatagt
tcaactcacaacgccggtgctttaaatttaccagtagggcttgatgatttaaatgttgga
tttattaaaaacggaaatggggtattgagattaactggaaaaaatagctatttaggtgca
actatcgttagacaaggtggtttaaatatctctaaaaaagctgataacagcggaggtttc
atatcaagcaacgtatatgtagaaaatacagctagtcttagcggcgatggagtaatcgat
aggaatttatataacgacggtatagtaagacctggaaatcaagatttgagtgatttaact
gtgaatggaacctatgagcaaagtagtacaggcactttgcagttagattttggagataag
aaaaactcaaagctaatcgctgctgattataatatacaaggaaaactcgaatacataccg
ctacctgctttttataccagtggtagttatgttagtatcgatttaggtggattaaaagcg
catttaaatgatttttcaagtgttgaggttgctggtaataatgctataaatttcgtagcg
gttttagatggagataagacttctataaataaaccagatcttccacaaatagatataaat
gagcaaaacaaagataattctgcagatcaaaaaccagatcaaaatcctaacccagatcca
gttttgcctgagcctgataaagatccaaaaccagataatcctactcatcctatagatcct
gctccaaaaccgtctgataaagaagagaatatttctggttcgacacaagatgaagtaaat
aaaccaagccaaaatcaagataaaaatccaaatttaaataataatcatagcgataaaaat
ccaaattcaaataataatttaatcgtaactcctacgataaaaccagatgcttataataga
ccaaatagcgacatcggcgcagctttaagagaaattcgttctatggtaaatttagataaa
cgctatcaagattattttgcttttttggataatgcggattcaaaaaactttgataaagct
ttaaaaactatcgaatccatagattatatgagtaacacggctcaaatagttagcggacat
catcaattcaatcaaaatagtatgctttttgcgttaaatcctgcttctcaaggtttaagt
ttagctcgtaattttgaaactgaaccgattttgttggcttctttagcatcagatatagct
attgatcttggtataaattcatatgatgaaaagcgatatatttggtatatgagtcctagt
tataagaagattaacgcagataattatagtggaaagtcatacggacttaacttcactata
ggagcaaaaccaagcgataattcgcagctaactttcaatactagctacttagagtctaag
ctaaattttgaagattctagctctaaaagcaaatatgttaatttcggctcaaattatatt
ttggatctagatagtgtaaaaatcttaagtggagctagtttgggatttgggcgaaatact
atgcaaagaggattgtttggtagtagtgagattttaagtggcagttataataacttttta
gcttcagctgaatttggtttggcaaaagattttaaactgaactcatttaccataactcca
ctttcgtattttagctatagttatatttttcaagactcttttaatgagagtggaagtgta
tttgcgaaatcttatgacaaaatcaaacatgatagcacgtctatcactgcaggagtgaat
ttatcgtacgatttggataaatttaatgttgatactaagctttctggatttgtcatttat
gagtatagattaagcggtaaagatctggaaaatagagctaaatttagagattttcaaaat
caaacttttactcaaagatatgctttaaatagagatcttatatatttaggatttagttcg
cagtttgattatactaattcattttttatgcgttttgagcttataaatgagattgccaaa
gatcagtataattttaatattttagcaaatttaggttttaaattttaa
DBGET
integrated database retrieval system
