Clostridium gasigenes: J1C67_11835
Help
Entry
J1C67_11835 CDS
T07299
Name
(GenBank) helix-turn-helix domain-containing protein
KO
K01198
xylan 1,4-beta-xylosidase [EC:
3.2.1.37
]
Organism
cgas
Clostridium gasigenes
Pathway
cgas00520
Amino sugar and nucleotide sugar metabolism
cgas01100
Metabolic pathways
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
cgas00001
]
09100 Metabolism
09107 Glycan biosynthesis and metabolism
00520 Amino sugar and nucleotide sugar metabolism
J1C67_11835
Enzymes [BR:
cgas01000
]
3. Hydrolases
3.2 Glycosylases
3.2.1 Glycosidases, i.e. enzymes that hydrolyse O- and S-glycosyl compounds
3.2.1.37 xylan 1,4-beta-xylosidase
J1C67_11835
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Glyco_hydro_39
HTH_18
HTH_AraC
AraC_binding
Cupin_2
Cupin_1
Ectoine_synth
MannoseP_isomer
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QSW18253
LinkDB
All DBs
Position
CGAS001:2540021..2542558
Genome browser
AA seq
845 aa
AA seq
DB search
MEYRYENIEHKLNIPIRIFTHYLEQFPYHWHEEMEMLFVLKGTVELFIDKEVNILEEGDI
FLINRNEIHYVKSTNPLESSQLLVLQFNTEYLNKYYANLSKLQFKLDSRQNNKENEKFYN
KIRSILATMMNVVLNKEEPYELLISRHLLDIIIILINKFTINEKSEYKELNVSENRLINI
IKYINNNYKDSEFAIAKIASEFYLNPQYVSRYFKENMGITIKTFLDNLRLNKSLNDLKLS
KDRVIDIAHRHGFPDEKSYYRVFKSILGITPTKYREVNGIEETNANVLNYFNINSRETLA
KLFEYLRTNDSFFEARKIGSNIKIIKTGEVIGELNHSFNKLITFGHAPYGLRNDFKKQLK
KIQKDIGFEYVRFHGIFSDEMMLYNENSRGEVYYNFNHIDTLIDGLIEDGLKPFIEIGFM
PKELSSSENKVFFWNCHASGPNNMEKWIDMVEKFTKHIINRYGINKVREWYFEFWNEPNL
EKVFWDGSREEFFNFFKLTYESIKAIDKDIKVGGFGNLKFGEFNSWMNEFKTYSEKHKCF
LDFFSFHAYQLECKYIDDIEIDITNEGIKYVESEDSEVKGNIKLKDILNIGDKGYISETI
REMVEIGDGLPGKCKEYWITEWNSTMDCRDLVHDTCFMAAFIVKTCVENSNLVKGMGFWT
FTDLFEEFRLKQNLFHGGFGFITYNGIKKASYHAFEFLNKLGKEIVYKDKGLIVTKKGED
YQLLFYNYCHYNDLYRSLDYSQISYLNRYDVFKDSVERGYSLSLQINKGKYQLEKFRVNR
EEGSSFDAWVTMGAPEMLSEDGYKYLEKASEVGYKTWGEKVEKDLNINTELLPHEIQLIV
AKKIY
NT seq
2538 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggagtataggtatgaaaatatagagcataaattaaatataccaattagaatatttact
cattacttagaacaatttccttatcattggcatgaagaaatggaaatgttatttgttcta
aaaggaacagttgagctttttattgataaagaagttaatattttagaagagggagatatt
tttttaataaatagaaatgaaattcactatgtaaagtcaactaatcctcttgaaagctca
cagttattagtgttgcaatttaatactgaatacttaaataaatattatgcaaatttaagc
aaattgcaatttaaactagattctagacaaaataataaagaaaatgaaaagttttataat
aagattaggtctatacttgcaacaatgatgaacgttgttcttaataaagaagagccttac
gagcttttaattagtaggcatttactagatattataattattttaattaataaatttact
attaatgaaaaaagtgaatataaggagttaaatgtaagtgaaaatagactaattaatatt
attaaatatataaataataattataaagatagtgagtttgcaattgcaaaaatagctagt
gaattttatctaaaccctcagtatgtctcaagatattttaaagaaaatatggggataaca
ataaaaacatttttagataatttaagattaaataaatctttaaatgatctaaaacttagc
aaagatagagttatagatatagctcataggcatggttttcctgatgaaaaatcatactac
agagtttttaaaagtatattaggaattacacctactaagtatagagaagttaatgggata
gaggaaactaatgcaaatgtattaaattattttaatattaatagtagagaaacattggct
aaactttttgaatatttaagaacaaatgattcgttttttgaagcgaggaaaataggatca
aatattaaaataattaaaactggagaagttataggtgaattaaatcacagttttaataaa
ttaataacatttggacatgcaccctatggattaagaaatgattttaaaaaacaacttaaa
aaaattcagaaggatattggttttgaatatgtaagattccatggaatattttctgatgaa
atgatgttatataatgaaaactcaagaggtgaagtatattataactttaaccatattgat
accctgattgatgggttaatagaagacgggttaaagccatttatagaaattggatttatg
ccaaaggaactttcatctagtgaaaataaagttttcttttggaactgtcatgcaagtggg
ccaaacaatatggaaaagtggatagatatggttgaaaagtttacaaaacatattattaat
agatatggaattaataaagttagagaatggtattttgaattttggaatgagccaaaccta
gagaaggtattttgggatggaagcagagaagagttttttaatttttttaagctaacttat
gaatctattaaagctattgataaggatattaaggttggaggtttcggaaatttaaagttt
ggtgaatttaatagttggatgaatgaatttaaaacttattcagagaaacataaatgcttt
ttagattttttctcttttcatgcttatcaattagaatgtaaatatatagatgatattgaa
attgatattactaatgaaggtataaagtatgtggaatcagaagatagtgaagttaaggga
aatataaaattaaaagatattcttaatattggtgacaagggttatatatctgaaactata
agagaaatggttgaaataggagatggattacctggaaaatgtaaagaatattggattaca
gaatggaactcaactatggattgtagggatttagtacatgatacatgttttatggcagca
tttattgtgaaaacctgtgttgaaaatagcaacctagttaaaggaatgggattttggaca
tttacagatttatttgaagagtttagattaaagcaaaatttatttcatggaggctttgga
tttataacatataatggtataaagaaagctagttatcatgcttttgaatttttaaataaa
ttaggtaaggaaattgtatataaagataaaggcttaatagttacaaaaaaaggggaagat
tatcaattactattttataattattgtcattataatgatttatatagatccttagattac
tctcaaatatcatatttaaatagatatgatgtttttaaagactcagttgaaagaggctat
agtttatctcttcaaataaataagggaaagtatcagttagaaaaatttagagttaatagg
gaagaaggttcatcatttgatgcttgggttacaatgggagccccagaaatgttatcagaa
gatggatataaatatttagaaaaagcttctgaagttggatataaaacttggggggaaaag
gttgaaaaagatttaaatattaatactgaattattaccacatgaaattcaattaatagtt
gctaaaaaaatatattaa
DBGET
integrated database retrieval system
