KEGG   Clostridium gasigenes: J1C67_18165
Entry
J1C67_18165       CDS       T07299                                 
Name
(GenBank) collagenase
  KO
K01387  microbial collagenase [EC:3.4.24.3]
Organism
cgas  Clostridium gasigenes
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:cgas00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09181 Protein families: metabolism
   01002 Peptidases and inhibitors [BR:cgas01002]
    J1C67_18165
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   02042 Bacterial toxins [BR:cgas02042]
    J1C67_18165
Enzymes [BR:cgas01000]
 3. Hydrolases
  3.4  Acting on peptide bonds (peptidases)
   3.4.24  Metalloendopeptidases
    3.4.24.3  microbial collagenase
     J1C67_18165
Peptidases and inhibitors [BR:cgas01002]
 Metallo peptidases
  Family M9
   J1C67_18165
Bacterial toxins [BR:cgas02042]
 Toxins that damage the extracellular matrix
  Hyaluronidases/Collagenases
   J1C67_18165
SSDB
Motif
Pfam: Peptidase_M9 Peptidase_M9_N ColG_sub PKD_4 PPC PKD PKD_3 K319L-like_PKD InlK_D3 7TMR-HDED
Other DBs
NCBI-ProteinID: QSW19428
LinkDB
Position
CGAS001:complement(3873281..3876598)
AA seq 1105 aa
MNKRIRGVASFLAVTIISTTLSTQRVFALDKNVEAQQSNSSYEQQDKQIGGQVKENIEEV
KHANSEAEVRSVKPKIPDDINVIVANEKSNEEYSMKDLNALSYEELVGKISVIPWNNITD
LFEYNEDAVEFYSDTNRMEYLLNDLSRRGKEFTPEDDLGIPTLIEVIRAGYYLAYYNNGI
PELKSKEGHKKCIPAILAIQSNPNFKFGTDAQDNILSTLGVLINNTTSNADIVNNFVPIL
NQYKENFDEFIKDPLKGKAIYNIITGVQYSITVYGYENSNDYSKSSWTGKIDGFIDFISY
LALKGELTEDNAWLINNGLYSIAKLSPVHSNPKEGLSVLTRCMEIYPYLSEQYLQVVSSI
ADNYNSTDDTGKEIDYDKVKAEAREKYLSKTYKFDDGQVVIKAGDKVTEEKINSVYWASK
EVQAQFFRVLGTDKALENGNKDDVLTIVIYNSPKEYKLNRLINGLDVENGGMYIEGDGTF
YTYERTSDESIYTLEELFRHEFTHYLQGRYLVPGMWGSGGIYEGNRLTWLEEGGAELFAG
ATRTENIMPRKSVVSNIVRTEKSDRYTVDKTMHSKYGSFDFYHYSFALQSYMYNKDLGKL
NAIFEAVKSNDIAKYDELIKNYSSNSNLEESYQNYMDSLIKDYDKLTTPLVAADYAIKHK
TKDSKEIYDDITNAARVTNVKTENKKSQFFDSFVLRGTYDAGKSEGKENDYNKMNNNLNE
ILNTLDGYSWSGYKTVTAYMVNYNVDRNSNVTWELVFNGILKEGITEEPSEKPVVNINVP
DKVYKNKEIKFTSNVTMDNNNKIIEYLWDFGDGNTSSEANPSHKYEKIGDYTVTLKVKDS
EGLSDNKSIKIKVENMSVIKPKTLNEFEVNDSIEKANGPILNDTLVKGNMENGDSDTFYF
DVLSDSELDINVQKSGEANITWVLYDSSDAENYIAYANEREENNYKGTYKATKGRYYIVV
YGFSQVKEEYTLSIDGNIGGGKIEEIDNNVIMEKENNNDFDTATTIHINDSVVKGGFSQE
DNLDMYSFEVSEEGTVDISLTPDSEGLGVAWTLHSEKDFNKYIAYPHREGKKVCNKMNLK
PGKYYLNVYRYEGQGYYTIENHFSN
NT seq 3318 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgaataaaagaataaggggagtagcaagctttttagctgttacaataattagtactact
ttatctactcaaagggtgtttgctttagacaaaaatgtggaagctcaacaaagtaatagc
tcttatgaacaacaagataaacaaattgggggacaagttaaggaaaatatagaagaggta
aaacatgcaaatagtgaagctgaggttagaagtgtaaagcctaagataccagatgatata
aatgtaatagttgctaatgaaaagtcaaatgaagaatattctatgaaggatttaaacgct
ttatcgtatgaagaattagttggaaaaatttctgttattccttggaataatataactgat
ttatttgagtacaatgaagatgctgtagaattttatagtgatacaaatcgtatggaatat
ttattaaatgatttaagtagaagagggaaagagtttaccccagaggatgacttagggata
cctactttaatagaagttataagagctggatactatttagcatattataataatggaata
ccagagctaaaaagtaaagaaggccataaaaaatgtattccggctatattagcaattcaa
agtaatccgaattttaagtttggtacagacgcacaggataatattctaagtacattagga
gtattaataaataatacaacatcaaatgcagatattgttaataattttgtgccaatttta
aaccaatataaagaaaattttgatgaatttataaaagatccacttaaaggaaaagctata
tataatataattacaggggtacaatatagcataactgtatatgggtatgaaaatagtaat
gactatagtaaatcttcttggacaggaaaaatagatggctttatagattttatatcttat
ttagctttgaaaggggagttaacagaagataatgcctggctaataaataatggattgtat
tctatagctaaacttagtccagttcatagtaacccaaaggaaggcttaagcgttttaact
aggtgtatggaaatatacccttatttaagtgaacaatatcttcaagttgtatcttcaata
gcagataattataattctactgatgataccggaaaagaaattgattatgataaagtaaaa
gctgaagcaagagaaaaatatttatctaaaacttataagtttgatgatggacaagtagta
ataaaggctggagataaagttactgaagaaaaaataaatagtgtatattgggcatctaaa
gaggttcaagcacaattttttagagttttaggtacggataaagctttagagaatggaaat
aaagatgatgtattaactatagtaatatataatagccctaaagagtacaagcttaataga
ttaataaatggtttagatgttgaaaatggtggtatgtatatagaaggagatggaacattt
tatacttatgaaaggacttctgatgagagcatatatactttagaagagttatttagacat
gaatttactcattatctacaaggtagatatttagttcctggtatgtggggttcaggtggg
atttatgaaggaaatagacttacttggcttgaagaaggtggtgcagagctttttgctgga
gctactagaaccgaaaatataatgcctagaaagtcagtagtaagtaatatagttcgtaca
gaaaaatcagatagatatactgtagataagacaatgcattcaaaatatggaagctttgat
ttttatcattatagttttgcattacaaagctatatgtataataaagatttaggaaaacta
aatgctatttttgaagctgttaagtctaatgatatagctaaatatgatgaattaataaaa
aattatagtagtaactctaatttagaagaatcttatcaaaactatatggatagtctaatt
aaagactatgataagctaactacacctttagtagcagctgattatgctattaagcataaa
actaaagattctaaagaaatttatgatgatataactaatgctgcaagagttacaaatgtt
aaaacagaaaataagaaatcacaattttttgatagctttgttttaagaggtacttatgat
gcaggaaaatcagaaggcaaagaaaatgattataataaaatgaataataatcttaatgaa
atattaaatacactagatggatattcatggtcaggatataagactgttacagcttatatg
gttaattataatgttgatagaaatagtaatgttacttgggagttagtgttcaatggaata
ttaaaagagggaataacagaagaaccatctgaaaaacctgtggtaaatataaatgtacca
gataaggtatataagaataaagaaattaaatttactagtaatgtaactatggataataat
aataagattattgagtatttatgggattttggtgatgggaatactagtagtgaagctaat
ccaagtcataaatatgaaaaaataggtgattatacagtaactttaaaggttaaagatagt
gaaggtctttcagataataaatcaattaaaataaaagttgagaatatgtcagtaataaaa
cctaaaactttaaatgaatttgaagttaatgattctattgaaaaggctaatggacctata
ttaaatgatactttagttaaaggtaatatggaaaatggagatagcgatactttctatttt
gatgtattatcagattcagagttagatataaatgtgcaaaaatcaggagaggctaatatt
acttgggtattatacgatagttctgatgcagagaactatatagcatatgcaaatgaaagg
gaagaaaataattataagggtacttataaagctactaagggcagatattatatagttgtt
tatggattttcacaagttaaagaagaatatacattaagtattgatggtaatataggtgga
ggaaaaattgaagaaattgataataatgttataatggaaaaggaaaataataatgatttc
gatactgcaactactattcatattaatgatagtgtagttaagggcggcttttctcaagag
gataacctagatatgtatagttttgaagtttcagaagaaggaactgtagatatatcgtta
acaccggatagtgaaggtttgggtgtggcttggactttgcattctgaaaaggactttaat
aaatatatagcatatcctcatagagaaggaaaaaaagtgtgtaataaaatgaatttaaag
ccaggtaaatactatttaaatgtatataggtatgaaggccaaggctattatacaatagaa
aatcattttagtaattaa

DBGET integrated database retrieval system