Clostridium gelidum: psyc5s11_11770
Help
Entry
psyc5s11_11770 CDS
T08447
Name
(GenBank) ABC transporter
KO
K18888
ATP-binding cassette, subfamily B, multidrug efflux pump
Organism
cgel
Clostridium gelidum
Pathway
cgel02010
ABC transporters
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
cgel00001
]
09130 Environmental Information Processing
09131 Membrane transport
02010 ABC transporters
psyc5s11_11770
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
cgel02000
]
psyc5s11_11770
Transporters [BR:
cgel02000
]
ABC transporters, eukaryotic type
ABCB (MDR/TAP) subfamily
ABCB-BAC subgroup
psyc5s11_11770
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
ABC_membrane
ABC_tran
SMC_N
AAA_21
AAA_30
MtlR
AAA_22
AAA_23
RsgA_GTPase
TsaE
NB-ARC
AAA_15
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BCZ45110
UniProt:
A0ABN6IW06
LinkDB
All DBs
Position
1357311..1359242
Genome browser
AA seq
643 aa
AA seq
DB search
MSQNNKPRPMRGPGNHGPRGSVKANKDSLKILKRLLAYVFKEYKFLFLIVSVTIIISSLA
NVIGTLFLRSLIDDYIVPLMNKTGADFGPLLKMIITMAVIYYVGVISTYIYSRIMIVVSQ
GSLKKIRDDMFSHMENLPIKFFDTHAHGDVMSLYTNDTDALRQMISQGIPQLLSAIITVI
SIFISMIYLSLPLAGIQVLIILLMFKVTKVIGGKSGKYFGLQQRDIGAVNGYIEEMMEGQ
KVVKVFCHEDEAKANFDKLNDMLFDSANNANKYANILMPIMGNIGYINYVLAAIVGAILA
ISGFAGFTIGALAAFLQLTRSFSQTINQMSQQFNFVIMALAGAERIFKLLDEKKEMDEGY
VTLVNAEEDEKGELTEVKKRTGTWAWKHPHEDGTITYTKLNGEVVFDDVDFGYNDEKIIL
HNIKLFAKPGQKIAFVGSTGAGKTTITNLINRFYDIQDGKIRYDGININKIKKDDLRSSL
GIVLQDAHLFTGTVADNIRYGKLDATDEEVKAAAKLANADQFIKHLPKGYDTILTGDGGN
LSQGQRQLLTIARAAIADPPVLILDEATSSIDTRTEKIVQEGMDKLMNGRTVFVIAHRLS
TIKNSDVIMVMDQGEIIERGNHDALIEEKGKYYQLYTGAFELS
NT seq
1932 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagtcaaaataataaacctagaccaatgagaggaccaggtaatcatggaccaagaggt
tcagtaaaggctaataaagattcactgaaaatattaaaaaggctactcgcttatgtattt
aaggaatataagtttttattcttgattgtatccgtaactattattataagttcccttgcg
aatgttattggaacattatttttaagaagtttaattgatgattatatagttccactaatg
aataaaactggtgcagattttggaccattacttaagatgataattactatggcagtaatt
tattatgttggagttatatcaacatatatatatagccgtattatgattgtcgtttctcaa
ggttctcttaagaaaataagagatgatatgttttctcatatggaaaatttaccaattaaa
ttctttgatacacatgcccatggagatgtaatgagtctttatacaaatgatacagatgca
ttaagacaaatgattagccaaggtataccacaattattatctgctattattactgttatt
agtatctttatttctatgatttatttaagtttaccacttgctggaattcaagttttaata
atattattaatgtttaaagttactaaagtaattggtggaaaaagtggaaaatactttgga
cttcaacaaagagatataggcgcagtaaatggatatattgaagaaatgatggaagggcaa
aaggttgtaaaagtattttgtcatgaagatgaagcaaaagctaattttgataaattaaat
gatatgctttttgatagtgctaataatgcaaataaatatgctaatattttaatgcctatt
atgggtaacatcggttatattaattatgttttagctgcaatagtcggagcaattcttgct
atttcaggatttgctggatttaccattggagcacttgcagctttcttacaattaacaaga
agcttcagccaaacaataaaccaaatgtcgcaacaatttaattttgtaattatggcactc
gctggagcagaacgtatctttaagcttcttgatgaaaagaaagaaatggatgaaggatat
gtaactttagttaatgcagaagaagatgaaaagggagaattaactgaagttaaaaaacgt
actggaacttgggcttggaagcatcctcatgaagatggaacaattacttatactaagctt
aatggtgaagtggtatttgatgatgttgattttggttacaatgatgaaaaaataatattg
cataacataaagctttttgcaaagcctggacaaaaaatagcctttgtaggatctacaggt
gcaggaaaaactactattacaaacttaattaatcgtttctatgatattcaagatggtaaa
atcagatatgatggaattaatataaacaagattaagaaagatgacttaagaagttccctt
ggaatagtacttcaagatgcgcatcttttcacaggaactgttgcagataacattagatat
ggtaaattagatgcaaccgatgaagaagtaaaagcagctgcaaaacttgcaaatgcagat
caatttataaaacatctgccaaaaggatatgatacaattcttacaggtgatggaggaaat
ctttcacaaggtcaaagacagcttctaacaatagctagagcagcaattgctgatccacca
gttttaatacttgatgaagctacatctagtattgatacaagaacagaaaaaattgtccaa
gagggtatggataaattaatgaatggtagaacagttttcgtaattgctcatagactttca
acaattaaaaattccgatgtaattatggtaatggatcaaggtgaaattattgaaagaggt
aatcatgatgctttaattgaagaaaaaggtaagtattatcaactatatacaggagcattt
gaattgtcataa
DBGET
integrated database retrieval system