Clostridium gelidum: psyc5s11_16960
Help
Entry
psyc5s11_16960 CDS
T08447
Name
(GenBank) GntR family transcriptional regulator
Organism
cgel
Clostridium gelidum
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Aminotran_1_2
GntR
Asp_aminotransf
Aminotran_5
HTH_36
Beta_elim_lyase
HTH_24
HTH_Crp_2
PALP
Fe_dep_repress
TrmB
Rrf2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BCZ45629
UniProt:
A0ABM7T9I5
LinkDB
All DBs
Position
complement(1966236..1967699)
Genome browser
AA seq
487 aa
AA seq
DB search
MIFSNLIINKNEPIYIQIETHIKQGIKSGELKKDSKLPSTREVSKFLNISRNSVISAYEE
LESRGIIVTKRGIGTFISIESEHERYEYNVDFIERVNNYGNTLRELDITKSELPYKKGMI
SFKSISPESHLFNLDDFKRSLLDAWTFEEANLLNYGYAKGYKPLIAYFFDYMKEKRVTTA
NKDILITNGFTEAFDIIISSLTTKGDVILCEEPTHNTALKIMKAYGLQVVQVKMDKEGLD
LNSLEDALDKYNPKFGYLIPSYNNPTGIVTKTERRKEIYKLFRKYSVPIIEDGFNEELLY
SSSPIDPIASLCGNGNGVIYIGSLSKILFPGLRIGWIFGDEKLIDVLESVKRGRNIHSSF
LDQSAFCYYLKSGAFSRYVKNVRKYYRDKYNLVIDMIHKYIPYEYITGEGGLHVFIKLTD
NIDARELLDLCYKDNVIFMPGDIFYENKLKGTDTFRIGFGRVSDEDIKNGIKIIGDNIKR
LVKNQNT
NT seq
1464 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttgatattttctaatcttattataaataaaaatgaacctatctacattcaaatagaaacg
catattaaacaaggaattaaaagtggtgaattgaaaaaagatagtaagctaccttccaca
agagaggtaagtaagtttttaaatataagtcgaaattctgttatttccgcttatgaagag
ctagaaagcagaggaataatagttactaaaagaggtataggtactttcatctctatagaa
agtgaacatgaacgttatgaatataatgttgattttatagaaagagttaataattacgga
aatactcttagagaacttgatattacaaaaagtgaattaccttataaaaaaggaatgata
tcttttaaatctatttctcctgaaagccatctttttaatcttgatgattttaaaagatct
cttttagacgcttggacttttgaagaagcaaatctacttaattatggttatgccaagggt
tataaaccattaatagcttacttttttgattatatgaaagaaaagcgtgtaacaactgct
aataaagatattttaataacaaatggttttactgaagcctttgatataatcataagttca
ttaacaactaaaggcgatgttattttatgtgaggagccaactcataatactgctttgaag
attatgaaagcctacggattgcaagttgttcaagtaaaaatggacaaagaaggactagat
ttaaactcacttgaagatgctttagataaatataatcctaagtttggatatttaatacct
tcatataataatccaacaggaattgtaactaaaactgaaagaagaaaagaaatatataaa
cttttcagaaaatattctgttcctataatagaagatggatttaacgaagaattattatac
tctagctctccaattgatccaatagcttctttatgtggaaatggtaatggagttatatat
ataggaagtctttcaaaaatactatttccaggtcttagaattgggtggatatttggagat
gaaaaactcatagatgttttagaaagtgtaaaacgcggcagaaatattcattcatcgttt
ttagatcaaagtgcattttgttattatttaaaaagtggtgcgtttagcaggtatgttaag
aatgtacgaaaatattatagagataaatataatctcgttatagatatgattcacaaatat
attccctatgaatatatcactggtgagggtggtctacatgtttttataaagcttacagat
aatatagatgcaagagaacttttagatctttgttataaagataatgttatatttatgcct
ggtgatatcttttatgaaaataaattaaaaggaactgatacatttagaataggttttgga
agagtaagtgatgaagatattaaaaatggtatcaaaataataggcgataatataaagcgc
ttagtaaaaaatcaaaatacctaa
DBGET
integrated database retrieval system