Clostridium gelidum: psyc5s11_19170
Help
Entry
psyc5s11_19170 CDS
T08447
Symbol
pehX
Name
(GenBank) exo-poly-alpha-D-galacturonosidase
KO
K18650
exo-poly-alpha-galacturonosidase [EC:
3.2.1.82
]
Organism
cgel
Clostridium gelidum
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
cgel00001
]
09190 Not Included in Pathway or Brite
09191 Unclassified: metabolism
99980 Enzymes with EC numbers
psyc5s11_19170 (pehX)
Enzymes [BR:
cgel01000
]
3. Hydrolases
3.2 Glycosylases
3.2.1 Glycosidases, i.e. enzymes that hydrolyse O- and S-glycosyl compounds
3.2.1.82 exo-poly-alpha-digalacturonosidase
psyc5s11_19170 (pehX)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Glyco_hydro_28
Pectate_lyase_3
fn3
Pur_ac_phosph_N
ASTN1_2_fn3
NDNF
DUF4625
fn3_4
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BCZ45850
LinkDB
All DBs
Position
2209874..2211637
Genome browser
AA seq
587 aa
AA seq
DB search
MKMKFRKSKIILSATVILILIGLLTFKKYSAYAQNVSIPKNPKIISQSITNEKATLIWEK
PDKYDNIKNYNIYQDGQKIGDANSGSTIAKEYFDRFYNDASNSNAVKISVHNYTVKNLKP
NTEYHFTIRSIDNEGKESQDSQTVNLKTDDTLKIFNIEDFGAKGDGTTINTKEIQKAINE
CSKDGEVLIPKGKVFKTGSISLKSEMTLKVEGTLLGSENADDYPYGDSSKVTKASSLINT
KSGSKNIRIVGLGVIDGNGWKENKEEKDPNGFFLSKESSLKTVTQNGILAAAQYKKAIEK
YGFSPKDSYSTRSNLLDMGAVTNLYIGDGLTLRNPSQHTESNSSSNNVVLNGVKLETFNC
NNGDGTGLGGGRGLIVVDSVLDTGDDDIVFNAGKGEKDSKNNPTGDIWIFDNYFGRGHGA
VVCGSYTAAWIENILAEDNILNGTGTGLRCKSSQGTGGGARNITFRDTAMKNLTDLGGQP
FIFTSQYNGDSPSDPVSASPIFHDITIENCSVDGASGNAILIEGLKDGCHNNIKFNNITF
KGTKPAILDYAENCTFKDVKFDDSIINPWEITNSTGLKFEGTTKVNK
NT seq
1764 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaatgaaatttagaaaaagtaaaattattttaagtgctactgtaattttaatatta
ataggattattgacatttaagaaatattcagcttatgcacaaaatgtatcaatacctaaa
aacccaaagataatttcacaatctataacaaatgaaaaagccacattgatttgggaaaag
cctgataaatatgataacattaaaaattataatatctatcaagatggacagaaaattgga
gatgcaaacagtggaagcactatagcaaaagaatactttgatcgtttttataatgatgct
tctaattctaatgcagtaaaaataagtgttcataattacacagtaaaaaaccttaaacca
aatacagaatatcattttactatccgttctatagataatgaaggaaaagaatctcaagat
agtcaaacagtgaacctaaaaacagatgatactctaaagatatttaatatagaagatttt
ggagcaaaaggtgatggaactacaattaatactaaggaaattcaaaaagcaataaatgaa
tgtagtaaggatggagaagtattaattccaaaaggaaaagtttttaaaactggttcaatt
tctttaaagagtgaaatgacacttaaagtagaaggaactttattaggatctgaaaatgca
gatgattatccttatggtgattctagtaaggtaactaaggcttcttctctaattaacaca
aaaagtggatcgaagaatattcgaatagttggcttgggagttatagatggaaatggatgg
aaggaaaataaggaagaaaaagatccaaatggtttctttctatcgaaggaaagcagcttg
aaaactgttacacagaatggaatacttgctgctgctcagtataaaaaagccattgaaaag
tatggattttcaccaaaagactcttattcaacccgatcaaatctattagatatgggagct
gtaactaatttatacataggtgatggattgacacttcgtaatccttcgcaacatacagaa
agtaatagtagtagtaataatgttgtattaaatggtgtgaagctggaaacttttaattgc
aataatggagatgggacaggtcttggaggcggtcgcggattaatagtagttgatagtgtg
cttgatacaggagatgatgatattgtatttaatgcaggaaaaggtgaaaaagattctaaa
aataatccaacaggtgatatctggatttttgataattattttggacgtggccatggagca
gtagtatgtggcagttatactgcagcttggatagaaaatatattagctgaggacaatatt
ttaaatggaacaggaacaggacttcgttgtaaatctagccaaggaactggtggtggagct
agaaatattactttcagagatactgcaatgaagaatttaaccgatcttggtggacagcca
tttatatttactagtcaatataatggggattcacctagtgaccctgtaagtgcttcacct
atatttcatgatattacaattgaaaattgttcagttgatggagcttctggtaatgcaatt
ttaattgaaggacttaaagatggttgtcataataacattaaatttaataatataaccttt
aaaggaacaaaacctgcaatattagattatgctgaaaattgtacatttaaagatgtaaag
tttgatgattctataattaacccatgggagattacaaatagtacgggcttgaagtttgaa
ggaacaacgaaagttaataaataa
DBGET
integrated database retrieval system
