Chlamydia gallinacea: M787_001425
Help
Entry
M787_001425 CDS
T04276
Name
(GenBank) helicase
Organism
cgz
Chlamydia gallinacea
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SNF2-rel_dom
Helicase_C
ResIII
DEAD
SNF2_assoc
SWIM
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ANG65982
UniProt:
A0A173DYH6
LinkDB
All DBs
Position
complement(322062..325568)
Genome browser
AA seq
1168 aa
AA seq
DB search
MLNFRKLRRDFTANILQDGKELFDQGAVINAKIISMTGETVCIGTQVRGAYDNVYECEIE
VDRSESDTIDSNCDCSYNYDCQHIVALLFYLEQYFNEMVVAYSQEANLDTNEEINEDVKK
ELQEAFVVAATREEERKDREHQKEILSEYIHAANTLSINPFFLPKKEYLDKNAAELAVLF
VPSNNSDEVFQANQHVEFQLILRLPGRSKPFYVSNIKTFLEGVLYQEPIILSGRRFFFTM
QSFSASDRKLIDLLIRYVRYANQVTEEKLLKSAYLTLTSLGVILSKMYEHQMADRSGTQL
GEKESFSGIFCRNLEEPLYWSASPAKIKFNLDFFDTPYKALLVTPLVLVDDDELQPEQAI
LLESNVPGIIHNNVYHHFAPQIRRAHLRSFSRLRDITIPEALFGSFRENALPVFKEYAEV
SNVEVLNSFVTLPYVEEVRGVCDMSYLDGELEAKLYFIYDSITIPATSFSLTYQDVRAFI
REDGILARNLVEERKIIEEVFSGFVYDERDGAYHVKSEKKIVEFMTETIPNNQHRITFNC
PETLSDQFIYDETVFDLSFRESSEIDSYEAELKVNGLLKGISLDLLWDCVSAKKRFLELP
KKGHNVKTGRKGRPGAAKLPCILVLDLEKISPVVQIFNEIGFKVLDDFVEKCPLWSLTGI
SSELFEGLPVNFTMTEKLAEIQKQIRGEVAFDFQEIPQQIQATLRSYQTEGIHWLERLRK
MHLNGILADDMGLGKTLQAIIAITQSRLEKGAGCSLIVCPTSLVYNWKEEFRKFNPEFKV
VVIDGVPVYRRKQLADLSKYDVAITSYNLLQKDIDIYKDFVFDYVVLDEAHHIKNRTTRN
AKSVKMIRSGHRLILTGTPIENSLEELWSLFDFLMPGLLSSYDRFVGKYIRTGNYMGNKA
DNMVALKKKVAPFILRRMKEDVLEDLPPVSEILYHCHLTESQRELYHSYAASAKKELSRL
VKQEGFDRIHIHVLATLTRLKQICCHPAIFAKDVPEPGDSAKYDMLMDLLSSLVESGHKT
VLFSQYTKMLSIIKQDLELRGIPFVYLDGSSKNRLELVNQFNEDPGLLVFLISLKAGGTG
LNLVGADTVIHYDMWWNPAVESQATDRVHRIGQSRSVSSYKLVTLNTIEEKILTLQDRKK
SLVKKVINSDDEVVSKLTWEEVLELLQI
NT seq
3507 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcttaattttcgcaaattacgacgagattttacagctaatattttgcaggatggcaag
gaactttttgaccaaggagctgtgattaatgcaaaaattatttctatgactggagagacg
gtgtgcataggtacacaggtccgaggtgcgtatgacaacgtatatgaatgtgaaattgag
gtggatcgttcggaatccgatactatcgattcgaattgtgactgttcatacaattacgat
tgtcaacatattgtggctctattgttttacctggaacaatattttaatgaaatggtggtt
gcttattctcaagaagctaatttggatacgaatgaagagattaatgaagatgtgaaaaaa
gagcttcaggaggcatttgttgttgctgcaactagggaagaagagcgtaaggatcgtgag
catcaaaaagaaatattaagtgaatacattcatgcagcaaatacattaagtattaatccc
tttttcttacctaaaaaggagtatttagacaaaaatgctgcggaacttgctgtcttattt
gttccttctaataattctgatgaagttttccaggcaaatcaacatgtagagtttcagtta
attcttcgtcttccaggtcgctccaagcctttttatgtttcgaatattaagactttctta
gaaggagtgttgtatcaggagccgattatcttgagtgggcgtcgtttcttctttacgatg
caatcatttagtgcttctgatcgcaaattgattgatttattgattcgttacgtacgttat
gcaaatcaggtaacagaagaaaaattattaaaatcagcatatcttacattaacatcttta
ggtgtgattttatctaagatgtatgaacatcaaatggccgatcgtagtggaactcaatta
ggtgaaaaagaaagtttttcagggatattttgtagaaatcttgaggaacctttatactgg
tcagcttctcctgcgaaaataaagtttaatttagatttttttgataccccgtataaagct
ttattagttactcctttggttctcgttgatgatgatgagttgcagccagaacaagcgatt
cttttggagtctaatgtccctggtattattcacaataacgtgtaccatcattttgctcct
caaattcgtcgtgcgcatttacgttctttctcgcgtttacgtgacattacgattccagaa
gctttatttggttcatttagggaaaatgctcttcctgtttttaaagaatatgcggaagtc
tccaatgttgaggttttaaactcgtttgtcactcttccttatgttgaggaggttcgtggt
gtatgtgatatgagttatttggatggagaattagaagctaaattatactttatttatgat
tctataactattcctgcgacttcattttctttaacatatcaagatgtccgtgcatttatt
cgcgaagacggtattttggctagaaatcttgttgaagagcgtaaaatcattgaagaggtc
ttctccggatttgtttatgatgagcgggatggggcatatcatgtaaagagtgagaagaag
atagttgaattcatgacagaaacgattcctaataaccaacatcggattacgtttaattgt
cctgaaactctgtcggatcaatttatttatgatgaaacagtgtttgatctttcctttaga
gaaagttctgaaattgattcttatgaagcagaacttaaggtgaatgggcttctgaagggg
attagcttagatttgctatgggattgtgttagtgctaagaagcgctttttggagctgcct
aagaagggacataatgttaagacagggcgtaaaggtaggccaggggcagctaaattacca
tgtattttggttttagatttagagaagatttctcctgtagtacaaattttcaatgaaatt
ggttttaaggttttagatgactttgtagaaaagtgtcctctttggagtttaacagggatt
tcatcagagctttttgagggacttcctgtcaatttcacaatgacagagaaattagctgaa
atacagaaacaaattcgtggtgaagttgcctttgacttccaagagattcctcagcagatt
caagcaaccttgcgtagctatcaaactgaagggattcattggttagagcgtctgagaaag
atgcatcttaatggtattttagctgatgatatgggattaggcaagactttacaagcaatc
atagcaattacgcaaagtcgcttagaaaaaggggcgggatgttctttaatcgtttgccct
acctctttagtatataactggaaagaagaatttcgtaagtttaatcccgagtttaaggta
gttgttattgatggagttcctgtttatcgtcgcaagcagttagcagatttatctaaatat
gatgtagcaattacttcttataatttgttgcaaaaggatatcgatatttataaagacttt
gtttttgattatgttgtcttagatgaagcacatcatattaaaaatcgtacgacacgtaat
gcaaaatctgtaaagatgattcgttcggggcatcggttaattttaactggaacacctata
gagaattctcttgaagaattgtggagcctatttgatttcttaatgccgggcttattgagt
agttatgatcgttttgtcggaaaatatattcgtacgggcaactatatggggaataaagca
gataatatggttgctttgaagaagaaggtagctccgtttattttgcgacgtatgaaagaa
gatgttttggaagatttacctccagtatcggaaattttatatcattgtcatcttacggaa
tcgcaacgggaattatatcattcttatgctgcctctgcaaagaaggagctttcacgttta
gttaaacaagaaggatttgatcgtatacatattcatgtgcttgctactcttacgcggtta
aaacagatttgttgtcatcctgcgatttttgctaaggatgttcctgaaccaggtgactcc
gcaaagtacgacatgcttatggatttactttcttctcttgtggaatcggggcataaaacg
gtgcttttcagccagtacacgaagatgttgagtattattaaacaggatttagaactacgt
ggtataccgttcgtatatttagatggttctagcaagaataggttagaattagtcaaccaa
tttaatgaagatcctgggttattagtatttttgatttctttgaaagcaggcggtacgggt
ttaaatcttgtgggggcagataccgtaattcattatgatatgtggtggaatcctgctgta
gaaagtcaagctacagaccgtgtgcatcgtataggtcaaagtcgttctgtatcttcatat
aagttagttactttaaatactattgaggagaaaattcttactctccaggataggaaaaag
agccttgtaaagaaagtgatcaactctgatgatgaagtcgtttctaagttaacttgggaa
gaagttctagaattgctacagatctga
DBGET
integrated database retrieval system
